Doublet Group distance statistics: 49098

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.000, 0.006, 0.012, 0.012 max_d=0.012 avg_d=0.006 std_dev=0.006
N3	A	0, 0.000, 0.012, 0.023, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.012 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.000, 0.012, 0.024, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.012 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.000, 0.016, 0.032, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.016 std_dev=0.016
C4	A	0, 0.000, 0.018, 0.036, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.018 std_dev=0.018
C6	A	0, 0.000, 0.018, 0.037, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.018 std_dev=0.018
C2	A	0, 0.000, 0.021, 0.042, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.021 std_dev=0.021
O2	A	0, 0.000, 0.051, 0.103, 0.103 max_d=0.103 avg_d=0.051 std_dev=0.051
O4	A	0, 0.000, 0.088, 0.176, 0.176 max_d=0.176 avg_d=0.088 std_dev=0.088
O3'	A	0, 0.000, 0.182, 0.363, 0.363 max_d=0.363 avg_d=0.182 std_dev=0.182
O2'	B	0, 0.000, 0.283, 0.567, 0.567 max_d=0.567 avg_d=0.283 std_dev=0.283
O4'	A	0, 0.000, 0.292, 0.584, 0.584 max_d=0.584 avg_d=0.292 std_dev=0.292
C2'	A	0, 0.000, 0.301, 0.602, 0.602 max_d=0.602 avg_d=0.301 std_dev=0.301
C3'	A	0, 0.000, 0.325, 0.650, 0.650 max_d=0.650 avg_d=0.325 std_dev=0.325
C4'	A	0, 0.000, 0.408, 0.816, 0.816 max_d=0.816 avg_d=0.408 std_dev=0.408
C2'	B	0, 0.000, 0.427, 0.855, 0.855 max_d=0.855 avg_d=0.427 std_dev=0.427
O2'	A	0, 0.000, 0.457, 0.915, 0.915 max_d=0.915 avg_d=0.457 std_dev=0.457
C3'	B	0, 0.000, 0.484, 0.968, 0.968 max_d=0.968 avg_d=0.484 std_dev=0.484
O3'	B	0, 0.000, 0.543, 1.086, 1.086 max_d=1.086 avg_d=0.543 std_dev=0.543
C4'	B	0, 0.000, 0.585, 1.169, 1.169 max_d=1.169 avg_d=0.585 std_dev=0.585
O4'	B	0, 0.000, 0.640, 1.280, 1.280 max_d=1.280 avg_d=0.640 std_dev=0.640
C5'	A	0, 0.000, 0.739, 1.478, 1.478 max_d=1.478 avg_d=0.739 std_dev=0.739
O5'	A	0, 0.000, 0.819, 1.638, 1.638 max_d=1.638 avg_d=0.819 std_dev=0.819
C1'	B	0, 0.000, 1.003, 2.006, 2.006 max_d=2.006 avg_d=1.003 std_dev=1.003
C5'	B	0, 0.000, 1.443, 2.887, 2.887 max_d=2.887 avg_d=1.443 std_dev=1.443
P	A	0, 0.000, 1.495, 2.989, 2.989 max_d=2.989 avg_d=1.495 std_dev=1.495
O5'	B	0, 0.000, 1.888, 3.776, 3.776 max_d=3.776 avg_d=1.888 std_dev=1.888
N1	B	0, 0.000, 2.020, 4.039, 4.039 max_d=4.039 avg_d=2.020 std_dev=2.020
OP2	A	0, 0.000, 2.159, 4.318, 4.318 max_d=4.318 avg_d=2.159 std_dev=2.159
C6	B	0, 0.000, 2.444, 4.888, 4.888 max_d=4.888 avg_d=2.444 std_dev=2.444
OP1	A	0, 0.000, 2.505, 5.011, 5.011 max_d=5.011 avg_d=2.505 std_dev=2.505
P	B	0, 0.000, 2.718, 5.436, 5.436 max_d=5.436 avg_d=2.718 std_dev=2.718
C2	B	0, 0.000, 2.853, 5.706, 5.706 max_d=5.706 avg_d=2.853 std_dev=2.853
O2	B	0, 0.000, 3.013, 6.025, 6.025 max_d=6.025 avg_d=3.013 std_dev=3.013
OP1	B	0, 0.000, 3.236, 6.471, 6.471 max_d=6.471 avg_d=3.236 std_dev=3.236
OP2	B	0, 0.000, 3.264, 6.529, 6.529 max_d=6.529 avg_d=3.264 std_dev=3.264
C5	B	0, 0.000, 3.429, 6.858, 6.858 max_d=6.858 avg_d=3.429 std_dev=3.429
N3	B	0, 0.000, 3.751, 7.502, 7.502 max_d=7.502 avg_d=3.751 std_dev=3.751
C4	B	0, 0.000, 4.044, 8.088, 8.088 max_d=8.088 avg_d=4.044 std_dev=4.044
O4	B	0, 0.000, 4.935, 9.870, 9.870 max_d=9.870 avg_d=4.935 std_dev=4.935

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.00	0.05	0.04	0.27	0.06
C2	0.01	0.00	0.05	0.01	0.01	0.05	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.11	0.03	0.02	0.09	0.01	0.36	0.39	0.04
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.02	0.01	0.03	0.04	0.05	0.00	0.04	0.06	0.00	0.01	0.04	0.00	0.08	0.25	0.35	0.17
C3'	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.05	0.40	0.10	0.17
C4	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.03	0.01	0.02	0.03	0.54	0.48	0.08
C4'	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.05	0.00	0.05	0.10	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.13	0.06	0.05
C5	0.00	0.01	0.03	0.01	0.00	0.03	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.00	0.01	0.03	0.06	0.45	0.47	0.05
C5'	0.03	0.03	0.04	0.02	0.02	0.01	0.08	0.00	0.11	0.04	0.03	0.08	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.08	0.21	0.01
C6	0.00	0.01	0.05	0.01	0.00	0.05	0.00	0.11	0.00	0.00	0.01	0.02	0.08	0.00	0.01	0.06	0.08	0.29	0.43	0.01
N1	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.05	0.25	0.37	0.01
N3	0.01	0.00	0.04	0.01	0.01	0.05	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00	0.10	0.03	0.02	0.07	0.00	0.49	0.44	0.08
O2	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.10	0.01	0.08	0.02	0.02	0.00	0.00	0.15	0.04	0.02	0.14	0.02	0.32	0.34	0.05
O2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.05	0.00	0.04	0.04	0.08	0.01	0.10	0.15	0.00	0.00	0.08	0.00	0.09	0.36	0.47	0.23
O3'	0.02	0.03	0.01	0.00	0.03	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.03	0.04	0.00	0.00	0.04	0.01	0.04	0.42	0.08	0.16
O4	0.01	0.02	0.04	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.08	0.04	0.00	0.03	0.01	0.63	0.49	0.11
O4'	0.00	0.09	0.00	0.01	0.02	0.00	0.03	0.02	0.06	0.01	0.07	0.14	0.00	0.01	0.03	0.00	0.01	0.15	0.06	0.02
O5'	0.05	0.01	0.08	0.05	0.03	0.01	0.06	0.01	0.08	0.05	0.00	0.02	0.09	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.04	0.36	0.25	0.40	0.54	0.13	0.45	0.08	0.29	0.25	0.49	0.32	0.36	0.42	0.63	0.15	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.27	0.39	0.35	0.10	0.48	0.06	0.47	0.21	0.43	0.37	0.44	0.34	0.47	0.08	0.49	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.06	0.04	0.17	0.17	0.08	0.05	0.05	0.01	0.01	0.01	0.08	0.05	0.23	0.16	0.11	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.40	1.22	0.18	0.09	2.25	0.02	2.01	0.19	1.49	1.07	1.86	0.75	0.03	0.02	2.65	0.25	0.68	0.66	1.32	0.84
C2	0.24	0.76	0.17	0.14	1.93	0.05	1.91	0.37	1.41	0.85	1.35	0.12	0.01	0.03	2.27	0.19	0.87	0.98	1.56	1.10
C2'	0.36	1.19	0.11	0.01	2.09	0.15	1.84	0.01	1.35	1.00	1.77	0.80	0.06	0.13	2.47	0.17	0.52	0.47	1.15	0.66
C3'	0.42	1.36	0.14	0.02	2.27	0.13	1.95	0.01	1.42	1.10	1.98	1.02	0.05	0.09	2.70	0.21	0.49	0.38	1.10	0.60
C4	0.15	0.47	0.14	0.12	1.39	0.02	1.52	0.33	1.20	0.67	0.90	0.15	0.01	0.03	1.53	0.11	0.80	0.91	1.38	0.99
C4'	0.50	1.52	0.21	0.10	2.42	0.06	2.04	0.05	1.50	1.21	2.17	1.20	0.03	0.04	2.85	0.28	0.52	0.37	1.07	0.60
C5	0.33	0.93	0.16	0.08	1.62	0.04	1.55	0.17	1.24	0.90	1.33	0.48	0.02	0.00	1.76	0.18	0.62	0.63	1.12	0.75
C5'	0.55	1.64	0.24	0.10	2.34	0.10	1.92	0.07	1.42	1.23	2.22	1.44	0.00	0.08	2.72	0.27	0.37	0.15	0.84	0.39
C6	0.40	1.17	0.17	0.07	1.94	0.04	1.76	0.14	1.35	1.03	1.67	0.75	0.03	0.02	2.18	0.23	0.60	0.57	1.14	0.73
N1	0.35	1.08	0.18	0.10	2.08	0.00	1.92	0.23	1.44	1.00	1.67	0.55	0.02	0.00	2.41	0.23	0.72	0.74	1.34	0.89
N3	0.15	0.47	0.16	0.15	1.60	0.07	1.73	0.41	1.30	0.69	0.98	0.22	0.00	0.05	1.84	0.14	0.91	1.07	1.59	1.15
O2	0.22	0.69	0.17	0.15	1.96	0.07	1.96	0.43	1.43	0.82	1.30	0.01	0.02	0.03	2.37	0.20	0.94	1.10	1.70	1.21
O2'	0.30	1.00	0.07	0.04	1.94	0.15	1.77	0.04	1.30	0.90	1.55	0.57	0.05	0.20	2.31	0.14	0.57	0.58	1.26	0.76
O3'	0.43	1.33	0.17	0.05	2.36	0.07	2.07	0.10	1.51	1.12	1.99	0.93	0.04	0.07	2.84	0.26	0.61	0.54	1.28	0.76
O4	0.03	0.01	0.09	0.12	0.87	0.02	1.16	0.37	0.95	0.36	0.33	0.66	0.00	0.05	0.96	0.00	0.84	1.01	1.40	1.04
O4'	0.48	1.45	0.23	0.14	2.44	0.01	2.10	0.18	1.55	1.20	2.13	1.04	0.02	0.07	2.87	0.31	0.64	0.56	1.21	0.76
O5'	0.45	1.48	0.15	0.00	2.08	0.23	1.70	0.22	1.25	1.10	1.99	1.32	0.05	0.03	2.40	0.14	0.24	0.02	0.69	0.25
OP1	0.43	0.66	0.65	0.83	1.10	1.20	0.64	1.32	0.22	0.17	1.11	0.66	0.78	0.73	1.43	0.85	0.88	1.19	0.53	0.96
OP2	0.67	1.60	0.45	0.24	2.00	0.13	1.65	0.25	1.28	1.21	1.98	1.55	0.37	0.23	2.26	0.24	0.24	0.07	0.64	0.19
P	0.21	1.24	0.08	0.25	1.67	0.56	1.26	0.65	0.86	0.79	1.66	1.20	0.22	0.24	1.96	0.18	0.20	0.49	0.18	0.25

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.23	0.01	0.01	0.11	0.10	0.09	0.07
C2	0.00	0.00	0.12	0.17	0.01	0.01	0.02	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.07	0.09	0.01	0.10	0.03	0.04	0.09	0.05
C2'	0.00	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.09	0.16	0.12	0.01	0.09	0.19	0.00	0.03	0.00	0.01	0.37	0.41	0.48	0.40
C3'	0.00	0.17	0.01	0.00	0.29	0.00	0.30	0.03	0.25	0.18	0.24	0.08	0.01	0.01	0.30	0.01	0.11	0.19	0.11	0.13
C4	0.01	0.01	0.00	0.29	0.00	0.09	0.01	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.26	0.13	0.01	0.01	0.19	0.23	0.28	0.21
C4'	0.01	0.01	0.01	0.00	0.09	0.00	0.15	0.01	0.15	0.06	0.03	0.09	0.23	0.02	0.09	0.00	0.02	0.04	0.01	0.01
C5	0.01	0.02	0.09	0.30	0.01	0.15	0.00	0.09	0.00	0.01	0.01	0.02	0.32	0.20	0.02	0.06	0.23	0.26	0.27	0.24
C5'	0.07	0.07	0.16	0.03	0.03	0.01	0.09	0.00	0.08	0.02	0.03	0.15	0.08	0.14	0.03	0.02	0.01	0.03	0.02	0.01
C6	0.01	0.01	0.12	0.25	0.00	0.15	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.02	0.28	0.14	0.02	0.09	0.16	0.16	0.14	0.15
N1	0.00	0.01	0.01	0.18	0.01	0.06	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.14	0.04	0.01	0.01	0.03	0.04	0.05	0.05
N3	0.00	0.00	0.09	0.24	0.01	0.03	0.01	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.15	0.01	0.00	0.07	0.11	0.14	0.20	0.14
O2	0.01	0.00	0.19	0.08	0.01	0.09	0.02	0.15	0.02	0.02	0.00	0.00	0.07	0.25	0.01	0.17	0.05	0.05	0.03	0.01
O2'	0.02	0.07	0.00	0.01	0.26	0.23	0.32	0.08	0.28	0.14	0.15	0.07	0.00	0.05	0.29	0.17	0.27	0.32	0.51	0.32
O3'	0.23	0.09	0.03	0.01	0.13	0.02	0.20	0.14	0.14	0.04	0.01	0.25	0.05	0.00	0.16	0.15	0.08	0.08	0.07	0.08
O4	0.01	0.01	0.00	0.30	0.01	0.09	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.29	0.16	0.00	0.02	0.21	0.27	0.32	0.24
O4'	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.06	0.02	0.09	0.01	0.07	0.17	0.17	0.15	0.02	0.00	0.03	0.06	0.09	0.09
O5'	0.11	0.03	0.37	0.11	0.19	0.02	0.23	0.01	0.16	0.03	0.11	0.05	0.27	0.08	0.21	0.03	0.00	0.00	0.00	0.01
OP1	0.10	0.04	0.41	0.19	0.23	0.04	0.26	0.03	0.16	0.04	0.14	0.05	0.32	0.08	0.27	0.06	0.00	0.00	0.01	0.00
OP2	0.09	0.09	0.48	0.11	0.28	0.01	0.27	0.02	0.14	0.05	0.20	0.03	0.51	0.07	0.32	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00
P	0.07	0.05	0.40	0.13	0.21	0.01	0.24	0.01	0.15	0.05	0.14	0.01	0.32	0.08	0.24	0.09	0.01	0.00	0.00	0.00