Doublet Group distance statistics: 49060

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 13, 8, 11, 3, 3, 4, 5, 2, 3, 3, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.001, 0.007, 0.012, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.007 std_dev=0.005
C6	A	0, 0.006, 0.014, 0.022, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.014 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.001, 0.010, 0.018, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.010 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.006, 0.015, 0.024, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.015 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.006, 0.016, 0.026, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.016 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.002, 0.014, 0.025, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.014 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.006, 0.017, 0.029, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.017 std_dev=0.012
N4	A	0, 0.019, 0.046, 0.073, 0.115 max_d=0.115 avg_d=0.046 std_dev=0.027
O2	A	0, 0.012, 0.039, 0.067, 0.163 max_d=0.163 avg_d=0.039 std_dev=0.027
O4'	A	0, 0.027, 0.109, 0.190, 0.407 max_d=0.407 avg_d=0.109 std_dev=0.082
C4'	A	0, 0.075, 0.169, 0.264, 0.525 max_d=0.525 avg_d=0.169 std_dev=0.094
C2'	A	0, 0.018, 0.116, 0.215, 0.633 max_d=0.633 avg_d=0.116 std_dev=0.098
C3'	A	0, 0.042, 0.177, 0.312, 0.771 max_d=0.771 avg_d=0.177 std_dev=0.135
N1	B	0, 0.122, 0.281, 0.439, 0.683 max_d=0.683 avg_d=0.281 std_dev=0.158
C5'	A	0, 0.126, 0.285, 0.444, 0.782 max_d=0.782 avg_d=0.285 std_dev=0.159
O2'	A	0, 0.016, 0.200, 0.384, 1.344 max_d=1.344 avg_d=0.200 std_dev=0.184
O5'	A	0, 0.151, 0.343, 0.534, 0.937 max_d=0.937 avg_d=0.343 std_dev=0.191
N2	B	0, 0.170, 0.366, 0.562, 0.916 max_d=0.916 avg_d=0.366 std_dev=0.196
C2	B	0, 0.140, 0.343, 0.545, 0.780 max_d=0.780 avg_d=0.343 std_dev=0.203
P	A	0, 0.111, 0.323, 0.534, 1.117 max_d=1.117 avg_d=0.323 std_dev=0.211
C6	B	0, 0.116, 0.333, 0.551, 0.923 max_d=0.923 avg_d=0.333 std_dev=0.218
O6	B	0, 0.085, 0.342, 0.598, 1.033 max_d=1.033 avg_d=0.342 std_dev=0.257
OP2	A	0, 0.136, 0.397, 0.658, 1.257 max_d=1.257 avg_d=0.397 std_dev=0.261
O3'	A	0, -0.033, 0.232, 0.497, 1.671 max_d=1.671 avg_d=0.232 std_dev=0.265
OP1	A	0, 0.168, 0.447, 0.726, 1.802 max_d=1.802 avg_d=0.447 std_dev=0.279
N3	B	0, 0.155, 0.440, 0.724, 1.086 max_d=1.086 avg_d=0.440 std_dev=0.285
C5	B	0, 0.137, 0.426, 0.715, 1.164 max_d=1.164 avg_d=0.426 std_dev=0.289
C4	B	0, 0.150, 0.467, 0.783, 1.126 max_d=1.126 avg_d=0.467 std_dev=0.317
N7	B	0, 0.143, 0.519, 0.895, 1.496 max_d=1.496 avg_d=0.519 std_dev=0.376
N9	B	0, 0.158, 0.579, 0.999, 1.480 max_d=1.480 avg_d=0.579 std_dev=0.421
OP2	B	0, 0.243, 0.677, 1.111, 1.735 max_d=1.735 avg_d=0.677 std_dev=0.434
C8	B	0, 0.160, 0.600, 1.040, 1.614 max_d=1.614 avg_d=0.600 std_dev=0.440
C3'	B	0, 0.208, 0.701, 1.195, 2.189 max_d=2.189 avg_d=0.701 std_dev=0.494
C1'	B	0, 0.164, 0.658, 1.152, 1.755 max_d=1.755 avg_d=0.658 std_dev=0.494
C4'	B	0, 0.182, 0.691, 1.201, 2.115 max_d=2.115 avg_d=0.691 std_dev=0.510
O3'	B	0, 0.278, 0.788, 1.298, 2.113 max_d=2.113 avg_d=0.788 std_dev=0.510
O5'	B	0, 0.228, 0.752, 1.275, 2.316 max_d=2.316 avg_d=0.752 std_dev=0.523
P	B	0, 0.196, 0.734, 1.272, 1.981 max_d=1.981 avg_d=0.734 std_dev=0.538
C5'	B	0, 0.191, 0.757, 1.322, 2.396 max_d=2.396 avg_d=0.757 std_dev=0.566
O4'	B	0, 0.124, 0.691, 1.258, 2.159 max_d=2.159 avg_d=0.691 std_dev=0.567
C2'	B	0, 0.184, 0.762, 1.339, 2.423 max_d=2.423 avg_d=0.762 std_dev=0.577
OP1	B	0, 0.158, 0.841, 1.524, 2.891 max_d=2.891 avg_d=0.841 std_dev=0.683
O2'	B	0, 0.142, 0.865, 1.588, 3.522 max_d=3.522 avg_d=0.865 std_dev=0.723

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.04	0.02	0.11	0.00	0.08	0.18	0.07	0.07
C2	0.02	0.00	0.05	0.04	0.01	0.02	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.08	0.13	0.04	0.12	0.23	0.10	0.10
C2'	0.01	0.05	0.00	0.01	0.04	0.01	0.05	0.07	0.06	0.02	0.04	0.04	0.09	0.00	0.02	0.01	0.13	0.21	0.14	0.15
C3'	0.02	0.04	0.01	0.00	0.05	0.01	0.06	0.02	0.06	0.03	0.04	0.05	0.08	0.02	0.01	0.01	0.05	0.13	0.09	0.05
C4	0.02	0.01	0.04	0.05	0.00	0.03	0.01	0.11	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.10	0.08	0.03	0.15	0.29	0.17	0.14
C4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.00	0.05	0.01	0.04	0.02	0.03	0.04	0.05	0.05	0.03	0.00	0.01	0.12	0.07	0.03
C5	0.01	0.01	0.05	0.06	0.01	0.05	0.00	0.12	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.04	0.03	0.16	0.29	0.18	0.15
C5'	0.03	0.07	0.07	0.02	0.11	0.01	0.12	0.00	0.10	0.07	0.09	0.12	0.06	0.03	0.05	0.01	0.01	0.08	0.07	0.02
C6	0.01	0.01	0.06	0.06	0.01	0.04	0.00	0.10	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.04	0.04	0.15	0.25	0.13	0.12
N1	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.02	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.05	0.09	0.01	0.12	0.22	0.10	0.09
N3	0.02	0.01	0.04	0.04	0.01	0.03	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.09	0.12	0.03	0.13	0.26	0.13	0.12
N4	0.02	0.02	0.04	0.05	0.01	0.04	0.01	0.12	0.01	0.02	0.02	0.00	0.03	0.11	0.08	0.03	0.15	0.30	0.20	0.16
O2	0.04	0.01	0.09	0.08	0.02	0.05	0.01	0.06	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.12	0.19	0.06	0.11	0.21	0.09	0.08
O2'	0.02	0.08	0.00	0.02	0.10	0.05	0.10	0.03	0.09	0.05	0.09	0.11	0.12	0.00	0.04	0.03	0.13	0.22	0.14	0.16
O3'	0.11	0.13	0.02	0.01	0.08	0.03	0.04	0.05	0.04	0.09	0.12	0.08	0.19	0.04	0.00	0.09	0.07	0.13	0.13	0.07
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.03	0.03	0.06	0.03	0.09	0.00	0.07	0.17	0.07	0.08
O5'	0.08	0.12	0.13	0.05	0.15	0.01	0.16	0.01	0.15	0.12	0.13	0.15	0.11	0.13	0.07	0.07	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.18	0.23	0.21	0.13	0.29	0.12	0.29	0.08	0.25	0.22	0.26	0.30	0.21	0.22	0.13	0.17	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.07	0.10	0.14	0.09	0.17	0.07	0.18	0.07	0.13	0.10	0.13	0.20	0.09	0.14	0.13	0.07	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.07	0.10	0.15	0.05	0.14	0.03	0.15	0.02	0.12	0.09	0.12	0.16	0.08	0.16	0.07	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.11	0.09	0.16	0.13	0.09	0.17	0.09	0.36	0.11	0.09	0.10	0.10	0.10	0.10	0.09	0.29	0.46	0.18	0.26	0.14	0.29	0.29	0.26
C2	0.12	0.09	0.14	0.12	0.11	0.11	0.13	0.31	0.14	0.13	0.11	0.11	0.09	0.15	0.12	0.29	0.46	0.10	0.20	0.16	0.22	0.23	0.17
C2'	0.15	0.13	0.23	0.14	0.13	0.18	0.13	0.36	0.14	0.13	0.14	0.13	0.14	0.13	0.14	0.37	0.44	0.20	0.30	0.15	0.33	0.31	0.29
C3'	0.20	0.14	0.26	0.16	0.16	0.23	0.14	0.40	0.14	0.16	0.14	0.14	0.17	0.15	0.17	0.38	0.40	0.27	0.34	0.16	0.36	0.35	0.33
C4	0.18	0.13	0.18	0.14	0.17	0.14	0.18	0.30	0.17	0.20	0.14	0.13	0.14	0.21	0.18	0.30	0.45	0.14	0.19	0.18	0.22	0.17	0.12
C4'	0.17	0.11	0.24	0.16	0.12	0.21	0.10	0.38	0.11	0.11	0.10	0.13	0.14	0.10	0.13	0.35	0.42	0.24	0.31	0.14	0.33	0.32	0.30
C5	0.17	0.13	0.17	0.15	0.15	0.15	0.16	0.32	0.16	0.18	0.13	0.14	0.14	0.18	0.17	0.30	0.47	0.14	0.21	0.17	0.22	0.18	0.14
C5'	0.14	0.09	0.22	0.13	0.10	0.17	0.10	0.35	0.12	0.10	0.11	0.10	0.11	0.10	0.11	0.36	0.43	0.19	0.27	0.16	0.28	0.26	0.24
C6	0.14	0.11	0.16	0.14	0.12	0.15	0.13	0.32	0.14	0.14	0.12	0.12	0.12	0.15	0.13	0.30	0.48	0.13	0.23	0.15	0.23	0.21	0.17
N1	0.11	0.09	0.14	0.12	0.10	0.13	0.11	0.33	0.13	0.11	0.10	0.10	0.09	0.12	0.10	0.29	0.47	0.12	0.23	0.15	0.24	0.24	0.19
N3	0.16	0.12	0.18	0.13	0.16	0.12	0.18	0.30	0.17	0.19	0.13	0.12	0.12	0.20	0.17	0.30	0.45	0.12	0.18	0.18	0.21	0.19	0.13
N4	0.21	0.14	0.21	0.16	0.19	0.16	0.21	0.31	0.18	0.24	0.14	0.14	0.15	0.24	0.21	0.31	0.42	0.18	0.18	0.19	0.25	0.14	0.11
O2	0.11	0.08	0.14	0.12	0.10	0.12	0.12	0.32	0.14	0.12	0.11	0.11	0.08	0.13	0.11	0.29	0.46	0.11	0.21	0.16	0.24	0.26	0.20
O2'	0.13	0.14	0.21	0.11	0.13	0.18	0.14	0.37	0.16	0.13	0.16	0.14	0.13	0.14	0.13	0.35	0.46	0.22	0.30	0.17	0.32	0.31	0.29
O3'	0.27	0.22	0.31	0.20	0.23	0.31	0.22	0.46	0.23	0.23	0.23	0.21	0.24	0.23	0.24	0.37	0.37	0.37	0.38	0.25	0.42	0.41	0.39
O4'	0.14	0.10	0.18	0.15	0.10	0.19	0.10	0.37	0.12	0.10	0.11	0.12	0.12	0.11	0.11	0.30	0.45	0.20	0.27	0.16	0.29	0.29	0.26
O5'	0.11	0.12	0.17	0.12	0.12	0.14	0.15	0.31	0.17	0.13	0.16	0.11	0.11	0.15	0.12	0.33	0.49	0.15	0.22	0.20	0.25	0.21	0.18
OP1	0.30	0.28	0.29	0.31	0.31	0.27	0.34	0.33	0.34	0.35	0.31	0.25	0.28	0.36	0.32	0.39	0.65	0.28	0.28	0.36	0.30	0.25	0.24
OP2	0.13	0.12	0.20	0.14	0.12	0.15	0.16	0.31	0.18	0.14	0.16	0.11	0.11	0.16	0.12	0.37	0.47	0.16	0.22	0.21	0.22	0.16	0.14
P	0.14	0.15	0.17	0.17	0.16	0.15	0.19	0.29	0.20	0.18	0.18	0.13	0.13	0.20	0.16	0.34	0.53	0.14	0.20	0.22	0.21	0.15	0.12

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.03	0.03	0.01	0.03	0.07	0.04	0.01	0.05	0.06	0.05	0.01	0.01	0.02	0.24	0.00	0.10	0.04	0.27	0.19	0.13
C2	0.05	0.00	0.10	0.07	0.02	0.08	0.02	0.28	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.23	0.41	0.08	0.20	0.03	0.30	0.28	0.24
C2'	0.00	0.10	0.00	0.01	0.05	0.02	0.06	0.08	0.07	0.10	0.08	0.12	0.10	0.09	0.04	0.01	0.08	0.02	0.24	0.08	0.35	0.21	0.22
C3'	0.03	0.07	0.01	0.00	0.03	0.01	0.07	0.05	0.06	0.14	0.04	0.11	0.08	0.13	0.06	0.02	0.02	0.01	0.22	0.08	0.32	0.22	0.20
C4	0.03	0.02	0.05	0.03	0.00	0.09	0.01	0.27	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.18	0.27	0.05	0.20	0.02	0.29	0.26	0.22
C4'	0.01	0.08	0.02	0.01	0.09	0.00	0.12	0.01	0.12	0.11	0.09	0.08	0.07	0.13	0.07	0.10	0.03	0.01	0.03	0.13	0.23	0.21	0.06
C5	0.03	0.02	0.06	0.07	0.01	0.12	0.00	0.32	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.23	0.19	0.04	0.25	0.02	0.30	0.35	0.28
C5'	0.07	0.28	0.08	0.05	0.27	0.01	0.32	0.00	0.35	0.25	0.32	0.27	0.24	0.32	0.21	0.04	0.13	0.02	0.01	0.37	0.21	0.22	0.02
C6	0.04	0.02	0.07	0.06	0.01	0.12	0.01	0.35	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.25	0.24	0.05	0.27	0.01	0.31	0.40	0.30
C8	0.01	0.02	0.10	0.14	0.01	0.11	0.01	0.25	0.02	0.00	0.03	0.02	0.02	0.01	0.00	0.22	0.06	0.06	0.23	0.03	0.29	0.24	0.22
N1	0.05	0.01	0.08	0.04	0.03	0.09	0.02	0.32	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.02	0.04	0.24	0.34	0.06	0.24	0.02	0.30	0.35	0.27
N2	0.06	0.01	0.12	0.11	0.02	0.08	0.02	0.27	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.02	0.03	0.26	0.49	0.10	0.19	0.04	0.29	0.27	0.23
N3	0.05	0.01	0.10	0.08	0.01	0.07	0.01	0.24	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.03	0.21	0.41	0.09	0.17	0.02	0.29	0.24	0.21
N7	0.01	0.02	0.09	0.13	0.01	0.13	0.01	0.32	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.25	0.08	0.06	0.27	0.03	0.30	0.37	0.29
N9	0.01	0.03	0.04	0.06	0.01	0.07	0.02	0.21	0.03	0.00	0.04	0.03	0.03	0.01	0.00	0.13	0.18	0.02	0.17	0.03	0.29	0.19	0.18
O2'	0.02	0.23	0.01	0.02	0.18	0.10	0.23	0.04	0.25	0.22	0.24	0.26	0.21	0.25	0.13	0.00	0.09	0.08	0.25	0.28	0.39	0.19	0.23
O3'	0.24	0.41	0.08	0.02	0.27	0.03	0.19	0.13	0.24	0.06	0.34	0.49	0.41	0.08	0.18	0.09	0.00	0.13	0.25	0.20	0.34	0.22	0.25
O4'	0.00	0.08	0.02	0.01	0.05	0.01	0.04	0.02	0.05	0.06	0.06	0.10	0.09	0.06	0.02	0.08	0.13	0.00	0.15	0.06	0.27	0.31	0.19
O5'	0.10	0.20	0.24	0.22	0.20	0.03	0.25	0.01	0.27	0.23	0.24	0.19	0.17	0.27	0.17	0.25	0.25	0.15	0.00	0.30	0.02	0.02	0.01
O6	0.04	0.03	0.08	0.08	0.02	0.13	0.02	0.37	0.01	0.03	0.02	0.04	0.02	0.03	0.03	0.28	0.20	0.06	0.30	0.00	0.32	0.47	0.34
OP1	0.27	0.30	0.35	0.32	0.29	0.23	0.30	0.21	0.31	0.29	0.30	0.29	0.29	0.30	0.29	0.39	0.34	0.27	0.02	0.32	0.00	0.01	0.01
OP2	0.19	0.28	0.21	0.22	0.26	0.21	0.35	0.22	0.40	0.24	0.35	0.27	0.24	0.37	0.19	0.19	0.22	0.31	0.02	0.47	0.01	0.00	0.01
P	0.13	0.24	0.22	0.20	0.22	0.06	0.28	0.02	0.30	0.22	0.27	0.23	0.21	0.29	0.18	0.23	0.25	0.19	0.01	0.34	0.01	0.01	0.00