Doublet Group distance statistics: 49076

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 1, 0, 2, 0, 3, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.004, 0.010, 0.017, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.010 std_dev=0.006
C2	A	0, 0.005, 0.013, 0.022, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.013 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.005, 0.014, 0.023, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.014 std_dev=0.009
C6	A	0, 0.005, 0.017, 0.028, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.017 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.001, 0.013, 0.025, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.013 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.007, 0.019, 0.031, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.019 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.006, 0.021, 0.036, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.021 std_dev=0.015
O2	A	0, 0.006, 0.035, 0.064, 0.099 max_d=0.099 avg_d=0.035 std_dev=0.029
O4	A	0, 0.016, 0.045, 0.074, 0.094 max_d=0.094 avg_d=0.045 std_dev=0.029
O2'	A	0, 0.140, 0.344, 0.548, 0.598 max_d=0.598 avg_d=0.344 std_dev=0.204
C2'	A	0, 0.152, 0.360, 0.567, 0.617 max_d=0.617 avg_d=0.360 std_dev=0.207
O4'	A	0, 0.144, 0.360, 0.575, 0.681 max_d=0.681 avg_d=0.360 std_dev=0.215
O4'	B	0, 0.200, 0.452, 0.705, 0.784 max_d=0.784 avg_d=0.452 std_dev=0.252
C1'	B	0, 0.193, 0.450, 0.707, 0.785 max_d=0.785 avg_d=0.450 std_dev=0.257
N1	B	0, 0.170, 0.429, 0.688, 0.882 max_d=0.882 avg_d=0.429 std_dev=0.259
C4'	B	0, 0.250, 0.528, 0.806, 0.895 max_d=0.895 avg_d=0.528 std_dev=0.278
C4	B	0, 0.235, 0.530, 0.825, 1.022 max_d=1.022 avg_d=0.530 std_dev=0.295
C2'	B	0, 0.163, 0.458, 0.754, 0.895 max_d=0.895 avg_d=0.458 std_dev=0.296
O2'	B	0, 0.233, 0.533, 0.833, 0.909 max_d=0.909 avg_d=0.533 std_dev=0.300
C4'	A	0, 0.220, 0.530, 0.841, 0.936 max_d=0.936 avg_d=0.530 std_dev=0.311
C3'	B	0, 0.264, 0.576, 0.888, 0.951 max_d=0.951 avg_d=0.576 std_dev=0.312
C5'	B	0, 0.267, 0.582, 0.897, 1.036 max_d=1.036 avg_d=0.582 std_dev=0.315
C6	B	0, 0.327, 0.643, 0.959, 0.950 max_d=0.950 avg_d=0.643 std_dev=0.316
O4	B	0, 0.297, 0.618, 0.939, 1.062 max_d=1.062 avg_d=0.618 std_dev=0.321
C2	B	0, 0.234, 0.556, 0.878, 0.895 max_d=0.895 avg_d=0.556 std_dev=0.322
C3'	A	0, 0.241, 0.572, 0.902, 0.973 max_d=0.973 avg_d=0.572 std_dev=0.330
C5	B	0, 0.347, 0.688, 1.029, 1.038 max_d=1.038 avg_d=0.688 std_dev=0.341
N3	B	0, 0.226, 0.567, 0.909, 0.961 max_d=0.961 avg_d=0.567 std_dev=0.342
O3'	B	0, 0.308, 0.680, 1.052, 1.120 max_d=1.120 avg_d=0.680 std_dev=0.372
O5'	B	0, 0.335, 0.723, 1.112, 1.254 max_d=1.254 avg_d=0.723 std_dev=0.388
O5'	A	0, 0.294, 0.713, 1.132, 1.278 max_d=1.278 avg_d=0.713 std_dev=0.419
O3'	A	0, 0.345, 0.818, 1.292, 1.378 max_d=1.378 avg_d=0.818 std_dev=0.474
O2	B	0, 0.349, 0.829, 1.308, 1.487 max_d=1.487 avg_d=0.829 std_dev=0.479
P	A	0, 0.344, 0.854, 1.363, 1.351 max_d=1.351 avg_d=0.854 std_dev=0.509
P	B	0, 0.471, 0.985, 1.500, 1.663 max_d=1.663 avg_d=0.985 std_dev=0.514
C5'	A	0, 0.360, 0.882, 1.404, 1.613 max_d=1.613 avg_d=0.882 std_dev=0.522
OP2	B	0, 0.455, 1.007, 1.560, 1.913 max_d=1.913 avg_d=1.007 std_dev=0.552
OP1	B	0, 0.601, 1.272, 1.944, 2.021 max_d=2.021 avg_d=1.272 std_dev=0.672
OP1	A	0, 0.404, 1.101, 1.798, 1.837 max_d=1.837 avg_d=1.101 std_dev=0.697
OP2	A	0, 0.366, 1.105, 1.843, 1.910 max_d=1.910 avg_d=1.105 std_dev=0.739

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.03	0.01	0.02	0.05	0.01	0.02	0.03	0.01	0.05	0.25	0.37	0.10
C2	0.02	0.00	0.09	0.10	0.01	0.04	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.05	0.12	0.01	0.02	0.07	0.26	0.45	0.14
C2'	0.00	0.09	0.00	0.01	0.04	0.01	0.02	0.01	0.04	0.02	0.07	0.14	0.00	0.02	0.04	0.01	0.06	0.09	0.58	0.24
C3'	0.01	0.10	0.01	0.00	0.07	0.01	0.04	0.01	0.04	0.04	0.10	0.14	0.02	0.01	0.07	0.01	0.10	0.19	0.60	0.30
C4	0.02	0.01	0.04	0.07	0.00	0.05	0.01	0.08	0.01	0.02	0.00	0.02	0.03	0.09	0.00	0.04	0.11	0.29	0.41	0.16
C4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.05	0.00	0.06	0.01	0.05	0.02	0.04	0.06	0.04	0.01	0.05	0.00	0.01	0.09	0.25	0.08
C5	0.03	0.01	0.02	0.04	0.01	0.06	0.00	0.09	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.05	0.01	0.06	0.12	0.29	0.35	0.16
C5'	0.02	0.04	0.01	0.01	0.08	0.01	0.09	0.00	0.08	0.04	0.06	0.04	0.05	0.02	0.09	0.01	0.01	0.10	0.06	0.02
C6	0.03	0.01	0.04	0.04	0.01	0.05	0.01	0.08	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.04	0.01	0.06	0.11	0.28	0.35	0.14
N1	0.01	0.01	0.02	0.04	0.02	0.02	0.02	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01	0.07	0.26	0.41	0.13
N3	0.02	0.01	0.07	0.10	0.00	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.02	0.05	0.13	0.01	0.02	0.09	0.28	0.45	0.16
O2	0.05	0.00	0.14	0.14	0.02	0.06	0.02	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.10	0.17	0.02	0.05	0.05	0.25	0.47	0.15
O2'	0.01	0.05	0.00	0.02	0.03	0.04	0.03	0.05	0.03	0.01	0.05	0.10	0.00	0.02	0.03	0.03	0.01	0.11	0.51	0.18
O3'	0.02	0.12	0.02	0.01	0.09	0.01	0.05	0.02	0.04	0.04	0.13	0.17	0.02	0.00	0.10	0.01	0.13	0.34	0.69	0.37
O4	0.03	0.01	0.04	0.07	0.00	0.05	0.01	0.09	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.10	0.00	0.04	0.12	0.29	0.40	0.16
O4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.00	0.06	0.01	0.06	0.01	0.02	0.05	0.03	0.01	0.04	0.00	0.10	0.33	0.18	0.12
O5'	0.05	0.07	0.06	0.10	0.11	0.01	0.12	0.01	0.11	0.07	0.09	0.05	0.01	0.13	0.12	0.10	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.25	0.26	0.09	0.19	0.29	0.09	0.29	0.10	0.28	0.26	0.28	0.25	0.11	0.34	0.29	0.33	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.37	0.45	0.58	0.60	0.41	0.25	0.35	0.06	0.35	0.41	0.45	0.47	0.51	0.69	0.40	0.18	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.10	0.14	0.24	0.30	0.16	0.08	0.16	0.02	0.14	0.13	0.16	0.15	0.18	0.37	0.16	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.15	0.25	0.03	0.13	0.33	0.17	0.34	0.24	0.30	0.23	0.29	0.26	0.11	0.15	0.36	0.18	0.22	0.33	0.21	0.25
C2	0.11	0.23	0.03	0.15	0.38	0.17	0.42	0.23	0.35	0.22	0.29	0.28	0.10	0.21	0.42	0.14	0.18	0.28	0.16	0.21
C2'	0.14	0.26	0.12	0.21	0.32	0.21	0.28	0.26	0.23	0.21	0.31	0.29	0.19	0.23	0.35	0.18	0.24	0.33	0.22	0.27
C3'	0.14	0.28	0.12	0.22	0.29	0.22	0.21	0.28	0.18	0.19	0.32	0.34	0.17	0.23	0.32	0.18	0.27	0.33	0.24	0.29
C4	0.08	0.21	0.06	0.16	0.38	0.17	0.46	0.20	0.39	0.21	0.27	0.36	0.11	0.24	0.42	0.10	0.16	0.23	0.10	0.15
C4'	0.15	0.27	0.02	0.11	0.27	0.16	0.21	0.24	0.18	0.20	0.29	0.32	0.11	0.07	0.29	0.17	0.26	0.35	0.24	0.28
C5	0.09	0.21	0.03	0.16	0.35	0.18	0.40	0.22	0.36	0.22	0.26	0.29	0.09	0.23	0.37	0.13	0.17	0.24	0.14	0.18
C5'	0.14	0.27	0.04	0.09	0.21	0.15	0.12	0.26	0.10	0.16	0.26	0.35	0.14	0.04	0.23	0.14	0.29	0.35	0.26	0.30
C6	0.13	0.22	0.03	0.16	0.33	0.19	0.36	0.25	0.32	0.22	0.27	0.25	0.09	0.21	0.35	0.17	0.21	0.29	0.19	0.23
N1	0.13	0.23	0.03	0.15	0.35	0.18	0.37	0.25	0.32	0.22	0.28	0.26	0.09	0.20	0.37	0.17	0.21	0.30	0.19	0.24
N3	0.09	0.22	0.05	0.16	0.39	0.17	0.45	0.21	0.38	0.21	0.28	0.33	0.11	0.24	0.44	0.11	0.16	0.25	0.12	0.17
O2	0.11	0.23	0.04	0.16	0.39	0.17	0.42	0.24	0.35	0.22	0.30	0.28	0.10	0.21	0.43	0.14	0.19	0.30	0.17	0.22
O2'	0.14	0.27	0.09	0.16	0.33	0.18	0.29	0.24	0.24	0.21	0.32	0.30	0.18	0.19	0.36	0.18	0.23	0.33	0.21	0.25
O3'	0.14	0.31	0.15	0.24	0.28	0.23	0.18	0.29	0.14	0.19	0.34	0.39	0.21	0.25	0.32	0.18	0.29	0.32	0.25	0.29
O4	0.10	0.23	0.09	0.17	0.41	0.18	0.51	0.18	0.42	0.21	0.28	0.44	0.14	0.25	0.45	0.10	0.16	0.20	0.09	0.14
O4'	0.19	0.27	0.09	0.11	0.32	0.17	0.31	0.24	0.28	0.25	0.30	0.28	0.13	0.11	0.34	0.21	0.24	0.35	0.23	0.27
O5'	0.14	0.24	0.03	0.11	0.19	0.12	0.11	0.21	0.10	0.16	0.24	0.32	0.07	0.01	0.20	0.12	0.25	0.28	0.22	0.25
OP1	0.11	0.13	0.13	0.03	0.09	0.34	0.09	0.37	0.09	0.09	0.11	0.19	0.30	0.02	0.09	0.29	0.11	0.34	0.14	0.19
OP2	0.05	0.07	0.06	0.11	0.07	0.11	0.12	0.20	0.12	0.06	0.06	0.14	0.09	0.01	0.07	0.03	0.16	0.51	0.28	0.29
P	0.06	0.11	0.03	0.01	0.07	0.13	0.05	0.13	0.05	0.05	0.10	0.18	0.09	0.01	0.07	0.11	0.06	0.28	0.11	0.12

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.04	0.01	0.03	0.02	0.02	0.01	0.03	0.04	0.02	0.03	0.05	0.00	0.06	0.11	0.10	0.05
C2	0.03	0.00	0.13	0.07	0.03	0.04	0.02	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.23	0.09	0.03	0.09	0.09	0.10	0.21	0.14
C2'	0.01	0.13	0.00	0.00	0.05	0.00	0.09	0.04	0.12	0.02	0.10	0.21	0.00	0.02	0.06	0.01	0.08	0.17	0.11	0.10
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.05	0.00	0.05	0.02	0.05	0.02	0.06	0.12	0.01	0.01	0.06	0.01	0.07	0.20	0.09	0.09
C4	0.04	0.03	0.05	0.05	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.03	0.01	0.03	0.07	0.06	0.01	0.03	0.13	0.16	0.29	0.17
C4'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.08	0.01	0.03	0.07	0.01	0.01	0.04	0.00	0.02	0.15	0.03	0.02
C5	0.03	0.02	0.09	0.05	0.01	0.07	0.00	0.08	0.00	0.02	0.01	0.03	0.15	0.05	0.02	0.10	0.16	0.16	0.27	0.15
C5'	0.02	0.08	0.04	0.02	0.05	0.01	0.08	0.00	0.09	0.03	0.08	0.12	0.03	0.02	0.07	0.01	0.01	0.13	0.04	0.01
C6	0.02	0.01	0.12	0.05	0.01	0.08	0.00	0.09	0.00	0.01	0.01	0.02	0.19	0.06	0.02	0.13	0.16	0.12	0.20	0.12
N1	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.02	0.03	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.03	0.04	0.01	0.09	0.09	0.17	0.09
N3	0.03	0.01	0.10	0.06	0.01	0.03	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.02	0.18	0.09	0.02	0.06	0.10	0.13	0.26	0.17
O2	0.04	0.01	0.21	0.12	0.03	0.07	0.03	0.12	0.02	0.02	0.02	0.00	0.40	0.16	0.04	0.16	0.07	0.11	0.19	0.14
O2'	0.02	0.23	0.00	0.01	0.07	0.01	0.15	0.03	0.19	0.03	0.18	0.40	0.00	0.05	0.08	0.02	0.10	0.20	0.17	0.14
O3'	0.03	0.09	0.02	0.01	0.06	0.01	0.05	0.02	0.06	0.03	0.09	0.16	0.05	0.00	0.07	0.01	0.06	0.23	0.09	0.09
O4	0.05	0.03	0.06	0.06	0.01	0.04	0.02	0.07	0.02	0.04	0.02	0.04	0.08	0.07	0.00	0.04	0.14	0.20	0.32	0.20
O4'	0.00	0.09	0.01	0.01	0.03	0.00	0.10	0.01	0.13	0.01	0.06	0.16	0.02	0.01	0.04	0.00	0.09	0.12	0.10	0.06
O5'	0.06	0.09	0.08	0.07	0.13	0.02	0.16	0.01	0.16	0.09	0.10	0.07	0.10	0.06	0.14	0.09	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.11	0.10	0.17	0.20	0.16	0.15	0.16	0.13	0.12	0.09	0.13	0.11	0.20	0.23	0.20	0.12	0.01	0.00	0.02	0.01
OP2	0.10	0.21	0.11	0.09	0.29	0.03	0.27	0.04	0.20	0.17	0.26	0.19	0.17	0.09	0.32	0.10	0.01	0.02	0.00	0.01
P	0.05	0.14	0.10	0.09	0.17	0.02	0.15	0.01	0.12	0.09	0.17	0.14	0.14	0.09	0.20	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00