Doublet Group distance statistics: 49116

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 1, 2, 1, 0, 4, 4, 1, 2, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.002, 0.006, 0.010, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.006 std_dev=0.004
N3	A	0, 0.001, 0.006, 0.011, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.006 std_dev=0.005
N1	A	0, 0.000, 0.009, 0.018, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.009 std_dev=0.009
C6	A	0, 0.000, 0.009, 0.018, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.009 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.000, 0.009, 0.018, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.009 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.004, 0.014, 0.024, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.014 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.004, 0.015, 0.025, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.015 std_dev=0.010
O2	A	0, 0.007, 0.040, 0.072, 0.152 max_d=0.152 avg_d=0.040 std_dev=0.033
O4	A	0, -0.004, 0.034, 0.071, 0.131 max_d=0.131 avg_d=0.034 std_dev=0.037
O3'	B	0, 0.173, 0.436, 0.699, 1.136 max_d=1.136 avg_d=0.436 std_dev=0.263
C1'	B	0, 0.239, 0.513, 0.786, 0.999 max_d=0.999 avg_d=0.513 std_dev=0.274
O4'	B	0, 0.238, 0.517, 0.797, 1.130 max_d=1.130 avg_d=0.517 std_dev=0.280
O2'	B	0, 0.240, 0.539, 0.839, 1.255 max_d=1.255 avg_d=0.539 std_dev=0.300
C3'	B	0, 0.209, 0.512, 0.814, 1.171 max_d=1.171 avg_d=0.512 std_dev=0.303
C4'	B	0, 0.195, 0.499, 0.802, 1.182 max_d=1.182 avg_d=0.499 std_dev=0.303
C2'	B	0, 0.246, 0.556, 0.866, 1.127 max_d=1.127 avg_d=0.556 std_dev=0.310
C5'	B	0, 0.181, 0.532, 0.883, 1.356 max_d=1.356 avg_d=0.532 std_dev=0.351
O4'	A	0, -0.111, 0.266, 0.643, 1.148 max_d=1.148 avg_d=0.266 std_dev=0.377
N9	B	0, 0.246, 0.627, 1.008, 1.316 max_d=1.316 avg_d=0.627 std_dev=0.381
N3	B	0, 0.220, 0.631, 1.043, 1.441 max_d=1.441 avg_d=0.631 std_dev=0.411
C2'	A	0, -0.126, 0.297, 0.720, 1.270 max_d=1.270 avg_d=0.297 std_dev=0.423
C4	B	0, 0.241, 0.680, 1.119, 1.511 max_d=1.511 avg_d=0.680 std_dev=0.439
C8	B	0, 0.285, 0.767, 1.250, 1.691 max_d=1.691 avg_d=0.767 std_dev=0.483
C2	B	0, 0.240, 0.779, 1.318, 1.833 max_d=1.833 avg_d=0.779 std_dev=0.539
C5	B	0, 0.282, 0.849, 1.416, 1.945 max_d=1.945 avg_d=0.849 std_dev=0.567
N2	B	0, 0.235, 0.804, 1.373, 1.910 max_d=1.910 avg_d=0.804 std_dev=0.569
C4'	A	0, -0.128, 0.442, 1.012, 1.710 max_d=1.710 avg_d=0.442 std_dev=0.570
N7	B	0, 0.307, 0.891, 1.476, 2.024 max_d=2.024 avg_d=0.891 std_dev=0.584
C3'	A	0, -0.147, 0.449, 1.046, 1.696 max_d=1.696 avg_d=0.449 std_dev=0.596
P	A	0, 0.018, 0.639, 1.260, 2.268 max_d=2.268 avg_d=0.639 std_dev=0.621
N1	B	0, 0.284, 0.948, 1.612, 2.264 max_d=2.264 avg_d=0.948 std_dev=0.664
C6	B	0, 0.313, 0.997, 1.682, 2.365 max_d=2.365 avg_d=0.997 std_dev=0.685
C5'	A	0, -0.122, 0.629, 1.380, 2.330 max_d=2.330 avg_d=0.629 std_dev=0.751
O2'	A	0, -0.250, 0.524, 1.298, 2.164 max_d=2.164 avg_d=0.524 std_dev=0.774
O5'	A	0, -0.059, 0.722, 1.503, 2.678 max_d=2.678 avg_d=0.722 std_dev=0.781
O6	B	0, 0.368, 1.177, 1.986, 2.824 max_d=2.824 avg_d=1.177 std_dev=0.809
O3'	A	0, -0.259, 0.682, 1.623, 2.466 max_d=2.466 avg_d=0.682 std_dev=0.941
OP2	A	0, -0.063, 0.910, 1.883, 3.016 max_d=3.016 avg_d=0.910 std_dev=0.973
OP1	A	0, -0.005, 1.025, 2.054, 3.560 max_d=3.560 avg_d=1.025 std_dev=1.029
O5'	B	0, -0.168, 1.025, 2.217, 3.560 max_d=3.560 avg_d=1.025 std_dev=1.193
P	B	0, -0.388, 1.267, 2.921, 4.760 max_d=4.760 avg_d=1.267 std_dev=1.655
OP2	B	0, -0.313, 1.609, 3.531, 5.279 max_d=5.279 avg_d=1.609 std_dev=1.922
OP1	B	0, -0.547, 1.560, 3.667, 5.923 max_d=5.923 avg_d=1.560 std_dev=2.107

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.05	0.02	0.27	0.02	0.00	0.26	0.24	0.15	0.18
C2	0.02	0.00	0.16	0.24	0.01	0.07	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00	0.16	0.09	0.02	0.06	0.24	0.21	0.38	0.22
C2'	0.00	0.16	0.00	0.00	0.03	0.01	0.13	0.18	0.16	0.01	0.11	0.29	0.00	0.02	0.04	0.02	0.37	0.36	0.50	0.38
C3'	0.01	0.24	0.00	0.00	0.30	0.01	0.27	0.01	0.21	0.18	0.29	0.22	0.01	0.01	0.33	0.02	0.12	0.07	0.24	0.06
C4	0.01	0.01	0.03	0.30	0.00	0.14	0.00	0.25	0.01	0.01	0.01	0.02	0.31	0.12	0.00	0.03	0.22	0.20	0.65	0.28
C4'	0.00	0.07	0.01	0.01	0.14	0.00	0.16	0.00	0.15	0.09	0.11	0.06	0.25	0.01	0.16	0.00	0.01	0.12	0.16	0.04
C5	0.01	0.01	0.13	0.27	0.00	0.16	0.00	0.28	0.00	0.00	0.00	0.01	0.33	0.15	0.01	0.06	0.21	0.19	0.58	0.25
C5'	0.08	0.14	0.18	0.01	0.25	0.00	0.28	0.00	0.25	0.15	0.19	0.10	0.06	0.21	0.27	0.01	0.01	0.16	0.18	0.01
C6	0.01	0.01	0.16	0.21	0.01	0.15	0.00	0.25	0.00	0.00	0.01	0.01	0.28	0.12	0.01	0.07	0.25	0.20	0.37	0.21
N1	0.00	0.01	0.01	0.18	0.01	0.09	0.00	0.15	0.00	0.00	0.01	0.01	0.18	0.09	0.01	0.01	0.24	0.21	0.28	0.19
N3	0.01	0.01	0.11	0.29	0.01	0.11	0.00	0.19	0.01	0.01	0.00	0.02	0.24	0.06	0.01	0.05	0.23	0.20	0.55	0.26
O2	0.05	0.00	0.29	0.22	0.02	0.06	0.01	0.10	0.01	0.01	0.02	0.00	0.13	0.19	0.03	0.11	0.24	0.22	0.31	0.21
O2'	0.02	0.16	0.00	0.01	0.31	0.25	0.33	0.06	0.28	0.18	0.24	0.13	0.00	0.04	0.33	0.18	0.25	0.22	0.62	0.34
O3'	0.27	0.09	0.02	0.01	0.12	0.01	0.15	0.21	0.12	0.09	0.06	0.19	0.04	0.00	0.16	0.18	0.35	0.32	0.38	0.32
O4	0.02	0.02	0.04	0.33	0.00	0.16	0.01	0.27	0.01	0.01	0.01	0.03	0.33	0.16	0.00	0.03	0.21	0.20	0.75	0.31
O4'	0.00	0.06	0.02	0.02	0.03	0.00	0.06	0.01	0.07	0.01	0.05	0.11	0.18	0.18	0.03	0.00	0.18	0.26	0.16	0.22
O5'	0.26	0.24	0.37	0.12	0.22	0.01	0.21	0.01	0.25	0.24	0.23	0.24	0.25	0.35	0.21	0.18	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.24	0.21	0.36	0.07	0.20	0.12	0.19	0.16	0.20	0.21	0.20	0.22	0.22	0.32	0.20	0.26	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.15	0.38	0.50	0.24	0.65	0.16	0.58	0.18	0.37	0.28	0.55	0.31	0.62	0.38	0.75	0.16	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.18	0.22	0.38	0.06	0.28	0.04	0.25	0.01	0.21	0.19	0.26	0.21	0.34	0.32	0.31	0.22	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.16	0.16	0.20	0.22	0.14	0.14	0.13	0.17	0.14	0.15	0.15	0.18	0.15	0.14	0.15	0.25	0.30	0.15	0.59	0.14	1.30	1.09	1.12
C2	0.16	0.21	0.16	0.16	0.18	0.13	0.17	0.18	0.19	0.16	0.20	0.23	0.19	0.17	0.16	0.22	0.26	0.13	0.30	0.19	1.04	0.83	0.87
C2'	0.29	0.24	0.28	0.23	0.26	0.27	0.26	0.31	0.25	0.29	0.24	0.23	0.25	0.28	0.28	0.32	0.22	0.24	0.33	0.25	0.93	0.76	0.77
C3'	0.22	0.34	0.23	0.20	0.28	0.18	0.28	0.24	0.31	0.22	0.34	0.37	0.31	0.24	0.24	0.31	0.24	0.22	0.59	0.31	0.93	0.90	0.86
C4	0.18	0.22	0.17	0.14	0.21	0.18	0.22	0.22	0.22	0.21	0.21	0.21	0.22	0.22	0.21	0.20	0.21	0.16	0.20	0.22	0.59	0.48	0.50
C4'	0.20	0.25	0.28	0.27	0.22	0.17	0.21	0.25	0.23	0.19	0.25	0.28	0.24	0.20	0.20	0.38	0.35	0.19	0.68	0.22	1.03	0.99	0.94
C5	0.17	0.16	0.16	0.14	0.16	0.17	0.16	0.20	0.15	0.17	0.15	0.16	0.16	0.16	0.17	0.21	0.22	0.14	0.18	0.15	0.55	0.46	0.49
C5'	0.25	0.34	0.28	0.25	0.29	0.33	0.28	0.42	0.30	0.24	0.33	0.36	0.32	0.25	0.26	0.40	0.29	0.30	0.63	0.30	0.65	0.79	0.67
C6	0.15	0.15	0.17	0.16	0.14	0.12	0.13	0.17	0.13	0.14	0.14	0.16	0.14	0.14	0.14	0.23	0.26	0.13	0.26	0.13	0.79	0.67	0.72
N1	0.15	0.16	0.17	0.17	0.14	0.12	0.14	0.16	0.15	0.14	0.16	0.18	0.16	0.14	0.14	0.23	0.27	0.13	0.38	0.15	1.05	0.86	0.91
N3	0.17	0.23	0.16	0.14	0.21	0.16	0.21	0.21	0.23	0.20	0.23	0.25	0.22	0.21	0.19	0.21	0.23	0.14	0.18	0.23	0.83	0.65	0.68
O2	0.15	0.23	0.16	0.16	0.18	0.13	0.18	0.18	0.20	0.16	0.23	0.25	0.20	0.17	0.16	0.22	0.26	0.12	0.37	0.21	1.19	0.94	0.98
O2'	0.38	0.52	0.34	0.19	0.47	0.18	0.46	0.20	0.49	0.40	0.51	0.54	0.50	0.43	0.42	0.45	0.22	0.24	0.53	0.49	1.33	1.05	1.08
O3'	0.29	0.29	0.39	0.36	0.29	0.24	0.29	0.28	0.30	0.30	0.30	0.29	0.28	0.30	0.29	0.51	0.40	0.25	0.71	0.30	1.05	1.00	0.94
O4	0.20	0.26	0.18	0.15	0.26	0.21	0.27	0.25	0.27	0.26	0.26	0.25	0.26	0.28	0.25	0.19	0.19	0.20	0.33	0.28	0.44	0.42	0.38
O4'	0.28	0.20	0.38	0.40	0.22	0.22	0.22	0.19	0.21	0.26	0.20	0.20	0.21	0.24	0.25	0.45	0.52	0.23	0.72	0.21	1.30	1.13	1.14
O5'	0.08	0.18	0.07	0.11	0.13	0.38	0.13	0.51	0.15	0.08	0.18	0.20	0.16	0.10	0.09	0.30	0.01	0.24	0.48	0.15	0.37	0.49	0.39
OP1	0.13	0.24	0.23	0.08	0.20	0.39	0.20	0.58	0.22	0.16	0.24	0.25	0.22	0.18	0.17	0.57	0.02	0.19	0.50	0.22	0.69	0.62	0.49
OP2	0.61	0.88	0.49	0.11	0.81	0.07	0.81	0.10	0.87	0.68	0.89	0.87	0.84	0.74	0.72	0.72	0.01	0.39	0.24	0.87	0.33	0.27	0.14
P	0.24	0.37	0.25	0.01	0.32	0.19	0.32	0.30	0.35	0.25	0.37	0.38	0.35	0.28	0.28	0.47	0.00	0.09	0.34	0.35	0.31	0.36	0.21

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.02	0.02	0.00	0.02	0.06	0.03	0.01	0.04	0.04	0.04	0.00	0.00	0.01	0.06	0.00	0.45	0.02	0.39	0.38	0.30
C2	0.04	0.00	0.03	0.07	0.01	0.12	0.01	0.18	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.16	0.12	0.45	0.01	0.27	0.57	0.34
C2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.03	0.01	0.03	0.05	0.03	0.03	0.03	0.04	0.03	0.03	0.02	0.00	0.02	0.02	0.42	0.03	0.58	0.44	0.37
C3'	0.02	0.07	0.00	0.00	0.03	0.00	0.02	0.02	0.03	0.05	0.06	0.10	0.07	0.04	0.01	0.01	0.00	0.02	0.20	0.03	0.27	0.19	0.08
C4	0.02	0.01	0.03	0.03	0.00	0.07	0.01	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.07	0.10	0.07	0.59	0.01	0.47	0.69	0.47
C4'	0.00	0.12	0.01	0.00	0.07	0.00	0.08	0.01	0.10	0.10	0.11	0.15	0.11	0.10	0.05	0.01	0.03	0.00	0.01	0.10	0.19	0.28	0.22
C5	0.02	0.01	0.03	0.02	0.01	0.08	0.00	0.22	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.08	0.08	0.05	0.72	0.01	0.68	0.96	0.68
C5'	0.06	0.18	0.05	0.02	0.17	0.01	0.22	0.00	0.24	0.24	0.21	0.18	0.15	0.26	0.16	0.04	0.02	0.01	0.01	0.27	0.32	0.33	0.01
C6	0.03	0.01	0.03	0.03	0.01	0.10	0.01	0.24	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.10	0.08	0.68	0.01	0.61	0.96	0.64
C8	0.01	0.02	0.03	0.05	0.00	0.10	0.01	0.24	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.08	0.04	0.04	0.84	0.02	0.94	1.10	0.87
N1	0.04	0.01	0.03	0.06	0.01	0.11	0.01	0.21	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.14	0.11	0.56	0.01	0.40	0.75	0.47
N2	0.04	0.01	0.04	0.10	0.01	0.15	0.01	0.18	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.10	0.18	0.15	0.35	0.02	0.28	0.50	0.32
N3	0.04	0.00	0.03	0.07	0.00	0.11	0.00	0.15	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.08	0.15	0.12	0.43	0.02	0.26	0.49	0.30
N7	0.00	0.01	0.03	0.04	0.00	0.10	0.00	0.26	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.09	0.05	0.03	0.85	0.02	0.95	1.21	0.91
N9	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.05	0.01	0.16	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.05	0.06	0.01	0.64	0.01	0.59	0.71	0.54
O2'	0.01	0.09	0.00	0.01	0.07	0.01	0.08	0.04	0.09	0.08	0.09	0.10	0.08	0.09	0.05	0.00	0.05	0.01	0.41	0.09	0.62	0.53	0.39
O3'	0.06	0.16	0.02	0.00	0.10	0.03	0.08	0.02	0.10	0.04	0.14	0.18	0.15	0.05	0.06	0.05	0.00	0.10	0.20	0.09	0.19	0.28	0.27
O4'	0.00	0.12	0.02	0.02	0.07	0.00	0.05	0.01	0.08	0.04	0.11	0.15	0.12	0.03	0.01	0.01	0.10	0.00	0.37	0.07	0.25	0.31	0.24
O5'	0.45	0.45	0.42	0.20	0.59	0.01	0.72	0.01	0.68	0.84	0.56	0.35	0.43	0.85	0.64	0.41	0.20	0.37	0.00	0.74	0.02	0.01	0.00
O6	0.02	0.01	0.03	0.03	0.01	0.10	0.01	0.27	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.09	0.09	0.07	0.74	0.00	0.73	1.11	0.76
OP1	0.39	0.27	0.58	0.27	0.47	0.19	0.68	0.32	0.61	0.94	0.40	0.28	0.26	0.95	0.59	0.62	0.19	0.25	0.02	0.73	0.00	0.01	0.00
OP2	0.38	0.57	0.44	0.19	0.69	0.28	0.96	0.33	0.96	1.10	0.75	0.50	0.49	1.21	0.71	0.53	0.28	0.31	0.01	1.11	0.01	0.00	0.00
P	0.30	0.34	0.37	0.08	0.47	0.22	0.68	0.01	0.64	0.87	0.47	0.32	0.30	0.91	0.54	0.39	0.27	0.24	0.00	0.76	0.00	0.00	0.00