Doublet Group distance statistics: 49082

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.003, 0.007, 0.010, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.007 std_dev=0.004
C6	A	0, 0.002, 0.007, 0.013, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.007 std_dev=0.005
C4	A	0, 0.001, 0.007, 0.013, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.007 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.000, 0.007, 0.014, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.007 std_dev=0.007
N3	A	0, 0.000, 0.007, 0.014, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.007 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.001, 0.008, 0.016, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.008 std_dev=0.007
C1'	A	0, 0.001, 0.009, 0.016, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.009 std_dev=0.007
O2	A	0, 0.005, 0.016, 0.026, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.016 std_dev=0.011
O4	A	0, 0.018, 0.049, 0.081, 0.085 max_d=0.085 avg_d=0.049 std_dev=0.031
C2'	A	0, 0.018, 0.108, 0.198, 0.224 max_d=0.224 avg_d=0.108 std_dev=0.090
O4'	A	0, 0.007, 0.104, 0.201, 0.255 max_d=0.255 avg_d=0.104 std_dev=0.097
O2'	A	0, 0.015, 0.164, 0.313, 0.408 max_d=0.408 avg_d=0.164 std_dev=0.149
C4'	A	0, 0.015, 0.172, 0.330, 0.383 max_d=0.383 avg_d=0.172 std_dev=0.158
C3'	A	0, 0.021, 0.185, 0.348, 0.375 max_d=0.375 avg_d=0.185 std_dev=0.164
C6	B	0, 0.172, 0.391, 0.609, 0.644 max_d=0.644 avg_d=0.391 std_dev=0.218
C5	B	0, 0.226, 0.472, 0.718, 0.754 max_d=0.754 avg_d=0.472 std_dev=0.246
C5'	A	0, 0.021, 0.276, 0.531, 0.588 max_d=0.588 avg_d=0.276 std_dev=0.255
O5'	A	0, 0.087, 0.356, 0.625, 0.659 max_d=0.659 avg_d=0.356 std_dev=0.269
O3'	A	0, 0.023, 0.298, 0.572, 0.659 max_d=0.659 avg_d=0.298 std_dev=0.274
OP1	A	0, 0.184, 0.460, 0.736, 0.813 max_d=0.813 avg_d=0.460 std_dev=0.276
C3'	B	0, 0.104, 0.394, 0.684, 0.832 max_d=0.832 avg_d=0.394 std_dev=0.290
P	A	0, 0.114, 0.421, 0.728, 0.900 max_d=0.900 avg_d=0.421 std_dev=0.307
C2'	B	0, 0.080, 0.414, 0.748, 0.974 max_d=0.974 avg_d=0.414 std_dev=0.334
C4'	B	0, 0.091, 0.445, 0.799, 1.062 max_d=1.062 avg_d=0.445 std_dev=0.354
O5'	B	0, 0.181, 0.539, 0.898, 0.998 max_d=0.998 avg_d=0.539 std_dev=0.359
C5'	B	0, 0.150, 0.519, 0.888, 1.067 max_d=1.067 avg_d=0.519 std_dev=0.369
OP2	A	0, 0.205, 0.581, 0.957, 1.114 max_d=1.114 avg_d=0.581 std_dev=0.376
O3'	B	0, 0.054, 0.434, 0.815, 1.139 max_d=1.139 avg_d=0.434 std_dev=0.380
O4'	B	0, 0.032, 0.445, 0.857, 1.259 max_d=1.259 avg_d=0.445 std_dev=0.413
C1'	B	0, -0.011, 0.402, 0.816, 1.246 max_d=1.246 avg_d=0.402 std_dev=0.413
O2'	B	0, 0.082, 0.501, 0.919, 1.204 max_d=1.204 avg_d=0.501 std_dev=0.418
N1	B	0, 0.040, 0.463, 0.885, 1.325 max_d=1.325 avg_d=0.463 std_dev=0.423
C4	B	0, 0.172, 0.702, 1.232, 1.709 max_d=1.709 avg_d=0.702 std_dev=0.530
P	B	0, 0.148, 0.717, 1.287, 1.668 max_d=1.668 avg_d=0.717 std_dev=0.570
O4	B	0, 0.219, 0.877, 1.536, 2.082 max_d=2.082 avg_d=0.877 std_dev=0.659
C2	B	0, -0.059, 0.693, 1.446, 2.258 max_d=2.258 avg_d=0.693 std_dev=0.752
N3	B	0, 0.021, 0.807, 1.594, 2.405 max_d=2.405 avg_d=0.807 std_dev=0.787
O2	B	0, -0.194, 0.816, 1.825, 2.922 max_d=2.922 avg_d=0.816 std_dev=1.010
OP2	B	0, 0.018, 1.045, 2.071, 3.029 max_d=3.029 avg_d=1.045 std_dev=1.026
OP1	B	0, -0.086, 0.991, 2.068, 3.186 max_d=3.186 avg_d=0.991 std_dev=1.077

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.06	0.11	0.15	0.06
C2	0.00	0.00	0.07	0.07	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.00	0.00	0.00	0.08	0.09	0.00	0.01	0.07	0.09	0.17	0.09
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.04	0.01	0.03	0.01	0.04	0.02	0.06	0.10	0.00	0.02	0.04	0.01	0.03	0.06	0.21	0.07
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.08	0.00	0.10	0.01	0.10	0.04	0.08	0.10	0.01	0.01	0.09	0.01	0.03	0.03	0.22	0.08
C4	0.01	0.00	0.04	0.08	0.00	0.06	0.00	0.11	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.10	0.00	0.03	0.14	0.12	0.22	0.15
C4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.06	0.00	0.08	0.00	0.08	0.03	0.03	0.04	0.04	0.00	0.07	0.00	0.01	0.08	0.16	0.03
C5	0.01	0.01	0.03	0.10	0.00	0.08	0.00	0.14	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.11	0.00	0.03	0.18	0.14	0.24	0.19
C5'	0.02	0.04	0.01	0.01	0.11	0.00	0.14	0.00	0.13	0.06	0.06	0.02	0.04	0.02	0.12	0.01	0.01	0.08	0.11	0.01
C6	0.01	0.01	0.04	0.10	0.00	0.08	0.00	0.13	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.10	0.01	0.03	0.18	0.12	0.22	0.16
N1	0.00	0.00	0.02	0.04	0.01	0.03	0.01	0.06	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.04	0.01	0.01	0.09	0.11	0.17	0.09
N3	0.01	0.00	0.06	0.08	0.00	0.03	0.01	0.06	0.01	0.00	0.00	0.00	0.07	0.10	0.00	0.02	0.09	0.09	0.19	0.11
O2	0.01	0.00	0.10	0.10	0.00	0.04	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.12	0.14	0.00	0.02	0.04	0.09	0.17	0.07
O2'	0.01	0.08	0.00	0.01	0.04	0.04	0.02	0.04	0.03	0.02	0.07	0.12	0.00	0.03	0.05	0.04	0.04	0.06	0.23	0.07
O3'	0.01	0.09	0.02	0.01	0.10	0.00	0.11	0.02	0.10	0.04	0.10	0.14	0.03	0.00	0.11	0.01	0.07	0.07	0.28	0.12
O4	0.01	0.00	0.04	0.09	0.00	0.07	0.00	0.12	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.11	0.00	0.03	0.14	0.13	0.23	0.17
O4'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.04	0.01	0.03	0.00	0.05	0.14	0.11	0.04
O5'	0.06	0.07	0.03	0.03	0.14	0.01	0.18	0.01	0.18	0.09	0.09	0.04	0.04	0.07	0.14	0.05	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.11	0.09	0.06	0.03	0.12	0.08	0.14	0.08	0.12	0.11	0.09	0.09	0.06	0.07	0.13	0.14	0.01	0.00	0.02	0.01
OP2	0.15	0.17	0.21	0.22	0.22	0.16	0.24	0.11	0.22	0.17	0.19	0.17	0.23	0.28	0.23	0.11	0.02	0.02	0.00	0.00
P	0.06	0.09	0.07	0.08	0.15	0.03	0.19	0.01	0.16	0.09	0.11	0.07	0.07	0.12	0.17	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.13	0.09	0.13	0.12	0.10	0.32	0.21	0.48	0.24	0.13	0.08	0.21	0.26	0.11	0.08	0.28	0.34	0.77	0.29	0.40
C2	0.12	0.16	0.14	0.10	0.07	0.30	0.20	0.47	0.23	0.11	0.14	0.35	0.33	0.15	0.06	0.28	0.39	0.68	0.19	0.45
C2'	0.13	0.03	0.11	0.12	0.10	0.32	0.18	0.43	0.20	0.12	0.04	0.07	0.25	0.09	0.09	0.31	0.26	0.61	0.32	0.29
C3'	0.14	0.13	0.08	0.11	0.13	0.29	0.14	0.35	0.15	0.13	0.13	0.14	0.16	0.07	0.13	0.30	0.17	0.48	0.42	0.19
C4	0.12	0.28	0.16	0.09	0.08	0.26	0.19	0.44	0.22	0.11	0.23	0.55	0.36	0.21	0.09	0.25	0.44	0.60	0.37	0.51
C4'	0.10	0.06	0.07	0.10	0.09	0.25	0.14	0.35	0.16	0.10	0.07	0.09	0.13	0.04	0.09	0.22	0.19	0.62	0.52	0.24
C5	0.13	0.25	0.16	0.09	0.10	0.27	0.21	0.46	0.24	0.13	0.19	0.48	0.34	0.25	0.10	0.25	0.42	0.64	0.27	0.48
C5'	0.06	0.07	0.04	0.07	0.07	0.16	0.09	0.24	0.09	0.06	0.07	0.11	0.09	0.02	0.07	0.13	0.14	0.52	0.65	0.20
C6	0.12	0.17	0.14	0.08	0.11	0.30	0.22	0.48	0.24	0.13	0.14	0.35	0.31	0.21	0.09	0.27	0.38	0.71	0.20	0.44
N1	0.12	0.14	0.14	0.10	0.09	0.31	0.21	0.48	0.24	0.12	0.12	0.30	0.30	0.15	0.07	0.28	0.37	0.72	0.19	0.43
N3	0.11	0.22	0.15	0.08	0.06	0.29	0.19	0.46	0.22	0.11	0.19	0.45	0.35	0.17	0.07	0.27	0.42	0.63	0.29	0.49
O2	0.12	0.14	0.14	0.11	0.06	0.31	0.19	0.47	0.23	0.11	0.13	0.31	0.33	0.13	0.05	0.29	0.38	0.70	0.18	0.44
O2'	0.12	0.03	0.10	0.11	0.10	0.30	0.18	0.42	0.19	0.12	0.04	0.07	0.22	0.08	0.09	0.29	0.25	0.64	0.38	0.28
O3'	0.18	0.22	0.08	0.12	0.18	0.27	0.14	0.29	0.14	0.18	0.22	0.27	0.10	0.12	0.19	0.30	0.10	0.36	0.51	0.13
O4	0.13	0.36	0.17	0.10	0.09	0.24	0.18	0.41	0.20	0.12	0.30	0.69	0.37	0.22	0.12	0.23	0.46	0.54	0.52	0.56
O4'	0.14	0.09	0.13	0.14	0.12	0.31	0.22	0.46	0.24	0.14	0.09	0.18	0.21	0.09	0.11	0.25	0.33	0.81	0.41	0.38
O5'	0.06	0.08	0.05	0.09	0.06	0.20	0.08	0.26	0.09	0.06	0.08	0.13	0.11	0.02	0.07	0.16	0.16	0.46	0.51	0.21
OP1	0.04	0.05	0.10	0.08	0.08	0.09	0.10	0.12	0.09	0.05	0.06	0.07	0.16	0.02	0.09	0.08	0.19	0.42	0.76	0.26
OP2	0.08	0.12	0.15	0.16	0.13	0.11	0.18	0.19	0.19	0.10	0.13	0.20	0.12	0.04	0.14	0.07	0.45	0.30	0.85	0.52
P	0.02	0.08	0.03	0.02	0.06	0.05	0.05	0.08	0.05	0.03	0.08	0.13	0.06	0.01	0.07	0.03	0.22	0.23	0.65	0.27

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.03	0.00	0.12	0.07	0.30	0.12
C2	0.01	0.00	0.10	0.04	0.01	0.05	0.00	0.10	0.00	0.01	0.01	0.01	0.18	0.08	0.02	0.09	0.20	0.19	0.62	0.25
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.06	0.01	0.05	0.05	0.08	0.02	0.10	0.14	0.00	0.03	0.09	0.01	0.07	0.15	0.21	0.07
C3'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.06	0.02	0.05	0.06	0.02	0.01	0.06	0.01	0.11	0.08	0.18	0.10
C4	0.03	0.01	0.06	0.05	0.00	0.04	0.00	0.11	0.01	0.02	0.01	0.01	0.08	0.05	0.00	0.04	0.26	0.34	0.95	0.34
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.04	0.00	0.06	0.00	0.06	0.02	0.04	0.08	0.02	0.01	0.05	0.00	0.01	0.19	0.17	0.02
C5	0.02	0.00	0.05	0.06	0.00	0.06	0.00	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.10	0.03	0.01	0.05	0.27	0.36	0.98	0.34
C5'	0.02	0.10	0.05	0.01	0.11	0.00	0.10	0.00	0.09	0.06	0.11	0.11	0.04	0.03	0.12	0.01	0.00	0.27	0.24	0.01
C6	0.02	0.00	0.08	0.06	0.01	0.06	0.01	0.09	0.00	0.00	0.01	0.01	0.14	0.03	0.02	0.08	0.25	0.28	0.81	0.30
N1	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.06	0.00	0.00	0.02	0.01	0.03	0.03	0.02	0.01	0.20	0.18	0.60	0.23
N3	0.02	0.01	0.10	0.05	0.01	0.04	0.00	0.11	0.01	0.02	0.00	0.01	0.17	0.08	0.01	0.08	0.23	0.26	0.79	0.30
O2	0.02	0.01	0.14	0.06	0.01	0.08	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.28	0.12	0.02	0.14	0.17	0.13	0.48	0.21
O2'	0.01	0.18	0.00	0.02	0.08	0.02	0.10	0.04	0.14	0.03	0.17	0.28	0.00	0.08	0.12	0.01	0.10	0.24	0.22	0.11
O3'	0.03	0.08	0.03	0.01	0.05	0.01	0.03	0.03	0.03	0.03	0.08	0.12	0.08	0.00	0.07	0.02	0.13	0.13	0.33	0.15
O4	0.03	0.02	0.09	0.06	0.00	0.05	0.01	0.12	0.02	0.02	0.01	0.02	0.12	0.07	0.00	0.05	0.26	0.38	1.03	0.36
O4'	0.00	0.09	0.01	0.01	0.04	0.00	0.05	0.01	0.08	0.01	0.08	0.14	0.01	0.02	0.05	0.00	0.13	0.11	0.15	0.11
O5'	0.12	0.20	0.07	0.11	0.26	0.01	0.27	0.00	0.25	0.20	0.23	0.17	0.10	0.13	0.26	0.13	0.00	0.02	0.03	0.00
OP1	0.07	0.19	0.15	0.08	0.34	0.19	0.36	0.27	0.28	0.18	0.26	0.13	0.24	0.13	0.38	0.11	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.30	0.62	0.21	0.18	0.95	0.17	0.98	0.24	0.81	0.60	0.79	0.48	0.22	0.33	1.03	0.15	0.03	0.01	0.00	0.01
P	0.12	0.25	0.07	0.10	0.34	0.02	0.34	0.01	0.30	0.23	0.30	0.21	0.11	0.15	0.36	0.11	0.00	0.01	0.01	0.00