Doublet Group distance statistics: 49112

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 2, 0, 2, 0, 5, 0, 8, 4, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.006, 0.013, 0.020, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.013 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.008, 0.016, 0.024, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.016 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.005, 0.014, 0.023, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.014 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.004, 0.014, 0.023, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.014 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.010, 0.020, 0.030, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.020 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.010, 0.020, 0.031, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.020 std_dev=0.010
C6	A	0, 0.006, 0.017, 0.028, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.017 std_dev=0.011
O2	A	0, 0.017, 0.049, 0.081, 0.134 max_d=0.134 avg_d=0.049 std_dev=0.032
O4	A	0, 0.012, 0.046, 0.079, 0.117 max_d=0.117 avg_d=0.046 std_dev=0.034
N3	B	0, 0.125, 0.351, 0.577, 1.037 max_d=1.037 avg_d=0.351 std_dev=0.226
C2	B	0, 0.086, 0.327, 0.569, 1.063 max_d=1.063 avg_d=0.327 std_dev=0.241
C4	B	0, 0.112, 0.356, 0.599, 1.146 max_d=1.146 avg_d=0.356 std_dev=0.244
C1'	B	0, 0.317, 0.561, 0.805, 1.153 max_d=1.153 avg_d=0.561 std_dev=0.244
N2	B	0, 0.146, 0.394, 0.641, 1.131 max_d=1.131 avg_d=0.394 std_dev=0.247
N9	B	0, 0.189, 0.439, 0.689, 1.215 max_d=1.215 avg_d=0.439 std_dev=0.250
N1	B	0, 0.032, 0.303, 0.574, 1.173 max_d=1.173 avg_d=0.303 std_dev=0.271
C2'	B	0, 0.407, 0.678, 0.950, 1.078 max_d=1.078 avg_d=0.678 std_dev=0.272
C5	B	0, 0.071, 0.351, 0.631, 1.335 max_d=1.335 avg_d=0.351 std_dev=0.280
C8	B	0, 0.196, 0.482, 0.768, 1.473 max_d=1.473 avg_d=0.482 std_dev=0.286
C6	B	0, 0.035, 0.326, 0.618, 1.346 max_d=1.346 avg_d=0.326 std_dev=0.292
O2'	B	0, 0.502, 0.799, 1.096, 1.255 max_d=1.255 avg_d=0.799 std_dev=0.297
O4'	B	0, 0.368, 0.668, 0.968, 1.576 max_d=1.576 avg_d=0.668 std_dev=0.300
N7	B	0, 0.138, 0.442, 0.747, 1.564 max_d=1.564 avg_d=0.442 std_dev=0.305
O6	B	0, 0.066, 0.386, 0.705, 1.551 max_d=1.551 avg_d=0.386 std_dev=0.320
C4'	B	0, 0.474, 0.851, 1.229, 1.887 max_d=1.887 avg_d=0.851 std_dev=0.378
O4'	A	0, -0.182, 0.202, 0.585, 1.442 max_d=1.442 avg_d=0.202 std_dev=0.384
C2'	A	0, -0.162, 0.255, 0.673, 1.599 max_d=1.599 avg_d=0.255 std_dev=0.418
C5'	B	0, 0.458, 0.916, 1.373, 2.218 max_d=2.218 avg_d=0.916 std_dev=0.458
C3'	B	0, 0.407, 0.912, 1.416, 2.285 max_d=2.285 avg_d=0.912 std_dev=0.505
C3'	A	0, -0.279, 0.308, 0.896, 2.174 max_d=2.174 avg_d=0.308 std_dev=0.588
O2'	A	0, -0.200, 0.406, 1.013, 2.391 max_d=2.391 avg_d=0.406 std_dev=0.606
C4'	A	0, -0.271, 0.339, 0.950, 2.316 max_d=2.316 avg_d=0.339 std_dev=0.610
O5'	B	0, 0.359, 1.017, 1.674, 2.831 max_d=2.831 avg_d=1.017 std_dev=0.657
P	B	0, 0.300, 1.030, 1.760, 3.023 max_d=3.023 avg_d=1.030 std_dev=0.730
O3'	A	0, -0.312, 0.437, 1.187, 2.742 max_d=2.742 avg_d=0.437 std_dev=0.749
OP1	B	0, 0.384, 1.163, 1.942, 3.072 max_d=3.072 avg_d=1.163 std_dev=0.779
OP2	B	0, 0.255, 1.055, 1.854, 3.425 max_d=3.425 avg_d=1.055 std_dev=0.800
O3'	B	0, 0.303, 1.107, 1.911, 3.313 max_d=3.313 avg_d=1.107 std_dev=0.804
C5'	A	0, -0.358, 0.531, 1.421, 3.369 max_d=3.369 avg_d=0.531 std_dev=0.890
O5'	A	0, -0.269, 0.772, 1.814, 3.914 max_d=3.914 avg_d=0.772 std_dev=1.041
P	A	0, -0.528, 0.870, 2.267, 5.239 max_d=5.239 avg_d=0.870 std_dev=1.398
OP1	A	0, -0.639, 1.176, 2.990, 6.500 max_d=6.500 avg_d=1.176 std_dev=1.814
OP2	A	0, -0.631, 1.235, 3.102, 7.045 max_d=7.045 avg_d=1.235 std_dev=1.867

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.19	0.01	0.01	0.16	0.32	0.20	0.09
C2	0.02	0.00	0.16	0.21	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.08	0.01	0.09	0.22	0.34	0.32	0.14
C2'	0.00	0.16	0.00	0.00	0.04	0.01	0.12	0.11	0.16	0.02	0.11	0.28	0.01	0.02	0.04	0.01	0.11	0.26	0.16	0.05
C3'	0.01	0.21	0.00	0.00	0.25	0.01	0.22	0.02	0.18	0.16	0.24	0.20	0.02	0.01	0.27	0.01	0.16	0.34	0.19	0.11
C4	0.01	0.01	0.04	0.25	0.00	0.12	0.01	0.17	0.01	0.01	0.01	0.01	0.25	0.10	0.01	0.02	0.24	0.37	0.29	0.15
C4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.12	0.00	0.16	0.01	0.16	0.08	0.07	0.06	0.20	0.02	0.13	0.01	0.02	0.32	0.13	0.09
C5	0.01	0.01	0.12	0.22	0.01	0.16	0.00	0.22	0.01	0.01	0.01	0.02	0.32	0.13	0.01	0.08	0.28	0.33	0.31	0.16
C5'	0.04	0.05	0.11	0.02	0.17	0.01	0.22	0.00	0.19	0.08	0.10	0.04	0.08	0.14	0.19	0.03	0.01	0.21	0.16	0.02
C6	0.01	0.01	0.16	0.18	0.01	0.16	0.01	0.19	0.00	0.01	0.01	0.02	0.29	0.10	0.01	0.11	0.27	0.30	0.29	0.16
N1	0.01	0.01	0.02	0.16	0.01	0.08	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.02	0.15	0.05	0.01	0.02	0.20	0.31	0.24	0.11
N3	0.02	0.00	0.11	0.24	0.01	0.07	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.15	0.08	0.01	0.06	0.22	0.36	0.32	0.16
O2	0.03	0.01	0.28	0.20	0.01	0.06	0.02	0.04	0.02	0.02	0.01	0.00	0.14	0.17	0.02	0.15	0.25	0.36	0.40	0.17
O2'	0.02	0.08	0.01	0.02	0.25	0.20	0.32	0.08	0.29	0.15	0.15	0.14	0.00	0.04	0.27	0.15	0.18	0.52	0.25	0.33
O3'	0.19	0.08	0.02	0.01	0.10	0.02	0.13	0.14	0.10	0.05	0.08	0.17	0.04	0.00	0.14	0.12	0.37	0.65	0.35	0.30
O4	0.01	0.01	0.04	0.27	0.01	0.13	0.01	0.19	0.01	0.01	0.01	0.02	0.27	0.14	0.00	0.02	0.24	0.39	0.31	0.17
O4'	0.01	0.09	0.01	0.01	0.02	0.01	0.08	0.03	0.11	0.02	0.06	0.15	0.15	0.12	0.02	0.00	0.23	0.33	0.23	0.12
O5'	0.16	0.22	0.11	0.16	0.24	0.02	0.28	0.01	0.27	0.20	0.22	0.25	0.18	0.37	0.24	0.23	0.00	0.02	0.03	0.01
OP1	0.32	0.34	0.26	0.34	0.37	0.32	0.33	0.21	0.30	0.31	0.36	0.36	0.52	0.65	0.39	0.33	0.02	0.00	0.03	0.01
OP2	0.20	0.32	0.16	0.19	0.29	0.13	0.31	0.16	0.29	0.24	0.32	0.40	0.25	0.35	0.31	0.23	0.03	0.03	0.00	0.02
P	0.09	0.14	0.05	0.11	0.15	0.09	0.16	0.02	0.16	0.11	0.16	0.17	0.33	0.30	0.17	0.12	0.01	0.01	0.02	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.10	0.21	0.20	0.13	0.17	0.08	0.21	0.13	0.24	0.16	0.24	0.21	0.17	0.19	0.13	0.11	0.36	0.11	0.08	0.26	0.12	0.12	0.06
C2	0.13	0.16	0.28	0.19	0.13	0.15	0.18	0.16	0.24	0.13	0.23	0.15	0.11	0.17	0.10	0.14	0.12	0.12	0.24	0.27	0.23	0.18	0.18
C2'	0.19	0.21	0.16	0.30	0.24	0.25	0.25	0.27	0.24	0.26	0.22	0.19	0.23	0.26	0.24	0.24	0.54	0.19	0.28	0.25	0.34	0.24	0.26
C3'	0.21	0.26	0.36	0.27	0.26	0.23	0.28	0.26	0.28	0.28	0.26	0.27	0.25	0.29	0.25	0.26	0.34	0.20	0.23	0.28	0.30	0.25	0.23
C4	0.18	0.17	0.34	0.33	0.15	0.25	0.22	0.23	0.27	0.14	0.26	0.14	0.12	0.20	0.12	0.19	0.18	0.17	0.33	0.30	0.31	0.21	0.25
C4'	0.17	0.37	0.32	0.24	0.28	0.17	0.29	0.21	0.33	0.24	0.37	0.44	0.32	0.26	0.23	0.28	0.38	0.15	0.16	0.33	0.21	0.20	0.17
C5	0.13	0.23	0.28	0.20	0.20	0.19	0.25	0.18	0.28	0.17	0.28	0.20	0.19	0.23	0.14	0.16	0.10	0.14	0.20	0.30	0.20	0.10	0.12
C5'	0.25	0.48	0.36	0.30	0.37	0.24	0.36	0.26	0.40	0.30	0.46	0.57	0.44	0.32	0.30	0.38	0.40	0.22	0.23	0.39	0.27	0.26	0.24
C6	0.10	0.24	0.22	0.12	0.20	0.12	0.24	0.14	0.28	0.18	0.28	0.23	0.20	0.22	0.15	0.12	0.21	0.11	0.12	0.29	0.15	0.11	0.07
N1	0.10	0.21	0.24	0.11	0.17	0.10	0.21	0.13	0.26	0.15	0.26	0.21	0.16	0.20	0.12	0.12	0.22	0.11	0.14	0.28	0.15	0.11	0.09
N3	0.16	0.14	0.33	0.29	0.12	0.21	0.18	0.21	0.24	0.13	0.23	0.12	0.10	0.17	0.11	0.17	0.12	0.15	0.32	0.28	0.31	0.24	0.25
O2	0.12	0.14	0.28	0.18	0.12	0.13	0.16	0.15	0.21	0.12	0.20	0.14	0.11	0.16	0.09	0.14	0.14	0.11	0.25	0.26	0.24	0.21	0.19
O2'	0.25	0.21	0.23	0.40	0.30	0.30	0.33	0.34	0.31	0.36	0.25	0.15	0.24	0.37	0.31	0.36	0.64	0.24	0.38	0.32	0.46	0.40	0.39
O3'	0.23	0.32	0.39	0.34	0.29	0.29	0.29	0.33	0.30	0.29	0.32	0.38	0.30	0.30	0.27	0.31	0.37	0.23	0.30	0.30	0.39	0.31	0.31
O4	0.22	0.15	0.39	0.46	0.17	0.33	0.24	0.30	0.29	0.16	0.25	0.12	0.14	0.21	0.16	0.22	0.34	0.21	0.43	0.31	0.40	0.29	0.34
O4'	0.13	0.36	0.26	0.20	0.24	0.12	0.28	0.17	0.34	0.19	0.38	0.43	0.28	0.23	0.17	0.23	0.41	0.13	0.08	0.36	0.12	0.18	0.11
O5'	0.35	0.64	0.34	0.22	0.46	0.33	0.45	0.28	0.52	0.32	0.61	0.76	0.56	0.37	0.36	0.43	0.35	0.38	0.30	0.52	0.34	0.25	0.29
OP1	0.86	1.14	0.59	0.83	1.01	0.90	0.98	0.91	1.02	0.86	1.09	1.22	1.10	0.89	0.91	0.44	1.00	0.90	0.88	1.00	0.86	0.83	0.88
OP2	0.41	0.86	0.40	0.22	0.59	0.42	0.60	0.37	0.72	0.40	0.85	1.02	0.72	0.47	0.45	0.58	0.26	0.47	0.33	0.73	0.42	0.26	0.34
P	0.41	0.79	0.28	0.39	0.61	0.41	0.60	0.41	0.68	0.45	0.76	0.89	0.71	0.51	0.49	0.35	0.58	0.42	0.39	0.67	0.40	0.38	0.40

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.02	0.01	0.02	0.04	0.02	0.01	0.01	0.03	0.20	0.01	0.13	0.02	0.11	0.16	0.07
C2	0.02	0.00	0.12	0.09	0.01	0.04	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.15	0.25	0.06	0.27	0.02	0.22	0.31	0.24
C2'	0.01	0.12	0.00	0.01	0.07	0.02	0.06	0.17	0.09	0.05	0.11	0.14	0.10	0.04	0.02	0.02	0.02	0.02	0.19	0.09	0.19	0.28	0.20
C3'	0.01	0.09	0.01	0.00	0.15	0.01	0.25	0.02	0.25	0.30	0.17	0.05	0.06	0.33	0.17	0.03	0.01	0.02	0.12	0.30	0.20	0.07	0.10
C4	0.01	0.01	0.07	0.15	0.00	0.04	0.01	0.13	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.19	0.11	0.04	0.30	0.02	0.25	0.28	0.25
C4'	0.01	0.04	0.02	0.01	0.04	0.00	0.09	0.01	0.08	0.17	0.04	0.08	0.05	0.16	0.07	0.20	0.02	0.01	0.02	0.11	0.09	0.17	0.05
C5	0.01	0.01	0.06	0.25	0.01	0.09	0.00	0.19	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.23	0.08	0.03	0.40	0.02	0.36	0.40	0.36
C5'	0.08	0.10	0.17	0.02	0.13	0.01	0.19	0.00	0.18	0.24	0.14	0.09	0.09	0.25	0.14	0.10	0.14	0.02	0.01	0.21	0.16	0.23	0.02
C6	0.02	0.01	0.09	0.25	0.01	0.08	0.01	0.18	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.23	0.07	0.05	0.40	0.01	0.37	0.44	0.38
C8	0.01	0.01	0.05	0.30	0.00	0.17	0.00	0.24	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.22	0.20	0.05	0.42	0.03	0.36	0.31	0.34
N1	0.02	0.01	0.11	0.17	0.01	0.04	0.01	0.14	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.20	0.12	0.06	0.34	0.01	0.30	0.39	0.32
N2	0.04	0.01	0.14	0.05	0.02	0.08	0.01	0.09	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.12	0.35	0.08	0.23	0.02	0.18	0.29	0.21
N3	0.02	0.01	0.10	0.06	0.01	0.05	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.14	0.28	0.06	0.23	0.02	0.18	0.25	0.19
N7	0.01	0.01	0.04	0.33	0.01	0.16	0.00	0.25	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.25	0.22	0.04	0.47	0.03	0.43	0.44	0.42
N9	0.01	0.01	0.02	0.17	0.01	0.07	0.01	0.14	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.16	0.05	0.02	0.28	0.02	0.22	0.22	0.21
O2'	0.03	0.15	0.02	0.03	0.19	0.20	0.23	0.10	0.23	0.22	0.20	0.12	0.14	0.25	0.16	0.00	0.05	0.14	0.15	0.25	0.19	0.27	0.14
O3'	0.20	0.25	0.02	0.01	0.11	0.02	0.08	0.14	0.07	0.20	0.12	0.35	0.28	0.22	0.05	0.05	0.00	0.13	0.19	0.14	0.37	0.22	0.22
O4'	0.01	0.06	0.02	0.02	0.04	0.01	0.03	0.02	0.05	0.05	0.06	0.08	0.06	0.04	0.02	0.14	0.13	0.00	0.11	0.05	0.10	0.16	0.05
O5'	0.13	0.27	0.19	0.12	0.30	0.02	0.40	0.01	0.40	0.42	0.34	0.23	0.23	0.47	0.28	0.15	0.19	0.11	0.00	0.44	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.02	0.09	0.30	0.02	0.11	0.02	0.21	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.25	0.14	0.05	0.44	0.00	0.44	0.51	0.44
OP1	0.11	0.22	0.19	0.20	0.25	0.09	0.36	0.16	0.37	0.36	0.30	0.18	0.18	0.43	0.22	0.19	0.37	0.10	0.02	0.44	0.00	0.02	0.01
OP2	0.16	0.31	0.28	0.07	0.28	0.17	0.40	0.23	0.44	0.31	0.39	0.29	0.25	0.44	0.22	0.27	0.22	0.16	0.02	0.51	0.02	0.00	0.02
P	0.07	0.24	0.20	0.10	0.25	0.05	0.36	0.02	0.38	0.34	0.32	0.21	0.19	0.42	0.21	0.14	0.22	0.05	0.01	0.44	0.01	0.02	0.00