Doublet Group distance statistics: 49158

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C4	A	0, 0.006, 0.010, 0.015, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.010 std_dev=0.004
C6	A	0, 0.002, 0.008, 0.014, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.008 std_dev=0.006
N3	A	0, 0.009, 0.016, 0.022, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.016 std_dev=0.007
C5	A	0, -0.001, 0.007, 0.014, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.007 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.011, 0.019, 0.027, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.019 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.005, 0.016, 0.027, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.016 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.014, 0.026, 0.038, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.026 std_dev=0.012
O4	A	0, 0.008, 0.019, 0.031, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.019 std_dev=0.012
O2	A	0, 0.030, 0.058, 0.085, 0.079 max_d=0.079 avg_d=0.058 std_dev=0.028
O3'	A	0, 0.106, 0.344, 0.582, 0.675 max_d=0.675 avg_d=0.344 std_dev=0.238
C2'	A	0, 0.057, 0.296, 0.536, 0.748 max_d=0.748 avg_d=0.296 std_dev=0.239
O4'	A	0, 0.018, 0.276, 0.534, 0.788 max_d=0.788 avg_d=0.276 std_dev=0.258
C4'	A	0, 0.059, 0.333, 0.608, 0.836 max_d=0.836 avg_d=0.333 std_dev=0.275
C3'	A	0, 0.072, 0.357, 0.642, 0.849 max_d=0.849 avg_d=0.357 std_dev=0.285
N3	B	0, 0.196, 0.493, 0.790, 0.967 max_d=0.967 avg_d=0.493 std_dev=0.297
O2'	B	0, 0.313, 0.627, 0.942, 0.903 max_d=0.903 avg_d=0.627 std_dev=0.314
N1	B	0, 0.309, 0.631, 0.954, 1.090 max_d=1.090 avg_d=0.631 std_dev=0.322
C2	B	0, 0.173, 0.499, 0.825, 0.988 max_d=0.988 avg_d=0.499 std_dev=0.326
OP2	A	0, 0.277, 0.609, 0.940, 1.181 max_d=1.181 avg_d=0.609 std_dev=0.331
C4	B	0, 0.362, 0.698, 1.033, 1.101 max_d=1.101 avg_d=0.698 std_dev=0.335
C1'	B	0, 0.342, 0.680, 1.018, 0.924 max_d=0.924 avg_d=0.680 std_dev=0.338
C2'	B	0, 0.284, 0.648, 1.012, 0.945 max_d=0.945 avg_d=0.648 std_dev=0.364
C3'	B	0, 0.237, 0.607, 0.977, 1.043 max_d=1.043 avg_d=0.607 std_dev=0.370
O4'	B	0, 0.401, 0.780, 1.159, 1.100 max_d=1.100 avg_d=0.780 std_dev=0.379
N9	B	0, 0.443, 0.832, 1.221, 1.202 max_d=1.202 avg_d=0.832 std_dev=0.389
P	A	0, 0.127, 0.522, 0.917, 1.228 max_d=1.228 avg_d=0.522 std_dev=0.395
O3'	B	0, 0.095, 0.490, 0.886, 1.141 max_d=1.141 avg_d=0.490 std_dev=0.396
O2'	A	0, 0.087, 0.488, 0.889, 1.251 max_d=1.251 avg_d=0.488 std_dev=0.401
C4'	B	0, 0.415, 0.818, 1.221, 1.225 max_d=1.225 avg_d=0.818 std_dev=0.403
C6	B	0, 0.454, 0.887, 1.319, 1.480 max_d=1.480 avg_d=0.887 std_dev=0.433
OP1	A	0, 0.221, 0.666, 1.111, 1.393 max_d=1.393 avg_d=0.666 std_dev=0.445
O5'	A	0, 0.113, 0.559, 1.005, 1.270 max_d=1.270 avg_d=0.559 std_dev=0.446
C5	B	0, 0.494, 0.955, 1.415, 1.490 max_d=1.490 avg_d=0.955 std_dev=0.460
C5'	B	0, 0.649, 1.158, 1.667, 1.610 max_d=1.610 avg_d=1.158 std_dev=0.509
C5'	A	0, 0.045, 0.573, 1.101, 1.543 max_d=1.543 avg_d=0.573 std_dev=0.528
O5'	B	0, 0.726, 1.281, 1.837, 1.773 max_d=1.773 avg_d=1.281 std_dev=0.555
C8	B	0, 0.617, 1.186, 1.755, 1.738 max_d=1.738 avg_d=1.186 std_dev=0.569
N6	B	0, 0.538, 1.111, 1.684, 1.838 max_d=1.838 avg_d=1.111 std_dev=0.573
N7	B	0, 0.643, 1.272, 1.901, 1.884 max_d=1.884 avg_d=1.272 std_dev=0.629
P	B	0, 0.888, 1.602, 2.316, 2.363 max_d=2.363 avg_d=1.602 std_dev=0.714
OP1	B	0, 0.963, 1.748, 2.533, 2.598 max_d=2.598 avg_d=1.748 std_dev=0.785
OP2	B	0, 0.927, 1.720, 2.513, 2.668 max_d=2.668 avg_d=1.720 std_dev=0.793

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.03	0.01	0.03	0.06	0.02	0.02	0.03	0.06	0.01	0.04	0.02	0.00	0.09	0.06	0.27	0.12
C2	0.03	0.00	0.05	0.03	0.00	0.06	0.01	0.17	0.01	0.01	0.00	0.00	0.13	0.08	0.01	0.09	0.19	0.04	0.29	0.08
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.05	0.01	0.10	0.06	0.11	0.03	0.04	0.09	0.00	0.02	0.04	0.01	0.10	0.10	0.29	0.13
C3'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.06	0.00	0.12	0.02	0.12	0.03	0.02	0.08	0.01	0.01	0.06	0.01	0.09	0.15	0.20	0.11
C4	0.03	0.00	0.05	0.06	0.00	0.11	0.00	0.27	0.00	0.01	0.00	0.01	0.04	0.03	0.01	0.06	0.32	0.10	0.26	0.13
C4'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.11	0.00	0.12	0.01	0.11	0.06	0.07	0.07	0.01	0.01	0.11	0.00	0.02	0.09	0.14	0.06
C5	0.03	0.01	0.10	0.12	0.00	0.12	0.00	0.30	0.00	0.01	0.00	0.01	0.06	0.07	0.01	0.04	0.36	0.11	0.25	0.14
C5'	0.06	0.17	0.06	0.02	0.27	0.01	0.30	0.00	0.27	0.18	0.21	0.14	0.05	0.02	0.29	0.02	0.01	0.12	0.03	0.02
C6	0.02	0.01	0.11	0.12	0.00	0.11	0.00	0.27	0.00	0.01	0.01	0.01	0.08	0.08	0.01	0.05	0.33	0.08	0.24	0.10
N1	0.02	0.01	0.03	0.03	0.01	0.06	0.01	0.18	0.01	0.00	0.00	0.02	0.02	0.04	0.01	0.03	0.21	0.04	0.27	0.07
N3	0.03	0.00	0.04	0.02	0.00	0.07	0.00	0.21	0.01	0.00	0.00	0.01	0.11	0.07	0.01	0.08	0.25	0.07	0.28	0.09
O2	0.06	0.00	0.09	0.08	0.01	0.07	0.01	0.14	0.01	0.02	0.01	0.00	0.21	0.12	0.03	0.14	0.15	0.02	0.30	0.09
O2'	0.01	0.13	0.00	0.01	0.04	0.01	0.06	0.05	0.08	0.02	0.11	0.21	0.00	0.03	0.05	0.01	0.12	0.15	0.34	0.17
O3'	0.04	0.08	0.02	0.01	0.03	0.01	0.07	0.02	0.08	0.04	0.07	0.12	0.03	0.00	0.03	0.06	0.09	0.16	0.20	0.10
O4	0.02	0.01	0.04	0.06	0.01	0.11	0.01	0.29	0.01	0.01	0.01	0.03	0.05	0.03	0.00	0.06	0.33	0.12	0.27	0.16
O4'	0.00	0.09	0.01	0.01	0.06	0.00	0.04	0.02	0.05	0.03	0.08	0.14	0.01	0.06	0.06	0.00	0.08	0.19	0.27	0.21
O5'	0.09	0.19	0.10	0.09	0.32	0.02	0.36	0.01	0.33	0.21	0.25	0.15	0.12	0.09	0.33	0.08	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.06	0.04	0.10	0.15	0.10	0.09	0.11	0.12	0.08	0.04	0.07	0.02	0.15	0.16	0.12	0.19	0.01	0.00	0.02	0.01
OP2	0.27	0.29	0.29	0.20	0.26	0.14	0.25	0.03	0.24	0.27	0.28	0.30	0.34	0.20	0.27	0.27	0.01	0.02	0.00	0.01
P	0.12	0.08	0.13	0.11	0.13	0.06	0.14	0.02	0.10	0.07	0.09	0.09	0.17	0.10	0.16	0.21	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.39	0.33	0.31	0.39	0.35	0.62	0.35	0.70	0.34	0.38	0.34	0.33	0.35	0.37	0.37	0.19	0.30	0.52	0.57	0.62	0.54	0.63
C2	0.29	0.33	0.22	0.26	0.29	0.45	0.28	0.47	0.30	0.26	0.32	0.32	0.30	0.27	0.27	0.18	0.18	0.38	0.32	0.36	0.29	0.37
C2'	0.23	0.28	0.15	0.23	0.23	0.44	0.22	0.52	0.24	0.19	0.27	0.27	0.23	0.20	0.21	0.10	0.21	0.34	0.40	0.41	0.35	0.43
C3'	0.21	0.25	0.14	0.21	0.21	0.43	0.21	0.57	0.22	0.20	0.24	0.24	0.22	0.21	0.20	0.09	0.16	0.33	0.47	0.53	0.44	0.52
C4	0.17	0.31	0.17	0.15	0.18	0.25	0.17	0.21	0.21	0.14	0.28	0.27	0.20	0.14	0.15	0.19	0.10	0.19	0.12	0.13	0.13	0.08
C4'	0.27	0.21	0.23	0.32	0.23	0.54	0.25	0.71	0.24	0.30	0.23	0.21	0.25	0.29	0.26	0.10	0.21	0.40	0.61	0.72	0.61	0.69
C5	0.19	0.35	0.18	0.17	0.24	0.27	0.21	0.23	0.26	0.16	0.32	0.33	0.24	0.17	0.18	0.19	0.10	0.21	0.13	0.13	0.12	0.11
C5'	0.15	0.25	0.12	0.17	0.19	0.31	0.17	0.53	0.19	0.14	0.23	0.23	0.18	0.15	0.15	0.13	0.12	0.18	0.47	0.57	0.46	0.52
C6	0.30	0.36	0.24	0.25	0.31	0.41	0.29	0.40	0.31	0.26	0.34	0.35	0.30	0.27	0.28	0.19	0.15	0.35	0.29	0.27	0.26	0.31
N1	0.33	0.34	0.26	0.30	0.32	0.50	0.31	0.53	0.32	0.30	0.33	0.34	0.32	0.31	0.31	0.18	0.21	0.42	0.39	0.41	0.36	0.43
N3	0.22	0.31	0.19	0.20	0.23	0.35	0.22	0.34	0.25	0.19	0.29	0.28	0.25	0.20	0.21	0.18	0.13	0.28	0.18	0.21	0.16	0.21
O2	0.31	0.33	0.23	0.28	0.30	0.49	0.30	0.54	0.32	0.29	0.33	0.32	0.32	0.30	0.29	0.17	0.20	0.41	0.37	0.44	0.34	0.44
O2'	0.24	0.35	0.14	0.21	0.26	0.43	0.24	0.50	0.27	0.19	0.32	0.33	0.26	0.20	0.22	0.11	0.20	0.35	0.36	0.36	0.30	0.39
O3'	0.30	0.31	0.19	0.26	0.30	0.52	0.32	0.69	0.32	0.32	0.32	0.30	0.33	0.33	0.30	0.08	0.18	0.44	0.58	0.69	0.58	0.67
O4	0.15	0.26	0.18	0.14	0.12	0.18	0.12	0.15	0.15	0.15	0.22	0.19	0.15	0.13	0.13	0.21	0.11	0.14	0.19	0.21	0.25	0.14
O4'	0.45	0.28	0.43	0.51	0.36	0.73	0.39	0.84	0.35	0.47	0.31	0.30	0.36	0.45	0.42	0.29	0.39	0.58	0.72	0.80	0.72	0.80
O5'	0.10	0.15	0.08	0.04	0.14	0.17	0.13	0.34	0.14	0.11	0.15	0.15	0.15	0.11	0.12	0.17	0.02	0.04	0.29	0.33	0.25	0.30
OP1	0.03	0.14	0.11	0.05	0.08	0.14	0.07	0.30	0.09	0.05	0.12	0.12	0.07	0.05	0.04	0.19	0.02	0.09	0.36	0.40	0.37	0.35
OP2	0.20	0.32	0.19	0.14	0.23	0.08	0.23	0.14	0.24	0.27	0.28	0.29	0.24	0.26	0.22	0.24	0.01	0.13	0.11	0.38	0.18	0.20
P	0.09	0.16	0.07	0.01	0.11	0.07	0.10	0.19	0.11	0.11	0.14	0.15	0.11	0.10	0.09	0.12	0.00	0.05	0.18	0.24	0.14	0.16

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.07	0.02	0.02	0.04	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.09	0.00	0.15	0.16	0.19	0.13
C2	0.04	0.00	0.14	0.09	0.01	0.03	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.25	0.11	0.07	0.27	0.25	0.36	0.25
C2'	0.00	0.14	0.00	0.01	0.06	0.02	0.02	0.11	0.04	0.09	0.10	0.14	0.02	0.06	0.01	0.00	0.03	0.01	0.15	0.27	0.23	0.19
C3'	0.01	0.09	0.01	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.02	0.07	0.07	0.10	0.02	0.06	0.02	0.01	0.00	0.01	0.06	0.14	0.08	0.05
C4	0.02	0.01	0.06	0.03	0.00	0.02	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.11	0.08	0.04	0.28	0.27	0.34	0.25
C4'	0.01	0.03	0.02	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.04	0.07	0.02	0.04	0.07	0.07	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.09	0.07	0.03
C5	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.05	0.00	0.19	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.08	0.02	0.35	0.35	0.42	0.33
C5'	0.07	0.12	0.11	0.01	0.14	0.01	0.19	0.00	0.20	0.21	0.15	0.09	0.24	0.23	0.14	0.09	0.05	0.02	0.01	0.09	0.02	0.01
C6	0.02	0.01	0.04	0.02	0.01	0.04	0.00	0.20	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.08	0.04	0.36	0.37	0.46	0.36
C8	0.02	0.01	0.09	0.07	0.00	0.07	0.00	0.21	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.00	0.12	0.11	0.04	0.35	0.34	0.36	0.31
N1	0.04	0.00	0.10	0.07	0.01	0.02	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.19	0.09	0.05	0.32	0.31	0.42	0.31
N3	0.05	0.00	0.14	0.10	0.00	0.04	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.25	0.11	0.06	0.23	0.21	0.31	0.21
N6	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.07	0.01	0.24	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.06	0.08	0.04	0.41	0.44	0.53	0.42
N7	0.01	0.01	0.06	0.06	0.00	0.07	0.00	0.23	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.08	0.10	0.02	0.38	0.39	0.45	0.37
N9	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.14	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.09	0.01	0.26	0.25	0.28	0.22
O2'	0.01	0.25	0.00	0.01	0.11	0.02	0.05	0.09	0.10	0.12	0.19	0.25	0.06	0.08	0.02	0.00	0.02	0.01	0.17	0.32	0.31	0.24
O3'	0.09	0.11	0.03	0.00	0.08	0.01	0.08	0.05	0.08	0.11	0.09	0.11	0.08	0.10	0.09	0.02	0.00	0.09	0.06	0.11	0.08	0.03
O4'	0.00	0.07	0.01	0.01	0.04	0.00	0.02	0.02	0.04	0.04	0.05	0.06	0.04	0.02	0.01	0.01	0.09	0.00	0.08	0.06	0.11	0.07
O5'	0.15	0.27	0.15	0.06	0.28	0.01	0.35	0.01	0.36	0.35	0.32	0.23	0.41	0.38	0.26	0.17	0.06	0.08	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.16	0.25	0.27	0.14	0.27	0.09	0.35	0.09	0.37	0.34	0.31	0.21	0.44	0.39	0.25	0.32	0.11	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.19	0.36	0.23	0.08	0.34	0.07	0.42	0.02	0.46	0.36	0.42	0.31	0.53	0.45	0.28	0.31	0.08	0.11	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.13	0.25	0.19	0.05	0.25	0.03	0.33	0.01	0.36	0.31	0.31	0.21	0.42	0.37	0.22	0.24	0.03	0.07	0.01	0.00	0.00	0.00