Doublet Group distance statistics: 49078

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 0, 1, 1, 1, 2, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.011, 0.021, 0.031, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.021 std_dev=0.010
C6	A	0, 0.011, 0.022, 0.033, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.022 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.012, 0.025, 0.037, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.025 std_dev=0.012
N3	A	0, 0.016, 0.032, 0.048, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.032 std_dev=0.016
C2	A	0, 0.019, 0.036, 0.053, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.036 std_dev=0.017
N1	A	0, 0.024, 0.042, 0.060, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.042 std_dev=0.018
C4	A	0, 0.021, 0.042, 0.062, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.042 std_dev=0.020
O2	A	0, 0.021, 0.044, 0.067, 0.079 max_d=0.079 avg_d=0.044 std_dev=0.023
O4	A	0, 0.033, 0.062, 0.092, 0.100 max_d=0.100 avg_d=0.062 std_dev=0.030
C2'	A	0, 0.005, 0.109, 0.213, 0.363 max_d=0.363 avg_d=0.109 std_dev=0.104
O2'	A	0, 0.049, 0.161, 0.272, 0.409 max_d=0.409 avg_d=0.161 std_dev=0.111
O4'	A	0, 0.089, 0.207, 0.324, 0.472 max_d=0.472 avg_d=0.207 std_dev=0.118
C3'	A	0, 0.057, 0.226, 0.395, 0.637 max_d=0.637 avg_d=0.226 std_dev=0.169
C4'	A	0, 0.158, 0.354, 0.550, 0.785 max_d=0.785 avg_d=0.354 std_dev=0.196
O3'	A	0, 0.049, 0.257, 0.466, 0.734 max_d=0.734 avg_d=0.257 std_dev=0.208
O5'	A	0, 0.362, 0.614, 0.865, 0.836 max_d=0.836 avg_d=0.614 std_dev=0.252
O2'	B	0, 0.277, 0.580, 0.883, 1.022 max_d=1.022 avg_d=0.580 std_dev=0.303
C2'	B	0, 0.275, 0.600, 0.925, 1.097 max_d=1.097 avg_d=0.600 std_dev=0.325
P	A	0, 0.268, 0.610, 0.951, 1.101 max_d=1.101 avg_d=0.610 std_dev=0.341
OP2	A	0, 0.331, 0.698, 1.064, 1.193 max_d=1.193 avg_d=0.698 std_dev=0.367
C1'	B	0, 0.379, 0.757, 1.134, 1.186 max_d=1.186 avg_d=0.757 std_dev=0.378
C3'	B	0, 0.410, 0.788, 1.165, 1.261 max_d=1.261 avg_d=0.788 std_dev=0.378
O3'	B	0, 0.474, 0.865, 1.257, 1.362 max_d=1.362 avg_d=0.865 std_dev=0.391
C5'	A	0, 0.244, 0.643, 1.042, 1.594 max_d=1.594 avg_d=0.643 std_dev=0.399
N1	B	0, 0.402, 0.810, 1.218, 1.179 max_d=1.179 avg_d=0.810 std_dev=0.408
OP1	A	0, 0.208, 0.638, 1.068, 1.380 max_d=1.380 avg_d=0.638 std_dev=0.430
C4'	B	0, 0.441, 0.875, 1.310, 1.368 max_d=1.368 avg_d=0.875 std_dev=0.434
O4'	B	0, 0.507, 0.952, 1.398, 1.343 max_d=1.343 avg_d=0.952 std_dev=0.446
C6	B	0, 0.492, 0.952, 1.412, 1.348 max_d=1.348 avg_d=0.952 std_dev=0.460
O5'	B	0, 0.558, 1.055, 1.552, 1.620 max_d=1.620 avg_d=1.055 std_dev=0.497
C2	B	0, 0.307, 0.821, 1.336, 1.812 max_d=1.812 avg_d=0.821 std_dev=0.514
C5'	B	0, 0.510, 1.027, 1.544, 1.613 max_d=1.613 avg_d=1.027 std_dev=0.517
C5	B	0, 0.564, 1.082, 1.599, 1.532 max_d=1.532 avg_d=1.082 std_dev=0.518
C4	B	0, 0.554, 1.133, 1.713, 1.865 max_d=1.865 avg_d=1.133 std_dev=0.580
O2	B	0, 0.110, 0.712, 1.314, 2.156 max_d=2.156 avg_d=0.712 std_dev=0.602
N3	B	0, 0.419, 1.047, 1.675, 2.242 max_d=2.242 avg_d=1.047 std_dev=0.628
O4	B	0, 0.662, 1.381, 2.100, 2.358 max_d=2.358 avg_d=1.381 std_dev=0.719
P	B	0, 0.810, 1.583, 2.356, 2.525 max_d=2.525 avg_d=1.583 std_dev=0.773
OP2	B	0, 0.823, 1.814, 2.806, 3.583 max_d=3.583 avg_d=1.814 std_dev=0.992
OP1	B	0, 1.066, 2.100, 3.135, 3.480 max_d=3.480 avg_d=2.100 std_dev=1.035

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.08	0.15	0.05
C2	0.01	0.00	0.04	0.08	0.03	0.04	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.08	0.02	0.01	0.12	0.09	0.13	0.06
C2'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.03	0.01	0.05	0.03	0.05	0.01	0.03	0.08	0.00	0.02	0.03	0.01	0.16	0.18	0.08	0.12
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.04	0.01	0.03	0.03	0.04	0.03	0.08	0.11	0.03	0.01	0.04	0.01	0.25	0.25	0.06	0.19
C4	0.02	0.03	0.03	0.04	0.00	0.06	0.00	0.14	0.01	0.02	0.01	0.02	0.04	0.04	0.01	0.03	0.18	0.11	0.12	0.09
C4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.06	0.00	0.07	0.01	0.05	0.03	0.06	0.04	0.04	0.02	0.06	0.01	0.02	0.11	0.18	0.03
C5	0.01	0.01	0.05	0.03	0.00	0.07	0.00	0.15	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.04	0.00	0.06	0.19	0.10	0.11	0.09
C5'	0.03	0.10	0.03	0.03	0.14	0.01	0.15	0.00	0.12	0.09	0.14	0.09	0.05	0.04	0.16	0.01	0.01	0.13	0.26	0.01
C6	0.01	0.01	0.05	0.04	0.01	0.05	0.00	0.12	0.00	0.01	0.02	0.01	0.03	0.04	0.00	0.06	0.16	0.08	0.12	0.06
N1	0.00	0.01	0.01	0.03	0.02	0.03	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.11	0.08	0.13	0.06
N3	0.01	0.00	0.03	0.08	0.01	0.06	0.01	0.14	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.08	0.01	0.03	0.16	0.11	0.13	0.08
O2	0.03	0.01	0.08	0.11	0.02	0.04	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.06	0.11	0.01	0.04	0.10	0.09	0.14	0.06
O2'	0.01	0.04	0.00	0.03	0.04	0.04	0.03	0.05	0.03	0.02	0.03	0.06	0.00	0.04	0.04	0.03	0.09	0.12	0.11	0.08
O3'	0.01	0.08	0.02	0.01	0.04	0.02	0.04	0.04	0.04	0.02	0.08	0.11	0.04	0.00	0.05	0.01	0.26	0.28	0.07	0.21
O4	0.01	0.02	0.03	0.04	0.01	0.06	0.00	0.16	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.05	0.00	0.04	0.20	0.12	0.13	0.11
O4'	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.06	0.02	0.03	0.04	0.03	0.01	0.04	0.00	0.10	0.10	0.22	0.10
O5'	0.04	0.12	0.16	0.25	0.18	0.02	0.19	0.01	0.16	0.11	0.16	0.10	0.09	0.26	0.20	0.10	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.08	0.09	0.18	0.25	0.11	0.11	0.10	0.13	0.08	0.08	0.11	0.09	0.12	0.28	0.12	0.10	0.02	0.00	0.03	0.01
OP2	0.15	0.13	0.08	0.06	0.12	0.18	0.11	0.26	0.12	0.13	0.13	0.14	0.11	0.07	0.13	0.22	0.02	0.03	0.00	0.00
P	0.05	0.06	0.12	0.19	0.09	0.03	0.09	0.01	0.06	0.06	0.08	0.06	0.08	0.21	0.11	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.11	0.26	0.13	0.12	0.24	0.12	0.21	0.18	0.18	0.12	0.31	0.42	0.18	0.16	0.29	0.11	0.14	0.13	0.48	0.23
C2	0.09	0.14	0.11	0.12	0.18	0.13	0.17	0.12	0.15	0.09	0.18	0.26	0.18	0.17	0.21	0.11	0.15	0.19	0.39	0.16
C2'	0.22	0.29	0.24	0.23	0.28	0.23	0.27	0.29	0.26	0.22	0.33	0.42	0.26	0.24	0.30	0.22	0.19	0.18	0.55	0.31
C3'	0.19	0.31	0.23	0.23	0.28	0.21	0.26	0.32	0.25	0.20	0.36	0.45	0.24	0.25	0.31	0.18	0.17	0.20	0.57	0.33
C4	0.12	0.14	0.11	0.13	0.18	0.14	0.18	0.12	0.17	0.13	0.17	0.20	0.18	0.17	0.20	0.13	0.15	0.28	0.27	0.09
C4'	0.09	0.33	0.09	0.08	0.32	0.08	0.25	0.24	0.21	0.14	0.43	0.50	0.14	0.12	0.41	0.09	0.14	0.16	0.53	0.28
C5	0.09	0.19	0.09	0.12	0.19	0.12	0.19	0.10	0.17	0.12	0.22	0.32	0.18	0.17	0.22	0.10	0.14	0.21	0.31	0.12
C5'	0.18	0.47	0.07	0.07	0.48	0.12	0.37	0.28	0.31	0.27	0.59	0.59	0.09	0.07	0.57	0.19	0.21	0.22	0.56	0.32
C6	0.09	0.24	0.11	0.12	0.22	0.11	0.19	0.13	0.17	0.10	0.27	0.42	0.18	0.17	0.25	0.09	0.15	0.15	0.39	0.18
N1	0.10	0.21	0.12	0.12	0.21	0.12	0.19	0.14	0.17	0.10	0.25	0.37	0.18	0.17	0.25	0.10	0.15	0.15	0.42	0.20
N3	0.10	0.12	0.11	0.13	0.17	0.14	0.17	0.12	0.16	0.11	0.15	0.19	0.18	0.17	0.19	0.13	0.15	0.26	0.31	0.11
O2	0.10	0.14	0.12	0.13	0.18	0.14	0.17	0.13	0.15	0.10	0.18	0.24	0.19	0.17	0.21	0.12	0.15	0.18	0.41	0.18
O2'	0.23	0.32	0.22	0.21	0.33	0.22	0.31	0.30	0.28	0.24	0.37	0.42	0.25	0.21	0.37	0.22	0.20	0.19	0.58	0.34
O3'	0.24	0.33	0.27	0.27	0.34	0.26	0.34	0.39	0.31	0.26	0.39	0.42	0.26	0.27	0.38	0.23	0.20	0.27	0.64	0.39
O4	0.15	0.17	0.13	0.15	0.19	0.17	0.20	0.15	0.19	0.17	0.18	0.17	0.18	0.18	0.20	0.17	0.16	0.36	0.20	0.08
O4'	0.09	0.32	0.08	0.07	0.31	0.07	0.25	0.18	0.21	0.13	0.40	0.49	0.15	0.12	0.38	0.09	0.14	0.15	0.48	0.23
O5'	0.27	0.36	0.31	0.26	0.25	0.27	0.23	0.35	0.26	0.22	0.40	0.51	0.36	0.25	0.32	0.26	0.16	0.13	0.46	0.23
OP1	0.19	0.35	0.21	0.20	0.25	0.21	0.19	0.34	0.21	0.19	0.39	0.45	0.22	0.21	0.31	0.19	0.21	0.31	0.60	0.38
OP2	0.15	0.29	0.22	0.24	0.24	0.22	0.22	0.33	0.24	0.10	0.34	0.40	0.22	0.26	0.30	0.16	0.15	0.12	0.38	0.19
P	0.16	0.31	0.21	0.19	0.20	0.20	0.17	0.31	0.21	0.12	0.35	0.45	0.23	0.18	0.27	0.16	0.12	0.11	0.43	0.21

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.11	0.01	0.00	0.00	0.02	0.02	0.05	0.01	0.01	0.17	0.18	0.34	0.14
C2	0.01	0.00	0.13	0.10	0.02	0.07	0.01	0.32	0.01	0.00	0.00	0.01	0.12	0.10	0.01	0.09	0.16	0.14	0.52	0.22
C2'	0.01	0.13	0.00	0.01	0.06	0.02	0.07	0.05	0.09	0.03	0.11	0.22	0.00	0.03	0.06	0.01	0.10	0.23	0.23	0.09
C3'	0.01	0.10	0.01	0.00	0.07	0.01	0.09	0.02	0.10	0.04	0.08	0.15	0.03	0.01	0.07	0.01	0.12	0.24	0.13	0.10
C4	0.02	0.02	0.06	0.07	0.00	0.12	0.00	0.41	0.01	0.02	0.01	0.02	0.04	0.10	0.01	0.02	0.19	0.22	0.67	0.33
C4'	0.00	0.07	0.02	0.01	0.12	0.00	0.13	0.00	0.11	0.07	0.10	0.05	0.09	0.01	0.13	0.01	0.02	0.32	0.06	0.12
C5	0.01	0.01	0.07	0.09	0.00	0.13	0.00	0.38	0.00	0.01	0.02	0.01	0.05	0.09	0.01	0.07	0.23	0.25	0.67	0.36
C5'	0.11	0.32	0.05	0.02	0.41	0.00	0.38	0.00	0.32	0.28	0.38	0.27	0.07	0.12	0.43	0.03	0.01	0.17	0.02	0.02
C6	0.01	0.01	0.09	0.10	0.01	0.11	0.00	0.32	0.00	0.01	0.02	0.01	0.07	0.10	0.01	0.09	0.23	0.18	0.58	0.31
N1	0.00	0.00	0.03	0.04	0.02	0.07	0.01	0.28	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.04	0.01	0.02	0.18	0.13	0.49	0.23
N3	0.00	0.00	0.11	0.08	0.01	0.10	0.02	0.38	0.02	0.01	0.00	0.01	0.10	0.11	0.01	0.07	0.18	0.16	0.60	0.26
O2	0.02	0.01	0.22	0.15	0.02	0.05	0.01	0.27	0.01	0.00	0.01	0.00	0.22	0.16	0.01	0.14	0.15	0.17	0.47	0.18
O2'	0.02	0.12	0.00	0.03	0.04	0.09	0.05	0.07	0.07	0.02	0.10	0.22	0.00	0.07	0.05	0.03	0.13	0.32	0.17	0.11
O3'	0.05	0.10	0.03	0.01	0.10	0.01	0.09	0.12	0.10	0.04	0.11	0.16	0.07	0.00	0.11	0.07	0.22	0.34	0.11	0.18
O4	0.01	0.01	0.06	0.07	0.01	0.13	0.01	0.43	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.11	0.00	0.03	0.20	0.26	0.71	0.35
O4'	0.01	0.09	0.01	0.01	0.02	0.01	0.07	0.03	0.09	0.02	0.07	0.14	0.03	0.07	0.03	0.00	0.24	0.19	0.30	0.12
O5'	0.17	0.16	0.10	0.12	0.19	0.02	0.23	0.01	0.23	0.18	0.18	0.15	0.13	0.22	0.20	0.24	0.00	0.02	0.04	0.01
OP1	0.18	0.14	0.23	0.24	0.22	0.32	0.25	0.17	0.18	0.13	0.16	0.17	0.32	0.34	0.26	0.19	0.02	0.00	0.03	0.01
OP2	0.34	0.52	0.23	0.13	0.67	0.06	0.67	0.02	0.58	0.49	0.60	0.47	0.17	0.11	0.71	0.30	0.04	0.03	0.00	0.01
P	0.14	0.22	0.09	0.10	0.33	0.12	0.36	0.02	0.31	0.23	0.26	0.18	0.11	0.18	0.35	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00