Doublet Group distance statistics: 49100

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.000, 0.008, 0.017, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.008 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.000, 0.012, 0.024, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.012 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.000, 0.023, 0.046, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.023 std_dev=0.023
C1'	A	0, 0.000, 0.030, 0.060, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.030 std_dev=0.030
C2	A	0, 0.000, 0.030, 0.060, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.030 std_dev=0.030
C6	A	0, 0.000, 0.032, 0.064, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.032 std_dev=0.032
C4	A	0, 0.000, 0.032, 0.065, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.032 std_dev=0.032
O2	A	0, 0.000, 0.059, 0.117, 0.117 max_d=0.117 avg_d=0.059 std_dev=0.059
O4	A	0, 0.000, 0.125, 0.250, 0.250 max_d=0.250 avg_d=0.125 std_dev=0.125
O2'	B	0, 0.000, 0.233, 0.466, 0.466 max_d=0.466 avg_d=0.233 std_dev=0.233
C2'	B	0, 0.000, 0.402, 0.804, 0.804 max_d=0.804 avg_d=0.402 std_dev=0.402
C2	B	0, 0.000, 0.474, 0.949, 0.949 max_d=0.949 avg_d=0.474 std_dev=0.474
O2'	A	0, 0.000, 0.481, 0.961, 0.961 max_d=0.961 avg_d=0.481 std_dev=0.481
C2'	A	0, 0.000, 0.497, 0.994, 0.994 max_d=0.994 avg_d=0.497 std_dev=0.497
O4'	A	0, 0.000, 0.505, 1.009, 1.009 max_d=1.009 avg_d=0.505 std_dev=0.505
N3	B	0, 0.000, 0.708, 1.415, 1.415 max_d=1.415 avg_d=0.708 std_dev=0.708
C1'	B	0, 0.000, 0.773, 1.545, 1.545 max_d=1.545 avg_d=0.773 std_dev=0.773
O5'	B	0, 0.000, 0.779, 1.559, 1.559 max_d=1.559 avg_d=0.779 std_dev=0.779
C4'	A	0, 0.000, 0.819, 1.638, 1.638 max_d=1.638 avg_d=0.819 std_dev=0.819
C3'	B	0, 0.000, 0.840, 1.680, 1.680 max_d=1.680 avg_d=0.840 std_dev=0.840
C3'	A	0, 0.000, 0.848, 1.696, 1.696 max_d=1.696 avg_d=0.848 std_dev=0.848
O3'	B	0, 0.000, 0.923, 1.846, 1.846 max_d=1.846 avg_d=0.923 std_dev=0.923
O4'	B	0, 0.000, 0.955, 1.910, 1.910 max_d=1.910 avg_d=0.955 std_dev=0.955
OP1	B	0, 0.000, 1.003, 2.006, 2.006 max_d=2.006 avg_d=1.003 std_dev=1.003
P	B	0, 0.000, 1.006, 2.012, 2.012 max_d=2.012 avg_d=1.006 std_dev=1.006
C4'	B	0, 0.000, 1.048, 2.095, 2.095 max_d=2.095 avg_d=1.048 std_dev=1.048
N1	B	0, 0.000, 1.119, 2.238, 2.238 max_d=2.238 avg_d=1.119 std_dev=1.119
OP2	B	0, 0.000, 1.132, 2.264, 2.264 max_d=2.264 avg_d=1.132 std_dev=1.132
O3'	A	0, 0.000, 1.167, 2.335, 2.335 max_d=2.335 avg_d=1.167 std_dev=1.167
OP1	A	0, 0.000, 1.168, 2.335, 2.335 max_d=2.335 avg_d=1.168 std_dev=1.168
O2	B	0, 0.000, 1.234, 2.469, 2.469 max_d=2.469 avg_d=1.234 std_dev=1.234
P	A	0, 0.000, 1.277, 2.553, 2.553 max_d=2.553 avg_d=1.277 std_dev=1.277
C5'	A	0, 0.000, 1.301, 2.601, 2.601 max_d=2.601 avg_d=1.301 std_dev=1.301
OP2	A	0, 0.000, 1.328, 2.656, 2.656 max_d=2.656 avg_d=1.328 std_dev=1.328
C5'	B	0, 0.000, 1.509, 3.018, 3.018 max_d=3.018 avg_d=1.509 std_dev=1.509
O5'	A	0, 0.000, 1.542, 3.084, 3.084 max_d=3.084 avg_d=1.542 std_dev=1.542
C4	B	0, 0.000, 1.905, 3.810, 3.810 max_d=3.810 avg_d=1.905 std_dev=1.905
O4	B	0, 0.000, 2.217, 4.435, 4.435 max_d=4.435 avg_d=2.217 std_dev=2.217
C6	B	0, 0.000, 2.388, 4.775, 4.775 max_d=4.775 avg_d=2.388 std_dev=2.388
C5	B	0, 0.000, 2.807, 5.614, 5.614 max_d=5.614 avg_d=2.807 std_dev=2.807

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.02	0.00	0.01	0.00	0.04	0.21	0.01	0.04
C2	0.01	0.00	0.13	0.13	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.00	0.00	0.00	0.08	0.15	0.00	0.10	0.05	0.12	0.09	0.09
C2'	0.00	0.13	0.00	0.00	0.05	0.01	0.03	0.01	0.08	0.02	0.13	0.18	0.00	0.01	0.08	0.00	0.01	0.41	0.09	0.09
C3'	0.01	0.13	0.00	0.00	0.15	0.01	0.10	0.02	0.05	0.08	0.17	0.11	0.01	0.00	0.17	0.01	0.06	0.45	0.09	0.12
C4	0.01	0.01	0.05	0.15	0.00	0.06	0.01	0.07	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.17	0.00	0.03	0.07	0.03	0.24	0.22
C4'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.00	0.11	0.01	0.11	0.04	0.01	0.09	0.01	0.01	0.06	0.01	0.01	0.21	0.03	0.02
C5	0.00	0.00	0.03	0.10	0.01	0.11	0.00	0.17	0.00	0.00	0.00	0.00	0.07	0.10	0.02	0.06	0.17	0.08	0.29	0.30
C5'	0.01	0.03	0.01	0.02	0.07	0.01	0.17	0.00	0.17	0.04	0.00	0.13	0.00	0.02	0.08	0.02	0.00	0.08	0.02	0.00
C6	0.00	0.01	0.08	0.05	0.02	0.11	0.00	0.17	0.00	0.00	0.01	0.02	0.10	0.04	0.02	0.09	0.15	0.00	0.21	0.25
N1	0.00	0.00	0.02	0.08	0.01	0.04	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.07	0.01	0.01	0.01	0.11	0.10	0.12
N3	0.01	0.00	0.13	0.17	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.07	0.20	0.00	0.09	0.01	0.05	0.16	0.15
O2	0.03	0.00	0.18	0.11	0.00	0.09	0.00	0.13	0.02	0.02	0.00	0.00	0.14	0.14	0.00	0.18	0.14	0.20	0.02	0.01
O2'	0.02	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.07	0.00	0.10	0.02	0.07	0.14	0.00	0.02	0.03	0.01	0.01	0.40	0.09	0.08
O3'	0.00	0.15	0.01	0.00	0.17	0.01	0.10	0.02	0.04	0.07	0.20	0.14	0.02	0.00	0.22	0.02	0.10	0.54	0.11	0.18
O4	0.01	0.00	0.08	0.17	0.00	0.06	0.02	0.08	0.02	0.01	0.00	0.00	0.03	0.22	0.00	0.04	0.08	0.07	0.26	0.23
O4'	0.00	0.10	0.00	0.01	0.03	0.01	0.06	0.02	0.09	0.01	0.09	0.18	0.01	0.02	0.04	0.00	0.09	0.10	0.00	0.06
O5'	0.04	0.05	0.01	0.06	0.07	0.01	0.17	0.00	0.15	0.01	0.01	0.14	0.01	0.10	0.08	0.09	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.21	0.12	0.41	0.45	0.03	0.21	0.08	0.08	0.00	0.11	0.05	0.20	0.40	0.54	0.07	0.10	0.01	0.00	0.04	0.03
OP2	0.01	0.09	0.09	0.09	0.24	0.03	0.29	0.02	0.21	0.10	0.16	0.02	0.09	0.11	0.26	0.00	0.01	0.04	0.00	0.02
P	0.04	0.09	0.09	0.12	0.22	0.02	0.30	0.00	0.25	0.12	0.15	0.01	0.08	0.18	0.23	0.06	0.00	0.03	0.02	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.13	0.26	0.20	0.31	0.43	0.21	0.63	0.29	0.40	0.00	0.05	0.64	0.09	0.35	0.58	0.09	0.16	0.16	0.10	0.14
C2	0.06	0.13	0.13	0.20	0.87	0.06	1.25	0.09	0.95	0.30	0.18	0.73	0.08	0.29	1.03	0.08	0.24	0.24	0.19	0.23
C2'	0.11	0.23	0.10	0.14	0.42	0.09	0.57	0.13	0.36	0.01	0.03	0.59	0.05	0.16	0.60	0.03	0.32	0.36	0.34	0.33
C3'	0.46	0.62	0.31	0.38	0.34	0.41	0.21	0.49	0.29	0.46	0.57	0.77	0.19	0.31	0.27	0.40	0.00	0.05	0.01	0.01
C4	0.12	0.05	0.09	0.14	0.83	0.01	1.24	0.03	1.05	0.39	0.25	0.65	0.09	0.21	0.89	0.11	0.23	0.23	0.18	0.22
C4'	0.53	0.69	0.43	0.58	0.51	0.59	0.38	0.74	0.42	0.56	0.68	0.81	0.21	0.53	0.47	0.52	0.23	0.22	0.35	0.29
C5	0.04	0.10	0.16	0.23	0.57	0.14	0.79	0.17	0.62	0.17	0.16	0.52	0.09	0.28	0.61	0.03	0.19	0.19	0.13	0.18
C5'	0.77	0.92	0.58	0.79	1.04	0.85	0.98	1.06	0.92	0.89	1.00	0.87	0.28	0.68	1.07	0.81	0.54	0.53	0.72	0.63
C6	0.11	0.18	0.19	0.29	0.46	0.20	0.63	0.26	0.42	0.04	0.06	0.53	0.08	0.33	0.55	0.08	0.17	0.18	0.11	0.16
N1	0.05	0.19	0.17	0.27	0.62	0.15	0.88	0.21	0.62	0.13	0.07	0.65	0.08	0.32	0.77	0.02	0.20	0.20	0.14	0.18
N3	0.13	0.08	0.09	0.15	0.95	0.00	1.41	0.01	1.13	0.40	0.25	0.74	0.08	0.24	1.06	0.14	0.24	0.25	0.20	0.24
O2	0.08	0.13	0.12	0.20	0.92	0.03	1.33	0.07	1.01	0.32	0.19	0.76	0.08	0.29	1.12	0.11	0.26	0.25	0.21	0.25
O2'	0.01	0.12	0.04	0.09	0.59	0.01	0.75	0.04	0.51	0.14	0.10	0.50	0.02	0.13	0.81	0.09	0.42	0.45	0.44	0.43
O3'	0.52	0.67	0.32	0.36	0.53	0.43	0.41	0.50	0.44	0.54	0.68	0.77	0.21	0.27	0.52	0.45	0.02	0.05	0.02	0.02
O4	0.23	0.01	0.01	0.04	0.84	0.09	1.29	0.09	1.18	0.49	0.29	0.61	0.06	0.11	0.88	0.19	0.24	0.25	0.20	0.24
O4'	0.34	0.49	0.35	0.53	0.09	0.46	0.07	0.60	0.05	0.30	0.39	0.72	0.14	0.53	0.00	0.34	0.11	0.12	0.24	0.17
O5'	0.89	1.07	0.64	0.84	1.28	0.94	1.24	1.15	1.14	1.06	1.19	0.96	0.28	0.66	1.29	0.94	0.65	0.61	0.84	0.74
OP1	0.91	0.78	0.64	0.93	1.36	1.09	1.67	1.37	1.51	1.09	0.91	0.43	0.32	0.79	1.39	1.03	0.77	0.77	0.99	0.88
OP2	1.13	1.04	0.84	1.07	1.36	1.21	1.64	1.40	1.62	1.33	1.09	0.73	0.45	0.82	1.26	1.21	0.83	0.72	0.93	0.87
P	1.03	1.01	0.79	1.03	1.38	1.14	1.58	1.37	1.49	1.21	1.10	0.74	0.43	0.85	1.35	1.11	0.79	0.73	0.95	0.86

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.02	0.02	0.01	0.04	0.03	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.01	0.00	0.03	0.07	0.11	0.00
C2	0.00	0.00	0.11	0.21	0.00	0.22	0.01	0.24	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.21	0.02	0.21	0.53	0.53	0.46	0.51
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.06	0.01	0.09	0.19	0.00	0.02	0.03	0.01	0.24	0.28	0.13	0.22
C3'	0.02	0.21	0.00	0.00	0.21	0.00	0.46	0.00	0.50	0.13	0.06	0.57	0.02	0.02	0.23	0.01	0.34	0.38	0.13	0.30
C4	0.02	0.00	0.03	0.21	0.00	0.19	0.00	0.42	0.00	0.01	0.00	0.01	0.18	0.19	0.01	0.04	0.19	0.29	0.52	0.34
C4'	0.01	0.22	0.01	0.00	0.19	0.00	0.44	0.01	0.48	0.10	0.08	0.57	0.05	0.01	0.21	0.00	0.01	0.10	0.15	0.02
C5	0.04	0.01	0.02	0.46	0.00	0.44	0.00	0.82	0.01	0.02	0.01	0.01	0.24	0.42	0.01	0.20	0.67	0.82	1.19	0.90
C5'	0.03	0.24	0.01	0.00	0.42	0.01	0.82	0.00	0.81	0.21	0.02	0.78	0.03	0.02	0.46	0.01	0.00	0.14	0.29	0.01
C6	0.03	0.01	0.06	0.50	0.00	0.48	0.01	0.81	0.00	0.01	0.00	0.01	0.21	0.42	0.00	0.25	0.69	0.76	1.09	0.85
N1	0.00	0.01	0.01	0.13	0.01	0.10	0.02	0.21	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.08	0.00	0.02	0.05	0.06	0.25	0.12
N3	0.00	0.00	0.09	0.06	0.00	0.08	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.08	0.08	0.02	0.12	0.33	0.31	0.22	0.28
O2	0.00	0.00	0.19	0.57	0.01	0.57	0.01	0.78	0.01	0.01	0.01	0.00	0.09	0.53	0.03	0.42	1.15	1.20	1.24	1.21
O2'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.18	0.05	0.24	0.03	0.21	0.08	0.08	0.09	0.00	0.07	0.18	0.09	0.09	0.16	0.05	0.10
O3'	0.03	0.21	0.02	0.02	0.19	0.01	0.42	0.02	0.42	0.08	0.08	0.53	0.07	0.00	0.22	0.02	0.33	0.43	0.16	0.33
O4	0.01	0.02	0.03	0.23	0.01	0.21	0.01	0.46	0.00	0.00	0.02	0.03	0.18	0.22	0.00	0.04	0.20	0.34	0.57	0.38
O4'	0.00	0.21	0.01	0.01	0.04	0.00	0.20	0.01	0.25	0.02	0.12	0.42	0.09	0.02	0.04	0.00	0.09	0.01	0.17	0.07
O5'	0.03	0.53	0.24	0.34	0.19	0.01	0.67	0.00	0.69	0.05	0.33	1.15	0.09	0.33	0.20	0.09	0.00	0.01	0.03	0.01
OP1	0.07	0.53	0.28	0.38	0.29	0.10	0.82	0.14	0.76	0.06	0.31	1.20	0.16	0.43	0.34	0.01	0.01	0.00	0.04	0.02
OP2	0.11	0.46	0.13	0.13	0.52	0.15	1.19	0.29	1.09	0.25	0.22	1.24	0.05	0.16	0.57	0.17	0.03	0.04	0.00	0.02
P	0.00	0.51	0.22	0.30	0.34	0.02	0.90	0.01	0.85	0.12	0.28	1.21	0.10	0.33	0.38	0.07	0.01	0.02	0.02	0.00