Doublet Group distance statistics: 49151

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 2, 6, 10, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.003, 0.005, 0.007, 0.010 max_d=0.010 avg_d=0.005 std_dev=0.002
C5	A	0, 0.001, 0.007, 0.013, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.007 std_dev=0.006
C2	A	0, 0.006, 0.012, 0.019, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.012 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.004, 0.011, 0.017, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.011 std_dev=0.007
C6	A	0, 0.006, 0.014, 0.022, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.014 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.004, 0.013, 0.022, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.013 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.005, 0.016, 0.027, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.016 std_dev=0.011
O2	A	0, 0.012, 0.028, 0.044, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.028 std_dev=0.016
O4	A	0, 0.010, 0.050, 0.090, 0.183 max_d=0.183 avg_d=0.050 std_dev=0.040
O4'	A	0, 0.015, 0.112, 0.208, 0.402 max_d=0.402 avg_d=0.112 std_dev=0.096
C2'	A	0, 0.001, 0.121, 0.241, 0.551 max_d=0.551 avg_d=0.121 std_dev=0.120
C4'	A	0, 0.035, 0.192, 0.348, 0.649 max_d=0.649 avg_d=0.192 std_dev=0.156
C2'	B	0, 0.124, 0.291, 0.457, 0.887 max_d=0.887 avg_d=0.291 std_dev=0.167
O2'	A	0, -0.029, 0.179, 0.387, 1.078 max_d=1.078 avg_d=0.179 std_dev=0.208
C3'	A	0, -0.002, 0.217, 0.436, 1.047 max_d=1.047 avg_d=0.217 std_dev=0.219
O2'	B	0, 0.142, 0.381, 0.620, 1.283 max_d=1.283 avg_d=0.381 std_dev=0.239
P	A	0, 0.067, 0.315, 0.564, 1.265 max_d=1.265 avg_d=0.315 std_dev=0.249
C5'	A	0, 0.019, 0.301, 0.583, 1.186 max_d=1.186 avg_d=0.301 std_dev=0.282
OP2	A	0, 0.139, 0.480, 0.821, 1.789 max_d=1.789 avg_d=0.480 std_dev=0.341
O5'	A	0, -0.087, 0.266, 0.619, 1.779 max_d=1.779 avg_d=0.266 std_dev=0.353
O3'	A	0, -0.051, 0.318, 0.687, 1.783 max_d=1.783 avg_d=0.318 std_dev=0.369
C1'	B	0, -0.003, 0.407, 0.817, 2.227 max_d=2.227 avg_d=0.407 std_dev=0.410
OP1	A	0, 0.046, 0.469, 0.892, 2.186 max_d=2.186 avg_d=0.469 std_dev=0.423
C3'	B	0, -0.127, 0.321, 0.769, 2.318 max_d=2.318 avg_d=0.321 std_dev=0.448
O3'	B	0, -0.163, 0.346, 0.856, 2.629 max_d=2.629 avg_d=0.346 std_dev=0.509
O4'	B	0, -0.102, 0.476, 1.055, 3.070 max_d=3.070 avg_d=0.476 std_dev=0.579
C4'	B	0, -0.196, 0.448, 1.093, 3.352 max_d=3.352 avg_d=0.448 std_dev=0.645
N9	B	0, -0.361, 0.500, 1.360, 4.410 max_d=4.410 avg_d=0.500 std_dev=0.860
OP1	B	0, 0.160, 1.149, 2.139, 5.341 max_d=5.341 avg_d=1.149 std_dev=0.990
N3	B	0, -0.540, 0.482, 1.505, 5.116 max_d=5.116 avg_d=0.482 std_dev=1.022
C5'	B	0, -0.109, 0.939, 1.986, 5.601 max_d=5.601 avg_d=0.939 std_dev=1.047
C4	B	0, -0.573, 0.524, 1.620, 5.519 max_d=5.519 avg_d=0.524 std_dev=1.097
OP2	B	0, 0.033, 1.144, 2.255, 5.855 max_d=5.855 avg_d=1.144 std_dev=1.111
C8	B	0, -0.557, 0.623, 1.804, 6.003 max_d=6.003 avg_d=0.623 std_dev=1.180
P	B	0, -0.477, 0.727, 1.930, 6.182 max_d=6.182 avg_d=0.727 std_dev=1.204
O5'	B	0, -0.472, 0.774, 2.019, 6.347 max_d=6.347 avg_d=0.774 std_dev=1.246
C2	B	0, -0.806, 0.566, 1.938, 6.807 max_d=6.807 avg_d=0.566 std_dev=1.372
C5	B	0, -0.850, 0.649, 2.148, 7.496 max_d=7.496 avg_d=0.649 std_dev=1.499
N7	B	0, -0.832, 0.714, 2.261, 7.777 max_d=7.777 avg_d=0.714 std_dev=1.547
N1	B	0, -1.072, 0.662, 2.397, 8.582 max_d=8.582 avg_d=0.662 std_dev=1.735
C6	B	0, -1.099, 0.712, 2.524, 8.992 max_d=8.992 avg_d=0.712 std_dev=1.811
N6	B	0, -1.350, 0.852, 3.054, 10.922 max_d=10.922 avg_d=0.852 std_dev=2.202

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.07	0.11	0.36	0.09
C2	0.01	0.00	0.06	0.09	0.01	0.05	0.00	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00	0.08	0.10	0.01	0.02	0.21	0.16	0.38	0.05
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.05	0.01	0.06	0.01	0.05	0.03	0.05	0.09	0.00	0.01	0.06	0.01	0.14	0.10	0.24	0.06
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.14	0.00	0.16	0.01	0.15	0.08	0.11	0.11	0.02	0.01	0.16	0.01	0.20	0.13	0.17	0.13
C4	0.02	0.01	0.05	0.14	0.00	0.10	0.01	0.16	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.15	0.01	0.03	0.31	0.28	0.36	0.14
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.10	0.00	0.11	0.01	0.10	0.05	0.07	0.06	0.07	0.01	0.11	0.00	0.01	0.08	0.17	0.05
C5	0.02	0.00	0.06	0.16	0.01	0.11	0.00	0.19	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.17	0.01	0.03	0.32	0.30	0.36	0.13
C5'	0.02	0.08	0.01	0.01	0.16	0.01	0.19	0.00	0.16	0.08	0.11	0.07	0.06	0.02	0.18	0.01	0.01	0.10	0.10	0.02
C6	0.02	0.01	0.05	0.15	0.01	0.10	0.00	0.16	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.14	0.02	0.03	0.26	0.25	0.38	0.06
N1	0.01	0.01	0.03	0.08	0.01	0.05	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.07	0.02	0.01	0.19	0.17	0.38	0.03
N3	0.01	0.00	0.05	0.11	0.01	0.07	0.00	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.12	0.01	0.02	0.27	0.21	0.38	0.10
O2	0.01	0.00	0.09	0.11	0.01	0.06	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.13	0.14	0.02	0.01	0.17	0.12	0.37	0.05
O2'	0.01	0.08	0.00	0.02	0.05	0.07	0.03	0.06	0.03	0.03	0.08	0.13	0.00	0.04	0.06	0.06	0.11	0.11	0.19	0.05
O3'	0.02	0.10	0.01	0.01	0.15	0.01	0.17	0.02	0.14	0.07	0.12	0.14	0.04	0.00	0.17	0.02	0.20	0.15	0.27	0.20
O4	0.03	0.01	0.06	0.16	0.01	0.11	0.01	0.18	0.02	0.02	0.01	0.02	0.06	0.17	0.00	0.04	0.34	0.31	0.35	0.18
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.06	0.02	0.04	0.00	0.10	0.12	0.39	0.18
O5'	0.07	0.21	0.14	0.20	0.31	0.01	0.32	0.01	0.26	0.19	0.27	0.17	0.11	0.20	0.34	0.10	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.11	0.16	0.10	0.13	0.28	0.08	0.30	0.10	0.25	0.17	0.21	0.12	0.11	0.15	0.31	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.36	0.38	0.24	0.17	0.36	0.17	0.36	0.10	0.38	0.38	0.38	0.37	0.19	0.27	0.35	0.39	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.05	0.06	0.13	0.14	0.05	0.13	0.02	0.06	0.03	0.10	0.05	0.05	0.20	0.18	0.18	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.24	0.88	0.11	0.13	0.60	0.10	0.63	0.11	0.77	0.37	0.88	0.73	0.78	0.49	0.40	0.11	0.23	0.24	0.13	0.33	0.30	0.14
C2	0.21	0.63	0.13	0.09	0.43	0.23	0.45	0.31	0.54	0.29	0.61	0.54	0.54	0.36	0.31	0.11	0.10	0.32	0.31	0.43	0.37	0.30
C2'	0.24	1.05	0.09	0.21	0.70	0.12	0.78	0.12	0.97	0.47	1.10	0.83	1.02	0.64	0.46	0.13	0.38	0.27	0.15	0.35	0.33	0.17
C3'	0.16	1.04	0.16	0.41	0.68	0.27	0.79	0.23	1.00	0.44	1.12	0.79	1.06	0.64	0.41	0.21	0.60	0.21	0.26	0.47	0.37	0.30
C4	0.09	0.16	0.10	0.20	0.13	0.31	0.14	0.39	0.14	0.15	0.15	0.16	0.15	0.16	0.13	0.11	0.16	0.24	0.36	0.53	0.38	0.36
C4'	0.16	0.97	0.10	0.37	0.65	0.30	0.72	0.32	0.90	0.38	1.02	0.77	0.94	0.56	0.40	0.11	0.50	0.16	0.37	0.48	0.37	0.36
C5	0.10	0.22	0.08	0.09	0.14	0.12	0.14	0.15	0.15	0.16	0.18	0.21	0.14	0.15	0.13	0.10	0.12	0.20	0.13	0.38	0.36	0.17
C5'	0.10	0.91	0.18	0.52	0.61	0.47	0.69	0.52	0.87	0.35	0.97	0.72	0.91	0.53	0.35	0.14	0.64	0.20	0.57	0.65	0.48	0.55
C6	0.16	0.48	0.10	0.07	0.32	0.10	0.29	0.12	0.36	0.18	0.44	0.43	0.35	0.22	0.21	0.11	0.10	0.21	0.12	0.32	0.35	0.15
N1	0.21	0.68	0.11	0.07	0.46	0.12	0.47	0.15	0.56	0.28	0.66	0.59	0.56	0.36	0.31	0.11	0.14	0.25	0.14	0.35	0.33	0.17
N3	0.15	0.34	0.12	0.17	0.25	0.32	0.24	0.43	0.28	0.18	0.32	0.31	0.28	0.21	0.19	0.12	0.09	0.32	0.42	0.53	0.40	0.40
O2	0.24	0.77	0.14	0.09	0.53	0.25	0.57	0.36	0.69	0.37	0.78	0.62	0.71	0.47	0.37	0.12	0.12	0.36	0.36	0.45	0.39	0.35
O2'	0.24	1.09	0.08	0.20	0.71	0.10	0.81	0.12	1.02	0.47	1.16	0.84	1.08	0.65	0.47	0.13	0.37	0.27	0.13	0.35	0.29	0.14
O3'	0.13	1.06	0.26	0.51	0.66	0.33	0.81	0.29	1.06	0.42	1.18	0.76	1.15	0.65	0.38	0.34	0.71	0.21	0.34	0.58	0.42	0.39
O4	0.11	0.34	0.10	0.30	0.30	0.42	0.33	0.55	0.36	0.27	0.36	0.30	0.37	0.32	0.23	0.14	0.26	0.20	0.50	0.65	0.41	0.48
O4'	0.25	0.90	0.13	0.20	0.62	0.18	0.65	0.22	0.79	0.37	0.90	0.76	0.80	0.50	0.41	0.18	0.28	0.17	0.25	0.35	0.31	0.22
O5'	0.17	0.47	0.35	0.68	0.24	0.66	0.30	0.70	0.43	0.09	0.51	0.33	0.46	0.19	0.07	0.21	0.76	0.42	0.73	0.72	0.65	0.68
OP1	0.12	0.47	0.31	0.77	0.28	0.83	0.34	0.96	0.46	0.11	0.52	0.35	0.49	0.24	0.10	0.09	0.71	0.46	1.03	0.98	0.77	0.95
OP2	0.39	0.83	0.11	0.26	0.71	0.10	0.72	0.18	0.80	0.52	0.84	0.76	0.79	0.62	0.56	0.17	0.34	0.23	0.29	0.58	0.30	0.36
P	0.07	0.45	0.29	0.66	0.28	0.60	0.31	0.67	0.41	0.11	0.47	0.35	0.43	0.22	0.12	0.12	0.70	0.32	0.73	0.77	0.63	0.70

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.11	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.00	0.25	0.20	0.30	0.09
C2	0.03	0.00	0.10	0.05	0.01	0.16	0.01	0.25	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.25	0.07	0.19	0.38	0.19	0.32	0.12
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.06	0.01	0.04	0.09	0.06	0.05	0.08	0.09	0.06	0.04	0.02	0.00	0.01	0.01	0.21	0.26	0.27	0.11
C3'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.02	0.08	0.02	0.05	0.04	0.07	0.03	0.02	0.00	0.02	0.09	0.34	0.25	0.13
C4	0.01	0.01	0.06	0.01	0.00	0.07	0.00	0.23	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.13	0.04	0.10	0.33	0.18	0.34	0.10
C4'	0.00	0.16	0.01	0.00	0.07	0.00	0.08	0.01	0.09	0.16	0.12	0.15	0.09	0.13	0.06	0.01	0.02	0.00	0.01	0.26	0.27	0.06
C5	0.01	0.01	0.04	0.03	0.00	0.08	0.00	0.29	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.09	0.03	0.05	0.32	0.20	0.36	0.11
C5'	0.11	0.25	0.09	0.01	0.23	0.01	0.29	0.00	0.28	0.39	0.26	0.22	0.31	0.37	0.24	0.08	0.04	0.02	0.01	0.19	0.31	0.01
C6	0.02	0.00	0.06	0.02	0.01	0.09	0.00	0.28	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.14	0.04	0.09	0.34	0.21	0.35	0.11
C8	0.01	0.01	0.05	0.08	0.01	0.16	0.00	0.39	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.12	0.06	0.09	0.26	0.20	0.40	0.16
N1	0.02	0.00	0.08	0.02	0.01	0.12	0.01	0.26	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.21	0.06	0.15	0.38	0.19	0.33	0.11
N3	0.03	0.01	0.09	0.05	0.01	0.15	0.01	0.22	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.23	0.07	0.18	0.36	0.19	0.31	0.12
N6	0.01	0.01	0.06	0.04	0.01	0.09	0.01	0.31	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.12	0.03	0.07	0.33	0.24	0.35	0.13
N7	0.01	0.01	0.04	0.07	0.00	0.13	0.00	0.37	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.08	0.05	0.05	0.28	0.23	0.39	0.16
N9	0.00	0.02	0.02	0.03	0.01	0.06	0.01	0.24	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.04	0.03	0.01	0.28	0.17	0.35	0.09
O2'	0.01	0.25	0.00	0.02	0.13	0.01	0.09	0.08	0.14	0.12	0.21	0.23	0.12	0.08	0.04	0.00	0.03	0.01	0.20	0.31	0.27	0.14
O3'	0.04	0.07	0.01	0.00	0.04	0.02	0.03	0.04	0.04	0.06	0.06	0.07	0.03	0.05	0.03	0.03	0.00	0.09	0.09	0.38	0.24	0.14
O4'	0.00	0.19	0.01	0.02	0.10	0.00	0.05	0.02	0.09	0.09	0.15	0.18	0.07	0.05	0.01	0.01	0.09	0.00	0.23	0.20	0.32	0.14
O5'	0.25	0.38	0.21	0.09	0.33	0.01	0.32	0.01	0.34	0.26	0.38	0.36	0.33	0.28	0.28	0.20	0.09	0.23	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.20	0.19	0.26	0.34	0.18	0.26	0.20	0.19	0.21	0.20	0.19	0.19	0.24	0.23	0.17	0.31	0.38	0.20	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.30	0.32	0.27	0.25	0.34	0.27	0.36	0.31	0.35	0.40	0.33	0.31	0.35	0.39	0.35	0.27	0.24	0.32	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.12	0.11	0.13	0.10	0.06	0.11	0.01	0.11	0.16	0.11	0.12	0.13	0.16	0.09	0.14	0.14	0.14	0.00	0.01	0.01	0.00