Doublet Group distance statistics: 49119

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 2, 2, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.008, 0.017, 0.027, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.017 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.010, 0.020, 0.029, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.020 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.007, 0.017, 0.027, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.017 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.008, 0.018, 0.029, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.018 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.015, 0.028, 0.040, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.028 std_dev=0.013
C6	A	0, 0.007, 0.020, 0.033, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.020 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.011, 0.026, 0.041, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.026 std_dev=0.015
O2	A	0, 0.045, 0.080, 0.115, 0.119 max_d=0.119 avg_d=0.080 std_dev=0.035
C2'	A	0, 0.013, 0.052, 0.091, 0.146 max_d=0.146 avg_d=0.052 std_dev=0.039
O4	A	0, 0.010, 0.053, 0.097, 0.150 max_d=0.150 avg_d=0.053 std_dev=0.043
O4'	A	0, 0.041, 0.093, 0.146, 0.184 max_d=0.184 avg_d=0.093 std_dev=0.052
C4'	A	0, 0.029, 0.099, 0.169, 0.249 max_d=0.249 avg_d=0.099 std_dev=0.070
C3'	A	0, 0.024, 0.095, 0.165, 0.253 max_d=0.253 avg_d=0.095 std_dev=0.071
O5'	A	0, 0.055, 0.132, 0.209, 0.217 max_d=0.217 avg_d=0.132 std_dev=0.077
O2'	A	0, 0.054, 0.133, 0.211, 0.234 max_d=0.234 avg_d=0.133 std_dev=0.079
P	A	0, 0.049, 0.132, 0.214, 0.311 max_d=0.311 avg_d=0.132 std_dev=0.083
C5'	A	0, 0.044, 0.150, 0.257, 0.404 max_d=0.404 avg_d=0.150 std_dev=0.106
O3'	A	0, 0.040, 0.151, 0.262, 0.386 max_d=0.386 avg_d=0.151 std_dev=0.111
OP2	A	0, 0.062, 0.250, 0.438, 0.605 max_d=0.605 avg_d=0.250 std_dev=0.188
OP1	A	0, 0.049, 0.243, 0.436, 0.596 max_d=0.596 avg_d=0.243 std_dev=0.193
O2'	B	0, 0.131, 0.512, 0.893, 1.121 max_d=1.121 avg_d=0.512 std_dev=0.381
C2'	B	0, 0.054, 0.582, 1.109, 1.550 max_d=1.550 avg_d=0.582 std_dev=0.528
O3'	B	0, 0.034, 0.570, 1.105, 1.520 max_d=1.520 avg_d=0.570 std_dev=0.536
C1'	B	0, 0.031, 0.596, 1.161, 1.653 max_d=1.653 avg_d=0.596 std_dev=0.565
OP2	B	0, 0.274, 0.864, 1.454, 1.796 max_d=1.796 avg_d=0.864 std_dev=0.590
P	B	0, 0.179, 0.775, 1.371, 1.914 max_d=1.914 avg_d=0.775 std_dev=0.596
C3'	B	0, 0.005, 0.609, 1.212, 1.729 max_d=1.729 avg_d=0.609 std_dev=0.603
O4'	B	0, -0.037, 0.640, 1.318, 1.918 max_d=1.918 avg_d=0.640 std_dev=0.678
C4'	B	0, -0.032, 0.651, 1.334, 1.945 max_d=1.945 avg_d=0.651 std_dev=0.683
OP1	B	0, 0.173, 0.872, 1.572, 2.148 max_d=2.148 avg_d=0.872 std_dev=0.700
N9	B	0, 0.039, 0.794, 1.548, 2.178 max_d=2.178 avg_d=0.794 std_dev=0.754
O5'	B	0, 0.087, 0.912, 1.736, 2.517 max_d=2.517 avg_d=0.912 std_dev=0.825
C5'	B	0, -0.091, 0.802, 1.695, 2.493 max_d=2.493 avg_d=0.802 std_dev=0.893
C8	B	0, 0.048, 0.954, 1.859, 2.610 max_d=2.610 avg_d=0.954 std_dev=0.905
C4	B	0, 0.022, 0.996, 1.971, 2.750 max_d=2.750 avg_d=0.996 std_dev=0.975
N3	B	0, 0.001, 1.050, 2.099, 2.907 max_d=2.907 avg_d=1.050 std_dev=1.049
N7	B	0, 0.041, 1.192, 2.343, 3.264 max_d=3.264 avg_d=1.192 std_dev=1.151
C5	B	0, 0.022, 1.210, 2.398, 3.339 max_d=3.339 avg_d=1.210 std_dev=1.188
C2	B	0, -0.022, 1.303, 2.628, 3.633 max_d=3.633 avg_d=1.303 std_dev=1.325
C6	B	0, 0.006, 1.474, 2.941, 4.066 max_d=4.066 avg_d=1.474 std_dev=1.468
N2	B	0, -0.043, 1.449, 2.940, 4.041 max_d=4.041 avg_d=1.449 std_dev=1.491
N1	B	0, -0.017, 1.482, 2.981, 4.125 max_d=4.125 avg_d=1.482 std_dev=1.499
O6	B	0, 0.006, 1.710, 3.414, 4.681 max_d=4.681 avg_d=1.710 std_dev=1.704

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.03	0.06	0.04
C2	0.01	0.00	0.03	0.04	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.04	0.02	0.01	0.06	0.06	0.09	0.07
C2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.05	0.10	0.05
C3'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.04	0.00	0.03	0.01	0.03	0.03	0.04	0.05	0.01	0.00	0.05	0.01	0.07	0.06	0.10	0.06
C4	0.02	0.01	0.02	0.04	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.05	0.01	0.02	0.09	0.09	0.12	0.09
C4'	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.01	0.03	0.04	0.02	0.03	0.00	0.02	0.04	0.04	0.02
C5	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.02	0.03	0.10	0.10	0.13	0.10
C5'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.00	0.03	0.03	0.03	0.04	0.04	0.02	0.03	0.01	0.01	0.05	0.02	0.01
C6	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.03	0.09	0.08	0.11	0.09
N1	0.00	0.00	0.01	0.03	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.07	0.06	0.09	0.07
N3	0.01	0.00	0.02	0.04	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.05	0.02	0.01	0.07	0.08	0.11	0.08
O2	0.03	0.00	0.05	0.05	0.02	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.07	0.05	0.03	0.03	0.06	0.06	0.09	0.07
O2'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.03	0.04	0.01	0.04	0.01	0.01	0.04	0.07	0.00	0.04	0.04	0.02	0.04	0.07	0.08	0.05
O3'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.05	0.02	0.05	0.02	0.03	0.03	0.05	0.05	0.04	0.00	0.06	0.02	0.09	0.10	0.12	0.07
O4	0.02	0.02	0.03	0.05	0.01	0.03	0.02	0.03	0.02	0.02	0.02	0.03	0.04	0.06	0.00	0.03	0.08	0.10	0.12	0.09
O4'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.03	0.02	0.02	0.03	0.00	0.06	0.05	0.06	0.05
O5'	0.04	0.06	0.04	0.07	0.09	0.02	0.10	0.01	0.09	0.07	0.07	0.06	0.04	0.09	0.08	0.06	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.03	0.06	0.05	0.06	0.09	0.04	0.10	0.05	0.08	0.06	0.08	0.06	0.07	0.10	0.10	0.05	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.06	0.09	0.10	0.10	0.12	0.04	0.13	0.02	0.11	0.09	0.11	0.09	0.08	0.12	0.12	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.04	0.07	0.05	0.06	0.09	0.02	0.10	0.01	0.09	0.07	0.08	0.07	0.05	0.07	0.09	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.39	1.11	0.20	0.11	0.81	0.17	0.91	0.17	1.09	0.63	1.18	1.23	0.89	0.80	0.60	0.19	0.07	0.35	0.22	1.15	0.56	0.47	0.32
C2	0.35	0.99	0.18	0.09	0.78	0.14	0.91	0.18	1.06	0.67	1.09	1.00	0.79	0.84	0.60	0.15	0.06	0.30	0.23	1.12	0.54	0.46	0.32
C2'	0.35	1.07	0.16	0.06	0.79	0.12	0.92	0.12	1.12	0.63	1.18	1.17	0.84	0.82	0.59	0.18	0.05	0.30	0.18	1.20	0.53	0.49	0.30
C3'	0.32	1.01	0.13	0.02	0.73	0.06	0.84	0.04	1.02	0.56	1.10	1.11	0.80	0.73	0.53	0.18	0.06	0.25	0.12	1.09	0.51	0.50	0.27
C4	0.24	0.58	0.13	0.06	0.57	0.04	0.65	0.06	0.70	0.52	0.67	0.48	0.52	0.63	0.46	0.15	0.11	0.14	0.13	0.74	0.49	0.46	0.28
C4'	0.34	1.05	0.16	0.05	0.74	0.09	0.82	0.06	1.00	0.53	1.10	1.19	0.85	0.69	0.53	0.19	0.03	0.27	0.13	1.05	0.52	0.47	0.27
C5	0.27	0.67	0.15	0.04	0.56	0.04	0.61	0.04	0.68	0.45	0.70	0.66	0.59	0.55	0.44	0.20	0.08	0.15	0.10	0.70	0.52	0.48	0.28
C5'	0.30	0.96	0.13	0.03	0.66	0.07	0.71	0.06	0.88	0.43	0.99	1.10	0.78	0.57	0.46	0.19	0.03	0.22	0.09	0.91	0.49	0.46	0.24
C6	0.33	0.86	0.17	0.06	0.66	0.07	0.72	0.07	0.83	0.50	0.88	0.91	0.74	0.63	0.50	0.20	0.04	0.23	0.14	0.85	0.54	0.48	0.29
N1	0.36	1.00	0.19	0.09	0.76	0.13	0.85	0.14	1.00	0.61	1.06	1.07	0.83	0.76	0.58	0.18	0.06	0.30	0.20	1.04	0.55	0.47	0.31
N3	0.29	0.79	0.15	0.07	0.70	0.09	0.83	0.13	0.93	0.64	0.91	0.68	0.65	0.79	0.55	0.14	0.08	0.23	0.20	0.98	0.51	0.45	0.30
O2	0.37	1.06	0.19	0.11	0.82	0.18	1.00	0.23	1.19	0.73	1.22	1.08	0.80	0.93	0.63	0.14	0.07	0.34	0.27	1.28	0.55	0.46	0.34
O2'	0.39	1.15	0.19	0.09	0.84	0.17	0.98	0.18	1.20	0.68	1.28	1.26	0.89	0.88	0.62	0.19	0.05	0.36	0.23	1.31	0.55	0.48	0.32
O3'	0.31	1.01	0.11	0.03	0.73	0.05	0.85	0.04	1.04	0.56	1.12	1.11	0.79	0.74	0.53	0.16	0.08	0.24	0.11	1.13	0.50	0.50	0.27
O4	0.13	0.31	0.09	0.11	0.40	0.09	0.51	0.06	0.52	0.46	0.42	0.19	0.27	0.54	0.36	0.13	0.18	0.05	0.11	0.56	0.45	0.44	0.25
O4'	0.38	1.07	0.20	0.11	0.77	0.15	0.84	0.13	1.01	0.56	1.11	1.21	0.88	0.71	0.56	0.20	0.09	0.32	0.19	1.05	0.55	0.46	0.30
O5'	0.33	0.90	0.15	0.06	0.64	0.11	0.68	0.09	0.82	0.44	0.91	1.01	0.75	0.56	0.47	0.20	0.07	0.25	0.13	0.84	0.54	0.51	0.29
OP1	0.19	0.77	0.06	0.13	0.49	0.20	0.51	0.28	0.65	0.25	0.77	0.90	0.62	0.37	0.31	0.17	0.15	0.16	0.19	0.67	0.38	0.42	0.14
OP2	0.21	0.63	0.09	0.10	0.43	0.14	0.43	0.20	0.53	0.24	0.62	0.73	0.54	0.33	0.29	0.18	0.13	0.15	0.14	0.54	0.49	0.50	0.24
P	0.20	0.72	0.06	0.10	0.47	0.16	0.48	0.21	0.61	0.25	0.72	0.85	0.60	0.36	0.31	0.15	0.12	0.16	0.15	0.62	0.43	0.43	0.18

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.06	0.00	0.02	0.03	0.01	0.02	0.05	0.03	0.02	0.04	0.08	0.06	0.02	0.01	0.02	0.10	0.00	0.11	0.03	0.19	0.17	0.03
C2	0.06	0.00	0.11	0.08	0.02	0.15	0.01	0.14	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.21	0.21	0.17	0.17	0.01	0.08	0.40	0.26
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.05	0.02	0.05	0.07	0.07	0.03	0.10	0.13	0.09	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.15	0.07	0.43	0.38	0.25
C3'	0.02	0.08	0.00	0.00	0.03	0.00	0.03	0.02	0.03	0.07	0.04	0.12	0.08	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.05	0.51	0.42	0.29
C4	0.03	0.02	0.05	0.03	0.00	0.07	0.00	0.11	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.01	0.10	0.15	0.10	0.20	0.02	0.10	0.37	0.28
C4'	0.01	0.15	0.02	0.00	0.07	0.00	0.04	0.01	0.06	0.09	0.11	0.19	0.15	0.07	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.06	0.27	0.22	0.10
C5	0.02	0.01	0.05	0.03	0.00	0.04	0.00	0.15	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.06	0.11	0.06	0.28	0.02	0.29	0.57	0.44
C5'	0.05	0.14	0.07	0.02	0.11	0.01	0.15	0.00	0.15	0.21	0.13	0.17	0.14	0.21	0.12	0.06	0.03	0.02	0.00	0.17	0.09	0.08	0.01
C6	0.03	0.01	0.07	0.03	0.01	0.06	0.01	0.15	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.10	0.13	0.09	0.28	0.01	0.33	0.65	0.48
C8	0.02	0.02	0.03	0.07	0.01	0.09	0.01	0.21	0.02	0.00	0.02	0.03	0.01	0.00	0.01	0.10	0.06	0.06	0.33	0.03	0.31	0.46	0.42
N1	0.04	0.01	0.10	0.04	0.02	0.11	0.01	0.13	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.17	0.18	0.13	0.22	0.01	0.19	0.54	0.39
N2	0.08	0.01	0.13	0.12	0.03	0.19	0.02	0.17	0.01	0.03	0.01	0.00	0.03	0.02	0.04	0.26	0.25	0.19	0.15	0.02	0.12	0.35	0.21
N3	0.06	0.01	0.09	0.08	0.01	0.15	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.02	0.18	0.21	0.17	0.15	0.01	0.10	0.29	0.19
N7	0.02	0.01	0.03	0.06	0.01	0.07	0.00	0.21	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.07	0.07	0.03	0.34	0.03	0.43	0.65	0.53
N9	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.12	0.02	0.01	0.02	0.04	0.02	0.01	0.00	0.04	0.10	0.01	0.22	0.02	0.08	0.28	0.23
O2'	0.02	0.21	0.01	0.01	0.10	0.02	0.06	0.06	0.10	0.10	0.17	0.26	0.18	0.07	0.04	0.00	0.03	0.02	0.18	0.08	0.56	0.49	0.35
O3'	0.10	0.21	0.02	0.00	0.15	0.02	0.11	0.03	0.13	0.06	0.18	0.25	0.21	0.07	0.10	0.03	0.00	0.07	0.06	0.11	0.55	0.43	0.29
O4'	0.00	0.17	0.01	0.01	0.10	0.00	0.06	0.02	0.09	0.06	0.13	0.19	0.17	0.03	0.01	0.02	0.07	0.00	0.10	0.07	0.11	0.22	0.12
O5'	0.11	0.17	0.15	0.08	0.20	0.01	0.28	0.00	0.28	0.33	0.22	0.15	0.15	0.34	0.22	0.18	0.06	0.10	0.00	0.32	0.02	0.02	0.01
O6	0.03	0.01	0.07	0.05	0.02	0.06	0.02	0.17	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.08	0.11	0.07	0.32	0.00	0.46	0.77	0.58
OP1	0.19	0.08	0.43	0.51	0.10	0.27	0.29	0.09	0.33	0.31	0.19	0.12	0.10	0.43	0.08	0.56	0.55	0.11	0.02	0.46	0.00	0.02	0.01
OP2	0.17	0.40	0.38	0.42	0.37	0.22	0.57	0.08	0.65	0.46	0.54	0.35	0.29	0.65	0.28	0.49	0.43	0.22	0.02	0.77	0.02	0.00	0.01
P	0.03	0.26	0.25	0.29	0.28	0.10	0.44	0.01	0.48	0.42	0.39	0.21	0.19	0.53	0.23	0.35	0.29	0.12	0.01	0.58	0.01	0.01	0.00