Doublet Group distance statistics: 49063

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 1, 1, 2, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.005, 0.010, 0.015, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.010 std_dev=0.005
N3	A	0, 0.008, 0.017, 0.025, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.017 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.010, 0.019, 0.028, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.019 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.012, 0.022, 0.032, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.022 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.013, 0.024, 0.035, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.024 std_dev=0.011
O2	A	0, 0.010, 0.025, 0.040, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.025 std_dev=0.015
N1	A	0, 0.014, 0.030, 0.046, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.030 std_dev=0.016
C1'	A	0, 0.026, 0.044, 0.063, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.044 std_dev=0.018
N4	A	0, 0.017, 0.036, 0.055, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.036 std_dev=0.019
C2'	A	0, 0.056, 0.135, 0.215, 0.250 max_d=0.250 avg_d=0.135 std_dev=0.079
O4'	A	0, 0.132, 0.229, 0.326, 0.324 max_d=0.324 avg_d=0.229 std_dev=0.097
O2'	A	0, 0.144, 0.246, 0.349, 0.317 max_d=0.317 avg_d=0.246 std_dev=0.102
C3'	A	0, 0.127, 0.266, 0.405, 0.471 max_d=0.471 avg_d=0.266 std_dev=0.139
O3'	A	0, 0.062, 0.223, 0.384, 0.488 max_d=0.488 avg_d=0.223 std_dev=0.161
C4'	A	0, 0.307, 0.522, 0.736, 0.657 max_d=0.657 avg_d=0.522 std_dev=0.214
N2	B	0, 0.278, 0.507, 0.736, 0.709 max_d=0.709 avg_d=0.507 std_dev=0.229
N1	B	0, 0.354, 0.618, 0.883, 0.849 max_d=0.849 avg_d=0.618 std_dev=0.265
C2	B	0, 0.375, 0.672, 0.970, 0.918 max_d=0.918 avg_d=0.672 std_dev=0.298
O6	B	0, 0.507, 0.866, 1.225, 1.091 max_d=1.091 avg_d=0.866 std_dev=0.359
C6	B	0, 0.512, 0.878, 1.244, 1.146 max_d=1.146 avg_d=0.878 std_dev=0.366
N3	B	0, 0.554, 0.987, 1.421, 1.321 max_d=1.321 avg_d=0.987 std_dev=0.434
C5'	A	0, 0.685, 1.161, 1.637, 1.424 max_d=1.424 avg_d=1.161 std_dev=0.476
C5	B	0, 0.694, 1.188, 1.682, 1.540 max_d=1.540 avg_d=1.188 std_dev=0.494
C4	B	0, 0.707, 1.221, 1.736, 1.594 max_d=1.594 avg_d=1.221 std_dev=0.515
O5'	A	0, 0.860, 1.455, 2.051, 1.759 max_d=1.759 avg_d=1.455 std_dev=0.596
N7	B	0, 0.885, 1.516, 2.147, 1.946 max_d=1.946 avg_d=1.516 std_dev=0.631
N9	B	0, 0.901, 1.554, 2.207, 2.009 max_d=2.009 avg_d=1.554 std_dev=0.653
P	A	0, 0.938, 1.593, 2.247, 1.965 max_d=1.965 avg_d=1.593 std_dev=0.655
C8	B	0, 1.004, 1.719, 2.434, 2.214 max_d=2.214 avg_d=1.719 std_dev=0.715
C1'	B	0, 0.999, 1.746, 2.492, 2.264 max_d=2.264 avg_d=1.746 std_dev=0.746
OP1	A	0, 1.081, 1.847, 2.613, 2.310 max_d=2.310 avg_d=1.847 std_dev=0.766
OP2	A	0, 1.104, 1.873, 2.641, 2.326 max_d=2.326 avg_d=1.873 std_dev=0.769
O4'	B	0, 1.057, 1.842, 2.627, 2.394 max_d=2.394 avg_d=1.842 std_dev=0.785
OP2	B	0, 1.139, 1.968, 2.797, 2.528 max_d=2.528 avg_d=1.968 std_dev=0.829
P	B	0, 1.150, 1.995, 2.840, 2.569 max_d=2.569 avg_d=1.995 std_dev=0.845
C2'	B	0, 1.097, 1.946, 2.796, 2.548 max_d=2.548 avg_d=1.946 std_dev=0.850
C5'	B	0, 1.189, 2.063, 2.937, 2.655 max_d=2.655 avg_d=2.063 std_dev=0.874
O5'	B	0, 1.177, 2.058, 2.939, 2.664 max_d=2.664 avg_d=2.058 std_dev=0.881
C4'	B	0, 1.200, 2.094, 2.987, 2.715 max_d=2.715 avg_d=2.094 std_dev=0.894
C3'	B	0, 1.239, 2.177, 3.115, 2.834 max_d=2.834 avg_d=2.177 std_dev=0.938
O2'	B	0, 1.195, 2.135, 3.075, 2.815 max_d=2.815 avg_d=2.135 std_dev=0.940
O3'	B	0, 1.480, 2.595, 3.711, 3.378 max_d=3.378 avg_d=2.595 std_dev=1.115
OP1	B	0, 1.448, 2.602, 3.756, 3.504 max_d=3.504 avg_d=2.602 std_dev=1.154

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.05	0.02	0.20	0.08
C2	0.01	0.00	0.03	0.04	0.01	0.02	0.01	0.06	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.05	0.02	0.12	0.03	0.16	0.05
C2'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.02	0.06	0.00	0.01	0.00	0.03	0.04	0.17	0.06
C3'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.04	0.00	0.03	0.01	0.03	0.02	0.04	0.04	0.06	0.01	0.00	0.01	0.02	0.07	0.16	0.06
C4	0.01	0.01	0.02	0.04	0.00	0.05	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.05	0.03	0.18	0.03	0.10	0.04
C4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.05	0.00	0.06	0.00	0.05	0.03	0.03	0.05	0.02	0.03	0.01	0.00	0.01	0.05	0.14	0.05
C5	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.06	0.00	0.13	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.04	0.03	0.19	0.03	0.10	0.05
C5'	0.01	0.06	0.00	0.01	0.11	0.00	0.13	0.00	0.11	0.06	0.08	0.12	0.03	0.03	0.01	0.00	0.00	0.08	0.04	0.01
C6	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.05	0.00	0.11	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.16	0.02	0.15	0.03
N1	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.11	0.02	0.18	0.05
N3	0.01	0.00	0.03	0.04	0.00	0.03	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.05	0.03	0.15	0.03	0.13	0.03
N4	0.01	0.01	0.02	0.04	0.00	0.05	0.02	0.12	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.05	0.03	0.19	0.05	0.09	0.07
O2	0.02	0.00	0.06	0.06	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.05	0.07	0.01	0.09	0.03	0.18	0.07
O2'	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.03	0.02	0.03	0.02	0.01	0.02	0.02	0.05	0.00	0.02	0.01	0.01	0.05	0.17	0.06
O3'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.05	0.01	0.04	0.01	0.03	0.02	0.05	0.05	0.07	0.02	0.00	0.00	0.04	0.11	0.13	0.06
O4'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.03	0.00	0.03	0.00	0.03	0.02	0.03	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.04	0.22	0.11
O5'	0.05	0.12	0.03	0.02	0.18	0.01	0.19	0.00	0.16	0.11	0.15	0.19	0.09	0.01	0.04	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.02	0.03	0.04	0.07	0.03	0.05	0.03	0.08	0.02	0.02	0.03	0.05	0.03	0.05	0.11	0.04	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.20	0.16	0.17	0.16	0.10	0.14	0.10	0.04	0.15	0.18	0.13	0.09	0.18	0.17	0.13	0.22	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.08	0.05	0.06	0.06	0.04	0.05	0.05	0.01	0.03	0.05	0.03	0.07	0.07	0.06	0.06	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.04	0.04	0.03	0.05	0.03	0.04	0.03	0.07	0.03	0.03	0.02	0.08	0.05	0.03	0.04	0.03	0.04	0.04	0.18	0.06	0.10	0.21	0.09
C2	0.04	0.05	0.06	0.04	0.03	0.04	0.03	0.03	0.04	0.03	0.04	0.08	0.05	0.03	0.03	0.10	0.06	0.03	0.15	0.06	0.13	0.24	0.13
C2'	0.12	0.11	0.11	0.12	0.10	0.12	0.08	0.14	0.06	0.09	0.06	0.15	0.13	0.08	0.11	0.07	0.12	0.12	0.24	0.07	0.12	0.17	0.07
C3'	0.13	0.11	0.12	0.13	0.11	0.13	0.07	0.14	0.05	0.09	0.06	0.15	0.13	0.07	0.11	0.08	0.11	0.13	0.25	0.06	0.12	0.17	0.08
C4	0.07	0.07	0.09	0.08	0.07	0.06	0.07	0.04	0.09	0.07	0.08	0.08	0.07	0.08	0.06	0.12	0.10	0.06	0.14	0.11	0.20	0.28	0.17
C4'	0.07	0.06	0.06	0.08	0.05	0.07	0.03	0.09	0.03	0.03	0.02	0.09	0.07	0.03	0.05	0.04	0.07	0.07	0.19	0.05	0.12	0.21	0.10
C5	0.04	0.05	0.06	0.06	0.04	0.04	0.05	0.04	0.07	0.05	0.06	0.08	0.05	0.06	0.04	0.09	0.08	0.04	0.15	0.10	0.17	0.27	0.16
C5'	0.06	0.05	0.05	0.06	0.04	0.06	0.03	0.08	0.05	0.03	0.03	0.08	0.06	0.04	0.04	0.05	0.07	0.06	0.18	0.08	0.10	0.21	0.09
C6	0.03	0.04	0.03	0.04	0.02	0.03	0.03	0.04	0.05	0.03	0.03	0.07	0.03	0.04	0.02	0.06	0.05	0.03	0.16	0.08	0.14	0.25	0.13
N1	0.02	0.03	0.03	0.03	0.01	0.03	0.02	0.05	0.04	0.02	0.02	0.07	0.03	0.03	0.01	0.07	0.04	0.02	0.16	0.06	0.11	0.23	0.12
N3	0.07	0.08	0.09	0.08	0.06	0.06	0.06	0.04	0.07	0.06	0.08	0.09	0.07	0.06	0.06	0.12	0.10	0.06	0.14	0.09	0.17	0.27	0.16
N4	0.09	0.09	0.13	0.12	0.10	0.09	0.11	0.07	0.12	0.11	0.10	0.09	0.09	0.12	0.10	0.14	0.14	0.08	0.12	0.14	0.25	0.31	0.21
O2	0.04	0.05	0.05	0.03	0.02	0.03	0.01	0.03	0.03	0.01	0.02	0.08	0.04	0.02	0.02	0.10	0.04	0.03	0.16	0.07	0.10	0.22	0.11
O2'	0.12	0.10	0.13	0.14	0.10	0.12	0.07	0.13	0.06	0.09	0.06	0.14	0.12	0.07	0.11	0.09	0.13	0.11	0.23	0.06	0.14	0.17	0.08
O3'	0.18	0.14	0.18	0.18	0.15	0.18	0.10	0.19	0.07	0.13	0.08	0.18	0.18	0.10	0.16	0.15	0.17	0.18	0.29	0.06	0.16	0.16	0.10
O4'	0.03	0.02	0.03	0.04	0.02	0.04	0.02	0.06	0.03	0.02	0.02	0.05	0.03	0.02	0.02	0.06	0.05	0.03	0.16	0.06	0.10	0.22	0.11
O5'	0.09	0.10	0.06	0.07	0.10	0.09	0.11	0.11	0.11	0.11	0.10	0.12	0.11	0.11	0.10	0.03	0.05	0.10	0.21	0.14	0.05	0.18	0.04
OP1	0.05	0.05	0.05	0.07	0.03	0.05	0.03	0.06	0.05	0.03	0.04	0.09	0.06	0.04	0.03	0.05	0.09	0.05	0.17	0.08	0.15	0.27	0.15
OP2	0.19	0.19	0.22	0.23	0.17	0.19	0.16	0.18	0.17	0.16	0.18	0.20	0.18	0.16	0.17	0.23	0.26	0.17	0.24	0.17	0.29	0.36	0.28
P	0.09	0.08	0.11	0.13	0.07	0.10	0.06	0.10	0.06	0.06	0.07	0.11	0.09	0.06	0.07	0.13	0.15	0.08	0.19	0.08	0.18	0.28	0.18

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.10	0.01	0.10	0.25	0.11
C2	0.02	0.00	0.03	0.03	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.07	0.03	0.02	0.15	0.01	0.10	0.24	0.11
C2'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.04	0.02	0.05	0.04	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.09	0.25	0.11
C3'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.04	0.01	0.06	0.02	0.06	0.09	0.04	0.04	0.03	0.09	0.05	0.01	0.01	0.01	0.05	0.07	0.11	0.20	0.09
C4	0.01	0.01	0.02	0.04	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.04	0.01	0.17	0.01	0.11	0.25	0.12
C4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.01	0.04	0.05	0.03	0.03	0.02	0.05	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.05	0.14	0.16	0.06
C5	0.01	0.01	0.02	0.06	0.00	0.04	0.00	0.07	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.08	0.01	0.23	0.01	0.13	0.22	0.12
C5'	0.01	0.04	0.02	0.02	0.05	0.01	0.07	0.00	0.08	0.09	0.06	0.03	0.03	0.09	0.05	0.03	0.02	0.01	0.01	0.09	0.16	0.07	0.01
C6	0.01	0.01	0.02	0.06	0.00	0.04	0.00	0.08	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.07	0.01	0.23	0.00	0.13	0.20	0.12
C8	0.01	0.01	0.04	0.09	0.00	0.05	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.11	0.02	0.27	0.01	0.15	0.24	0.14
N1	0.02	0.00	0.02	0.04	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.04	0.02	0.19	0.01	0.11	0.22	0.11
N2	0.02	0.00	0.05	0.04	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.06	0.03	0.12	0.02	0.09	0.24	0.11
N3	0.02	0.00	0.04	0.03	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.03	0.02	0.13	0.01	0.09	0.25	0.12
N7	0.01	0.01	0.04	0.09	0.00	0.05	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.11	0.02	0.28	0.01	0.16	0.21	0.14
N9	0.01	0.01	0.01	0.05	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.05	0.01	0.18	0.01	0.12	0.25	0.12
O2'	0.01	0.07	0.00	0.01	0.04	0.03	0.03	0.03	0.04	0.02	0.06	0.10	0.07	0.02	0.02	0.00	0.02	0.03	0.03	0.04	0.14	0.22	0.08
O3'	0.02	0.03	0.01	0.01	0.04	0.02	0.08	0.02	0.07	0.11	0.04	0.06	0.03	0.11	0.05	0.02	0.00	0.02	0.12	0.09	0.17	0.16	0.07
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.01	0.03	0.02	0.00	0.10	0.02	0.10	0.22	0.10
O5'	0.10	0.15	0.02	0.05	0.17	0.01	0.23	0.01	0.23	0.27	0.19	0.12	0.13	0.28	0.18	0.03	0.12	0.10	0.00	0.25	0.02	0.01	0.01
O6	0.01	0.01	0.03	0.07	0.01	0.05	0.01	0.09	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.04	0.09	0.02	0.25	0.00	0.15	0.18	0.13
OP1	0.10	0.10	0.09	0.11	0.11	0.14	0.13	0.16	0.13	0.15	0.11	0.09	0.09	0.16	0.12	0.14	0.17	0.10	0.02	0.15	0.00	0.02	0.01
OP2	0.25	0.24	0.25	0.20	0.25	0.16	0.22	0.07	0.20	0.24	0.22	0.24	0.25	0.21	0.25	0.22	0.16	0.22	0.01	0.18	0.02	0.00	0.01
P	0.11	0.11	0.11	0.09	0.12	0.06	0.12	0.01	0.12	0.14	0.11	0.11	0.12	0.14	0.12	0.08	0.07	0.10	0.01	0.13	0.01	0.01	0.00