Doublet Group distance statistics: 49110

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 5, 9, 6, 7, 2, 2, 1, 3, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.004, 0.010, 0.015, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.010 std_dev=0.006
N3	A	0, 0.001, 0.007, 0.014, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.007 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.004, 0.012, 0.019, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.012 std_dev=0.007
C4	A	0, 0.005, 0.013, 0.022, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.013 std_dev=0.009
C6	A	0, 0.005, 0.013, 0.022, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.013 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.006, 0.016, 0.026, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.016 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.002, 0.012, 0.023, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.012 std_dev=0.011
O2	A	0, 0.004, 0.029, 0.055, 0.095 max_d=0.095 avg_d=0.029 std_dev=0.025
O4	A	0, 0.004, 0.059, 0.114, 0.273 max_d=0.273 avg_d=0.059 std_dev=0.055
O2'	B	0, 0.179, 0.392, 0.604, 0.897 max_d=0.897 avg_d=0.392 std_dev=0.212
C2'	B	0, 0.127, 0.402, 0.676, 1.248 max_d=1.248 avg_d=0.402 std_dev=0.275
C1'	B	0, 0.110, 0.389, 0.669, 1.466 max_d=1.466 avg_d=0.389 std_dev=0.279
O4'	B	0, 0.110, 0.449, 0.788, 1.462 max_d=1.462 avg_d=0.449 std_dev=0.339
C3'	A	0, -0.191, 0.177, 0.546, 2.232 max_d=2.232 avg_d=0.177 std_dev=0.368
O4'	A	0, -0.242, 0.159, 0.560, 2.544 max_d=2.544 avg_d=0.159 std_dev=0.401
O3'	A	0, -0.204, 0.202, 0.608, 2.186 max_d=2.186 avg_d=0.202 std_dev=0.406
C2'	A	0, -0.266, 0.169, 0.604, 2.701 max_d=2.701 avg_d=0.169 std_dev=0.435
C4'	A	0, -0.233, 0.217, 0.667, 2.829 max_d=2.829 avg_d=0.217 std_dev=0.450
C3'	B	0, -0.047, 0.485, 1.018, 3.170 max_d=3.170 avg_d=0.485 std_dev=0.532
C4'	B	0, -0.039, 0.532, 1.102, 3.252 max_d=3.252 avg_d=0.532 std_dev=0.571
N9	B	0, -0.141, 0.455, 1.050, 3.765 max_d=3.765 avg_d=0.455 std_dev=0.595
O5'	B	0, 0.005, 0.613, 1.221, 3.292 max_d=3.292 avg_d=0.613 std_dev=0.608
P	B	0, -0.004, 0.659, 1.323, 3.662 max_d=3.662 avg_d=0.659 std_dev=0.663
O3'	B	0, -0.201, 0.485, 1.172, 4.410 max_d=4.410 avg_d=0.485 std_dev=0.687
OP2	B	0, -0.020, 0.707, 1.434, 3.991 max_d=3.991 avg_d=0.707 std_dev=0.727
OP1	B	0, -0.028, 0.715, 1.459, 4.121 max_d=4.121 avg_d=0.715 std_dev=0.744
O2'	A	0, -0.464, 0.304, 1.071, 4.578 max_d=4.578 avg_d=0.304 std_dev=0.768
C5'	B	0, -0.128, 0.650, 1.429, 4.420 max_d=4.420 avg_d=0.650 std_dev=0.779
C8	B	0, -0.220, 0.578, 1.376, 4.980 max_d=4.980 avg_d=0.578 std_dev=0.798
C5'	A	0, -0.519, 0.367, 1.253, 5.607 max_d=5.607 avg_d=0.367 std_dev=0.886
C4	B	0, -0.494, 0.485, 1.463, 6.225 max_d=6.225 avg_d=0.485 std_dev=0.978
O5'	A	0, -0.654, 0.411, 1.475, 6.709 max_d=6.709 avg_d=0.411 std_dev=1.064
N7	B	0, -0.512, 0.645, 1.801, 7.272 max_d=7.272 avg_d=0.645 std_dev=1.156
N3	B	0, -0.666, 0.514, 1.695, 7.489 max_d=7.489 avg_d=0.514 std_dev=1.180
C5	B	0, -0.660, 0.588, 1.835, 7.896 max_d=7.896 avg_d=0.588 std_dev=1.247
P	A	0, -0.965, 0.581, 2.126, 9.749 max_d=9.749 avg_d=0.581 std_dev=1.545
C2	B	0, -0.938, 0.647, 2.232, 10.042 max_d=10.042 avg_d=0.647 std_dev=1.585
OP2	A	0, -0.925, 0.696, 2.317, 10.220 max_d=10.220 avg_d=0.696 std_dev=1.621
C6	B	0, -0.969, 0.695, 2.359, 10.525 max_d=10.525 avg_d=0.695 std_dev=1.664
N1	B	0, -1.057, 0.724, 2.504, 11.290 max_d=11.290 avg_d=0.724 std_dev=1.780
OP1	A	0, -1.169, 0.695, 2.560, 11.636 max_d=11.636 avg_d=0.695 std_dev=1.865
N2	B	0, -1.131, 0.764, 2.659, 11.955 max_d=11.955 avg_d=0.764 std_dev=1.895
O6	B	0, -1.154, 0.813, 2.781, 12.410 max_d=12.410 avg_d=0.813 std_dev=1.967

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.14	0.01	0.00	0.10	0.07	0.22	0.14
C2	0.02	0.00	0.08	0.08	0.00	0.10	0.01	0.14	0.01	0.00	0.00	0.00	0.08	0.14	0.00	0.08	0.19	0.30	0.26	0.16
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.04	0.01	0.08	0.09	0.10	0.02	0.06	0.15	0.00	0.03	0.05	0.02	0.18	0.17	0.30	0.19
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.07	0.00	0.10	0.02	0.11	0.05	0.07	0.14	0.01	0.01	0.07	0.01	0.04	0.05	0.06	0.03
C4	0.01	0.00	0.04	0.07	0.00	0.04	0.00	0.11	0.01	0.01	0.00	0.00	0.13	0.08	0.00	0.02	0.18	0.16	0.57	0.35
C4'	0.01	0.10	0.01	0.00	0.04	0.00	0.11	0.00	0.12	0.02	0.07	0.19	0.09	0.02	0.05	0.00	0.01	0.08	0.07	0.02
C5	0.01	0.01	0.08	0.10	0.00	0.11	0.00	0.25	0.00	0.01	0.01	0.01	0.14	0.07	0.01	0.07	0.36	0.40	0.78	0.58
C5'	0.04	0.14	0.09	0.02	0.11	0.00	0.25	0.00	0.26	0.07	0.10	0.32	0.05	0.08	0.11	0.01	0.01	0.14	0.14	0.01
C6	0.01	0.01	0.10	0.11	0.01	0.12	0.00	0.26	0.00	0.00	0.01	0.01	0.12	0.07	0.01	0.09	0.38	0.40	0.70	0.56
N1	0.01	0.00	0.02	0.05	0.01	0.02	0.01	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.07	0.10	0.01	0.01	0.14	0.11	0.37	0.23
N3	0.01	0.00	0.06	0.07	0.00	0.07	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00	0.11	0.11	0.00	0.05	0.14	0.24	0.35	0.16
O2	0.03	0.00	0.15	0.14	0.00	0.19	0.01	0.32	0.01	0.01	0.00	0.00	0.12	0.19	0.01	0.15	0.42	0.61	0.35	0.41
O2'	0.02	0.08	0.00	0.01	0.13	0.09	0.14	0.05	0.12	0.07	0.11	0.12	0.00	0.05	0.15	0.07	0.17	0.17	0.37	0.19
O3'	0.14	0.14	0.03	0.01	0.08	0.02	0.07	0.08	0.07	0.10	0.11	0.19	0.05	0.00	0.08	0.10	0.09	0.14	0.10	0.10
O4	0.01	0.00	0.05	0.07	0.00	0.05	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01	0.15	0.08	0.00	0.03	0.18	0.17	0.60	0.36
O4'	0.00	0.08	0.02	0.01	0.02	0.00	0.07	0.01	0.09	0.01	0.05	0.15	0.07	0.10	0.03	0.00	0.04	0.08	0.10	0.09
O5'	0.10	0.19	0.18	0.04	0.18	0.01	0.36	0.01	0.38	0.14	0.14	0.42	0.17	0.09	0.18	0.04	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.07	0.30	0.17	0.05	0.16	0.08	0.40	0.14	0.40	0.11	0.24	0.61	0.17	0.14	0.17	0.08	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.22	0.26	0.30	0.06	0.57	0.07	0.78	0.14	0.70	0.37	0.35	0.35	0.37	0.10	0.60	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.14	0.16	0.19	0.03	0.35	0.02	0.58	0.01	0.56	0.23	0.16	0.41	0.19	0.10	0.36	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.11	0.41	0.18	0.08	0.16	0.18	0.21	0.14	0.22	0.34	0.28	0.61	0.37	0.37	0.12	0.16	0.22	0.19	0.14	0.28	0.15	0.22	0.15
C2	0.20	0.82	0.19	0.21	0.43	0.15	0.36	0.21	0.49	0.20	0.71	1.05	0.69	0.23	0.22	0.16	0.16	0.19	0.10	0.46	0.15	0.24	0.13
C2'	0.15	0.34	0.17	0.16	0.17	0.22	0.30	0.16	0.29	0.42	0.24	0.53	0.32	0.49	0.18	0.19	0.35	0.18	0.18	0.39	0.24	0.24	0.19
C3'	0.18	0.28	0.06	0.26	0.14	0.38	0.32	0.31	0.34	0.37	0.22	0.45	0.28	0.49	0.12	0.13	0.52	0.30	0.32	0.48	0.35	0.32	0.33
C4	0.22	0.95	0.19	0.35	0.60	0.24	0.59	0.33	0.76	0.29	0.91	1.10	0.79	0.41	0.35	0.17	0.41	0.15	0.16	0.75	0.25	0.28	0.19
C4'	0.39	0.40	0.20	0.45	0.22	0.62	0.13	0.56	0.17	0.12	0.23	0.56	0.43	0.22	0.18	0.19	0.68	0.55	0.57	0.25	0.54	0.52	0.56
C5	0.18	0.69	0.18	0.28	0.45	0.18	0.42	0.24	0.53	0.22	0.64	0.80	0.61	0.29	0.26	0.16	0.30	0.12	0.13	0.51	0.19	0.23	0.14
C5'	0.71	0.57	0.55	0.84	0.47	0.99	0.26	0.94	0.23	0.26	0.38	0.69	0.64	0.15	0.48	0.48	1.04	0.90	0.96	0.13	0.95	0.87	0.95
C6	0.14	0.52	0.18	0.16	0.28	0.12	0.23	0.14	0.30	0.18	0.43	0.65	0.46	0.19	0.14	0.16	0.13	0.14	0.12	0.27	0.13	0.21	0.12
N1	0.16	0.59	0.18	0.15	0.29	0.14	0.22	0.14	0.31	0.22	0.47	0.78	0.52	0.23	0.14	0.16	0.12	0.18	0.11	0.28	0.13	0.22	0.12
N3	0.22	0.97	0.20	0.30	0.56	0.20	0.53	0.29	0.70	0.24	0.91	1.19	0.80	0.33	0.31	0.17	0.30	0.18	0.13	0.68	0.21	0.28	0.17
O2	0.20	0.84	0.19	0.20	0.42	0.15	0.34	0.21	0.48	0.22	0.72	1.11	0.70	0.23	0.21	0.16	0.13	0.21	0.09	0.44	0.15	0.25	0.13
O2'	0.23	0.24	0.38	0.24	0.33	0.18	0.56	0.30	0.51	0.74	0.31	0.39	0.18	0.80	0.43	0.27	0.13	0.20	0.24	0.64	0.29	0.33	0.26
O3'	0.12	0.29	0.24	0.09	0.36	0.20	0.62	0.17	0.64	0.67	0.44	0.36	0.23	0.81	0.37	0.20	0.35	0.12	0.14	0.80	0.20	0.21	0.16
O4	0.22	1.07	0.19	0.43	0.70	0.34	0.75	0.45	0.96	0.39	1.10	1.21	0.86	0.56	0.42	0.17	0.56	0.16	0.24	0.98	0.34	0.35	0.28
O4'	0.37	0.52	0.14	0.32	0.31	0.49	0.17	0.42	0.21	0.11	0.36	0.69	0.53	0.16	0.22	0.14	0.50	0.49	0.46	0.18	0.38	0.44	0.45
O5'	0.85	0.72	0.71	0.95	0.63	1.05	0.43	0.98	0.40	0.41	0.55	0.83	0.79	0.30	0.63	0.71	1.13	0.96	1.05	0.27	1.06	0.96	1.04
OP1	1.15	0.92	1.08	1.36	0.90	1.47	0.71	1.46	0.65	0.75	0.76	0.99	1.01	0.62	0.94	1.01	1.41	1.31	1.54	0.51	1.64	1.40	1.55
OP2	1.28	1.04	1.26	1.43	1.05	1.44	0.90	1.43	0.83	0.96	0.91	1.08	1.13	0.84	1.11	1.29	1.47	1.35	1.58	0.72	1.61	1.53	1.58
P	1.21	0.97	1.14	1.39	0.94	1.45	0.75	1.40	0.69	0.79	0.80	1.03	1.06	0.66	0.99	1.11	1.51	1.33	1.50	0.55	1.53	1.40	1.49

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.00	0.03	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.13	0.00	0.18	0.02	0.12	0.25	0.11
C2	0.03	0.00	0.08	0.06	0.01	0.05	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.18	0.22	0.08	0.23	0.01	0.36	0.33	0.20
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.04	0.01	0.03	0.08	0.04	0.07	0.06	0.10	0.08	0.05	0.02	0.00	0.03	0.01	0.26	0.05	0.17	0.35	0.25
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.03	0.05	0.04	0.08	0.05	0.04	0.02	0.02	0.01	0.01	0.15	0.03	0.13	0.23	0.14
C4	0.01	0.01	0.04	0.03	0.00	0.03	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.09	0.16	0.05	0.27	0.01	0.20	0.42	0.24
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.06	0.05	0.07	0.05	0.06	0.03	0.05	0.04	0.01	0.02	0.04	0.15	0.22	0.06
C5	0.01	0.01	0.03	0.02	0.00	0.04	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.09	0.12	0.03	0.34	0.01	0.22	0.59	0.37
C5'	0.03	0.09	0.08	0.01	0.09	0.01	0.12	0.00	0.12	0.16	0.10	0.10	0.07	0.16	0.09	0.03	0.05	0.02	0.01	0.13	0.18	0.21	0.01
C6	0.02	0.00	0.04	0.03	0.01	0.04	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.15	0.04	0.32	0.00	0.25	0.59	0.35
C8	0.00	0.01	0.07	0.05	0.00	0.06	0.01	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.13	0.07	0.05	0.42	0.01	0.30	0.67	0.47
N1	0.03	0.00	0.06	0.04	0.01	0.05	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.14	0.19	0.06	0.27	0.00	0.30	0.45	0.27
N2	0.03	0.00	0.10	0.08	0.01	0.07	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.22	0.25	0.09	0.21	0.01	0.47	0.25	0.21
N3	0.02	0.01	0.08	0.05	0.00	0.05	0.00	0.07	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.17	0.21	0.08	0.21	0.01	0.33	0.29	0.17
N7	0.01	0.01	0.05	0.04	0.00	0.06	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.12	0.08	0.04	0.41	0.01	0.33	0.75	0.50
N9	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.03	0.01	0.09	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.06	0.11	0.02	0.29	0.01	0.14	0.43	0.27
O2'	0.02	0.18	0.00	0.02	0.09	0.05	0.09	0.03	0.11	0.13	0.14	0.22	0.17	0.12	0.06	0.00	0.03	0.03	0.22	0.12	0.19	0.33	0.22
O3'	0.13	0.22	0.03	0.01	0.16	0.04	0.12	0.05	0.15	0.07	0.19	0.25	0.21	0.08	0.11	0.03	0.00	0.11	0.10	0.13	0.14	0.26	0.11
O4'	0.00	0.08	0.01	0.01	0.05	0.01	0.03	0.02	0.04	0.05	0.06	0.09	0.08	0.04	0.02	0.03	0.11	0.00	0.15	0.04	0.22	0.16	0.10
O5'	0.18	0.23	0.26	0.15	0.27	0.02	0.34	0.01	0.32	0.42	0.27	0.21	0.21	0.41	0.29	0.22	0.10	0.15	0.00	0.35	0.02	0.01	0.00
O6	0.02	0.01	0.05	0.03	0.01	0.04	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.13	0.04	0.35	0.00	0.28	0.68	0.41
OP1	0.12	0.36	0.17	0.13	0.20	0.15	0.22	0.18	0.25	0.30	0.30	0.47	0.33	0.33	0.14	0.19	0.14	0.22	0.02	0.28	0.00	0.01	0.00
OP2	0.25	0.33	0.35	0.23	0.42	0.22	0.59	0.21	0.59	0.67	0.45	0.25	0.29	0.75	0.43	0.33	0.26	0.16	0.01	0.68	0.01	0.00	0.00
P	0.11	0.20	0.25	0.14	0.24	0.06	0.37	0.01	0.35	0.47	0.27	0.21	0.17	0.50	0.27	0.22	0.11	0.10	0.00	0.41	0.00	0.00	0.00