Doublet Group distance statistics: 49062

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 1, 0, 0, 1, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.002, 0.005, 0.008, 0.009 max_d=0.009 avg_d=0.005 std_dev=0.003
N3	A	0, 0.003, 0.006, 0.010, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.006 std_dev=0.004
N1	A	0, 0.003, 0.010, 0.017, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.010 std_dev=0.007
C1'	A	0, 0.005, 0.014, 0.024, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.014 std_dev=0.009
C6	A	0, 0.003, 0.013, 0.022, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.013 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.003, 0.013, 0.023, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.013 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.003, 0.014, 0.024, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.014 std_dev=0.011
O2	A	0, 0.008, 0.031, 0.054, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.031 std_dev=0.023
N4	A	0, 0.012, 0.042, 0.072, 0.089 max_d=0.089 avg_d=0.042 std_dev=0.030
C2'	A	0, 0.088, 0.155, 0.222, 0.239 max_d=0.239 avg_d=0.155 std_dev=0.067
O4'	A	0, 0.054, 0.133, 0.212, 0.248 max_d=0.248 avg_d=0.133 std_dev=0.079
C4'	A	0, 0.070, 0.218, 0.365, 0.490 max_d=0.490 avg_d=0.218 std_dev=0.147
C5'	A	0, 0.158, 0.334, 0.510, 0.559 max_d=0.559 avg_d=0.334 std_dev=0.176
O2'	A	0, 0.094, 0.365, 0.635, 1.017 max_d=1.017 avg_d=0.365 std_dev=0.270
OP1	A	0, 0.198, 0.560, 0.923, 1.238 max_d=1.238 avg_d=0.560 std_dev=0.363
C3'	A	0, -0.083, 0.321, 0.725, 1.363 max_d=1.363 avg_d=0.321 std_dev=0.404
O5'	A	0, 0.053, 0.468, 0.883, 1.486 max_d=1.486 avg_d=0.468 std_dev=0.415
N7	B	0, 0.250, 0.674, 1.097, 1.383 max_d=1.383 avg_d=0.674 std_dev=0.423
C8	B	0, 0.274, 0.705, 1.136, 1.273 max_d=1.273 avg_d=0.705 std_dev=0.431
O2'	B	0, 0.238, 0.670, 1.101, 1.151 max_d=1.151 avg_d=0.670 std_dev=0.432
N9	B	0, 0.257, 0.690, 1.123, 1.338 max_d=1.338 avg_d=0.690 std_dev=0.433
C5	B	0, 0.203, 0.643, 1.083, 1.544 max_d=1.544 avg_d=0.643 std_dev=0.440
C1'	B	0, 0.264, 0.704, 1.144, 1.252 max_d=1.252 avg_d=0.704 std_dev=0.440
C4	B	0, 0.218, 0.658, 1.099, 1.514 max_d=1.514 avg_d=0.658 std_dev=0.441
C2'	B	0, 0.241, 0.685, 1.129, 1.217 max_d=1.217 avg_d=0.685 std_dev=0.444
N3	B	0, 0.182, 0.646, 1.110, 1.638 max_d=1.638 avg_d=0.646 std_dev=0.464
C6	B	0, 0.131, 0.613, 1.095, 1.739 max_d=1.739 avg_d=0.613 std_dev=0.482
O4'	B	0, 0.306, 0.799, 1.291, 1.433 max_d=1.433 avg_d=0.799 std_dev=0.493
C2	B	0, 0.104, 0.606, 1.107, 1.805 max_d=1.805 avg_d=0.606 std_dev=0.502
P	A	0, 0.129, 0.634, 1.138, 1.851 max_d=1.851 avg_d=0.634 std_dev=0.504
O6	B	0, 0.108, 0.614, 1.119, 1.814 max_d=1.814 avg_d=0.614 std_dev=0.506
C3'	B	0, 0.272, 0.783, 1.294, 1.463 max_d=1.463 avg_d=0.783 std_dev=0.511
N1	B	0, 0.074, 0.592, 1.111, 1.865 max_d=1.865 avg_d=0.592 std_dev=0.519
C4'	B	0, 0.321, 0.843, 1.365, 1.465 max_d=1.465 avg_d=0.843 std_dev=0.522
O3'	B	0, 0.272, 0.807, 1.341, 1.492 max_d=1.492 avg_d=0.807 std_dev=0.535
N2	B	0, 0.037, 0.580, 1.123, 1.933 max_d=1.933 avg_d=0.580 std_dev=0.543
C5'	B	0, 0.368, 0.988, 1.607, 1.895 max_d=1.895 avg_d=0.988 std_dev=0.619
O3'	A	0, -0.221, 0.456, 1.133, 2.225 max_d=2.225 avg_d=0.456 std_dev=0.677
O5'	B	0, 0.301, 1.069, 1.838, 2.565 max_d=2.565 avg_d=1.069 std_dev=0.768
OP2	A	0, 0.106, 0.874, 1.643, 2.808 max_d=2.808 avg_d=0.874 std_dev=0.769
P	B	0, 0.207, 1.422, 2.637, 4.249 max_d=4.249 avg_d=1.422 std_dev=1.215
OP2	B	0, 0.188, 1.462, 2.736, 4.478 max_d=4.478 avg_d=1.462 std_dev=1.274
OP1	B	0, 0.106, 1.568, 3.030, 5.080 max_d=5.080 avg_d=1.568 std_dev=1.462

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.06	0.00	0.07	0.07	0.13	0.13
C2	0.01	0.00	0.03	0.11	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.19	0.10	0.02	0.06	0.03	0.05	0.06
C2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.03	0.02	0.02	0.10	0.01	0.01	0.04	0.04	0.04	0.00	0.07	0.00	0.25	0.16	0.34	0.29
C3'	0.02	0.11	0.00	0.00	0.24	0.00	0.28	0.01	0.25	0.14	0.17	0.26	0.05	0.01	0.01	0.01	0.03	0.09	0.04	0.02
C4	0.01	0.00	0.03	0.24	0.00	0.08	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.20	0.25	0.02	0.17	0.07	0.16	0.06
C4'	0.00	0.03	0.02	0.00	0.08	0.00	0.10	0.00	0.10	0.05	0.05	0.08	0.03	0.19	0.05	0.00	0.01	0.03	0.02	0.02
C5	0.01	0.00	0.02	0.28	0.00	0.10	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.16	0.30	0.02	0.20	0.08	0.18	0.07
C5'	0.04	0.03	0.10	0.01	0.08	0.00	0.10	0.00	0.08	0.03	0.05	0.09	0.02	0.07	0.08	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01
C6	0.00	0.00	0.01	0.25	0.00	0.10	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.12	0.26	0.02	0.15	0.04	0.08	0.04
N1	0.01	0.01	0.01	0.14	0.01	0.05	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.13	0.14	0.01	0.06	0.03	0.06	0.07
N3	0.01	0.00	0.04	0.17	0.00	0.05	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.21	0.17	0.02	0.11	0.04	0.09	0.04
N4	0.01	0.01	0.04	0.26	0.00	0.08	0.00	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.22	0.28	0.03	0.20	0.10	0.22	0.09
O2	0.02	0.00	0.04	0.05	0.00	0.03	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.19	0.05	0.03	0.03	0.04	0.08	0.09
O2'	0.01	0.19	0.00	0.01	0.20	0.19	0.16	0.07	0.12	0.13	0.21	0.22	0.19	0.00	0.09	0.13	0.17	0.06	0.37	0.22
O3'	0.06	0.10	0.07	0.01	0.25	0.05	0.30	0.08	0.26	0.14	0.17	0.28	0.05	0.09	0.00	0.06	0.08	0.22	0.12	0.12
O4'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.13	0.06	0.00	0.04	0.04	0.06	0.06
O5'	0.07	0.06	0.25	0.03	0.17	0.01	0.20	0.01	0.15	0.06	0.11	0.20	0.03	0.17	0.08	0.04	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.07	0.03	0.16	0.09	0.07	0.03	0.08	0.02	0.04	0.03	0.04	0.10	0.04	0.06	0.22	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.13	0.05	0.34	0.04	0.16	0.02	0.18	0.01	0.08	0.06	0.09	0.22	0.08	0.37	0.12	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.13	0.06	0.29	0.02	0.06	0.02	0.07	0.01	0.04	0.07	0.04	0.09	0.09	0.22	0.12	0.06	0.01	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.24	0.08	0.22	0.20	0.14	0.22	0.10	0.22	0.13	0.17	0.16	0.09	0.13	0.12	0.19	0.26	0.20	0.24	0.22	0.20	0.13	0.26	0.29
C2	0.29	0.16	0.29	0.28	0.22	0.28	0.16	0.29	0.09	0.23	0.07	0.15	0.23	0.17	0.25	0.30	0.29	0.28	0.32	0.12	0.28	0.40	0.41
C2'	0.25	0.11	0.21	0.20	0.17	0.23	0.12	0.24	0.11	0.18	0.10	0.08	0.18	0.14	0.21	0.23	0.18	0.26	0.27	0.14	0.21	0.35	0.37
C3'	0.13	0.21	0.20	0.22	0.16	0.17	0.17	0.15	0.20	0.14	0.22	0.24	0.18	0.15	0.14	0.21	0.26	0.12	0.13	0.20	0.22	0.13	0.12
C4	0.30	0.21	0.31	0.31	0.25	0.30	0.21	0.32	0.15	0.25	0.15	0.21	0.25	0.21	0.27	0.31	0.31	0.28	0.35	0.10	0.32	0.45	0.45
C4'	0.11	0.17	0.08	0.08	0.10	0.09	0.13	0.08	0.20	0.09	0.23	0.21	0.11	0.11	0.09	0.12	0.09	0.11	0.08	0.24	0.18	0.09	0.10
C5	0.28	0.16	0.28	0.27	0.21	0.27	0.17	0.29	0.11	0.23	0.10	0.15	0.22	0.19	0.25	0.29	0.28	0.27	0.31	0.09	0.25	0.39	0.40
C5'	0.13	0.16	0.10	0.08	0.10	0.10	0.12	0.09	0.18	0.10	0.21	0.21	0.10	0.10	0.10	0.14	0.09	0.13	0.09	0.22	0.15	0.10	0.12
C6	0.27	0.11	0.26	0.25	0.18	0.25	0.14	0.26	0.09	0.21	0.07	0.10	0.18	0.16	0.23	0.28	0.25	0.26	0.28	0.11	0.19	0.33	0.35
N1	0.27	0.10	0.26	0.24	0.18	0.25	0.13	0.26	0.09	0.20	0.07	0.08	0.18	0.15	0.22	0.28	0.25	0.26	0.27	0.14	0.20	0.33	0.35
N3	0.30	0.22	0.31	0.31	0.25	0.30	0.21	0.32	0.14	0.26	0.15	0.22	0.26	0.21	0.28	0.31	0.32	0.29	0.36	0.09	0.34	0.46	0.47
N4	0.31	0.25	0.32	0.33	0.27	0.31	0.24	0.34	0.19	0.27	0.20	0.24	0.27	0.24	0.29	0.31	0.34	0.29	0.38	0.14	0.38	0.50	0.49
O2	0.29	0.15	0.30	0.29	0.22	0.29	0.14	0.30	0.08	0.22	0.06	0.15	0.23	0.16	0.25	0.31	0.30	0.28	0.33	0.17	0.29	0.40	0.42
O2'	0.21	0.12	0.22	0.21	0.07	0.22	0.13	0.22	0.26	0.08	0.28	0.12	0.08	0.11	0.11	0.29	0.24	0.22	0.22	0.34	0.19	0.27	0.32
O3'	0.31	0.32	0.42	0.44	0.30	0.37	0.29	0.35	0.28	0.29	0.30	0.34	0.32	0.28	0.30	0.44	0.50	0.29	0.30	0.27	0.39	0.17	0.18
O4'	0.22	0.13	0.20	0.16	0.11	0.19	0.11	0.18	0.18	0.14	0.21	0.16	0.10	0.11	0.16	0.25	0.17	0.21	0.16	0.24	0.10	0.15	0.18
O5'	0.11	0.15	0.10	0.09	0.09	0.10	0.10	0.11	0.14	0.12	0.18	0.21	0.10	0.11	0.10	0.11	0.10	0.11	0.13	0.17	0.10	0.20	0.20
OP1	0.12	0.13	0.09	0.08	0.09	0.10	0.10	0.10	0.14	0.11	0.16	0.17	0.09	0.10	0.10	0.12	0.08	0.12	0.11	0.17	0.13	0.15	0.16
OP2	0.09	0.13	0.09	0.10	0.07	0.09	0.07	0.11	0.10	0.10	0.14	0.20	0.09	0.09	0.08	0.10	0.12	0.09	0.16	0.12	0.09	0.28	0.25
P	0.10	0.16	0.09	0.09	0.08	0.09	0.10	0.10	0.16	0.09	0.20	0.22	0.10	0.09	0.08	0.11	0.10	0.10	0.11	0.19	0.09	0.17	0.17

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.07	0.01	0.07	0.15	0.17
C2	0.01	0.00	0.13	0.11	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.16	0.15	0.04	0.11	0.00	0.14	0.29	0.29
C2'	0.00	0.13	0.00	0.00	0.06	0.01	0.03	0.01	0.06	0.06	0.10	0.16	0.13	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.05	0.14	0.02	0.02
C3'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.04	0.00	0.03	0.01	0.04	0.10	0.08	0.14	0.10	0.08	0.02	0.01	0.01	0.00	0.06	0.05	0.24	0.10	0.10
C4	0.01	0.00	0.06	0.04	0.00	0.01	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.08	0.06	0.02	0.13	0.01	0.17	0.29	0.29
C4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.02	0.06	0.01	0.05	0.03	0.05	0.02	0.03	0.02	0.00	0.01	0.04	0.04	0.01	0.02
C5	0.00	0.00	0.03	0.03	0.00	0.03	0.00	0.08	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.04	0.02	0.17	0.01	0.24	0.36	0.34
C5'	0.02	0.03	0.01	0.01	0.05	0.00	0.08	0.00	0.08	0.10	0.05	0.01	0.02	0.11	0.05	0.03	0.04	0.01	0.01	0.10	0.02	0.01	0.01
C6	0.01	0.00	0.06	0.04	0.00	0.02	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.08	0.06	0.03	0.17	0.00	0.25	0.38	0.36
C8	0.01	0.00	0.06	0.10	0.00	0.06	0.00	0.10	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.11	0.02	0.20	0.01	0.25	0.33	0.32
N1	0.01	0.00	0.10	0.08	0.00	0.01	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.13	0.12	0.03	0.14	0.00	0.20	0.34	0.33
N2	0.02	0.00	0.16	0.14	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.20	0.20	0.04	0.08	0.01	0.10	0.27	0.27
N3	0.01	0.00	0.13	0.10	0.00	0.03	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.15	0.14	0.04	0.09	0.01	0.12	0.25	0.26
N7	0.00	0.00	0.04	0.08	0.00	0.05	0.00	0.11	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.08	0.01	0.20	0.01	0.30	0.40	0.36
N9	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.02	0.01	0.13	0.01	0.16	0.25	0.26
O2'	0.01	0.16	0.00	0.01	0.08	0.03	0.05	0.03	0.08	0.04	0.13	0.20	0.15	0.02	0.02	0.00	0.02	0.02	0.03	0.07	0.17	0.03	0.03
O3'	0.01	0.15	0.01	0.01	0.06	0.02	0.04	0.04	0.06	0.11	0.12	0.20	0.14	0.08	0.02	0.02	0.00	0.01	0.12	0.06	0.43	0.22	0.24
O4'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.02	0.03	0.04	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.07	0.03	0.14	0.15	0.19
O5'	0.07	0.11	0.02	0.06	0.13	0.01	0.17	0.01	0.17	0.20	0.14	0.08	0.09	0.20	0.13	0.03	0.12	0.07	0.00	0.19	0.01	0.01	0.01
O6	0.01	0.00	0.05	0.05	0.01	0.04	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.06	0.03	0.19	0.00	0.30	0.43	0.39
OP1	0.07	0.14	0.14	0.24	0.17	0.04	0.24	0.02	0.25	0.25	0.20	0.10	0.12	0.30	0.16	0.17	0.43	0.14	0.01	0.30	0.00	0.01	0.01
OP2	0.15	0.29	0.02	0.10	0.29	0.01	0.36	0.01	0.38	0.33	0.34	0.27	0.25	0.40	0.25	0.03	0.22	0.15	0.01	0.43	0.01	0.00	0.01
P	0.17	0.29	0.02	0.10	0.29	0.02	0.34	0.01	0.36	0.32	0.33	0.27	0.26	0.36	0.26	0.03	0.24	0.19	0.01	0.39	0.01	0.01	0.00