Doublet Group distance statistics: 49093

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.001, 0.004, 0.008, 0.009 max_d=0.009 avg_d=0.004 std_dev=0.004
N3	A	0, 0.002, 0.006, 0.009, 0.009 max_d=0.009 avg_d=0.006 std_dev=0.004
N1	A	0, 0.003, 0.011, 0.019, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.011 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.004, 0.014, 0.024, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.014 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.004, 0.014, 0.024, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.014 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.004, 0.014, 0.024, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.014 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.004, 0.015, 0.026, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.015 std_dev=0.011
O2	A	0, 0.009, 0.032, 0.054, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.032 std_dev=0.023
O4	A	0, 0.012, 0.043, 0.074, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.043 std_dev=0.031
O4'	A	0, 0.006, 0.090, 0.174, 0.203 max_d=0.203 avg_d=0.090 std_dev=0.084
C2'	A	0, 0.022, 0.108, 0.194, 0.211 max_d=0.211 avg_d=0.108 std_dev=0.086
O2'	A	0, 0.037, 0.140, 0.243, 0.244 max_d=0.244 avg_d=0.140 std_dev=0.103
C3'	A	0, 0.006, 0.161, 0.316, 0.370 max_d=0.370 avg_d=0.161 std_dev=0.155
C4'	A	0, -0.019, 0.141, 0.301, 0.365 max_d=0.365 avg_d=0.141 std_dev=0.160
O3'	A	0, 0.013, 0.249, 0.485, 0.566 max_d=0.566 avg_d=0.249 std_dev=0.236
C5'	A	0, 0.005, 0.248, 0.491, 0.578 max_d=0.578 avg_d=0.248 std_dev=0.243
O5'	A	0, 0.051, 0.318, 0.585, 0.653 max_d=0.653 avg_d=0.318 std_dev=0.267
O4'	B	0, -0.031, 0.294, 0.618, 0.746 max_d=0.746 avg_d=0.294 std_dev=0.325
O2	B	0, -0.002, 0.330, 0.661, 0.784 max_d=0.784 avg_d=0.330 std_dev=0.332
C1'	B	0, -0.054, 0.343, 0.741, 0.900 max_d=0.900 avg_d=0.343 std_dev=0.397
P	A	0, 0.029, 0.434, 0.839, 0.975 max_d=0.975 avg_d=0.434 std_dev=0.405
C4'	B	0, -0.051, 0.357, 0.764, 0.927 max_d=0.927 avg_d=0.357 std_dev=0.407
C2	B	0, -0.020, 0.392, 0.804, 0.961 max_d=0.961 avg_d=0.392 std_dev=0.412
OP1	A	0, 0.162, 0.580, 0.997, 0.968 max_d=0.968 avg_d=0.580 std_dev=0.418
N1	B	0, -0.036, 0.414, 0.863, 1.038 max_d=1.038 avg_d=0.414 std_dev=0.449
N3	B	0, 0.006, 0.501, 0.996, 1.175 max_d=1.175 avg_d=0.501 std_dev=0.495
O2'	B	0, -0.068, 0.443, 0.953, 1.158 max_d=1.158 avg_d=0.443 std_dev=0.511
OP2	A	0, 0.105, 0.642, 1.179, 1.314 max_d=1.314 avg_d=0.642 std_dev=0.537
C2'	B	0, -0.090, 0.453, 0.996, 1.217 max_d=1.217 avg_d=0.453 std_dev=0.543
C5'	B	0, -0.098, 0.445, 0.989, 1.210 max_d=1.210 avg_d=0.445 std_dev=0.543
C3'	B	0, -0.081, 0.463, 1.008, 1.228 max_d=1.228 avg_d=0.463 std_dev=0.545
O3'	B	0, -0.002, 0.548, 1.099, 1.301 max_d=1.301 avg_d=0.548 std_dev=0.550
C6	B	0, -0.022, 0.537, 1.096, 1.307 max_d=1.307 avg_d=0.537 std_dev=0.559
C4	B	0, 0.020, 0.643, 1.265, 1.485 max_d=1.485 avg_d=0.643 std_dev=0.622
C5	B	0, 0.007, 0.658, 1.309, 1.544 max_d=1.544 avg_d=0.658 std_dev=0.651
O5'	B	0, -0.105, 0.557, 1.219, 1.487 max_d=1.487 avg_d=0.557 std_dev=0.662
O4	B	0, 0.050, 0.751, 1.453, 1.689 max_d=1.689 avg_d=0.751 std_dev=0.702
P	B	0, -0.007, 0.723, 1.452, 1.722 max_d=1.722 avg_d=0.723 std_dev=0.730
OP2	B	0, 0.074, 0.837, 1.600, 1.845 max_d=1.845 avg_d=0.837 std_dev=0.763
OP1	B	0, 0.005, 0.778, 1.551, 1.832 max_d=1.832 avg_d=0.778 std_dev=0.773

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.00	0.04	0.05	0.11	0.05
C2	0.01	0.00	0.03	0.06	0.01	0.05	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.05	0.01	0.03	0.06	0.03	0.12	0.04
C2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.06	0.00	0.03	0.03	0.00	0.02	0.04	0.07	0.03
C3'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.05	0.09	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.03	0.03	0.01
C4	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.03	0.00	0.03	0.07	0.09	0.19	0.10
C4'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.01	0.00	0.04	0.00	0.04	0.01	0.04	0.10	0.03	0.02	0.01	0.00	0.00	0.05	0.02	0.01
C5	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.04	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.05	0.13	0.15	0.24	0.17
C5'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.05	0.02	0.08	0.17	0.03	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.02	0.00
C6	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.05	0.12	0.14	0.21	0.15
N1	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.05	0.14	0.06
N3	0.01	0.00	0.03	0.05	0.01	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.05	0.01	0.01	0.04	0.02	0.14	0.04
O2	0.01	0.00	0.06	0.09	0.01	0.10	0.01	0.17	0.01	0.01	0.00	0.00	0.10	0.09	0.01	0.06	0.13	0.12	0.14	0.12
O2'	0.01	0.06	0.00	0.01	0.03	0.03	0.00	0.03	0.02	0.01	0.06	0.10	0.00	0.06	0.04	0.03	0.04	0.07	0.04	0.03
O3'	0.03	0.05	0.03	0.01	0.03	0.02	0.02	0.01	0.03	0.01	0.05	0.09	0.06	0.00	0.03	0.03	0.01	0.05	0.05	0.03
O4	0.02	0.01	0.03	0.03	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.03	0.00	0.03	0.07	0.10	0.21	0.11
O4'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.05	0.01	0.01	0.06	0.03	0.03	0.03	0.00	0.04	0.05	0.10	0.04
O5'	0.04	0.06	0.02	0.01	0.07	0.00	0.13	0.00	0.12	0.05	0.04	0.13	0.04	0.01	0.07	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00
OP1	0.05	0.03	0.04	0.03	0.09	0.05	0.15	0.03	0.14	0.05	0.02	0.12	0.07	0.05	0.10	0.05	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.11	0.12	0.07	0.03	0.19	0.02	0.24	0.02	0.21	0.14	0.14	0.14	0.04	0.05	0.21	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00
P	0.05	0.04	0.03	0.01	0.10	0.01	0.17	0.00	0.15	0.06	0.04	0.12	0.03	0.03	0.11	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.06	0.08	0.04	0.04	0.09	0.04	0.08	0.00	0.07	0.07	0.09	0.10	0.02	0.05	0.10	0.06	0.01	0.08	0.06	0.06
C2	0.00	0.02	0.02	0.03	0.06	0.04	0.08	0.11	0.06	0.02	0.03	0.06	0.02	0.08	0.07	0.03	0.12	0.19	0.19	0.19
C2'	0.05	0.06	0.03	0.03	0.08	0.03	0.08	0.01	0.06	0.05	0.07	0.08	0.01	0.05	0.10	0.04	0.02	0.09	0.08	0.07
C3'	0.06	0.08	0.05	0.05	0.09	0.04	0.08	0.01	0.06	0.06	0.09	0.11	0.04	0.08	0.10	0.05	0.01	0.06	0.06	0.05
C4	0.05	0.02	0.07	0.09	0.05	0.12	0.06	0.17	0.07	0.04	0.04	0.05	0.06	0.08	0.07	0.09	0.17	0.22	0.21	0.22
C4'	0.06	0.08	0.05	0.05	0.08	0.05	0.07	0.02	0.05	0.06	0.08	0.10	0.03	0.07	0.09	0.05	0.02	0.03	0.03	0.03
C5	0.01	0.08	0.04	0.09	0.11	0.10	0.08	0.13	0.05	0.05	0.11	0.09	0.06	0.10	0.13	0.02	0.11	0.16	0.12	0.14
C5'	0.07	0.09	0.07	0.08	0.08	0.06	0.06	0.04	0.05	0.07	0.09	0.12	0.05	0.10	0.09	0.05	0.04	0.00	0.04	0.03
C6	0.05	0.10	0.01	0.04	0.12	0.03	0.10	0.06	0.07	0.07	0.11	0.11	0.02	0.06	0.13	0.04	0.05	0.11	0.08	0.09
N1	0.04	0.07	0.02	0.03	0.08	0.02	0.07	0.06	0.05	0.04	0.07	0.09	0.01	0.06	0.09	0.02	0.07	0.13	0.11	0.12
N3	0.04	0.01	0.05	0.06	0.07	0.09	0.09	0.15	0.09	0.05	0.03	0.04	0.04	0.07	0.07	0.08	0.17	0.23	0.24	0.24
O2	0.01	0.01	0.02	0.03	0.08	0.03	0.10	0.10	0.08	0.03	0.03	0.05	0.02	0.10	0.09	0.03	0.13	0.20	0.22	0.21
O2'	0.06	0.07	0.05	0.04	0.09	0.05	0.10	0.03	0.08	0.06	0.07	0.08	0.03	0.05	0.10	0.06	0.03	0.09	0.06	0.06
O3'	0.04	0.06	0.03	0.03	0.07	0.01	0.07	0.04	0.05	0.04	0.07	0.10	0.02	0.06	0.09	0.03	0.05	0.12	0.10	0.10
O4	0.10	0.03	0.11	0.13	0.05	0.16	0.08	0.20	0.10	0.08	0.03	0.01	0.09	0.10	0.06	0.15	0.21	0.25	0.25	0.26
O4'	0.06	0.08	0.05	0.05	0.08	0.05	0.07	0.02	0.06	0.06	0.08	0.10	0.02	0.06	0.09	0.05	0.02	0.02	0.03	0.03
O5'	0.07	0.07	0.09	0.10	0.03	0.07	0.02	0.07	0.03	0.06	0.06	0.10	0.09	0.11	0.03	0.05	0.07	0.02	0.07	0.06
OP1	0.04	0.02	0.06	0.08	0.02	0.06	0.03	0.08	0.03	0.03	0.01	0.02	0.08	0.07	0.02	0.04	0.08	0.09	0.08	0.09
OP2	0.16	0.16	0.12	0.10	0.18	0.13	0.19	0.12	0.18	0.17	0.17	0.13	0.15	0.07	0.19	0.18	0.13	0.13	0.13	0.12
P	0.04	0.03	0.04	0.03	0.06	0.03	0.07	0.03	0.06	0.05	0.04	0.01	0.07	0.04	0.06	0.06	0.02	0.03	0.02	0.02

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01
C2	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.07	0.00	0.00	0.03	0.04	0.07	0.06
C2'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.03	0.05	0.06	0.04
C3'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.04	0.02	0.00	0.02	0.00	0.03	0.07	0.06	0.05
C4	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.04	0.00	0.01	0.07	0.11	0.15	0.12
C4'	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.03	0.01	0.00
C5	0.00	0.00	0.02	0.03	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.02	0.00	0.01	0.09	0.12	0.16	0.12
C5'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.05	0.00	0.06	0.00	0.05	0.03	0.03	0.01	0.00	0.00	0.06	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00
C6	0.00	0.00	0.02	0.03	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.02	0.00	0.01	0.07	0.09	0.11	0.09
N1	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.03	0.00	0.00	0.04	0.04	0.06	0.05
N3	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.06	0.00	0.00	0.06	0.08	0.11	0.09
O2	0.02	0.00	0.03	0.04	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.10	0.01	0.02	0.01	0.01	0.05	0.04
O2'	0.01	0.04	0.00	0.02	0.05	0.02	0.04	0.00	0.02	0.02	0.05	0.05	0.00	0.02	0.05	0.02	0.03	0.07	0.09	0.06
O3'	0.04	0.07	0.01	0.00	0.04	0.01	0.02	0.00	0.02	0.03	0.06	0.10	0.02	0.00	0.04	0.02	0.03	0.10	0.08	0.06
O4	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.01	0.05	0.04	0.00	0.01	0.08	0.13	0.17	0.13
O4'	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.03
O5'	0.00	0.03	0.03	0.03	0.07	0.00	0.09	0.00	0.07	0.04	0.06	0.01	0.03	0.03	0.08	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00
OP1	0.01	0.04	0.05	0.07	0.11	0.03	0.12	0.02	0.09	0.04	0.08	0.01	0.07	0.10	0.13	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00
OP2	0.02	0.07	0.06	0.06	0.15	0.01	0.16	0.00	0.11	0.06	0.11	0.05	0.09	0.08	0.17	0.04	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.01	0.06	0.04	0.05	0.12	0.00	0.12	0.00	0.09	0.05	0.09	0.04	0.06	0.06	0.13	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00