Doublet Group distance statistics: 49153

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 1, 5, 4, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N1	A	0, 0.007, 0.015, 0.023, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.015 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.010, 0.018, 0.026, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.018 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.015, 0.023, 0.031, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.023 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.011, 0.019, 0.027, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.019 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.006, 0.015, 0.024, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.015 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.015, 0.025, 0.035, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.025 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.017, 0.030, 0.043, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.030 std_dev=0.013
O2	A	0, 0.018, 0.040, 0.063, 0.098 max_d=0.098 avg_d=0.040 std_dev=0.022
O4	A	0, 0.028, 0.052, 0.077, 0.096 max_d=0.096 avg_d=0.052 std_dev=0.025
O4'	A	0, 0.058, 0.169, 0.279, 0.397 max_d=0.397 avg_d=0.169 std_dev=0.111
C2'	A	0, 0.138, 0.279, 0.420, 0.532 max_d=0.532 avg_d=0.279 std_dev=0.141
O3'	A	0, 0.202, 0.345, 0.487, 0.612 max_d=0.612 avg_d=0.345 std_dev=0.143
C3'	A	0, 0.161, 0.320, 0.480, 0.509 max_d=0.509 avg_d=0.320 std_dev=0.159
O2'	B	0, 0.209, 0.382, 0.556, 0.719 max_d=0.719 avg_d=0.382 std_dev=0.174
P	A	0, 0.147, 0.329, 0.511, 0.610 max_d=0.610 avg_d=0.329 std_dev=0.182
C2'	B	0, 0.168, 0.365, 0.563, 0.815 max_d=0.815 avg_d=0.365 std_dev=0.197
C4'	A	0, 0.057, 0.265, 0.473, 0.675 max_d=0.675 avg_d=0.265 std_dev=0.208
O2'	A	0, 0.218, 0.434, 0.650, 0.782 max_d=0.782 avg_d=0.434 std_dev=0.216
OP2	A	0, 0.258, 0.484, 0.711, 0.797 max_d=0.797 avg_d=0.484 std_dev=0.227
C1'	B	0, 0.141, 0.388, 0.636, 0.964 max_d=0.964 avg_d=0.388 std_dev=0.247
OP1	A	0, 0.246, 0.499, 0.752, 1.053 max_d=1.053 avg_d=0.499 std_dev=0.253
N9	B	0, 0.203, 0.466, 0.729, 1.072 max_d=1.072 avg_d=0.466 std_dev=0.263
N3	B	0, 0.192, 0.511, 0.829, 1.115 max_d=1.115 avg_d=0.511 std_dev=0.318
C3'	B	0, 0.212, 0.533, 0.853, 1.032 max_d=1.032 avg_d=0.533 std_dev=0.320
C8	B	0, 0.252, 0.577, 0.902, 1.262 max_d=1.262 avg_d=0.577 std_dev=0.325
O5'	A	0, 0.097, 0.423, 0.750, 0.984 max_d=0.984 avg_d=0.423 std_dev=0.326
C4	B	0, 0.202, 0.537, 0.873, 1.190 max_d=1.190 avg_d=0.537 std_dev=0.336
O4'	B	0, 0.228, 0.592, 0.955, 1.292 max_d=1.292 avg_d=0.592 std_dev=0.363
O3'	B	0, 0.209, 0.586, 0.964, 1.259 max_d=1.259 avg_d=0.586 std_dev=0.377
C5'	A	0, 0.047, 0.440, 0.832, 1.133 max_d=1.133 avg_d=0.440 std_dev=0.392
C2	B	0, 0.252, 0.660, 1.067, 1.447 max_d=1.447 avg_d=0.660 std_dev=0.408
C4'	B	0, 0.246, 0.667, 1.089, 1.370 max_d=1.370 avg_d=0.667 std_dev=0.422
N7	B	0, 0.277, 0.745, 1.213, 1.582 max_d=1.582 avg_d=0.745 std_dev=0.468
C5	B	0, 0.249, 0.724, 1.198, 1.523 max_d=1.523 avg_d=0.724 std_dev=0.475
O5'	B	0, 0.446, 0.951, 1.456, 1.778 max_d=1.778 avg_d=0.951 std_dev=0.505
C5'	B	0, 0.335, 0.866, 1.398, 1.659 max_d=1.659 avg_d=0.866 std_dev=0.532
N1	B	0, 0.309, 0.859, 1.408, 1.964 max_d=1.964 avg_d=0.859 std_dev=0.549
C6	B	0, 0.303, 0.907, 1.510, 2.052 max_d=2.052 avg_d=0.907 std_dev=0.603
OP1	B	0, 0.590, 1.253, 1.917, 2.330 max_d=2.330 avg_d=1.253 std_dev=0.664
OP2	B	0, 0.698, 1.398, 2.098, 2.538 max_d=2.538 avg_d=1.398 std_dev=0.700
P	B	0, 0.413, 1.118, 1.822, 2.257 max_d=2.257 avg_d=1.118 std_dev=0.705
N6	B	0, 0.389, 1.167, 1.944, 2.666 max_d=2.666 avg_d=1.167 std_dev=0.777

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.06	0.02	0.01	0.02	0.04	0.02	0.06	0.02	0.01	0.19	0.11	0.20	0.09
C2	0.02	0.00	0.07	0.03	0.01	0.05	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.00	0.11	0.07	0.01	0.08	0.19	0.11	0.25	0.14
C2'	0.00	0.07	0.00	0.01	0.06	0.01	0.10	0.08	0.11	0.03	0.05	0.12	0.01	0.02	0.07	0.02	0.43	0.31	0.12	0.26
C3'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.05	0.01	0.08	0.05	0.08	0.03	0.03	0.07	0.03	0.01	0.06	0.01	0.31	0.27	0.13	0.20
C4	0.02	0.01	0.06	0.05	0.00	0.06	0.00	0.15	0.01	0.01	0.00	0.01	0.11	0.07	0.00	0.06	0.21	0.16	0.26	0.17
C4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.06	0.00	0.06	0.01	0.06	0.04	0.05	0.06	0.02	0.03	0.06	0.01	0.03	0.09	0.27	0.04
C5	0.02	0.01	0.10	0.08	0.00	0.06	0.00	0.17	0.00	0.01	0.01	0.01	0.15	0.08	0.01	0.05	0.20	0.16	0.26	0.17
C5'	0.06	0.11	0.08	0.05	0.15	0.01	0.17	0.00	0.16	0.12	0.13	0.10	0.07	0.04	0.16	0.02	0.01	0.09	0.34	0.03
C6	0.02	0.01	0.11	0.08	0.01	0.06	0.00	0.16	0.00	0.00	0.01	0.01	0.15	0.08	0.01	0.06	0.21	0.13	0.26	0.15
N1	0.01	0.01	0.03	0.03	0.01	0.04	0.01	0.12	0.00	0.00	0.01	0.01	0.06	0.06	0.02	0.04	0.20	0.11	0.25	0.13
N3	0.02	0.00	0.05	0.03	0.00	0.05	0.01	0.13	0.01	0.01	0.00	0.01	0.11	0.07	0.01	0.07	0.20	0.13	0.26	0.16
O2	0.04	0.00	0.12	0.07	0.01	0.06	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.21	0.11	0.01	0.10	0.18	0.11	0.25	0.13
O2'	0.02	0.11	0.01	0.03	0.11	0.02	0.15	0.07	0.15	0.06	0.11	0.21	0.00	0.05	0.12	0.02	0.46	0.38	0.16	0.32
O3'	0.06	0.07	0.02	0.01	0.07	0.03	0.08	0.04	0.08	0.06	0.07	0.11	0.05	0.00	0.07	0.04	0.19	0.23	0.15	0.14
O4	0.02	0.01	0.07	0.06	0.00	0.06	0.01	0.16	0.01	0.02	0.01	0.01	0.12	0.07	0.00	0.07	0.20	0.18	0.26	0.18
O4'	0.01	0.08	0.02	0.01	0.06	0.01	0.05	0.02	0.06	0.04	0.07	0.10	0.02	0.04	0.07	0.00	0.09	0.10	0.29	0.11
O5'	0.19	0.19	0.43	0.31	0.21	0.03	0.20	0.01	0.21	0.20	0.20	0.18	0.46	0.19	0.20	0.09	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.11	0.11	0.31	0.27	0.16	0.09	0.16	0.09	0.13	0.11	0.13	0.11	0.38	0.23	0.18	0.10	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.20	0.25	0.12	0.13	0.26	0.27	0.26	0.34	0.26	0.25	0.26	0.25	0.16	0.15	0.26	0.29	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.14	0.26	0.20	0.17	0.04	0.17	0.03	0.15	0.13	0.16	0.13	0.32	0.14	0.18	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.14	0.14	0.16	0.17	0.11	0.15	0.13	0.15	0.15	0.14	0.15	0.10	0.17	0.15	0.12	0.22	0.21	0.19	0.19	0.31	0.43	0.21
C2	0.13	0.32	0.16	0.21	0.20	0.18	0.24	0.17	0.30	0.15	0.34	0.23	0.32	0.20	0.14	0.21	0.32	0.20	0.20	0.30	0.40	0.18
C2'	0.10	0.11	0.11	0.10	0.11	0.12	0.13	0.14	0.14	0.13	0.12	0.11	0.16	0.15	0.11	0.19	0.11	0.17	0.19	0.25	0.44	0.20
C3'	0.17	0.24	0.14	0.12	0.22	0.16	0.25	0.19	0.27	0.23	0.26	0.22	0.29	0.26	0.20	0.18	0.11	0.23	0.25	0.31	0.49	0.27
C4	0.13	0.43	0.14	0.22	0.32	0.17	0.36	0.19	0.42	0.24	0.45	0.36	0.43	0.31	0.23	0.19	0.38	0.21	0.21	0.32	0.34	0.18
C4'	0.26	0.26	0.25	0.19	0.30	0.20	0.35	0.22	0.34	0.35	0.30	0.26	0.37	0.38	0.31	0.28	0.16	0.28	0.29	0.41	0.53	0.34
C5	0.12	0.37	0.13	0.19	0.28	0.14	0.29	0.16	0.33	0.19	0.36	0.33	0.33	0.24	0.20	0.19	0.34	0.21	0.17	0.32	0.32	0.15
C5'	0.42	0.48	0.36	0.26	0.53	0.30	0.59	0.33	0.59	0.57	0.53	0.47	0.62	0.62	0.51	0.36	0.19	0.42	0.43	0.51	0.65	0.48
C6	0.11	0.28	0.15	0.18	0.18	0.14	0.19	0.14	0.23	0.12	0.27	0.23	0.23	0.15	0.12	0.21	0.27	0.18	0.16	0.31	0.36	0.17
N1	0.13	0.25	0.16	0.19	0.15	0.16	0.18	0.15	0.22	0.12	0.25	0.18	0.23	0.15	0.12	0.21	0.27	0.19	0.18	0.31	0.40	0.18
N3	0.12	0.41	0.15	0.22	0.27	0.18	0.32	0.18	0.39	0.20	0.43	0.31	0.41	0.27	0.18	0.19	0.36	0.19	0.21	0.30	0.37	0.17
O2	0.14	0.29	0.16	0.22	0.18	0.19	0.22	0.18	0.29	0.14	0.33	0.20	0.32	0.19	0.13	0.21	0.31	0.20	0.22	0.29	0.42	0.18
O2'	0.15	0.22	0.17	0.11	0.22	0.10	0.27	0.11	0.29	0.24	0.27	0.19	0.32	0.28	0.20	0.26	0.12	0.12	0.19	0.19	0.45	0.17
O3'	0.14	0.18	0.13	0.11	0.16	0.13	0.20	0.16	0.20	0.19	0.19	0.16	0.23	0.22	0.16	0.19	0.12	0.19	0.22	0.28	0.47	0.24
O4	0.17	0.47	0.15	0.23	0.38	0.18	0.43	0.23	0.49	0.32	0.51	0.40	0.51	0.39	0.29	0.18	0.40	0.25	0.27	0.34	0.35	0.23
O4'	0.21	0.13	0.23	0.20	0.18	0.17	0.21	0.17	0.19	0.25	0.15	0.14	0.21	0.25	0.21	0.31	0.21	0.22	0.23	0.38	0.45	0.26
O5'	0.20	0.33	0.18	0.16	0.26	0.20	0.26	0.19	0.27	0.23	0.30	0.31	0.27	0.25	0.23	0.22	0.16	0.23	0.19	0.27	0.40	0.19
OP1	0.24	0.12	0.26	0.22	0.17	0.20	0.21	0.23	0.17	0.32	0.12	0.13	0.21	0.30	0.24	0.28	0.23	0.24	0.31	0.50	0.56	0.42
OP2	0.17	0.14	0.16	0.17	0.12	0.18	0.12	0.18	0.13	0.13	0.14	0.15	0.14	0.14	0.13	0.23	0.22	0.22	0.19	0.33	0.38	0.24
P	0.17	0.15	0.16	0.14	0.12	0.15	0.13	0.15	0.12	0.19	0.12	0.15	0.14	0.18	0.15	0.21	0.17	0.20	0.18	0.37	0.42	0.26

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.07	0.01	0.11	0.23	0.34	0.14
C2	0.02	0.00	0.03	0.05	0.01	0.12	0.01	0.18	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.11	0.10	0.13	0.27	0.24	0.50	0.24
C2'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.04	0.06	0.04	0.05	0.03	0.02	0.05	0.05	0.02	0.01	0.02	0.01	0.09	0.32	0.26	0.17
C3'	0.02	0.05	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.05	0.04	0.05	0.03	0.04	0.02	0.02	0.00	0.01	0.10	0.32	0.16	0.10
C4	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.06	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.07	0.07	0.07	0.23	0.24	0.48	0.24
C4'	0.01	0.12	0.01	0.00	0.06	0.00	0.06	0.01	0.07	0.06	0.10	0.10	0.07	0.05	0.03	0.02	0.02	0.00	0.03	0.24	0.21	0.04
C5	0.01	0.01	0.04	0.02	0.00	0.06	0.00	0.14	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.07	0.06	0.05	0.25	0.28	0.51	0.27
C5'	0.03	0.18	0.06	0.01	0.13	0.01	0.14	0.00	0.16	0.12	0.18	0.16	0.16	0.14	0.09	0.04	0.02	0.02	0.01	0.19	0.17	0.02
C6	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01	0.07	0.00	0.16	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.09	0.07	0.07	0.27	0.28	0.52	0.28
C8	0.02	0.01	0.05	0.05	0.00	0.06	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.07	0.05	0.06	0.20	0.29	0.47	0.26
N1	0.02	0.00	0.03	0.04	0.01	0.10	0.01	0.18	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.09	0.11	0.28	0.26	0.51	0.26
N3	0.02	0.00	0.02	0.05	0.00	0.10	0.00	0.16	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.10	0.10	0.13	0.24	0.23	0.47	0.22
N6	0.01	0.01	0.05	0.03	0.01	0.07	0.01	0.16	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.09	0.06	0.06	0.27	0.31	0.52	0.29
N7	0.01	0.01	0.05	0.04	0.00	0.05	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.07	0.05	0.04	0.23	0.32	0.50	0.28
N9	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.03	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.04	0.06	0.03	0.19	0.24	0.44	0.22
O2'	0.02	0.11	0.01	0.02	0.07	0.02	0.07	0.04	0.09	0.07	0.11	0.10	0.09	0.07	0.04	0.00	0.07	0.02	0.11	0.37	0.28	0.22
O3'	0.07	0.10	0.02	0.00	0.07	0.02	0.06	0.02	0.07	0.05	0.09	0.10	0.06	0.05	0.06	0.07	0.00	0.08	0.11	0.34	0.16	0.10
O4'	0.01	0.13	0.01	0.01	0.07	0.00	0.05	0.02	0.07	0.06	0.11	0.13	0.06	0.04	0.03	0.02	0.08	0.00	0.12	0.17	0.33	0.09
O5'	0.11	0.27	0.09	0.10	0.23	0.03	0.25	0.01	0.27	0.20	0.28	0.24	0.27	0.23	0.19	0.11	0.11	0.12	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.23	0.24	0.32	0.32	0.24	0.24	0.28	0.19	0.28	0.29	0.26	0.23	0.31	0.32	0.24	0.37	0.34	0.17	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.34	0.50	0.26	0.16	0.48	0.21	0.51	0.17	0.52	0.47	0.51	0.47	0.52	0.50	0.44	0.28	0.16	0.33	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.14	0.24	0.17	0.10	0.24	0.04	0.27	0.02	0.28	0.26	0.26	0.22	0.29	0.28	0.22	0.22	0.10	0.09	0.01	0.00	0.00	0.00