Doublet Group distance statistics: 49090

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.000, 0.004, 0.008, 0.010 max_d=0.010 avg_d=0.004 std_dev=0.004
N3	A	0, 0.002, 0.006, 0.011, 0.011 max_d=0.011 avg_d=0.006 std_dev=0.004
N1	A	0, -0.001, 0.010, 0.021, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.010 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.001, 0.015, 0.028, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.015 std_dev=0.013
C2	A	0, 0.002, 0.015, 0.029, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.015 std_dev=0.014
C6	A	0, 0.000, 0.014, 0.028, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.014 std_dev=0.014
C4	A	0, -0.001, 0.014, 0.029, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.014 std_dev=0.015
O2	A	0, 0.002, 0.039, 0.076, 0.090 max_d=0.090 avg_d=0.039 std_dev=0.037
O4	A	0, -0.008, 0.051, 0.111, 0.135 max_d=0.135 avg_d=0.051 std_dev=0.060
C5	B	0, -0.086, 0.229, 0.545, 0.675 max_d=0.675 avg_d=0.229 std_dev=0.315
C6	B	0, -0.094, 0.265, 0.625, 0.774 max_d=0.774 avg_d=0.265 std_dev=0.360
O4'	A	0, -0.094, 0.279, 0.653, 0.807 max_d=0.807 avg_d=0.279 std_dev=0.373
C4	B	0, -0.110, 0.285, 0.680, 0.844 max_d=0.844 avg_d=0.285 std_dev=0.395
O4	B	0, -0.109, 0.310, 0.729, 0.903 max_d=0.903 avg_d=0.310 std_dev=0.419
C5'	B	0, -0.103, 0.324, 0.750, 0.926 max_d=0.926 avg_d=0.324 std_dev=0.426
C2'	A	0, -0.123, 0.322, 0.767, 0.951 max_d=0.951 avg_d=0.322 std_dev=0.445
OP1	A	0, -0.109, 0.351, 0.812, 1.002 max_d=1.002 avg_d=0.351 std_dev=0.460
N1	B	0, -0.127, 0.338, 0.804, 0.996 max_d=0.996 avg_d=0.338 std_dev=0.465
N3	B	0, -0.133, 0.355, 0.842, 1.044 max_d=1.044 avg_d=0.355 std_dev=0.487
C2'	B	0, -0.122, 0.386, 0.894, 1.104 max_d=1.104 avg_d=0.386 std_dev=0.508
O5'	A	0, -0.125, 0.391, 0.906, 1.119 max_d=1.119 avg_d=0.391 std_dev=0.516
C2	B	0, -0.146, 0.380, 0.905, 1.123 max_d=1.123 avg_d=0.380 std_dev=0.526
O2'	B	0, -0.118, 0.412, 0.942, 1.161 max_d=1.161 avg_d=0.412 std_dev=0.530
C1'	B	0, -0.135, 0.397, 0.928, 1.148 max_d=1.148 avg_d=0.397 std_dev=0.531
C4'	A	0, -0.145, 0.388, 0.922, 1.143 max_d=1.143 avg_d=0.388 std_dev=0.533
O3'	B	0, -0.129, 0.408, 0.945, 1.166 max_d=1.166 avg_d=0.408 std_dev=0.537
P	A	0, -0.134, 0.411, 0.956, 1.181 max_d=1.181 avg_d=0.411 std_dev=0.545
O4'	B	0, -0.141, 0.411, 0.963, 1.191 max_d=1.191 avg_d=0.411 std_dev=0.552
C3'	B	0, -0.135, 0.427, 0.990, 1.222 max_d=1.222 avg_d=0.427 std_dev=0.562
C4'	B	0, -0.140, 0.423, 0.987, 1.220 max_d=1.220 avg_d=0.423 std_dev=0.564
C3'	A	0, -0.163, 0.420, 1.002, 1.244 max_d=1.244 avg_d=0.420 std_dev=0.583
O2	B	0, -0.164, 0.452, 1.067, 1.322 max_d=1.322 avg_d=0.452 std_dev=0.616
OP2	B	0, -0.155, 0.465, 1.085, 1.342 max_d=1.342 avg_d=0.465 std_dev=0.620
C5'	A	0, -0.179, 0.488, 1.155, 1.431 max_d=1.431 avg_d=0.488 std_dev=0.667
O2'	A	0, -0.207, 0.545, 1.297, 1.609 max_d=1.609 avg_d=0.545 std_dev=0.752
OP2	A	0, -0.210, 0.596, 1.401, 1.735 max_d=1.735 avg_d=0.596 std_dev=0.806
O3'	A	0, -0.262, 0.659, 1.579, 1.961 max_d=1.961 avg_d=0.659 std_dev=0.921
P	B	0, -0.255, 0.716, 1.687, 2.088 max_d=2.088 avg_d=0.716 std_dev=0.971
O5'	B	0, -0.330, 0.939, 2.208, 2.733 max_d=2.733 avg_d=0.939 std_dev=1.269
OP1	B	0, -0.360, 0.980, 2.319, 2.873 max_d=2.873 avg_d=0.980 std_dev=1.339

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.27	0.01	0.00	0.12	0.08	0.11	0.12
C2	0.01	0.00	0.12	0.13	0.01	0.05	0.01	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.27	0.06	0.01	0.07	0.07	0.13	0.10	0.10
C2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.04	0.01	0.14	0.18	0.16	0.02	0.06	0.27	0.00	0.00	0.05	0.02	0.35	0.34	0.35	0.38
C3'	0.02	0.13	0.00	0.00	0.17	0.00	0.14	0.00	0.10	0.09	0.16	0.09	0.01	0.01	0.20	0.01	0.00	0.02	0.04	0.01
C4	0.01	0.01	0.04	0.17	0.00	0.00	0.00	0.10	0.00	0.01	0.01	0.01	0.15	0.07	0.00	0.04	0.06	0.21	0.12	0.11
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.08	0.15	0.06	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.00
C5	0.00	0.01	0.14	0.14	0.00	0.02	0.00	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.15	0.00	0.09	0.08	0.19	0.12	0.12
C5'	0.05	0.05	0.18	0.00	0.10	0.00	0.10	0.00	0.09	0.07	0.07	0.01	0.02	0.12	0.09	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00
C6	0.00	0.00	0.16	0.10	0.00	0.02	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.01	0.06	0.21	0.00	0.09	0.09	0.15	0.12	0.12
N1	0.00	0.00	0.02	0.09	0.01	0.01	0.01	0.07	0.00	0.00	0.00	0.01	0.09	0.17	0.01	0.02	0.09	0.12	0.11	0.11
N3	0.01	0.00	0.06	0.16	0.01	0.03	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.26	0.03	0.01	0.02	0.05	0.18	0.10	0.10
O2	0.02	0.00	0.27	0.09	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.39	0.01	0.02	0.16	0.06	0.08	0.09	0.10
O2'	0.02	0.27	0.00	0.01	0.15	0.15	0.01	0.02	0.06	0.09	0.26	0.39	0.00	0.05	0.16	0.09	0.32	0.33	0.31	0.39
O3'	0.27	0.06	0.00	0.01	0.07	0.06	0.15	0.12	0.21	0.17	0.03	0.01	0.05	0.00	0.02	0.23	0.15	0.11	0.22	0.17
O4	0.01	0.01	0.05	0.20	0.00	0.01	0.00	0.09	0.00	0.01	0.01	0.02	0.16	0.02	0.00	0.04	0.05	0.23	0.11	0.11
O4'	0.00	0.07	0.02	0.01	0.04	0.01	0.09	0.01	0.09	0.02	0.02	0.16	0.09	0.23	0.04	0.00	0.04	0.08	0.03	0.05
O5'	0.12	0.07	0.35	0.00	0.06	0.01	0.08	0.01	0.09	0.09	0.05	0.06	0.32	0.15	0.05	0.04	0.00	0.00	0.01	0.00
OP1	0.08	0.13	0.34	0.02	0.21	0.03	0.19	0.00	0.15	0.12	0.18	0.08	0.33	0.11	0.23	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00
OP2	0.11	0.10	0.35	0.04	0.12	0.02	0.12	0.02	0.12	0.11	0.10	0.09	0.31	0.22	0.11	0.03	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.12	0.10	0.38	0.01	0.11	0.00	0.12	0.00	0.12	0.11	0.10	0.10	0.39	0.17	0.11	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.23	0.10	0.34	0.42	0.16	0.34	0.02	0.24	0.09	0.08	0.20	0.15	0.41	0.43	0.22	0.21	0.40	0.45	0.34	0.32
C2	0.04	0.21	0.17	0.28	0.20	0.22	0.08	0.17	0.01	0.06	0.27	0.28	0.19	0.34	0.24	0.06	0.19	0.30	0.29	0.18
C2'	0.60	0.29	0.71	0.73	0.22	0.65	0.39	0.57	0.51	0.49	0.16	0.20	0.77	0.69	0.12	0.56	0.71	0.73	0.67	0.65
C3'	0.33	0.00	0.51	0.52	0.06	0.38	0.15	0.28	0.26	0.21	0.14	0.09	0.65	0.51	0.16	0.26	0.47	0.47	0.37	0.36
C4	0.14	0.34	0.01	0.16	0.26	0.10	0.14	0.13	0.10	0.19	0.35	0.43	0.03	0.22	0.28	0.10	0.00	0.18	0.29	0.06
C4'	0.28	0.03	0.42	0.42	0.00	0.31	0.15	0.21	0.24	0.20	0.06	0.05	0.52	0.39	0.07	0.20	0.45	0.44	0.33	0.33
C5	0.15	0.37	0.03	0.21	0.28	0.12	0.16	0.14	0.12	0.22	0.37	0.47	0.02	0.28	0.30	0.10	0.05	0.22	0.30	0.10
C5'	0.24	0.05	0.36	0.36	0.05	0.26	0.18	0.18	0.23	0.18	0.01	0.03	0.45	0.32	0.00	0.16	0.41	0.41	0.31	0.30
C6	0.03	0.33	0.17	0.32	0.27	0.22	0.14	0.18	0.07	0.15	0.35	0.42	0.19	0.38	0.30	0.01	0.20	0.32	0.32	0.18
N1	0.08	0.22	0.22	0.34	0.22	0.26	0.09	0.19	0.00	0.05	0.28	0.30	0.27	0.38	0.26	0.09	0.26	0.35	0.31	0.22
N3	0.05	0.27	0.08	0.21	0.23	0.15	0.11	0.14	0.06	0.13	0.30	0.36	0.07	0.27	0.26	0.03	0.07	0.22	0.28	0.11
O2	0.09	0.15	0.19	0.30	0.17	0.24	0.06	0.17	0.02	0.01	0.22	0.20	0.22	0.34	0.22	0.10	0.23	0.33	0.29	0.20
O2'	0.79	0.67	0.72	0.74	0.48	0.77	0.56	0.68	0.68	0.76	0.52	0.63	0.64	0.66	0.37	0.79	0.84	0.85	0.76	0.79
O3'	0.00	0.30	0.21	0.18	0.25	0.01	0.04	0.09	0.03	0.08	0.40	0.42	0.39	0.15	0.31	0.11	0.14	0.10	0.03	0.03
O4	0.19	0.35	0.05	0.08	0.26	0.04	0.14	0.10	0.12	0.22	0.35	0.46	0.11	0.12	0.27	0.16	0.11	0.10	0.28	0.00
O4'	0.12	0.16	0.25	0.29	0.18	0.19	0.04	0.09	0.04	0.01	0.24	0.24	0.35	0.29	0.24	0.06	0.31	0.33	0.21	0.19
O5'	0.16	0.06	0.29	0.32	0.05	0.22	0.08	0.15	0.14	0.09	0.12	0.13	0.37	0.31	0.11	0.11	0.30	0.33	0.27	0.23
OP1	0.08	0.08	0.16	0.20	0.07	0.15	0.03	0.09	0.07	0.03	0.12	0.13	0.20	0.20	0.10	0.04	0.22	0.28	0.22	0.16
OP2	0.18	0.01	0.29	0.31	0.03	0.22	0.15	0.15	0.19	0.13	0.04	0.06	0.36	0.28	0.01	0.12	0.32	0.34	0.27	0.24
P	0.12	0.06	0.23	0.27	0.05	0.19	0.07	0.12	0.12	0.07	0.11	0.13	0.30	0.27	0.09	0.08	0.26	0.30	0.25	0.19

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.08	0.01	0.00	0.15	0.15	0.11	0.07
C2	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.10	0.01	0.01	0.33	0.26	0.07	0.17
C2'	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.03	0.03	0.03	0.02	0.01	0.02	0.00	0.03	0.03	0.00	0.11	0.02	0.10	0.06
C3'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.22	0.06	0.13	0.12
C4	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.06	0.00	0.16	0.00	0.01	0.00	0.01	0.06	0.07	0.00	0.02	0.26	0.17	0.03	0.13
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.06	0.00	0.06	0.00	0.06	0.04	0.04	0.01	0.00	0.03	0.06	0.01	0.02	0.09	0.14	0.02
C5	0.00	0.00	0.03	0.00	0.00	0.06	0.00	0.18	0.00	0.01	0.00	0.00	0.08	0.04	0.00	0.01	0.13	0.06	0.07	0.04
C5'	0.06	0.11	0.03	0.03	0.16	0.00	0.18	0.00	0.16	0.12	0.14	0.08	0.02	0.03	0.17	0.02	0.01	0.12	0.15	0.00
C6	0.00	0.00	0.03	0.00	0.00	0.06	0.00	0.16	0.00	0.00	0.00	0.00	0.08	0.04	0.00	0.01	0.09	0.05	0.02	0.02
N1	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.04	0.01	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.07	0.01	0.01	0.21	0.16	0.06	0.09
N3	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.04	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.09	0.01	0.02	0.34	0.25	0.03	0.18
O2	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.13	0.01	0.01	0.38	0.33	0.12	0.21
O2'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.06	0.00	0.08	0.02	0.08	0.04	0.03	0.02	0.00	0.03	0.07	0.01	0.15	0.05	0.10	0.08
O3'	0.08	0.10	0.03	0.00	0.07	0.03	0.04	0.03	0.04	0.07	0.09	0.13	0.03	0.00	0.07	0.11	0.22	0.05	0.15	0.12
O4	0.01	0.01	0.03	0.00	0.00	0.06	0.00	0.17	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.07	0.00	0.02	0.27	0.17	0.06	0.13
O4'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.11	0.02	0.00	0.31	0.25	0.18	0.14
O5'	0.15	0.33	0.11	0.22	0.26	0.02	0.13	0.01	0.09	0.21	0.34	0.38	0.15	0.22	0.27	0.31	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.15	0.26	0.02	0.06	0.17	0.09	0.06	0.12	0.05	0.16	0.25	0.33	0.05	0.05	0.17	0.25	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.11	0.07	0.10	0.13	0.03	0.14	0.07	0.15	0.02	0.06	0.03	0.12	0.10	0.15	0.06	0.18	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.07	0.17	0.06	0.12	0.13	0.02	0.04	0.00	0.02	0.09	0.18	0.21	0.08	0.12	0.13	0.14	0.00	0.00	0.00	0.00