Doublet Group distance statistics: 49099

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.000, 0.017, 0.033, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.017 std_dev=0.017
C5	A	0, 0.000, 0.025, 0.051, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.025 std_dev=0.025
C4	A	0, 0.000, 0.026, 0.051, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.026 std_dev=0.026
C2	A	0, 0.000, 0.027, 0.054, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.027 std_dev=0.027
N1	A	0, 0.000, 0.028, 0.056, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.028 std_dev=0.028
C6	A	0, 0.000, 0.039, 0.078, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.039 std_dev=0.039
C1'	A	0, 0.000, 0.040, 0.079, 0.079 max_d=0.079 avg_d=0.040 std_dev=0.040
O2	A	0, 0.000, 0.044, 0.087, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.044 std_dev=0.044
O4	A	0, 0.000, 0.093, 0.186, 0.186 max_d=0.186 avg_d=0.093 std_dev=0.093
O2	B	0, 0.000, 0.284, 0.569, 0.569 max_d=0.569 avg_d=0.284 std_dev=0.284
C2	B	0, 0.000, 0.302, 0.604, 0.604 max_d=0.604 avg_d=0.302 std_dev=0.302
N3	B	0, 0.000, 0.318, 0.636, 0.636 max_d=0.636 avg_d=0.318 std_dev=0.318
N1	B	0, 0.000, 0.324, 0.647, 0.647 max_d=0.647 avg_d=0.324 std_dev=0.324
C6	B	0, 0.000, 0.334, 0.668, 0.668 max_d=0.668 avg_d=0.334 std_dev=0.334
C5	B	0, 0.000, 0.340, 0.681, 0.681 max_d=0.681 avg_d=0.340 std_dev=0.340
C4	B	0, 0.000, 0.353, 0.705, 0.705 max_d=0.705 avg_d=0.353 std_dev=0.353
C1'	B	0, 0.000, 0.423, 0.846, 0.846 max_d=0.846 avg_d=0.423 std_dev=0.423
O2'	B	0, 0.000, 0.442, 0.884, 0.884 max_d=0.884 avg_d=0.442 std_dev=0.442
C2'	B	0, 0.000, 0.461, 0.921, 0.921 max_d=0.921 avg_d=0.461 std_dev=0.461
C3'	B	0, 0.000, 0.511, 1.023, 1.023 max_d=1.023 avg_d=0.511 std_dev=0.511
O4'	B	0, 0.000, 0.516, 1.033, 1.033 max_d=1.033 avg_d=0.516 std_dev=0.516
O4	B	0, 0.000, 0.530, 1.060, 1.060 max_d=1.060 avg_d=0.530 std_dev=0.530
O3'	B	0, 0.000, 0.568, 1.136, 1.136 max_d=1.136 avg_d=0.568 std_dev=0.568
C4'	B	0, 0.000, 0.677, 1.354, 1.354 max_d=1.354 avg_d=0.677 std_dev=0.677
O5'	B	0, 0.000, 0.726, 1.452, 1.452 max_d=1.452 avg_d=0.726 std_dev=0.726
C2'	A	0, 0.000, 0.756, 1.513, 1.513 max_d=1.513 avg_d=0.756 std_dev=0.756
OP2	B	0, 0.000, 0.813, 1.626, 1.626 max_d=1.626 avg_d=0.813 std_dev=0.813
P	B	0, 0.000, 0.817, 1.634, 1.634 max_d=1.634 avg_d=0.817 std_dev=0.817
O4'	A	0, 0.000, 0.838, 1.676, 1.676 max_d=1.676 avg_d=0.838 std_dev=0.838
OP1	B	0, 0.000, 0.848, 1.697, 1.697 max_d=1.697 avg_d=0.848 std_dev=0.848
C5'	B	0, 0.000, 0.864, 1.729, 1.729 max_d=1.729 avg_d=0.864 std_dev=0.864
O2'	A	0, 0.000, 1.135, 2.269, 2.269 max_d=2.269 avg_d=1.135 std_dev=1.135
C3'	A	0, 0.000, 1.161, 2.323, 2.323 max_d=2.323 avg_d=1.161 std_dev=1.161
C4'	A	0, 0.000, 1.229, 2.458, 2.458 max_d=2.458 avg_d=1.229 std_dev=1.229
O3'	A	0, 0.000, 1.429, 2.858, 2.858 max_d=2.858 avg_d=1.429 std_dev=1.429
OP1	A	0, 0.000, 1.440, 2.880, 2.880 max_d=2.880 avg_d=1.440 std_dev=1.440
P	A	0, 0.000, 1.485, 2.971, 2.971 max_d=2.971 avg_d=1.485 std_dev=1.485
OP2	A	0, 0.000, 1.597, 3.195, 3.195 max_d=3.195 avg_d=1.597 std_dev=1.597
C5'	A	0, 0.000, 1.695, 3.390, 3.390 max_d=3.390 avg_d=1.695 std_dev=1.695
O5'	A	0, 0.000, 1.956, 3.912, 3.912 max_d=3.912 avg_d=1.956 std_dev=1.956

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.10	0.04	0.01	0.01	0.02	0.05	0.24	0.02	0.00	0.12	0.04	0.57	0.04
C2	0.01	0.00	0.19	0.26	0.00	0.00	0.01	0.11	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.04	0.02	0.13	0.38	0.24	0.19	0.22
C2'	0.01	0.19	0.00	0.00	0.00	0.01	0.12	0.20	0.16	0.01	0.12	0.34	0.01	0.01	0.01	0.01	0.19	0.48	1.09	0.54
C3'	0.01	0.26	0.00	0.00	0.31	0.01	0.27	0.01	0.22	0.20	0.30	0.24	0.04	0.01	0.34	0.02	0.04	0.22	0.64	0.27
C4	0.02	0.00	0.00	0.31	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.25	0.12	0.00	0.04	0.61	0.48	0.23	0.51
C4'	0.00	0.00	0.01	0.01	0.11	0.00	0.17	0.00	0.17	0.06	0.04	0.06	0.31	0.02	0.12	0.00	0.01	0.17	0.41	0.02
C5	0.04	0.01	0.12	0.27	0.01	0.17	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.31	0.14	0.03	0.17	0.62	0.48	0.18	0.51
C5'	0.10	0.11	0.20	0.01	0.01	0.00	0.05	0.00	0.03	0.07	0.08	0.15	0.10	0.22	0.02	0.02	0.01	0.37	0.30	0.03
C6	0.04	0.01	0.16	0.22	0.01	0.17	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.02	0.27	0.08	0.02	0.22	0.50	0.34	0.15	0.32
N1	0.01	0.00	0.01	0.20	0.00	0.06	0.01	0.07	0.01	0.00	0.00	0.01	0.12	0.04	0.01	0.02	0.35	0.20	0.32	0.16
N3	0.01	0.00	0.12	0.30	0.01	0.04	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.13	0.04	0.02	0.08	0.50	0.36	0.04	0.37
O2	0.02	0.00	0.34	0.24	0.01	0.06	0.01	0.15	0.02	0.01	0.00	0.00	0.15	0.11	0.03	0.24	0.29	0.17	0.27	0.14
O2'	0.05	0.03	0.01	0.04	0.25	0.31	0.31	0.10	0.27	0.12	0.13	0.15	0.00	0.01	0.27	0.24	0.08	0.44	1.17	0.49
O3'	0.24	0.04	0.01	0.01	0.12	0.02	0.14	0.22	0.08	0.04	0.04	0.11	0.01	0.00	0.15	0.18	0.11	0.00	0.46	0.08
O4	0.02	0.02	0.01	0.34	0.00	0.12	0.03	0.02	0.02	0.01	0.02	0.03	0.27	0.15	0.00	0.05	0.67	0.58	0.43	0.61
O4'	0.00	0.13	0.01	0.02	0.04	0.00	0.17	0.02	0.22	0.02	0.08	0.24	0.24	0.18	0.05	0.00	0.23	0.39	0.24	0.23
O5'	0.12	0.38	0.19	0.04	0.61	0.01	0.62	0.01	0.50	0.35	0.50	0.29	0.08	0.11	0.67	0.23	0.00	0.05	0.03	0.00
OP1	0.04	0.24	0.48	0.22	0.48	0.17	0.48	0.37	0.34	0.20	0.36	0.17	0.44	0.00	0.58	0.39	0.05	0.00	0.00	0.00
OP2	0.57	0.19	1.09	0.64	0.23	0.41	0.18	0.30	0.15	0.32	0.04	0.27	1.17	0.46	0.43	0.24	0.03	0.00	0.00	0.01
P	0.04	0.22	0.54	0.27	0.51	0.02	0.51	0.03	0.32	0.16	0.37	0.14	0.49	0.08	0.61	0.23	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.13	0.14	0.09	0.09	0.09	0.13	0.02	0.02	0.03	0.09	0.15	0.16	0.07	0.04	0.19	0.13	0.13	0.13	0.01	0.04
C2	0.06	0.10	0.01	0.01	0.13	0.02	0.03	0.14	0.00	0.05	0.15	0.10	0.02	0.04	0.30	0.05	0.23	0.22	0.08	0.14
C2'	0.06	0.05	0.08	0.10	0.09	0.05	0.04	0.15	0.02	0.05	0.03	0.11	0.14	0.20	0.27	0.04	0.22	0.21	0.00	0.10
C3'	0.14	0.03	0.25	0.25	0.05	0.20	0.01	0.10	0.05	0.05	0.07	0.07	0.28	0.18	0.01	0.13	0.04	0.05	0.21	0.12
C4	0.13	0.18	0.05	0.05	0.25	0.06	0.17	0.08	0.12	0.14	0.23	0.15	0.01	0.01	0.37	0.12	0.18	0.21	0.04	0.11
C4'	0.03	0.23	0.10	0.10	0.37	0.05	0.31	0.09	0.22	0.16	0.34	0.20	0.18	0.09	0.37	0.06	0.17	0.16	0.04	0.10
C5	0.16	0.19	0.10	0.08	0.22	0.13	0.15	0.00	0.12	0.16	0.23	0.17	0.04	0.02	0.33	0.16	0.11	0.16	0.03	0.04
C5'	0.24	0.53	0.05	0.04	0.63	0.13	0.53	0.23	0.44	0.41	0.64	0.53	0.07	0.04	0.61	0.28	0.30	0.30	0.17	0.24
C6	0.14	0.16	0.09	0.08	0.16	0.12	0.09	0.00	0.07	0.11	0.19	0.15	0.04	0.02	0.28	0.14	0.11	0.15	0.03	0.03
N1	0.11	0.13	0.06	0.05	0.14	0.08	0.05	0.06	0.04	0.08	0.17	0.13	0.02	0.00	0.28	0.10	0.16	0.17	0.01	0.07
N3	0.07	0.12	0.00	0.00	0.20	0.00	0.09	0.16	0.04	0.07	0.18	0.10	0.04	0.04	0.36	0.06	0.24	0.23	0.09	0.16
O2	0.03	0.06	0.01	0.01	0.08	0.02	0.03	0.19	0.04	0.01	0.11	0.08	0.03	0.05	0.24	0.01	0.28	0.24	0.13	0.18
O2'	0.04	0.11	0.18	0.20	0.23	0.08	0.08	0.21	0.01	0.01	0.23	0.10	0.27	0.28	0.43	0.00	0.34	0.37	0.17	0.23
O3'	0.04	0.17	0.16	0.18	0.31	0.11	0.25	0.03	0.16	0.10	0.27	0.15	0.24	0.17	0.31	0.00	0.12	0.12	0.02	0.07
O4	0.15	0.19	0.07	0.06	0.26	0.06	0.21	0.09	0.16	0.17	0.23	0.16	0.00	0.02	0.36	0.14	0.18	0.24	0.07	0.14
O4'	0.09	0.04	0.14	0.15	0.29	0.13	0.27	0.04	0.16	0.05	0.16	0.05	0.21	0.16	0.30	0.06	0.16	0.15	0.06	0.09
O5'	0.33	0.01	0.57	0.57	0.05	0.47	0.10	0.40	0.20	0.18	0.12	0.09	0.67	0.52	0.06	0.30	0.36	0.36	0.51	0.43
OP1	0.60	0.30	0.75	0.79	0.19	0.78	0.30	0.72	0.41	0.43	0.18	0.27	0.81	0.77	0.16	0.62	0.61	0.55	0.67	0.64
OP2	0.53	0.09	0.74	0.82	0.05	0.76	0.11	0.70	0.27	0.29	0.07	0.05	0.81	0.83	0.10	0.56	0.59	0.52	0.58	0.58
P	0.53	0.21	0.71	0.74	0.12	0.70	0.25	0.64	0.36	0.37	0.09	0.14	0.79	0.70	0.10	0.54	0.55	0.51	0.64	0.59

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.03	0.02	0.03	0.03	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.07	0.06	0.01	0.03	0.01	0.22	0.10
C2	0.02	0.00	0.00	0.01	0.02	0.04	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.08	0.03	0.03	0.04	0.07	0.27	0.16
C2'	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.01	0.01	0.08	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.03	0.08	0.00	0.12	0.19	0.04	0.07
C3'	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.00	0.03	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.07	0.00	0.00	0.16	0.09	0.02
C4	0.03	0.02	0.03	0.04	0.00	0.01	0.01	0.10	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.02	0.09	0.09	0.26	0.13
C4'	0.02	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.08	0.03	0.06	0.02	0.01	0.01	0.08	0.11	0.03
C5	0.03	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.13	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.03	0.01	0.02	0.12	0.08	0.25	0.10
C5'	0.03	0.02	0.08	0.01	0.10	0.01	0.13	0.00	0.12	0.06	0.06	0.04	0.04	0.13	0.11	0.01	0.01	0.05	0.00	0.03
C6	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.12	0.00	0.01	0.01	0.03	0.04	0.03	0.03	0.02	0.11	0.05	0.25	0.10
N1	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.06	0.01	0.00	0.01	0.02	0.04	0.07	0.04	0.02	0.06	0.04	0.25	0.13
N3	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.07	0.02	0.02	0.07	0.08	0.27	0.15
O2	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.08	0.03	0.04	0.03	0.02	0.01	0.00	0.03	0.10	0.03	0.06	0.00	0.08	0.29	0.19
O2'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.03	0.02	0.04	0.04	0.04	0.00	0.03	0.00	0.03	0.08	0.01	0.13	0.25	0.03	0.11
O3'	0.07	0.08	0.03	0.00	0.03	0.06	0.03	0.13	0.03	0.07	0.07	0.10	0.03	0.00	0.01	0.03	0.08	0.11	0.10	0.03
O4	0.06	0.03	0.08	0.07	0.01	0.02	0.01	0.11	0.03	0.04	0.02	0.03	0.08	0.01	0.00	0.02	0.10	0.09	0.25	0.11
O4'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.06	0.01	0.03	0.02	0.00	0.04	0.08	0.28	0.18
O5'	0.03	0.04	0.12	0.00	0.09	0.01	0.12	0.01	0.11	0.06	0.07	0.00	0.13	0.08	0.10	0.04	0.00	0.01	0.00	0.01
OP1	0.01	0.07	0.19	0.16	0.09	0.08	0.08	0.05	0.05	0.04	0.08	0.08	0.25	0.11	0.09	0.08	0.01	0.00	0.03	0.01
OP2	0.22	0.27	0.04	0.09	0.26	0.11	0.25	0.00	0.25	0.25	0.27	0.29	0.03	0.10	0.25	0.28	0.00	0.03	0.00	0.01
P	0.10	0.16	0.07	0.02	0.13	0.03	0.10	0.03	0.10	0.13	0.15	0.19	0.11	0.03	0.11	0.18	0.01	0.01	0.01	0.00