Doublet Group distance statistics: 49140

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.000, 0.003, 0.006, 0.006 max_d=0.006 avg_d=0.003 std_dev=0.003
N3	A	0, 0.000, 0.006, 0.013, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.006 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.000, 0.013, 0.025, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.013 std_dev=0.013
C6	A	0, 0.000, 0.013, 0.026, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.013 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.000, 0.014, 0.028, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.014 std_dev=0.014
C2	A	0, 0.000, 0.016, 0.033, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.016 std_dev=0.016
C1'	A	0, 0.000, 0.018, 0.036, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.018 std_dev=0.018
O2	A	0, 0.000, 0.032, 0.064, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.032 std_dev=0.032
O4	A	0, 0.000, 0.067, 0.134, 0.134 max_d=0.134 avg_d=0.067 std_dev=0.067
C3'	B	0, 0.000, 0.463, 0.926, 0.926 max_d=0.926 avg_d=0.463 std_dev=0.463
O4'	B	0, 0.000, 0.487, 0.974, 0.974 max_d=0.974 avg_d=0.487 std_dev=0.487
C2'	B	0, 0.000, 0.495, 0.991, 0.991 max_d=0.991 avg_d=0.495 std_dev=0.495
C1'	B	0, 0.000, 0.645, 1.290, 1.290 max_d=1.290 avg_d=0.645 std_dev=0.645
O2'	B	0, 0.000, 0.749, 1.498, 1.498 max_d=1.498 avg_d=0.749 std_dev=0.749
C4'	B	0, 0.000, 0.806, 1.611, 1.611 max_d=1.611 avg_d=0.806 std_dev=0.806
O4'	A	0, 0.000, 0.901, 1.802, 1.802 max_d=1.802 avg_d=0.901 std_dev=0.901
C2'	A	0, 0.000, 0.962, 1.923, 1.923 max_d=1.923 avg_d=0.962 std_dev=0.962
O2'	A	0, 0.000, 1.050, 2.100, 2.100 max_d=2.100 avg_d=1.050 std_dev=1.050
O3'	B	0, 0.000, 1.407, 2.814, 2.814 max_d=2.814 avg_d=1.407 std_dev=1.407
C4'	A	0, 0.000, 1.414, 2.827, 2.827 max_d=2.827 avg_d=1.414 std_dev=1.414
N9	B	0, 0.000, 1.506, 3.012, 3.012 max_d=3.012 avg_d=1.506 std_dev=1.506
C3'	A	0, 0.000, 1.523, 3.045, 3.045 max_d=3.045 avg_d=1.523 std_dev=1.523
C5'	B	0, 0.000, 1.656, 3.313, 3.313 max_d=3.313 avg_d=1.656 std_dev=1.656
C8	B	0, 0.000, 2.183, 4.367, 4.367 max_d=4.367 avg_d=2.183 std_dev=2.183
C4	B	0, 0.000, 2.186, 4.372, 4.372 max_d=4.372 avg_d=2.186 std_dev=2.186
O3'	A	0, 0.000, 2.218, 4.436, 4.436 max_d=4.436 avg_d=2.218 std_dev=2.218
C5'	A	0, 0.000, 2.343, 4.685, 4.685 max_d=4.685 avg_d=2.343 std_dev=2.343
O5'	B	0, 0.000, 2.404, 4.807, 4.807 max_d=4.807 avg_d=2.404 std_dev=2.404
N3	B	0, 0.000, 2.535, 5.070, 5.070 max_d=5.070 avg_d=2.535 std_dev=2.535
O5'	A	0, 0.000, 2.583, 5.167, 5.167 max_d=5.167 avg_d=2.583 std_dev=2.583
C5	B	0, 0.000, 2.867, 5.734, 5.734 max_d=5.734 avg_d=2.867 std_dev=2.867
N7	B	0, 0.000, 2.935, 5.871, 5.871 max_d=5.871 avg_d=2.935 std_dev=2.935
P	B	0, 0.000, 3.333, 6.667, 6.667 max_d=6.667 avg_d=3.333 std_dev=3.333
C2	B	0, 0.000, 3.342, 6.685, 6.685 max_d=6.685 avg_d=3.342 std_dev=3.342
OP2	B	0, 0.000, 3.375, 6.751, 6.751 max_d=6.751 avg_d=3.375 std_dev=3.375
C6	B	0, 0.000, 3.638, 7.276, 7.276 max_d=7.276 avg_d=3.638 std_dev=3.638
OP1	B	0, 0.000, 3.665, 7.330, 7.330 max_d=7.330 avg_d=3.665 std_dev=3.665
N1	B	0, 0.000, 3.748, 7.495, 7.495 max_d=7.495 avg_d=3.748 std_dev=3.748
P	A	0, 0.000, 3.810, 7.620, 7.620 max_d=7.620 avg_d=3.810 std_dev=3.810
N2	B	0, 0.000, 4.018, 8.036, 8.036 max_d=8.036 avg_d=4.018 std_dev=4.018
OP1	A	0, 0.000, 4.210, 8.421, 8.421 max_d=8.421 avg_d=4.210 std_dev=4.210
O6	B	0, 0.000, 4.341, 8.682, 8.682 max_d=8.682 avg_d=4.341 std_dev=4.341
OP2	A	0, 0.000, 4.831, 9.662, 9.662 max_d=9.662 avg_d=4.831 std_dev=4.831

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.07	0.43	0.09	0.18
C2	0.02	0.00	0.25	0.16	0.01	0.06	0.01	0.20	0.00	0.01	0.00	0.00	0.23	0.22	0.00	0.16	0.32	1.01	0.36	0.57
C2'	0.00	0.25	0.00	0.00	0.03	0.02	0.14	0.01	0.21	0.01	0.19	0.42	0.00	0.00	0.05	0.00	0.00	0.24	0.12	0.03
C3'	0.00	0.16	0.00	0.00	0.02	0.00	0.11	0.01	0.15	0.01	0.12	0.25	0.01	0.00	0.03	0.01	0.07	0.04	0.22	0.09
C4	0.01	0.01	0.03	0.02	0.00	0.03	0.00	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.03	0.00	0.00	0.21	0.67	0.17	0.36
C4'	0.01	0.06	0.02	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.04	0.01	0.06	0.08	0.06	0.02	0.04	0.00	0.01	0.10	0.02	0.02
C5	0.01	0.01	0.14	0.11	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.13	0.15	0.01	0.14	0.01	0.18	0.11	0.00
C5'	0.02	0.20	0.01	0.01	0.13	0.01	0.02	0.00	0.08	0.07	0.21	0.26	0.07	0.05	0.16	0.00	0.00	0.09	0.09	0.01
C6	0.00	0.00	0.21	0.15	0.00	0.04	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.01	0.17	0.20	0.01	0.20	0.08	0.09	0.15	0.07
N1	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.13	0.55	0.12	0.26
N3	0.01	0.00	0.19	0.12	0.00	0.06	0.00	0.21	0.00	0.01	0.00	0.00	0.18	0.18	0.00	0.12	0.33	1.02	0.36	0.59
O2	0.03	0.00	0.42	0.25	0.01	0.08	0.01	0.26	0.01	0.01	0.00	0.00	0.43	0.36	0.01	0.28	0.40	1.26	0.51	0.72
O2'	0.01	0.23	0.00	0.01	0.03	0.06	0.13	0.07	0.17	0.02	0.18	0.43	0.00	0.01	0.05	0.02	0.04	0.19	0.13	0.01
O3'	0.00	0.22	0.00	0.00	0.03	0.02	0.15	0.05	0.20	0.01	0.18	0.36	0.01	0.00	0.05	0.01	0.14	0.14	0.40	0.23
O4	0.01	0.00	0.05	0.03	0.00	0.04	0.01	0.16	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.05	0.00	0.02	0.24	0.73	0.21	0.41
O4'	0.00	0.16	0.00	0.01	0.00	0.00	0.14	0.00	0.20	0.00	0.12	0.28	0.02	0.01	0.02	0.00	0.05	0.36	0.17	0.17
O5'	0.07	0.32	0.00	0.07	0.21	0.01	0.01	0.00	0.08	0.13	0.33	0.40	0.04	0.14	0.24	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00
OP1	0.43	1.01	0.24	0.04	0.67	0.10	0.18	0.09	0.09	0.55	1.02	1.26	0.19	0.14	0.73	0.36	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.09	0.36	0.12	0.22	0.17	0.02	0.11	0.09	0.15	0.12	0.36	0.51	0.13	0.40	0.21	0.17	0.00	0.00	0.00	0.00
P	0.18	0.57	0.03	0.09	0.36	0.02	0.00	0.01	0.07	0.26	0.59	0.72	0.01	0.23	0.41	0.17	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.07	0.83	0.19	0.33	0.19	0.08	0.16	0.64	0.03	0.67	0.50	1.26	0.74	0.65	0.14	0.17	0.99	0.14	1.15	0.18	1.36	1.65	1.58
C2	0.19	1.35	0.21	0.32	0.60	0.06	0.36	0.45	0.61	0.26	1.08	1.81	1.14	0.13	0.17	0.12	0.94	0.04	0.81	0.47	0.93	1.13	1.07
C2'	0.38	0.45	0.25	0.20	0.27	0.70	0.65	1.39	0.44	1.23	0.08	0.94	0.34	1.20	0.63	0.15	0.50	0.69	1.97	0.66	2.30	2.43	2.46
C3'	0.43	0.06	0.16	0.05	0.55	0.60	1.01	1.33	0.87	1.47	0.36	0.51	0.04	1.53	0.82	0.04	0.74	0.74	2.02	1.12	2.29	2.68	2.62
C4	0.27	1.61	0.19	0.26	0.89	0.06	0.75	0.25	1.02	0.13	1.40	2.00	1.38	0.33	0.43	0.04	0.79	0.03	0.45	0.93	0.50	0.59	0.56
C4'	0.01	0.16	0.32	0.56	0.31	0.12	0.79	0.54	0.73	1.10	0.26	0.56	0.21	1.25	0.47	0.44	1.34	0.18	1.20	1.02	1.44	2.07	1.84
C5	0.23	1.24	0.19	0.28	0.68	0.06	0.49	0.29	0.69	0.04	1.03	1.53	1.12	0.11	0.29	0.06	0.84	0.01	0.54	0.59	0.55	0.69	0.65
C5'	0.12	0.13	0.60	0.97	0.44	0.53	0.95	0.04	0.99	1.05	0.58	0.19	0.01	1.32	0.46	0.74	1.78	0.04	0.73	1.31	0.85	1.73	1.35
C6	0.15	0.97	0.19	0.32	0.41	0.07	0.16	0.46	0.34	0.35	0.71	1.31	0.88	0.26	0.07	0.11	0.94	0.08	0.83	0.20	0.86	1.09	1.03
N1	0.14	1.06	0.20	0.33	0.41	0.07	0.12	0.52	0.33	0.43	0.77	1.48	0.93	0.34	0.04	0.14	0.97	0.08	0.94	0.17	1.05	1.29	1.23
N3	0.24	1.58	0.20	0.29	0.80	0.06	0.62	0.34	0.92	0.02	1.35	2.04	1.33	0.16	0.33	0.07	0.87	0.01	0.61	0.81	0.70	0.82	0.79
O2	0.18	1.37	0.21	0.33	0.58	0.06	0.32	0.48	0.59	0.31	1.09	1.88	1.15	0.19	0.15	0.14	0.97	0.04	0.86	0.44	1.04	1.24	1.18
O2'	0.39	0.43	0.29	0.25	0.30	0.71	0.71	1.45	0.50	1.28	0.05	0.94	0.32	1.28	0.66	0.20	0.39	0.67	2.01	0.74	2.54	2.58	2.61
O3'	0.71	0.29	0.43	0.39	0.92	0.95	1.43	1.81	1.30	1.90	0.75	0.20	0.30	2.00	1.18	0.12	0.39	1.04	2.52	1.59	3.09	3.39	3.38
O4	0.30	1.88	0.17	0.22	1.09	0.06	1.03	0.14	1.34	0.37	1.72	2.29	1.57	0.62	0.58	0.01	0.68	0.07	0.27	1.29	0.30	0.31	0.32
O4'	0.33	0.68	0.56	0.80	0.20	0.44	0.20	0.12	0.12	0.56	0.31	1.05	0.69	0.64	0.01	0.55	1.50	0.21	0.69	0.36	0.87	1.40	1.21
O5'	0.32	0.02	0.84	1.26	0.25	0.77	0.70	0.27	0.76	0.75	0.41	0.25	0.13	0.99	0.24	0.96	2.13	0.23	0.40	1.02	0.44	1.23	0.90
OP1	1.03	0.20	1.72	2.36	0.30	1.92	0.05	1.66	0.26	0.24	0.11	0.28	0.44	0.10	0.53	1.63	2.91	1.08	0.90	0.50	1.03	0.20	0.50
OP2	0.59	0.41	1.39	1.89	0.38	1.23	0.92	0.82	1.17	0.58	0.88	0.22	0.10	1.04	0.12	1.68	2.73	0.50	0.06	1.52	0.01	0.85	0.47
P	0.75	0.06	1.46	2.04	0.05	1.46	0.48	1.06	0.66	0.24	0.43	0.09	0.19	0.60	0.15	1.55	2.86	0.72	0.33	0.94	0.34	0.46	0.13

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.11	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.26	0.00	0.16	0.01	0.09	0.02	0.10
C2	0.02	0.00	0.30	0.27	0.00	0.05	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.10	0.04	0.23	0.43	0.00	0.27	0.04	0.35
C2'	0.00	0.30	0.00	0.00	0.16	0.01	0.07	0.22	0.12	0.16	0.23	0.36	0.30	0.08	0.01	0.00	0.02	0.00	0.24	0.08	0.19	0.23	0.24
C3'	0.00	0.27	0.00	0.00	0.26	0.00	0.30	0.01	0.33	0.22	0.32	0.25	0.23	0.29	0.19	0.00	0.00	0.01	0.01	0.34	0.06	0.12	0.04
C4	0.01	0.00	0.16	0.26	0.00	0.01	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.01	0.12	0.33	0.00	0.16	0.00	0.24
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00	0.05	0.01	0.03	0.13	0.01	0.08	0.05	0.12	0.05	0.20	0.04	0.00	0.02	0.05	0.03	0.08	0.00
C5	0.01	0.00	0.07	0.30	0.00	0.05	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.17	0.10	0.05	0.30	0.00	0.10	0.03	0.22
C5'	0.11	0.13	0.22	0.01	0.09	0.01	0.04	0.00	0.05	0.02	0.09	0.15	0.13	0.02	0.07	0.03	0.17	0.02	0.00	0.03	0.04	0.00	0.00
C6	0.01	0.00	0.12	0.33	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.14	0.12	0.10	0.35	0.00	0.15	0.01	0.27
C8	0.00	0.00	0.16	0.22	0.00	0.13	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.30	0.10	0.14	0.11	0.00	0.05	0.11	0.04
N1	0.01	0.00	0.23	0.32	0.00	0.01	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.05	0.18	0.41	0.00	0.23	0.02	0.34
N2	0.02	0.00	0.36	0.25	0.00	0.08	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.20	0.09	0.28	0.46	0.00	0.32	0.06	0.39
N3	0.02	0.00	0.30	0.23	0.00	0.05	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.12	0.10	0.23	0.39	0.00	0.25	0.03	0.31
N7	0.01	0.00	0.08	0.29	0.00	0.12	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.29	0.17	0.07	0.17	0.00	0.03	0.10	0.10
N9	0.00	0.01	0.01	0.19	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.14	0.03	0.00	0.22	0.01	0.08	0.04	0.14
O2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.05	0.20	0.17	0.03	0.14	0.30	0.02	0.20	0.12	0.29	0.14	0.00	0.02	0.16	0.01	0.19	0.00	0.16	0.07
O3'	0.26	0.04	0.02	0.00	0.01	0.04	0.10	0.17	0.12	0.10	0.05	0.09	0.10	0.17	0.03	0.02	0.00	0.25	0.07	0.17	0.26	0.23	0.16
O4'	0.00	0.23	0.00	0.01	0.12	0.00	0.05	0.02	0.10	0.14	0.18	0.28	0.23	0.07	0.00	0.16	0.25	0.00	0.05	0.07	0.03	0.17	0.01
O5'	0.16	0.43	0.24	0.01	0.33	0.02	0.30	0.00	0.35	0.11	0.41	0.46	0.39	0.17	0.22	0.01	0.07	0.05	0.00	0.33	0.00	0.01	0.00
O6	0.01	0.00	0.08	0.34	0.00	0.05	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.19	0.17	0.07	0.33	0.00	0.12	0.03	0.25
OP1	0.09	0.27	0.19	0.06	0.16	0.03	0.10	0.04	0.15	0.05	0.23	0.32	0.25	0.03	0.08	0.00	0.26	0.03	0.00	0.12	0.00	0.01	0.00
OP2	0.02	0.04	0.23	0.12	0.00	0.08	0.03	0.00	0.01	0.11	0.02	0.06	0.03	0.10	0.04	0.16	0.23	0.17	0.01	0.03	0.01	0.00	0.00
P	0.10	0.35	0.24	0.04	0.24	0.00	0.22	0.00	0.27	0.04	0.34	0.39	0.31	0.10	0.14	0.07	0.16	0.01	0.00	0.25	0.00	0.00	0.00