Doublet Group distance statistics: 49115

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 2, 2, 1, 3, 5, 3, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.005, 0.012, 0.019, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.012 std_dev=0.007
N3	A	0, 0.002, 0.011, 0.019, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.011 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.012, 0.025, 0.039, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.025 std_dev=0.014
C1'	A	0, 0.015, 0.031, 0.047, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.031 std_dev=0.016
C4	A	0, 0.014, 0.030, 0.047, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.030 std_dev=0.016
C2	A	0, 0.013, 0.029, 0.046, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.029 std_dev=0.017
C6	A	0, 0.015, 0.032, 0.048, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.032 std_dev=0.017
O2	A	0, 0.026, 0.063, 0.100, 0.158 max_d=0.158 avg_d=0.063 std_dev=0.037
O4	A	0, 0.050, 0.116, 0.182, 0.229 max_d=0.229 avg_d=0.116 std_dev=0.066
O3'	B	0, 0.243, 0.419, 0.595, 0.780 max_d=0.780 avg_d=0.419 std_dev=0.176
O4'	B	0, 0.187, 0.380, 0.574, 0.768 max_d=0.768 avg_d=0.380 std_dev=0.193
C3'	B	0, 0.307, 0.504, 0.701, 0.787 max_d=0.787 avg_d=0.504 std_dev=0.197
C4'	B	0, 0.284, 0.491, 0.698, 0.835 max_d=0.835 avg_d=0.491 std_dev=0.207
C1'	B	0, 0.144, 0.352, 0.560, 0.746 max_d=0.746 avg_d=0.352 std_dev=0.208
C2'	B	0, 0.304, 0.517, 0.731, 0.809 max_d=0.809 avg_d=0.517 std_dev=0.213
C4	B	0, 0.194, 0.413, 0.633, 0.791 max_d=0.791 avg_d=0.413 std_dev=0.219
N3	B	0, 0.229, 0.451, 0.672, 0.714 max_d=0.714 avg_d=0.451 std_dev=0.222
N9	B	0, 0.172, 0.396, 0.620, 0.865 max_d=0.865 avg_d=0.396 std_dev=0.224
C5	B	0, 0.245, 0.481, 0.716, 0.861 max_d=0.861 avg_d=0.481 std_dev=0.236
C2	B	0, 0.257, 0.504, 0.752, 0.829 max_d=0.829 avg_d=0.504 std_dev=0.247
N1	B	0, 0.273, 0.521, 0.769, 0.895 max_d=0.895 avg_d=0.521 std_dev=0.248
C8	B	0, 0.226, 0.476, 0.725, 0.944 max_d=0.944 avg_d=0.476 std_dev=0.249
C6	B	0, 0.277, 0.530, 0.784, 0.890 max_d=0.890 avg_d=0.530 std_dev=0.253
O2'	B	0, 0.369, 0.632, 0.896, 1.203 max_d=1.203 avg_d=0.632 std_dev=0.263
N7	B	0, 0.262, 0.533, 0.804, 0.959 max_d=0.959 avg_d=0.533 std_dev=0.271
P	A	0, 0.439, 0.734, 1.030, 1.222 max_d=1.222 avg_d=0.734 std_dev=0.296
N2	B	0, 0.302, 0.602, 0.902, 1.188 max_d=1.188 avg_d=0.602 std_dev=0.300
O6	B	0, 0.310, 0.613, 0.916, 1.212 max_d=1.212 avg_d=0.613 std_dev=0.303
C5'	B	0, 0.467, 0.787, 1.108, 1.215 max_d=1.215 avg_d=0.787 std_dev=0.321
O4'	A	0, 0.067, 0.466, 0.866, 1.096 max_d=1.096 avg_d=0.466 std_dev=0.399
OP2	A	0, 0.786, 1.205, 1.623, 1.875 max_d=1.875 avg_d=1.205 std_dev=0.419
C4'	A	0, 0.280, 0.735, 1.190, 1.471 max_d=1.471 avg_d=0.735 std_dev=0.455
OP1	A	0, 0.535, 1.019, 1.504, 1.834 max_d=1.834 avg_d=1.019 std_dev=0.485
O5'	A	0, 0.383, 0.877, 1.371, 2.022 max_d=2.022 avg_d=0.877 std_dev=0.494
C3'	A	0, 0.214, 0.717, 1.220, 1.512 max_d=1.512 avg_d=0.717 std_dev=0.503
C2'	A	0, 0.059, 0.563, 1.067, 1.367 max_d=1.367 avg_d=0.563 std_dev=0.504
O3'	A	0, 0.343, 0.935, 1.526, 1.833 max_d=1.833 avg_d=0.935 std_dev=0.591
C5'	A	0, 0.454, 1.080, 1.705, 2.209 max_d=2.209 avg_d=1.080 std_dev=0.625
O5'	B	0, 0.825, 1.452, 2.079, 2.196 max_d=2.196 avg_d=1.452 std_dev=0.627
O2'	A	0, 0.107, 0.962, 1.818, 2.142 max_d=2.142 avg_d=0.962 std_dev=0.855
P	B	0, 0.893, 2.023, 3.154, 3.342 max_d=3.342 avg_d=2.023 std_dev=1.130
OP2	B	0, 1.087, 2.571, 4.054, 4.739 max_d=4.739 avg_d=2.571 std_dev=1.484
OP1	B	0, 1.029, 2.572, 4.116, 4.558 max_d=4.558 avg_d=2.572 std_dev=1.543

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.02	0.13	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.11	0.02	0.01	0.17	0.12	0.34	0.11
C2	0.02	0.00	0.16	0.28	0.01	0.08	0.01	0.16	0.01	0.01	0.01	0.01	0.17	0.23	0.02	0.06	0.30	0.21	0.52	0.28
C2'	0.00	0.16	0.00	0.01	0.07	0.03	0.18	0.23	0.20	0.04	0.09	0.34	0.01	0.08	0.08	0.01	0.38	0.41	0.73	0.48
C3'	0.02	0.28	0.01	0.00	0.26	0.01	0.18	0.03	0.13	0.17	0.30	0.31	0.03	0.02	0.28	0.02	0.11	0.16	0.45	0.21
C4	0.02	0.01	0.07	0.26	0.00	0.12	0.01	0.26	0.02	0.01	0.01	0.02	0.33	0.26	0.01	0.04	0.36	0.31	0.74	0.41
C4'	0.02	0.08	0.03	0.01	0.12	0.00	0.11	0.00	0.10	0.07	0.10	0.09	0.27	0.09	0.13	0.01	0.02	0.13	0.26	0.07
C5	0.02	0.01	0.18	0.18	0.01	0.11	0.00	0.29	0.01	0.01	0.01	0.02	0.34	0.19	0.02	0.08	0.29	0.26	0.67	0.37
C5'	0.13	0.16	0.23	0.03	0.26	0.00	0.29	0.00	0.28	0.19	0.21	0.12	0.09	0.20	0.27	0.02	0.01	0.20	0.12	0.02
C6	0.02	0.01	0.20	0.13	0.02	0.10	0.01	0.28	0.00	0.01	0.02	0.02	0.28	0.14	0.02	0.09	0.23	0.18	0.48	0.26
N1	0.01	0.01	0.04	0.17	0.01	0.07	0.01	0.19	0.01	0.00	0.01	0.02	0.18	0.15	0.02	0.01	0.23	0.15	0.42	0.21
N3	0.01	0.01	0.09	0.30	0.01	0.10	0.01	0.21	0.02	0.01	0.00	0.02	0.26	0.28	0.01	0.03	0.35	0.28	0.66	0.37
O2	0.03	0.01	0.34	0.31	0.02	0.09	0.02	0.12	0.02	0.02	0.02	0.00	0.12	0.25	0.03	0.11	0.29	0.20	0.47	0.26
O2'	0.02	0.17	0.01	0.03	0.33	0.27	0.34	0.09	0.28	0.18	0.26	0.12	0.00	0.12	0.37	0.17	0.31	0.34	0.89	0.47
O3'	0.11	0.23	0.08	0.02	0.26	0.09	0.19	0.20	0.14	0.15	0.28	0.25	0.12	0.00	0.29	0.09	0.11	0.11	0.43	0.17
O4	0.02	0.02	0.08	0.28	0.01	0.13	0.02	0.27	0.02	0.02	0.01	0.03	0.37	0.29	0.00	0.05	0.38	0.36	0.83	0.46
O4'	0.01	0.06	0.01	0.02	0.04	0.01	0.08	0.02	0.09	0.01	0.03	0.11	0.17	0.09	0.05	0.00	0.20	0.29	0.30	0.26
O5'	0.17	0.30	0.38	0.11	0.36	0.02	0.29	0.01	0.23	0.23	0.35	0.29	0.31	0.11	0.38	0.20	0.00	0.02	0.03	0.00
OP1	0.12	0.21	0.41	0.16	0.31	0.13	0.26	0.20	0.18	0.15	0.28	0.20	0.34	0.11	0.36	0.29	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.34	0.52	0.73	0.45	0.74	0.26	0.67	0.12	0.48	0.42	0.66	0.47	0.89	0.43	0.83	0.30	0.03	0.02	0.00	0.01
P	0.11	0.28	0.48	0.21	0.41	0.07	0.37	0.02	0.26	0.21	0.37	0.26	0.47	0.17	0.46	0.26	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.11	0.13	0.14	0.16	0.10	0.15	0.10	0.21	0.12	0.11	0.13	0.17	0.11	0.11	0.10	0.20	0.17	0.10	0.18	0.12	1.17	0.76	0.87
C2	0.13	0.13	0.17	0.16	0.11	0.11	0.12	0.12	0.13	0.13	0.13	0.16	0.10	0.12	0.12	0.27	0.21	0.12	0.26	0.13	0.97	0.68	0.76
C2'	0.37	0.27	0.40	0.36	0.32	0.33	0.32	0.30	0.29	0.36	0.28	0.26	0.29	0.34	0.36	0.50	0.36	0.35	0.28	0.29	0.88	0.50	0.60
C3'	0.15	0.26	0.15	0.17	0.18	0.21	0.18	0.27	0.21	0.15	0.25	0.31	0.23	0.16	0.15	0.17	0.15	0.18	0.29	0.22	0.73	0.52	0.50
C4	0.16	0.13	0.19	0.16	0.13	0.11	0.13	0.12	0.13	0.15	0.14	0.15	0.11	0.14	0.15	0.29	0.23	0.16	0.34	0.14	0.67	0.62	0.59
C4'	0.15	0.20	0.18	0.17	0.16	0.18	0.16	0.25	0.17	0.15	0.19	0.23	0.19	0.15	0.15	0.23	0.21	0.16	0.30	0.17	0.78	0.57	0.51
C5	0.15	0.12	0.18	0.16	0.10	0.10	0.11	0.10	0.11	0.13	0.12	0.16	0.10	0.12	0.13	0.29	0.23	0.14	0.27	0.12	0.65	0.50	0.55
C5'	0.27	0.30	0.20	0.21	0.28	0.41	0.28	0.46	0.29	0.27	0.29	0.31	0.29	0.27	0.27	0.23	0.18	0.40	0.55	0.29	0.46	0.60	0.35
C6	0.12	0.13	0.17	0.16	0.09	0.11	0.10	0.11	0.11	0.12	0.13	0.17	0.10	0.11	0.11	0.26	0.22	0.11	0.19	0.11	0.82	0.49	0.65
N1	0.11	0.13	0.15	0.16	0.10	0.12	0.10	0.14	0.11	0.11	0.13	0.17	0.10	0.11	0.11	0.24	0.20	0.11	0.20	0.12	0.98	0.63	0.76
N3	0.15	0.13	0.18	0.16	0.12	0.11	0.13	0.11	0.14	0.14	0.14	0.16	0.11	0.14	0.14	0.29	0.22	0.15	0.31	0.15	0.82	0.66	0.68
O2	0.12	0.13	0.16	0.16	0.11	0.12	0.12	0.14	0.13	0.13	0.14	0.16	0.11	0.12	0.12	0.27	0.21	0.12	0.25	0.14	1.05	0.74	0.81
O2'	0.40	0.49	0.40	0.27	0.45	0.19	0.45	0.17	0.46	0.41	0.48	0.51	0.48	0.42	0.43	0.59	0.32	0.29	0.16	0.46	1.32	0.85	0.94
O3'	0.17	0.29	0.16	0.16	0.22	0.19	0.22	0.27	0.25	0.17	0.29	0.34	0.26	0.19	0.18	0.20	0.16	0.15	0.30	0.26	0.77	0.67	0.56
O4	0.17	0.14	0.19	0.16	0.16	0.13	0.16	0.16	0.16	0.18	0.16	0.16	0.14	0.17	0.17	0.29	0.22	0.18	0.40	0.17	0.56	0.70	0.56
O4'	0.27	0.21	0.35	0.37	0.22	0.27	0.22	0.30	0.21	0.25	0.21	0.22	0.21	0.23	0.24	0.36	0.43	0.18	0.22	0.21	1.12	0.72	0.80
O5'	0.16	0.37	0.11	0.11	0.26	0.25	0.24	0.36	0.29	0.16	0.35	0.43	0.33	0.19	0.18	0.25	0.02	0.15	0.42	0.29	0.36	0.50	0.29
OP1	0.23	0.43	0.27	0.09	0.34	0.26	0.33	0.43	0.38	0.24	0.42	0.47	0.40	0.28	0.28	0.56	0.03	0.09	0.55	0.37	0.44	0.82	0.45
OP2	0.56	0.91	0.38	0.11	0.78	0.10	0.77	0.11	0.85	0.60	0.91	0.95	0.86	0.68	0.66	0.50	0.03	0.36	0.29	0.84	0.28	0.41	0.36
P	0.28	0.49	0.22	0.02	0.40	0.11	0.39	0.21	0.43	0.28	0.48	0.53	0.46	0.32	0.33	0.36	0.01	0.11	0.33	0.43	0.24	0.49	0.28

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.07	0.03	0.01	0.04	0.06	0.05	0.01	0.00	0.02	0.11	0.00	0.16	0.03	0.22	0.47	0.16
C2	0.05	0.00	0.09	0.09	0.01	0.11	0.01	0.19	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.21	0.21	0.13	0.32	0.01	0.17	0.83	0.35
C2'	0.01	0.09	0.00	0.01	0.04	0.03	0.03	0.06	0.04	0.07	0.06	0.12	0.09	0.05	0.02	0.01	0.04	0.03	0.25	0.04	0.22	0.41	0.15
C3'	0.02	0.09	0.01	0.00	0.04	0.00	0.03	0.04	0.04	0.06	0.07	0.12	0.09	0.05	0.02	0.02	0.01	0.01	0.31	0.04	0.26	0.33	0.29
C4	0.02	0.01	0.04	0.04	0.00	0.07	0.00	0.18	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.12	0.15	0.08	0.27	0.01	0.23	0.85	0.32
C4'	0.01	0.11	0.03	0.00	0.07	0.00	0.08	0.01	0.09	0.08	0.10	0.12	0.10	0.08	0.05	0.02	0.03	0.01	0.02	0.10	0.29	0.17	0.23
C5	0.02	0.01	0.03	0.03	0.00	0.08	0.00	0.21	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.09	0.14	0.06	0.30	0.01	0.37	1.06	0.43
C5'	0.07	0.19	0.06	0.04	0.18	0.01	0.21	0.00	0.23	0.19	0.22	0.19	0.17	0.22	0.15	0.06	0.05	0.02	0.01	0.25	0.28	0.32	0.02
C6	0.03	0.01	0.04	0.04	0.01	0.09	0.01	0.23	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.16	0.08	0.34	0.01	0.34	1.11	0.46
C8	0.01	0.02	0.07	0.06	0.01	0.08	0.01	0.19	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.11	0.10	0.05	0.23	0.02	0.50	1.01	0.41
N1	0.04	0.00	0.06	0.07	0.01	0.10	0.01	0.22	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.17	0.19	0.11	0.34	0.01	0.20	0.99	0.40
N2	0.06	0.01	0.12	0.12	0.02	0.12	0.02	0.19	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.02	0.03	0.26	0.24	0.15	0.33	0.02	0.25	0.77	0.36
N3	0.05	0.01	0.09	0.09	0.00	0.10	0.01	0.17	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.20	0.20	0.13	0.28	0.01	0.19	0.73	0.30
N7	0.01	0.02	0.05	0.05	0.01	0.08	0.00	0.22	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.09	0.11	0.04	0.27	0.02	0.54	1.15	0.49
N9	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.05	0.01	0.15	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.00	0.05	0.12	0.02	0.22	0.02	0.28	0.79	0.28
O2'	0.02	0.21	0.01	0.02	0.12	0.02	0.09	0.06	0.12	0.11	0.17	0.26	0.20	0.09	0.05	0.00	0.07	0.03	0.31	0.11	0.22	0.45	0.23
O3'	0.11	0.21	0.04	0.01	0.15	0.03	0.14	0.05	0.16	0.10	0.19	0.24	0.20	0.11	0.12	0.07	0.00	0.09	0.26	0.15	0.45	0.31	0.42
O4'	0.00	0.13	0.03	0.01	0.08	0.01	0.06	0.02	0.08	0.05	0.11	0.15	0.13	0.04	0.02	0.03	0.09	0.00	0.30	0.07	0.26	0.48	0.30
O5'	0.16	0.32	0.25	0.31	0.27	0.02	0.30	0.01	0.34	0.23	0.34	0.33	0.28	0.27	0.22	0.31	0.26	0.30	0.00	0.35	0.02	0.03	0.01
O6	0.03	0.01	0.04	0.04	0.01	0.10	0.01	0.25	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.11	0.15	0.07	0.35	0.00	0.43	1.22	0.53
OP1	0.22	0.17	0.22	0.26	0.23	0.29	0.37	0.28	0.34	0.50	0.20	0.25	0.19	0.54	0.28	0.22	0.45	0.26	0.02	0.43	0.00	0.01	0.01
OP2	0.47	0.83	0.41	0.33	0.85	0.17	1.06	0.32	1.11	1.01	0.99	0.77	0.73	1.15	0.79	0.45	0.31	0.48	0.03	1.22	0.01	0.00	0.01
P	0.16	0.35	0.15	0.29	0.32	0.23	0.43	0.02	0.46	0.41	0.40	0.36	0.30	0.49	0.28	0.23	0.42	0.30	0.01	0.53	0.01	0.01	0.00