Doublet Group distance statistics: 49123

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 1, 1, 1, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.001, 0.011, 0.021, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.011 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.007, 0.018, 0.030, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.018 std_dev=0.012
C5	A	0, 0.005, 0.017, 0.029, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.017 std_dev=0.012
C6	A	0, 0.008, 0.020, 0.033, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.020 std_dev=0.013
N1	A	0, 0.000, 0.013, 0.026, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.013 std_dev=0.013
C2	A	0, 0.001, 0.018, 0.035, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.018 std_dev=0.017
C1'	A	0, 0.002, 0.022, 0.043, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.022 std_dev=0.021
C2'	A	0, 0.045, 0.101, 0.158, 0.184 max_d=0.184 avg_d=0.101 std_dev=0.057
O4'	A	0, 0.057, 0.117, 0.178, 0.204 max_d=0.204 avg_d=0.117 std_dev=0.061
O2	A	0, -0.004, 0.060, 0.125, 0.209 max_d=0.209 avg_d=0.060 std_dev=0.065
O2'	A	0, 0.061, 0.132, 0.204, 0.208 max_d=0.208 avg_d=0.132 std_dev=0.071
C4'	A	0, 0.086, 0.185, 0.284, 0.276 max_d=0.276 avg_d=0.185 std_dev=0.099
C3'	A	0, 0.081, 0.181, 0.281, 0.295 max_d=0.295 avg_d=0.181 std_dev=0.100
O4	A	0, 0.007, 0.116, 0.224, 0.262 max_d=0.262 avg_d=0.116 std_dev=0.109
O3'	A	0, 0.107, 0.257, 0.407, 0.444 max_d=0.444 avg_d=0.257 std_dev=0.150
C5'	A	0, 0.130, 0.291, 0.452, 0.471 max_d=0.471 avg_d=0.291 std_dev=0.161
O5'	A	0, 0.108, 0.280, 0.452, 0.523 max_d=0.523 avg_d=0.280 std_dev=0.172
C4	B	0, 0.166, 0.345, 0.524, 0.542 max_d=0.542 avg_d=0.345 std_dev=0.179
N3	B	0, 0.150, 0.340, 0.529, 0.597 max_d=0.597 avg_d=0.340 std_dev=0.190
C2	B	0, 0.184, 0.429, 0.674, 0.671 max_d=0.671 avg_d=0.429 std_dev=0.245
N9	B	0, 0.169, 0.416, 0.663, 0.740 max_d=0.740 avg_d=0.416 std_dev=0.247
O2'	B	0, 0.166, 0.459, 0.752, 0.808 max_d=0.808 avg_d=0.459 std_dev=0.293
C5	B	0, 0.181, 0.492, 0.802, 0.916 max_d=0.916 avg_d=0.492 std_dev=0.311
N2	B	0, 0.235, 0.569, 0.904, 0.961 max_d=0.961 avg_d=0.569 std_dev=0.335
C2'	B	0, 0.126, 0.464, 0.801, 0.979 max_d=0.979 avg_d=0.464 std_dev=0.337
N1	B	0, 0.184, 0.529, 0.873, 0.963 max_d=0.963 avg_d=0.529 std_dev=0.345
OP2	A	0, 0.020, 0.374, 0.728, 0.934 max_d=0.934 avg_d=0.374 std_dev=0.354
P	A	0, 0.095, 0.453, 0.812, 0.980 max_d=0.980 avg_d=0.453 std_dev=0.359
C1'	B	0, 0.140, 0.502, 0.864, 1.042 max_d=1.042 avg_d=0.502 std_dev=0.362
C8	B	0, 0.139, 0.540, 0.940, 1.142 max_d=1.142 avg_d=0.540 std_dev=0.401
C6	B	0, 0.182, 0.587, 0.992, 1.159 max_d=1.159 avg_d=0.587 std_dev=0.405
N7	B	0, 0.142, 0.598, 1.054, 1.282 max_d=1.282 avg_d=0.598 std_dev=0.456
OP1	A	0, 0.154, 0.629, 1.104, 1.261 max_d=1.261 avg_d=0.629 std_dev=0.475
O6	B	0, 0.194, 0.776, 1.359, 1.650 max_d=1.650 avg_d=0.776 std_dev=0.582
O4'	B	0, 0.025, 0.683, 1.341, 1.728 max_d=1.728 avg_d=0.683 std_dev=0.658
C3'	B	0, 0.004, 0.705, 1.406, 1.830 max_d=1.830 avg_d=0.705 std_dev=0.701
O3'	B	0, 0.007, 0.842, 1.678, 2.139 max_d=2.139 avg_d=0.842 std_dev=0.836
C4'	B	0, -0.061, 0.837, 1.735, 2.281 max_d=2.281 avg_d=0.837 std_dev=0.898
C5'	B	0, -0.126, 1.006, 2.137, 2.829 max_d=2.829 avg_d=1.006 std_dev=1.131
O5'	B	0, -0.439, 1.591, 3.620, 4.850 max_d=4.850 avg_d=1.591 std_dev=2.030
OP2	B	0, -0.482, 1.863, 4.208, 5.613 max_d=5.613 avg_d=1.863 std_dev=2.345
P	B	0, -0.754, 2.219, 5.193, 6.964 max_d=6.964 avg_d=2.219 std_dev=2.974
OP1	B	0, -0.945, 2.950, 6.845, 9.143 max_d=9.143 avg_d=2.950 std_dev=3.895

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.02	0.01	0.03	0.08	0.01	0.01	0.03	0.01	0.05	0.05	0.08	0.07
C2	0.03	0.00	0.04	0.05	0.01	0.04	0.02	0.06	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.05	0.08	0.10	0.11	0.11
C2'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.04	0.01	0.04	0.02	0.04	0.02	0.03	0.08	0.00	0.01	0.05	0.01	0.03	0.06	0.06	0.04
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.05	0.01	0.06	0.02	0.06	0.04	0.04	0.08	0.01	0.01	0.07	0.02	0.05	0.09	0.09	0.06
C4	0.03	0.01	0.04	0.05	0.00	0.05	0.01	0.07	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.06	0.00	0.04	0.08	0.08	0.07	0.08
C4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.05	0.00	0.05	0.01	0.05	0.03	0.04	0.08	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.04	0.03	0.02
C5	0.03	0.02	0.04	0.06	0.01	0.05	0.00	0.08	0.00	0.02	0.01	0.03	0.03	0.07	0.02	0.04	0.08	0.08	0.06	0.07
C5'	0.02	0.06	0.02	0.02	0.07	0.01	0.08	0.00	0.07	0.04	0.06	0.10	0.05	0.03	0.08	0.01	0.01	0.05	0.03	0.02
C6	0.02	0.02	0.04	0.06	0.01	0.05	0.00	0.07	0.00	0.01	0.01	0.05	0.03	0.07	0.01	0.04	0.07	0.07	0.06	0.06
N1	0.01	0.02	0.02	0.04	0.02	0.03	0.02	0.04	0.01	0.00	0.01	0.05	0.01	0.04	0.02	0.02	0.06	0.07	0.09	0.08
N3	0.03	0.01	0.03	0.04	0.00	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.04	0.01	0.04	0.07	0.09	0.09	0.09
O2	0.08	0.01	0.08	0.08	0.01	0.08	0.03	0.10	0.05	0.05	0.00	0.00	0.06	0.07	0.01	0.09	0.12	0.14	0.13	0.14
O2'	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.04	0.03	0.05	0.03	0.01	0.03	0.06	0.00	0.02	0.06	0.03	0.03	0.07	0.05	0.04
O3'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.06	0.01	0.07	0.03	0.07	0.04	0.04	0.07	0.02	0.00	0.08	0.01	0.08	0.15	0.14	0.11
O4	0.03	0.01	0.05	0.07	0.00	0.06	0.02	0.08	0.01	0.02	0.01	0.01	0.06	0.08	0.00	0.05	0.10	0.10	0.09	0.10
O4'	0.01	0.05	0.01	0.02	0.04	0.01	0.04	0.01	0.04	0.02	0.04	0.09	0.03	0.01	0.05	0.00	0.08	0.08	0.12	0.11
O5'	0.05	0.08	0.03	0.05	0.08	0.01	0.08	0.01	0.07	0.06	0.07	0.12	0.03	0.08	0.10	0.08	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.05	0.10	0.06	0.09	0.08	0.04	0.08	0.05	0.07	0.07	0.09	0.14	0.07	0.15	0.10	0.08	0.02	0.00	0.03	0.01
OP2	0.08	0.11	0.06	0.09	0.07	0.03	0.06	0.03	0.06	0.09	0.09	0.13	0.05	0.14	0.09	0.12	0.02	0.03	0.00	0.02
P	0.07	0.11	0.04	0.06	0.08	0.02	0.07	0.02	0.06	0.08	0.09	0.14	0.04	0.11	0.10	0.11	0.01	0.01	0.02	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.30	0.22	0.37	0.53	0.17	0.59	0.22	0.76	0.31	0.29	0.30	0.22	0.15	0.23	0.24	0.20	0.39	0.43	1.73	0.41	2.52	1.85	2.35
C2	0.28	0.22	0.32	0.38	0.21	0.46	0.25	0.62	0.23	0.42	0.26	0.26	0.17	0.40	0.29	0.16	0.22	0.38	1.59	0.26	2.41	1.56	2.08
C2'	0.41	0.20	0.47	0.69	0.17	0.78	0.23	0.96	0.35	0.30	0.31	0.19	0.15	0.22	0.28	0.27	0.57	0.58	1.99	0.49	2.96	2.02	2.67
C3'	0.35	0.15	0.45	0.73	0.10	0.77	0.24	0.92	0.36	0.12	0.28	0.12	0.08	0.25	0.16	0.28	0.65	0.52	1.89	0.50	2.53	1.97	2.51
C4	0.19	0.17	0.21	0.18	0.21	0.24	0.27	0.34	0.20	0.35	0.16	0.21	0.16	0.37	0.25	0.10	0.14	0.22	1.16	0.19	1.71	1.04	1.44
C4'	0.25	0.14	0.35	0.62	0.10	0.63	0.21	0.75	0.31	0.11	0.25	0.12	0.08	0.21	0.12	0.22	0.56	0.40	1.57	0.44	2.07	1.90	2.22
C5	0.16	0.16	0.19	0.18	0.15	0.21	0.14	0.27	0.13	0.19	0.15	0.17	0.15	0.17	0.17	0.12	0.13	0.17	1.05	0.14	1.45	0.95	1.29
C5'	0.16	0.10	0.25	0.53	0.09	0.49	0.23	0.54	0.29	0.14	0.21	0.06	0.04	0.26	0.05	0.20	0.55	0.27	1.12	0.41	1.30	1.54	1.65
C6	0.21	0.18	0.27	0.32	0.16	0.34	0.18	0.42	0.23	0.20	0.22	0.18	0.15	0.17	0.19	0.18	0.21	0.25	1.27	0.27	1.71	1.22	1.60
N1	0.26	0.21	0.32	0.41	0.18	0.47	0.21	0.60	0.26	0.32	0.27	0.22	0.16	0.25	0.24	0.18	0.27	0.36	1.55	0.32	2.23	1.54	2.03
N3	0.25	0.21	0.27	0.28	0.23	0.36	0.31	0.50	0.23	0.44	0.21	0.26	0.17	0.47	0.30	0.13	0.15	0.32	1.41	0.24	2.15	1.33	1.81
O2	0.29	0.23	0.33	0.42	0.21	0.51	0.26	0.71	0.25	0.45	0.27	0.28	0.17	0.42	0.31	0.18	0.25	0.42	1.71	0.29	2.69	1.74	2.30
O2'	0.44	0.21	0.48	0.74	0.19	0.85	0.22	1.08	0.35	0.35	0.32	0.21	0.17	0.24	0.32	0.27	0.61	0.65	2.09	0.50	3.34	2.29	2.94
O3'	0.37	0.16	0.45	0.82	0.10	0.88	0.28	1.08	0.41	0.11	0.31	0.12	0.08	0.32	0.14	0.30	0.77	0.58	1.99	0.58	2.86	2.30	2.88
O4	0.19	0.22	0.17	0.14	0.29	0.19	0.40	0.28	0.38	0.38	0.26	0.22	0.21	0.45	0.28	0.08	0.22	0.22	1.02	0.41	1.54	0.88	1.24
O4'	0.21	0.17	0.29	0.47	0.12	0.51	0.19	0.64	0.28	0.15	0.26	0.17	0.11	0.17	0.13	0.17	0.38	0.33	1.50	0.38	2.06	1.76	2.12
O5'	0.15	0.06	0.24	0.50	0.07	0.43	0.20	0.42	0.24	0.16	0.16	0.03	0.03	0.25	0.05	0.20	0.53	0.23	0.91	0.34	0.91	1.20	1.26
OP1	0.08	0.04	0.07	0.37	0.09	0.32	0.21	0.28	0.23	0.24	0.13	0.07	0.05	0.30	0.10	0.13	0.57	0.18	0.25	0.33	0.33	0.74	0.47
OP2	0.05	0.05	0.05	0.17	0.06	0.10	0.15	0.08	0.15	0.22	0.05	0.12	0.06	0.23	0.09	0.13	0.39	0.04	0.07	0.22	0.25	0.42	0.22
P	0.07	0.02	0.10	0.34	0.07	0.27	0.19	0.21	0.21	0.20	0.12	0.07	0.03	0.26	0.07	0.16	0.49	0.13	0.36	0.29	0.17	0.79	0.63

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.03	0.02	0.02	0.03	0.02	0.03	0.02	0.03	0.04	0.02	0.03	0.01	0.02	0.08	0.01	0.45	0.05	0.65	0.23	0.38
C2	0.03	0.00	0.05	0.07	0.01	0.07	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.09	0.18	0.07	0.56	0.03	1.05	0.23	0.55
C2'	0.01	0.05	0.00	0.01	0.03	0.02	0.05	0.05	0.05	0.07	0.04	0.07	0.06	0.07	0.03	0.01	0.02	0.02	0.38	0.07	0.40	0.33	0.39
C3'	0.03	0.07	0.01	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.06	0.06	0.06	0.08	0.07	0.07	0.03	0.03	0.01	0.02	0.03	0.07	0.19	0.20	0.05
C4	0.02	0.01	0.03	0.04	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.14	0.04	0.69	0.02	1.22	0.33	0.71
C4'	0.02	0.07	0.02	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.04	0.07	0.05	0.10	0.07	0.06	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.06	0.07	0.09	0.13
C5	0.03	0.01	0.05	0.06	0.01	0.03	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.07	0.13	0.03	0.86	0.02	1.62	0.45	0.98
C5'	0.02	0.04	0.05	0.01	0.01	0.01	0.05	0.00	0.04	0.10	0.01	0.08	0.05	0.10	0.03	0.05	0.01	0.01	0.01	0.07	0.20	0.10	0.02
C6	0.03	0.01	0.05	0.06	0.01	0.04	0.01	0.04	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.03	0.03	0.06	0.15	0.04	0.84	0.01	1.66	0.44	0.98
C8	0.02	0.01	0.07	0.06	0.01	0.07	0.01	0.10	0.03	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.13	0.08	0.05	0.96	0.05	1.67	0.54	1.10
N1	0.03	0.01	0.04	0.06	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.04	0.17	0.05	0.71	0.03	1.37	0.33	0.77
N2	0.04	0.01	0.07	0.08	0.01	0.10	0.01	0.08	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.14	0.20	0.09	0.45	0.03	0.84	0.16	0.39
N3	0.02	0.01	0.06	0.07	0.01	0.07	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.09	0.18	0.07	0.51	0.02	0.91	0.21	0.47
N7	0.03	0.01	0.07	0.07	0.00	0.06	0.01	0.10	0.03	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.13	0.10	0.04	1.00	0.06	1.90	0.57	1.21
N9	0.01	0.02	0.03	0.03	0.01	0.02	0.03	0.03	0.03	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.05	0.09	0.01	0.72	0.05	1.18	0.36	0.74
O2'	0.02	0.09	0.01	0.03	0.03	0.02	0.07	0.05	0.06	0.13	0.04	0.14	0.09	0.13	0.05	0.00	0.06	0.02	0.31	0.10	0.27	0.35	0.35
O3'	0.08	0.18	0.02	0.01	0.14	0.02	0.13	0.01	0.15	0.08	0.17	0.20	0.18	0.10	0.09	0.06	0.00	0.05	0.16	0.15	0.48	0.09	0.27
O4'	0.01	0.07	0.02	0.02	0.04	0.01	0.03	0.01	0.04	0.05	0.05	0.09	0.07	0.04	0.01	0.02	0.05	0.00	0.33	0.06	0.57	0.15	0.19
O5'	0.45	0.56	0.38	0.03	0.69	0.01	0.86	0.01	0.84	0.96	0.71	0.45	0.51	1.00	0.72	0.31	0.16	0.33	0.00	0.91	0.02	0.01	0.01
O6	0.05	0.03	0.07	0.07	0.02	0.06	0.02	0.07	0.01	0.05	0.03	0.03	0.02	0.06	0.05	0.10	0.15	0.06	0.91	0.00	1.87	0.50	1.11
OP1	0.65	1.05	0.40	0.19	1.22	0.07	1.62	0.20	1.66	1.67	1.37	0.84	0.91	1.90	1.18	0.27	0.48	0.57	0.02	1.87	0.00	0.03	0.01
OP2	0.23	0.23	0.33	0.20	0.33	0.09	0.45	0.10	0.44	0.54	0.33	0.16	0.21	0.57	0.36	0.35	0.09	0.15	0.01	0.50	0.03	0.00	0.01
P	0.38	0.55	0.39	0.05	0.71	0.13	0.98	0.02	0.98	1.10	0.77	0.39	0.47	1.21	0.74	0.35	0.27	0.19	0.01	1.11	0.01	0.01	0.00