Doublet Group distance statistics: 49138

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.000, 0.006, 0.012, 0.012 max_d=0.012 avg_d=0.006 std_dev=0.006
C6	A	0, 0.000, 0.009, 0.018, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.009 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.000, 0.012, 0.024, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.012 std_dev=0.012
N3	A	0, 0.000, 0.013, 0.026, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.013 std_dev=0.013
C2	A	0, 0.000, 0.015, 0.030, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.015 std_dev=0.015
C1'	A	0, 0.000, 0.016, 0.033, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.016 std_dev=0.016
N1	A	0, 0.000, 0.018, 0.036, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.018 std_dev=0.018
O2	A	0, 0.000, 0.021, 0.041, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.021 std_dev=0.021
O4	A	0, 0.000, 0.091, 0.183, 0.183 max_d=0.183 avg_d=0.091 std_dev=0.091
O2'	B	0, 0.000, 0.328, 0.655, 0.655 max_d=0.655 avg_d=0.328 std_dev=0.328
OP1	A	0, 0.000, 0.333, 0.666, 0.666 max_d=0.666 avg_d=0.333 std_dev=0.333
C2'	B	0, 0.000, 0.343, 0.686, 0.686 max_d=0.686 avg_d=0.343 std_dev=0.343
C3'	B	0, 0.000, 0.376, 0.752, 0.752 max_d=0.752 avg_d=0.376 std_dev=0.376
P	A	0, 0.000, 0.412, 0.823, 0.823 max_d=0.823 avg_d=0.412 std_dev=0.412
C4'	B	0, 0.000, 0.427, 0.853, 0.853 max_d=0.853 avg_d=0.427 std_dev=0.427
OP2	A	0, 0.000, 0.450, 0.901, 0.901 max_d=0.901 avg_d=0.450 std_dev=0.450
O3'	B	0, 0.000, 0.451, 0.903, 0.903 max_d=0.903 avg_d=0.451 std_dev=0.451
O4'	A	0, 0.000, 0.549, 1.099, 1.099 max_d=1.099 avg_d=0.549 std_dev=0.549
O4'	B	0, 0.000, 0.608, 1.215, 1.215 max_d=1.215 avg_d=0.608 std_dev=0.608
O5'	A	0, 0.000, 0.658, 1.316, 1.316 max_d=1.316 avg_d=0.658 std_dev=0.658
C2'	A	0, 0.000, 0.674, 1.347, 1.347 max_d=1.347 avg_d=0.674 std_dev=0.674
C1'	B	0, 0.000, 0.686, 1.372, 1.372 max_d=1.372 avg_d=0.686 std_dev=0.686
C3'	A	0, 0.000, 0.766, 1.532, 1.532 max_d=1.532 avg_d=0.766 std_dev=0.766
C4'	A	0, 0.000, 0.813, 1.626, 1.626 max_d=1.626 avg_d=0.813 std_dev=0.813
C5'	B	0, 0.000, 0.872, 1.745, 1.745 max_d=1.745 avg_d=0.872 std_dev=0.872
O3'	A	0, 0.000, 0.899, 1.798, 1.798 max_d=1.798 avg_d=0.899 std_dev=0.899
P	B	0, 0.000, 0.987, 1.975, 1.975 max_d=1.975 avg_d=0.987 std_dev=0.987
N9	B	0, 0.000, 1.084, 2.168, 2.168 max_d=2.168 avg_d=1.084 std_dev=1.084
O5'	B	0, 0.000, 1.106, 2.212, 2.212 max_d=2.212 avg_d=1.106 std_dev=1.106
C5'	A	0, 0.000, 1.175, 2.349, 2.349 max_d=2.349 avg_d=1.175 std_dev=1.175
O2'	A	0, 0.000, 1.228, 2.456, 2.456 max_d=2.456 avg_d=1.228 std_dev=1.228
C8	B	0, 0.000, 1.285, 2.569, 2.569 max_d=2.569 avg_d=1.285 std_dev=1.285
C4	B	0, 0.000, 1.327, 2.653, 2.653 max_d=2.653 avg_d=1.327 std_dev=1.327
N3	B	0, 0.000, 1.370, 2.740, 2.740 max_d=2.740 avg_d=1.370 std_dev=1.370
N7	B	0, 0.000, 1.564, 3.127, 3.127 max_d=3.127 avg_d=1.564 std_dev=1.564
C5	B	0, 0.000, 1.578, 3.156, 3.156 max_d=3.156 avg_d=1.578 std_dev=1.578
OP2	B	0, 0.000, 1.621, 3.242, 3.242 max_d=3.242 avg_d=1.621 std_dev=1.621
C2	B	0, 0.000, 1.656, 3.313, 3.313 max_d=3.313 avg_d=1.656 std_dev=1.656
N2	B	0, 0.000, 1.794, 3.588, 3.588 max_d=3.588 avg_d=1.794 std_dev=1.794
OP1	B	0, 0.000, 1.805, 3.609, 3.609 max_d=3.609 avg_d=1.805 std_dev=1.805
C6	B	0, 0.000, 1.856, 3.713, 3.713 max_d=3.713 avg_d=1.856 std_dev=1.856
N1	B	0, 0.000, 1.866, 3.732, 3.732 max_d=3.732 avg_d=1.866 std_dev=1.866
O6	B	0, 0.000, 2.107, 4.213, 4.213 max_d=4.213 avg_d=2.107 std_dev=2.107

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.06	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.21	0.02	0.00	0.33	0.01	0.31	0.18
C2	0.02	0.00	0.16	0.23	0.01	0.09	0.01	0.05	0.01	0.00	0.00	0.00	0.12	0.05	0.01	0.01	0.38	0.05	0.31	0.22
C2'	0.00	0.16	0.00	0.00	0.03	0.00	0.16	0.16	0.19	0.01	0.10	0.32	0.00	0.00	0.04	0.02	0.63	0.37	0.76	0.58
C3'	0.00	0.23	0.00	0.00	0.23	0.01	0.16	0.02	0.11	0.15	0.26	0.24	0.01	0.00	0.24	0.02	0.31	0.12	0.44	0.23
C4	0.01	0.01	0.03	0.23	0.00	0.12	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00	0.34	0.03	0.00	0.04	0.42	0.14	0.30	0.27
C4'	0.00	0.09	0.00	0.01	0.12	0.00	0.10	0.00	0.09	0.07	0.11	0.08	0.20	0.04	0.12	0.01	0.03	0.05	0.11	0.04
C5	0.01	0.01	0.16	0.16	0.00	0.10	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.38	0.02	0.00	0.08	0.43	0.14	0.30	0.28
C5'	0.06	0.05	0.16	0.02	0.07	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.07	0.05	0.02	0.21	0.07	0.02	0.00	0.13	0.06	0.03
C6	0.00	0.01	0.19	0.11	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.33	0.02	0.00	0.10	0.43	0.09	0.31	0.26
N1	0.01	0.00	0.01	0.15	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.19	0.07	0.01	0.03	0.39	0.04	0.31	0.22
N3	0.02	0.00	0.10	0.26	0.00	0.11	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.23	0.01	0.00	0.01	0.40	0.10	0.31	0.25
O2	0.02	0.00	0.32	0.24	0.00	0.08	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.07	0.08	0.01	0.05	0.34	0.03	0.30	0.20
O2'	0.02	0.12	0.00	0.01	0.34	0.20	0.38	0.02	0.33	0.19	0.23	0.07	0.00	0.02	0.37	0.14	0.42	0.22	0.69	0.48
O3'	0.21	0.05	0.00	0.00	0.03	0.04	0.02	0.21	0.02	0.07	0.01	0.08	0.02	0.00	0.04	0.11	0.04	0.03	0.15	0.00
O4	0.02	0.01	0.04	0.24	0.00	0.12	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.37	0.04	0.00	0.04	0.43	0.16	0.31	0.29
O4'	0.00	0.01	0.02	0.02	0.04	0.01	0.08	0.02	0.10	0.03	0.01	0.05	0.14	0.11	0.04	0.00	0.07	0.19	0.01	0.10
O5'	0.33	0.38	0.63	0.31	0.42	0.03	0.43	0.00	0.43	0.39	0.40	0.34	0.42	0.04	0.43	0.07	0.00	0.00	0.01	0.00
OP1	0.01	0.05	0.37	0.12	0.14	0.05	0.14	0.13	0.09	0.04	0.10	0.03	0.22	0.03	0.16	0.19	0.00	0.00	0.00	0.00
OP2	0.31	0.31	0.76	0.44	0.30	0.11	0.30	0.06	0.31	0.31	0.31	0.30	0.69	0.15	0.31	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.18	0.22	0.58	0.23	0.27	0.04	0.28	0.03	0.26	0.22	0.25	0.20	0.48	0.00	0.29	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.30	0.62	0.05	0.09	0.50	0.09	0.47	0.28	0.53	0.32	0.59	0.67	0.58	0.38	0.39	0.21	0.17	0.17	0.03	0.53	0.31	0.02	0.17
C2	0.40	0.72	0.12	0.17	0.63	0.02	0.62	0.13	0.66	0.48	0.71	0.74	0.70	0.54	0.53	0.23	0.24	0.30	0.20	0.66	0.13	0.29	0.00
C2'	0.66	0.85	0.44	0.51	0.81	0.29	0.79	0.15	0.82	0.69	0.84	0.84	0.85	0.73	0.73	0.20	0.57	0.51	0.31	0.82	0.16	0.31	0.19
C3'	0.02	0.16	0.20	0.04	0.11	0.20	0.11	0.28	0.14	0.05	0.15	0.17	0.14	0.07	0.07	0.43	0.02	0.04	0.20	0.15	0.25	0.21	0.25
C4	0.39	0.49	0.17	0.23	0.54	0.13	0.53	0.02	0.51	0.50	0.49	0.43	0.52	0.51	0.51	0.20	0.31	0.36	0.39	0.50	0.04	0.46	0.13
C4'	0.13	0.02	0.39	0.25	0.05	0.34	0.06	0.46	0.02	0.14	0.01	0.05	0.00	0.11	0.10	0.63	0.23	0.17	0.32	0.02	0.46	0.30	0.36
C5	0.33	0.34	0.14	0.22	0.39	0.09	0.36	0.05	0.34	0.35	0.33	0.29	0.38	0.35	0.38	0.21	0.32	0.30	0.27	0.33	0.06	0.29	0.03
C5'	0.30	0.29	0.55	0.35	0.30	0.35	0.31	0.40	0.30	0.32	0.30	0.29	0.29	0.32	0.31	0.78	0.38	0.25	0.36	0.29	0.38	0.36	0.34
C6	0.30	0.40	0.09	0.16	0.39	0.02	0.36	0.18	0.37	0.30	0.39	0.39	0.42	0.31	0.35	0.24	0.28	0.21	0.11	0.36	0.19	0.13	0.09
N1	0.34	0.59	0.08	0.14	0.51	0.04	0.49	0.20	0.52	0.37	0.56	0.60	0.58	0.41	0.43	0.24	0.23	0.23	0.10	0.51	0.21	0.15	0.09
N3	0.42	0.67	0.16	0.21	0.64	0.08	0.63	0.04	0.66	0.54	0.67	0.65	0.67	0.58	0.56	0.21	0.28	0.35	0.33	0.65	0.02	0.43	0.09
O2	0.41	0.84	0.11	0.15	0.69	0.00	0.69	0.15	0.77	0.52	0.82	0.89	0.78	0.60	0.56	0.22	0.22	0.30	0.19	0.77	0.15	0.29	0.01
O2'	1.04	1.58	0.76	0.67	1.39	0.44	1.38	0.27	1.49	1.14	1.56	1.64	1.51	1.25	1.21	0.60	0.65	0.79	0.46	1.50	0.27	0.51	0.33
O3'	0.00	0.23	0.31	0.17	0.13	0.26	0.13	0.35	0.19	0.03	0.23	0.28	0.19	0.07	0.06	0.52	0.15	0.05	0.26	0.20	0.32	0.26	0.30
O4	0.41	0.47	0.23	0.27	0.56	0.20	0.57	0.12	0.54	0.57	0.49	0.38	0.51	0.58	0.55	0.14	0.33	0.41	0.52	0.53	0.16	0.62	0.24
O4'	0.06	0.19	0.32	0.24	0.08	0.36	0.06	0.53	0.11	0.06	0.17	0.25	0.16	0.02	0.00	0.57	0.19	0.13	0.30	0.11	0.56	0.23	0.39
O5'	0.25	0.36	0.00	0.04	0.30	0.00	0.27	0.19	0.30	0.17	0.34	0.39	0.35	0.19	0.24	0.11	0.04	0.19	0.14	0.30	0.26	0.15	0.15
OP1	0.00	0.03	0.05	0.03	0.01	0.11	0.05	0.35	0.03	0.11	0.00	0.04	0.03	0.10	0.04	0.12	0.01	0.05	0.29	0.03	0.45	0.29	0.28
OP2	0.05	0.12	0.02	0.04	0.04	0.08	0.00	0.24	0.04	0.10	0.09	0.16	0.11	0.08	0.01	0.13	0.02	0.03	0.46	0.03	0.35	0.57	0.39
P	0.09	0.14	0.03	0.01	0.09	0.06	0.06	0.24	0.09	0.01	0.12	0.15	0.14	0.01	0.05	0.05	0.01	0.04	0.30	0.09	0.30	0.33	0.26

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.04	0.07	0.04	0.00	0.00	0.04	0.14	0.00	0.18	0.00	0.06	0.35	0.26
C2	0.05	0.00	0.12	0.06	0.01	0.07	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.06	0.11	0.03	0.19	0.01	0.09	0.45	0.33
C2'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.02	0.02	0.05	0.15	0.03	0.14	0.05	0.19	0.13	0.13	0.05	0.00	0.04	0.03	0.13	0.08	0.29	0.26	0.08
C3'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.04	0.00	0.03	0.00	0.02	0.02	0.04	0.08	0.06	0.02	0.03	0.00	0.01	0.01	0.25	0.01	0.03	0.33	0.19
C4	0.02	0.01	0.02	0.04	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.08	0.12	0.01	0.19	0.01	0.12	0.47	0.32
C4'	0.02	0.07	0.02	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.05	0.11	0.07	0.03	0.00	0.14	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.08	0.07
C5	0.01	0.01	0.05	0.03	0.00	0.00	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.19	0.11	0.01	0.18	0.01	0.17	0.53	0.33
C5'	0.00	0.02	0.15	0.00	0.03	0.01	0.07	0.00	0.06	0.10	0.02	0.06	0.02	0.10	0.04	0.03	0.09	0.05	0.00	0.09	0.05	0.01	0.01
C6	0.02	0.00	0.03	0.02	0.00	0.01	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.17	0.12	0.02	0.17	0.01	0.18	0.52	0.33
C8	0.01	0.01	0.14	0.02	0.00	0.03	0.01	0.10	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.24	0.08	0.01	0.21	0.02	0.17	0.57	0.34
N1	0.04	0.00	0.05	0.04	0.01	0.05	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.06	0.12	0.03	0.18	0.01	0.14	0.48	0.33
N2	0.07	0.01	0.19	0.08	0.02	0.11	0.01	0.06	0.00	0.02	0.00	0.00	0.02	0.01	0.03	0.17	0.10	0.05	0.20	0.01	0.06	0.43	0.33
N3	0.04	0.01	0.13	0.06	0.01	0.07	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.08	0.12	0.02	0.19	0.01	0.08	0.43	0.32
N7	0.00	0.01	0.13	0.02	0.00	0.03	0.00	0.10	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.26	0.09	0.01	0.19	0.02	0.21	0.59	0.33
N9	0.00	0.02	0.05	0.03	0.00	0.00	0.01	0.04	0.00	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.12	0.11	0.00	0.20	0.01	0.11	0.47	0.31
O2'	0.04	0.06	0.00	0.00	0.08	0.14	0.19	0.03	0.17	0.24	0.06	0.17	0.08	0.26	0.12	0.00	0.12	0.09	0.18	0.23	0.26	0.28	0.13
O3'	0.14	0.11	0.04	0.01	0.12	0.01	0.11	0.09	0.12	0.08	0.12	0.10	0.12	0.09	0.11	0.12	0.00	0.10	0.19	0.13	0.07	0.24	0.16
O4'	0.00	0.03	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.02	0.01	0.03	0.05	0.02	0.01	0.00	0.09	0.10	0.00	0.09	0.01	0.04	0.21	0.24
O5'	0.18	0.19	0.13	0.25	0.19	0.02	0.18	0.00	0.17	0.21	0.18	0.20	0.19	0.19	0.20	0.18	0.19	0.09	0.00	0.16	0.01	0.02	0.01
O6	0.00	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.23	0.13	0.01	0.16	0.00	0.22	0.53	0.32
OP1	0.06	0.09	0.29	0.03	0.12	0.03	0.17	0.05	0.18	0.17	0.14	0.06	0.08	0.21	0.11	0.26	0.07	0.04	0.01	0.22	0.00	0.00	0.00
OP2	0.35	0.45	0.26	0.33	0.47	0.08	0.53	0.01	0.52	0.57	0.48	0.43	0.43	0.59	0.47	0.28	0.24	0.21	0.02	0.53	0.00	0.00	0.00
P	0.26	0.33	0.08	0.19	0.32	0.07	0.33	0.01	0.33	0.34	0.33	0.33	0.32	0.33	0.31	0.13	0.16	0.24	0.01	0.32	0.00	0.00	0.00