Doublet Group distance statistics: 49072

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 3, 5, 3, 4, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.005, 0.010, 0.015, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.010 std_dev=0.005
C6	A	0, 0.009, 0.018, 0.026, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.018 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.012, 0.022, 0.031, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.022 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.011, 0.021, 0.031, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.021 std_dev=0.010
N3	A	0, 0.007, 0.017, 0.027, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.017 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.010, 0.021, 0.032, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.021 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.013, 0.029, 0.046, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.029 std_dev=0.016
O2	A	0, 0.013, 0.042, 0.072, 0.136 max_d=0.136 avg_d=0.042 std_dev=0.030
O4	A	0, 0.036, 0.069, 0.102, 0.133 max_d=0.133 avg_d=0.069 std_dev=0.033
C2'	A	0, 0.087, 0.230, 0.373, 0.709 max_d=0.709 avg_d=0.230 std_dev=0.143
O3'	A	0, 0.184, 0.354, 0.524, 0.743 max_d=0.743 avg_d=0.354 std_dev=0.170
C3'	A	0, 0.194, 0.366, 0.538, 0.730 max_d=0.730 avg_d=0.366 std_dev=0.172
C4'	A	0, 0.241, 0.445, 0.649, 0.868 max_d=0.868 avg_d=0.445 std_dev=0.204
O2'	A	0, 0.099, 0.309, 0.518, 1.069 max_d=1.069 avg_d=0.309 std_dev=0.209
O2	B	0, 0.087, 0.297, 0.507, 0.929 max_d=0.929 avg_d=0.297 std_dev=0.210
O4'	A	0, 0.081, 0.316, 0.552, 0.929 max_d=0.929 avg_d=0.316 std_dev=0.235
O5'	A	0, 0.275, 0.516, 0.757, 1.056 max_d=1.056 avg_d=0.516 std_dev=0.241
O2'	B	0, 0.199, 0.447, 0.695, 1.204 max_d=1.204 avg_d=0.447 std_dev=0.248
O3'	B	0, 0.112, 0.378, 0.644, 1.139 max_d=1.139 avg_d=0.378 std_dev=0.266
C2	B	0, 0.057, 0.333, 0.609, 1.183 max_d=1.183 avg_d=0.333 std_dev=0.276
N3	B	0, 0.057, 0.364, 0.671, 1.265 max_d=1.265 avg_d=0.364 std_dev=0.307
C2'	B	0, 0.174, 0.481, 0.789, 1.396 max_d=1.396 avg_d=0.481 std_dev=0.307
O4'	B	0, 0.196, 0.512, 0.828, 1.474 max_d=1.474 avg_d=0.512 std_dev=0.316
C3'	B	0, 0.157, 0.477, 0.797, 1.352 max_d=1.352 avg_d=0.477 std_dev=0.320
C1'	B	0, 0.102, 0.425, 0.749, 1.458 max_d=1.458 avg_d=0.425 std_dev=0.323
N1	B	0, 0.060, 0.405, 0.749, 1.500 max_d=1.500 avg_d=0.405 std_dev=0.345
C4'	B	0, 0.175, 0.521, 0.867, 1.464 max_d=1.464 avg_d=0.521 std_dev=0.346
C5'	A	0, 0.260, 0.613, 0.966, 1.509 max_d=1.509 avg_d=0.613 std_dev=0.353
P	A	0, 0.222, 0.604, 0.985, 1.701 max_d=1.701 avg_d=0.604 std_dev=0.382
OP2	A	0, 0.259, 0.646, 1.033, 1.852 max_d=1.852 avg_d=0.646 std_dev=0.387
C4	B	0, 0.049, 0.446, 0.844, 1.611 max_d=1.611 avg_d=0.446 std_dev=0.398
C5'	B	0, 0.293, 0.702, 1.112, 1.688 max_d=1.688 avg_d=0.702 std_dev=0.410
O4	B	0, 0.093, 0.522, 0.951, 1.708 max_d=1.708 avg_d=0.522 std_dev=0.429
C6	B	0, 0.046, 0.483, 0.921, 1.843 max_d=1.843 avg_d=0.483 std_dev=0.437
OP1	B	0, 0.302, 0.747, 1.191, 1.824 max_d=1.824 avg_d=0.747 std_dev=0.445
O5'	B	0, 0.194, 0.639, 1.084, 1.780 max_d=1.780 avg_d=0.639 std_dev=0.445
P	B	0, 0.251, 0.715, 1.179, 1.852 max_d=1.852 avg_d=0.715 std_dev=0.464
C5	B	0, 0.036, 0.505, 0.973, 1.924 max_d=1.924 avg_d=0.505 std_dev=0.469
OP1	A	0, 0.152, 0.644, 1.135, 2.063 max_d=2.063 avg_d=0.644 std_dev=0.492
OP2	B	0, -0.071, 0.905, 1.881, 4.625 max_d=4.625 avg_d=0.905 std_dev=0.976

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.02	0.04	0.02	0.02	0.10	0.01	0.02	0.04	0.06	0.03	0.09	0.04	0.01	0.07	0.14	0.14	0.08
C2	0.04	0.00	0.09	0.07	0.01	0.04	0.01	0.20	0.01	0.01	0.01	0.01	0.16	0.15	0.01	0.06	0.10	0.12	0.12	0.08
C2'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.06	0.02	0.05	0.10	0.06	0.04	0.08	0.15	0.00	0.04	0.07	0.03	0.12	0.21	0.18	0.13
C3'	0.02	0.07	0.00	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.06	0.03	0.06	0.12	0.01	0.01	0.05	0.01	0.12	0.27	0.20	0.17
C4	0.04	0.01	0.06	0.05	0.00	0.07	0.01	0.29	0.01	0.02	0.01	0.01	0.11	0.12	0.01	0.04	0.15	0.11	0.14	0.10
C4'	0.02	0.04	0.02	0.00	0.07	0.00	0.09	0.00	0.09	0.04	0.05	0.06	0.01	0.02	0.07	0.01	0.02	0.15	0.08	0.04
C5	0.02	0.01	0.05	0.06	0.01	0.09	0.00	0.31	0.00	0.01	0.01	0.02	0.08	0.09	0.01	0.09	0.16	0.13	0.14	0.11
C5'	0.10	0.20	0.10	0.01	0.29	0.00	0.31	0.00	0.28	0.21	0.24	0.15	0.08	0.07	0.30	0.01	0.01	0.14	0.03	0.02
C6	0.01	0.01	0.06	0.06	0.01	0.09	0.00	0.28	0.00	0.01	0.01	0.02	0.08	0.08	0.01	0.11	0.15	0.13	0.12	0.11
N1	0.02	0.01	0.04	0.03	0.02	0.04	0.01	0.21	0.01	0.00	0.01	0.02	0.05	0.10	0.02	0.02	0.11	0.13	0.12	0.08
N3	0.04	0.01	0.08	0.06	0.01	0.05	0.01	0.24	0.01	0.01	0.00	0.01	0.15	0.15	0.01	0.04	0.12	0.11	0.12	0.08
O2	0.06	0.01	0.15	0.12	0.01	0.06	0.02	0.15	0.02	0.02	0.01	0.00	0.25	0.21	0.01	0.12	0.10	0.13	0.13	0.09
O2'	0.03	0.16	0.00	0.01	0.11	0.01	0.08	0.08	0.08	0.05	0.15	0.25	0.00	0.04	0.12	0.03	0.15	0.25	0.23	0.17
O3'	0.09	0.15	0.04	0.01	0.12	0.02	0.09	0.07	0.08	0.10	0.15	0.21	0.04	0.00	0.12	0.11	0.11	0.35	0.24	0.19
O4	0.04	0.01	0.07	0.05	0.01	0.07	0.01	0.30	0.01	0.02	0.01	0.01	0.12	0.12	0.00	0.05	0.15	0.11	0.15	0.11
O4'	0.01	0.06	0.03	0.01	0.04	0.01	0.09	0.01	0.11	0.02	0.04	0.12	0.03	0.11	0.05	0.00	0.19	0.16	0.27	0.21
O5'	0.07	0.10	0.12	0.12	0.15	0.02	0.16	0.01	0.15	0.11	0.12	0.10	0.15	0.11	0.15	0.19	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.14	0.12	0.21	0.27	0.11	0.15	0.13	0.14	0.13	0.13	0.11	0.13	0.25	0.35	0.11	0.16	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.14	0.12	0.18	0.20	0.14	0.08	0.14	0.03	0.12	0.12	0.12	0.13	0.23	0.24	0.15	0.27	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.08	0.08	0.13	0.17	0.10	0.04	0.11	0.02	0.11	0.08	0.08	0.09	0.17	0.19	0.11	0.21	0.01	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.24	0.15	0.22	0.21	0.20	0.23	0.24	0.23	0.26	0.22	0.16	0.11	0.23	0.20	0.20	0.26	0.24	0.16	0.49	0.22
C2	0.16	0.11	0.14	0.15	0.16	0.18	0.16	0.17	0.16	0.14	0.14	0.09	0.17	0.13	0.18	0.23	0.17	0.15	0.31	0.16
C2'	0.33	0.15	0.34	0.33	0.19	0.33	0.30	0.35	0.34	0.29	0.13	0.10	0.34	0.30	0.16	0.34	0.36	0.19	0.66	0.34
C3'	0.30	0.13	0.31	0.30	0.19	0.30	0.29	0.32	0.33	0.26	0.11	0.11	0.31	0.28	0.16	0.30	0.34	0.15	0.72	0.33
C4	0.08	0.13	0.09	0.10	0.14	0.14	0.10	0.13	0.08	0.08	0.16	0.16	0.14	0.07	0.16	0.19	0.11	0.18	0.16	0.12
C4'	0.18	0.09	0.16	0.17	0.14	0.17	0.18	0.16	0.19	0.14	0.12	0.14	0.16	0.19	0.15	0.18	0.20	0.15	0.53	0.17
C5	0.08	0.13	0.08	0.10	0.13	0.14	0.09	0.13	0.08	0.08	0.16	0.17	0.14	0.10	0.15	0.17	0.11	0.17	0.19	0.12
C5'	0.23	0.19	0.19	0.22	0.19	0.21	0.14	0.19	0.14	0.15	0.22	0.27	0.21	0.30	0.23	0.23	0.22	0.23	0.49	0.18
C6	0.14	0.11	0.12	0.15	0.13	0.18	0.12	0.16	0.13	0.11	0.14	0.14	0.15	0.16	0.14	0.20	0.16	0.15	0.30	0.15
N1	0.18	0.11	0.16	0.17	0.15	0.19	0.17	0.18	0.18	0.15	0.14	0.10	0.18	0.16	0.16	0.23	0.19	0.15	0.36	0.17
N3	0.12	0.11	0.10	0.11	0.14	0.16	0.12	0.15	0.11	0.10	0.15	0.12	0.14	0.09	0.17	0.22	0.13	0.16	0.22	0.13
O2	0.18	0.13	0.15	0.15	0.18	0.19	0.19	0.18	0.19	0.16	0.16	0.09	0.18	0.13	0.21	0.24	0.18	0.15	0.35	0.16
O2'	0.47	0.37	0.45	0.42	0.42	0.45	0.51	0.50	0.54	0.49	0.35	0.24	0.41	0.36	0.35	0.47	0.50	0.28	0.78	0.49
O3'	0.35	0.24	0.34	0.31	0.34	0.33	0.44	0.37	0.44	0.36	0.24	0.14	0.31	0.27	0.32	0.35	0.40	0.18	0.80	0.39
O4	0.10	0.16	0.11	0.11	0.16	0.13	0.12	0.13	0.10	0.11	0.18	0.19	0.16	0.09	0.18	0.18	0.11	0.20	0.13	0.13
O4'	0.13	0.10	0.20	0.22	0.15	0.19	0.18	0.16	0.18	0.12	0.14	0.13	0.22	0.23	0.16	0.13	0.14	0.20	0.38	0.15
O5'	0.18	0.20	0.15	0.15	0.17	0.14	0.14	0.15	0.15	0.15	0.22	0.27	0.16	0.19	0.19	0.16	0.21	0.19	0.50	0.18
OP1	0.19	0.32	0.14	0.13	0.35	0.12	0.28	0.14	0.24	0.24	0.37	0.35	0.15	0.15	0.38	0.14	0.19	0.29	0.53	0.19
OP2	0.17	0.34	0.13	0.13	0.37	0.11	0.31	0.11	0.27	0.26	0.38	0.35	0.16	0.16	0.38	0.14	0.15	0.20	0.49	0.18
P	0.15	0.27	0.11	0.10	0.27	0.09	0.22	0.10	0.19	0.19	0.30	0.31	0.13	0.14	0.29	0.11	0.16	0.20	0.50	0.17

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.06	0.02	0.01	0.02	0.04	0.02	0.08	0.03	0.00	0.05	0.15	0.11	0.05
C2	0.02	0.00	0.04	0.02	0.01	0.05	0.01	0.14	0.01	0.01	0.00	0.01	0.09	0.10	0.02	0.07	0.09	0.32	0.23	0.10
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.03	0.02	0.06	0.06	0.07	0.02	0.03	0.07	0.01	0.03	0.04	0.02	0.10	0.12	0.22	0.10
C3'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.03	0.00	0.05	0.02	0.05	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01	0.03	0.01	0.09	0.21	0.11	0.09
C4	0.02	0.01	0.03	0.03	0.00	0.06	0.01	0.18	0.01	0.01	0.01	0.02	0.08	0.08	0.01	0.04	0.12	0.49	0.37	0.14
C4'	0.01	0.05	0.02	0.00	0.06	0.00	0.05	0.01	0.04	0.03	0.05	0.07	0.03	0.02	0.06	0.01	0.02	0.14	0.13	0.02
C5	0.02	0.01	0.06	0.05	0.01	0.05	0.00	0.18	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.07	0.01	0.06	0.12	0.51	0.38	0.14
C5'	0.06	0.14	0.06	0.02	0.18	0.01	0.18	0.00	0.16	0.13	0.17	0.14	0.05	0.04	0.19	0.01	0.01	0.20	0.22	0.01
C6	0.02	0.01	0.07	0.05	0.01	0.04	0.01	0.16	0.00	0.00	0.01	0.02	0.10	0.07	0.02	0.07	0.11	0.43	0.30	0.12
N1	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.13	0.00	0.00	0.01	0.02	0.04	0.08	0.02	0.02	0.09	0.31	0.21	0.10
N3	0.02	0.00	0.03	0.01	0.01	0.05	0.01	0.17	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.10	0.02	0.06	0.11	0.40	0.31	0.12
O2	0.04	0.01	0.07	0.04	0.02	0.07	0.01	0.14	0.02	0.02	0.01	0.00	0.14	0.12	0.02	0.13	0.09	0.24	0.20	0.09
O2'	0.02	0.09	0.01	0.02	0.08	0.03	0.10	0.05	0.10	0.04	0.08	0.14	0.00	0.05	0.08	0.03	0.12	0.15	0.29	0.13
O3'	0.08	0.10	0.03	0.01	0.08	0.02	0.07	0.04	0.07	0.08	0.10	0.12	0.05	0.00	0.08	0.09	0.07	0.26	0.11	0.09
O4	0.03	0.02	0.04	0.03	0.01	0.06	0.01	0.19	0.02	0.02	0.02	0.02	0.08	0.08	0.00	0.04	0.12	0.52	0.41	0.14
O4'	0.00	0.07	0.02	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.07	0.02	0.06	0.13	0.03	0.09	0.04	0.00	0.13	0.15	0.18	0.14
O5'	0.05	0.09	0.10	0.09	0.12	0.02	0.12	0.01	0.11	0.09	0.11	0.09	0.12	0.07	0.12	0.13	0.00	0.03	0.01	0.01
OP1	0.15	0.32	0.12	0.21	0.49	0.14	0.51	0.20	0.43	0.31	0.40	0.24	0.15	0.26	0.52	0.15	0.03	0.00	0.01	0.01
OP2	0.11	0.23	0.22	0.11	0.37	0.13	0.38	0.22	0.30	0.21	0.31	0.20	0.29	0.11	0.41	0.18	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.05	0.10	0.10	0.09	0.14	0.02	0.14	0.01	0.12	0.10	0.12	0.09	0.13	0.09	0.14	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00