Doublet Group distance statistics: 49164

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.000, 0.009, 0.018, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.009 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.002, 0.012, 0.023, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.012 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.001, 0.016, 0.030, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.016 std_dev=0.014
C5	A	0, 0.000, 0.015, 0.030, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.015 std_dev=0.015
C4	A	0, -0.004, 0.012, 0.028, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.012 std_dev=0.016
C2	A	0, 0.000, 0.017, 0.033, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.017 std_dev=0.016
N1	A	0, -0.004, 0.016, 0.035, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.016 std_dev=0.019
O4	A	0, -0.004, 0.024, 0.052, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.024 std_dev=0.028
O2	A	0, -0.007, 0.023, 0.053, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.023 std_dev=0.030
O3'	A	0, -0.040, 0.288, 0.615, 0.746 max_d=0.746 avg_d=0.288 std_dev=0.328
O4'	A	0, 0.037, 0.404, 0.770, 0.888 max_d=0.888 avg_d=0.404 std_dev=0.367
P	A	0, 0.049, 0.456, 0.864, 0.989 max_d=0.989 avg_d=0.456 std_dev=0.407
C3'	A	0, 0.018, 0.429, 0.840, 0.984 max_d=0.984 avg_d=0.429 std_dev=0.411
C2'	A	0, -0.002, 0.425, 0.852, 1.009 max_d=1.009 avg_d=0.425 std_dev=0.427
C4'	A	0, 0.056, 0.487, 0.918, 1.048 max_d=1.048 avg_d=0.487 std_dev=0.431
O5'	A	0, 0.174, 0.610, 1.047, 0.997 max_d=0.997 avg_d=0.610 std_dev=0.437
O3'	B	0, 0.135, 0.608, 1.081, 1.154 max_d=1.154 avg_d=0.608 std_dev=0.473
C4'	B	0, 0.134, 0.612, 1.091, 1.168 max_d=1.168 avg_d=0.612 std_dev=0.478
OP2	A	0, 0.169, 0.661, 1.152, 1.178 max_d=1.178 avg_d=0.661 std_dev=0.491
O4'	B	0, 0.039, 0.540, 1.040, 1.206 max_d=1.206 avg_d=0.540 std_dev=0.501
N3	B	0, -0.009, 0.501, 1.011, 1.201 max_d=1.201 avg_d=0.501 std_dev=0.510
C3'	B	0, 0.034, 0.550, 1.066, 1.240 max_d=1.240 avg_d=0.550 std_dev=0.516
C2	B	0, 0.071, 0.601, 1.131, 1.289 max_d=1.289 avg_d=0.601 std_dev=0.530
O5'	B	0, 0.192, 0.734, 1.276, 1.293 max_d=1.293 avg_d=0.734 std_dev=0.542
C5'	B	0, 0.203, 0.745, 1.288, 1.275 max_d=1.275 avg_d=0.745 std_dev=0.542
C1'	B	0, -0.071, 0.499, 1.069, 1.296 max_d=1.296 avg_d=0.499 std_dev=0.570
O2'	B	0, 0.026, 0.613, 1.200, 1.404 max_d=1.404 avg_d=0.613 std_dev=0.587
C2'	B	0, -0.104, 0.503, 1.111, 1.358 max_d=1.358 avg_d=0.503 std_dev=0.607
P	B	0, 0.249, 0.871, 1.493, 1.412 max_d=1.412 avg_d=0.871 std_dev=0.622
C4	B	0, -0.029, 0.596, 1.221, 1.459 max_d=1.459 avg_d=0.596 std_dev=0.625
N1	B	0, 0.120, 0.774, 1.427, 1.597 max_d=1.597 avg_d=0.774 std_dev=0.653
N9	B	0, -0.122, 0.553, 1.228, 1.504 max_d=1.504 avg_d=0.553 std_dev=0.675
C5'	A	0, 0.099, 0.780, 1.461, 1.659 max_d=1.659 avg_d=0.780 std_dev=0.681
O2'	A	0, 0.011, 0.694, 1.377, 1.623 max_d=1.623 avg_d=0.694 std_dev=0.683
OP1	A	0, -0.099, 0.588, 1.274, 1.551 max_d=1.551 avg_d=0.588 std_dev=0.686
C6	B	0, 0.109, 0.850, 1.592, 1.806 max_d=1.806 avg_d=0.850 std_dev=0.741
C5	B	0, 0.023, 0.769, 1.516, 1.780 max_d=1.780 avg_d=0.769 std_dev=0.746
C8	B	0, -0.106, 0.695, 1.496, 1.818 max_d=1.818 avg_d=0.695 std_dev=0.801
N7	B	0, -0.025, 0.825, 1.675, 1.994 max_d=1.994 avg_d=0.825 std_dev=0.850
N6	B	0, 0.162, 1.024, 1.886, 2.110 max_d=2.110 avg_d=1.024 std_dev=0.862
OP2	B	0, 0.277, 1.188, 2.099, 2.214 max_d=2.214 avg_d=1.188 std_dev=0.911
OP1	B	0, 0.454, 1.566, 2.679, 2.477 max_d=2.477 avg_d=1.566 std_dev=1.112

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.03	0.02	0.01	0.00	0.07	0.00	0.01	0.02	0.05	0.00	0.17	0.01	0.01	0.27	0.09	0.44	0.04
C2	0.03	0.00	0.04	0.06	0.02	0.17	0.02	0.31	0.01	0.00	0.01	0.00	0.17	0.18	0.01	0.21	0.42	0.13	0.28	0.07
C2'	0.01	0.04	0.00	0.01	0.02	0.03	0.07	0.16	0.10	0.03	0.03	0.07	0.01	0.03	0.01	0.02	0.66	0.51	0.08	0.35
C3'	0.03	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.02	0.06	0.01	0.03	0.11	0.03	0.00	0.02	0.01	0.38	0.37	0.28	0.18
C4	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.04	0.01	0.16	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.13	0.01	0.02	0.43	0.07	0.27	0.04
C4'	0.01	0.17	0.03	0.01	0.04	0.00	0.09	0.01	0.12	0.02	0.13	0.29	0.01	0.00	0.04	0.00	0.00	0.07	0.49	0.09
C5	0.00	0.02	0.07	0.06	0.01	0.09	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.02	0.23	0.09	0.00	0.13	0.38	0.14	0.38	0.11
C5'	0.07	0.31	0.16	0.02	0.16	0.01	0.04	0.00	0.07	0.13	0.29	0.43	0.13	0.09	0.17	0.01	0.01	0.07	0.34	0.01
C6	0.00	0.01	0.10	0.06	0.00	0.12	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.28	0.10	0.01	0.18	0.36	0.11	0.47	0.12
N1	0.01	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.13	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.15	0.00	0.01	0.37	0.07	0.40	0.03
N3	0.02	0.01	0.03	0.03	0.01	0.13	0.01	0.29	0.00	0.00	0.00	0.00	0.11	0.16	0.01	0.15	0.44	0.08	0.24	0.07
O2	0.05	0.00	0.07	0.11	0.01	0.29	0.02	0.43	0.01	0.01	0.00	0.00	0.32	0.23	0.01	0.37	0.41	0.21	0.24	0.13
O2'	0.00	0.17	0.01	0.03	0.05	0.01	0.23	0.13	0.28	0.03	0.11	0.32	0.00	0.04	0.04	0.01	0.66	0.64	0.05	0.42
O3'	0.17	0.18	0.03	0.00	0.13	0.00	0.09	0.09	0.10	0.15	0.16	0.23	0.04	0.00	0.12	0.13	0.19	0.26	0.32	0.08
O4	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.04	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.12	0.00	0.02	0.43	0.08	0.22	0.04
O4'	0.01	0.21	0.02	0.01	0.02	0.00	0.13	0.01	0.18	0.01	0.15	0.37	0.01	0.13	0.02	0.00	0.08	0.18	0.69	0.30
O5'	0.27	0.42	0.66	0.38	0.43	0.00	0.38	0.01	0.36	0.37	0.44	0.41	0.66	0.19	0.43	0.08	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.09	0.13	0.51	0.37	0.07	0.07	0.14	0.07	0.11	0.07	0.08	0.21	0.64	0.26	0.08	0.18	0.02	0.00	0.04	0.01
OP2	0.44	0.28	0.08	0.28	0.27	0.49	0.38	0.34	0.47	0.40	0.24	0.24	0.05	0.32	0.22	0.69	0.01	0.04	0.00	0.01
P	0.04	0.07	0.35	0.18	0.04	0.09	0.11	0.01	0.12	0.03	0.07	0.13	0.42	0.08	0.04	0.30	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.05	0.10	0.09	0.15	0.04	0.20	0.07	0.23	0.09	0.03	0.11	0.06	0.11	0.06	0.03	0.12	0.15	0.12	0.22	0.31	0.21	0.14
C2	0.05	0.06	0.08	0.13	0.06	0.22	0.06	0.31	0.06	0.06	0.06	0.06	0.06	0.05	0.05	0.11	0.10	0.14	0.27	0.43	0.25	0.25
C2'	0.23	0.18	0.25	0.15	0.24	0.05	0.26	0.04	0.23	0.27	0.19	0.21	0.23	0.28	0.26	0.31	0.16	0.10	0.19	0.15	0.36	0.14
C3'	0.02	0.06	0.04	0.04	0.03	0.14	0.01	0.16	0.03	0.01	0.04	0.06	0.02	0.01	0.01	0.10	0.01	0.13	0.20	0.16	0.21	0.06
C4	0.14	0.10	0.17	0.21	0.14	0.28	0.15	0.38	0.14	0.16	0.12	0.12	0.15	0.15	0.15	0.17	0.18	0.20	0.35	0.52	0.33	0.34
C4'	0.17	0.15	0.16	0.17	0.17	0.24	0.16	0.25	0.16	0.17	0.14	0.17	0.15	0.16	0.17	0.16	0.13	0.23	0.25	0.30	0.21	0.20
C5	0.19	0.05	0.22	0.26	0.13	0.28	0.12	0.32	0.10	0.17	0.06	0.09	0.09	0.14	0.17	0.24	0.24	0.22	0.31	0.42	0.29	0.27
C5'	0.13	0.22	0.10	0.05	0.21	0.13	0.24	0.13	0.26	0.20	0.25	0.20	0.27	0.23	0.18	0.10	0.05	0.16	0.16	0.20	0.18	0.12
C6	0.13	0.06	0.18	0.22	0.06	0.24	0.06	0.26	0.04	0.10	0.06	0.04	0.04	0.07	0.10	0.22	0.22	0.16	0.25	0.34	0.24	0.19
N1	0.07	0.07	0.11	0.16	0.05	0.22	0.05	0.27	0.06	0.05	0.07	0.05	0.06	0.05	0.05	0.14	0.16	0.13	0.24	0.36	0.23	0.19
N3	0.08	0.09	0.10	0.15	0.10	0.24	0.11	0.35	0.11	0.10	0.10	0.09	0.11	0.10	0.09	0.12	0.11	0.16	0.31	0.50	0.29	0.31
O2	0.03	0.06	0.04	0.11	0.05	0.21	0.05	0.31	0.06	0.04	0.06	0.05	0.06	0.04	0.04	0.09	0.06	0.13	0.26	0.44	0.24	0.25
O2'	0.48	0.65	0.47	0.32	0.62	0.22	0.68	0.20	0.69	0.62	0.68	0.60	0.69	0.67	0.58	0.50	0.26	0.33	0.38	0.32	0.65	0.40
O3'	0.03	0.08	0.05	0.01	0.06	0.08	0.07	0.10	0.07	0.05	0.08	0.06	0.08	0.06	0.05	0.09	0.01	0.05	0.19	0.14	0.25	0.04
O4	0.16	0.15	0.18	0.21	0.19	0.29	0.20	0.44	0.20	0.20	0.18	0.15	0.21	0.21	0.18	0.17	0.18	0.21	0.40	0.59	0.39	0.42
O4'	0.29	0.15	0.32	0.34	0.24	0.37	0.22	0.39	0.18	0.27	0.14	0.21	0.17	0.24	0.27	0.32	0.31	0.33	0.37	0.48	0.31	0.35
O5'	0.39	0.56	0.29	0.25	0.52	0.29	0.51	0.31	0.53	0.43	0.55	0.55	0.52	0.47	0.46	0.23	0.20	0.37	0.36	0.26	0.47	0.33
OP1	0.06	0.25	0.15	0.17	0.17	0.15	0.22	0.11	0.28	0.10	0.30	0.18	0.32	0.17	0.08	0.20	0.19	0.08	0.07	0.12	0.24	0.13
OP2	0.10	0.16	0.21	0.14	0.10	0.04	0.12	0.07	0.10	0.20	0.13	0.15	0.12	0.19	0.13	0.34	0.13	0.07	0.13	0.22	0.28	0.17
P	0.07	0.17	0.02	0.04	0.16	0.08	0.19	0.05	0.20	0.15	0.20	0.14	0.23	0.18	0.13	0.07	0.08	0.07	0.05	0.13	0.20	0.03

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.01	0.14	0.15	0.20	0.01
C2	0.01	0.00	0.03	0.02	0.00	0.08	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.07	0.31	0.09	0.24	0.05
C2'	0.01	0.03	0.00	0.01	0.03	0.02	0.04	0.07	0.04	0.05	0.04	0.02	0.06	0.06	0.03	0.00	0.01	0.02	0.05	0.16	0.15	0.02
C3'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.03	0.02	0.04	0.01	0.04	0.00	0.00	0.10	0.26	0.16	0.05
C4	0.01	0.00	0.03	0.01	0.00	0.05	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.04	0.02	0.06	0.27	0.08	0.24	0.05
C4'	0.00	0.08	0.02	0.00	0.05	0.00	0.03	0.00	0.05	0.04	0.07	0.08	0.03	0.03	0.01	0.03	0.02	0.00	0.02	0.25	0.21	0.03
C5	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.03	0.05	0.27	0.12	0.26	0.08
C5'	0.01	0.11	0.07	0.03	0.05	0.00	0.03	0.00	0.05	0.07	0.08	0.10	0.04	0.06	0.01	0.08	0.01	0.02	0.01	0.22	0.20	0.01
C6	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.05	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.02	0.06	0.29	0.11	0.27	0.08
C8	0.00	0.01	0.05	0.04	0.01	0.04	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.05	0.05	0.03	0.20	0.16	0.25	0.11
N1	0.00	0.00	0.04	0.01	0.00	0.07	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.02	0.06	0.32	0.07	0.25	0.06
N3	0.00	0.00	0.02	0.03	0.00	0.08	0.00	0.10	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.05	0.00	0.07	0.29	0.12	0.23	0.05
N6	0.01	0.01	0.06	0.02	0.01	0.03	0.01	0.04	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.07	0.04	0.05	0.29	0.18	0.28	0.11
N7	0.00	0.01	0.06	0.04	0.01	0.03	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.06	0.05	0.03	0.23	0.20	0.27	0.13
N9	0.00	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.04	0.03	0.22	0.09	0.23	0.05
O2'	0.01	0.05	0.00	0.04	0.04	0.03	0.05	0.08	0.05	0.05	0.05	0.05	0.07	0.06	0.03	0.00	0.05	0.02	0.06	0.16	0.11	0.03
O3'	0.03	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.03	0.01	0.02	0.05	0.02	0.00	0.04	0.05	0.04	0.05	0.00	0.01	0.12	0.29	0.16	0.08
O4'	0.01	0.07	0.02	0.00	0.06	0.00	0.05	0.02	0.06	0.03	0.06	0.07	0.05	0.03	0.03	0.02	0.01	0.00	0.17	0.18	0.24	0.02
O5'	0.14	0.31	0.05	0.10	0.27	0.02	0.27	0.01	0.29	0.20	0.32	0.29	0.29	0.23	0.22	0.06	0.12	0.17	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.15	0.09	0.16	0.26	0.08	0.25	0.12	0.22	0.11	0.16	0.07	0.12	0.18	0.20	0.09	0.16	0.29	0.18	0.01	0.00	0.03	0.01
OP2	0.20	0.24	0.15	0.16	0.24	0.21	0.26	0.20	0.27	0.25	0.25	0.23	0.28	0.27	0.23	0.11	0.16	0.24	0.01	0.03	0.00	0.00
P	0.01	0.05	0.02	0.05	0.05	0.03	0.08	0.01	0.08	0.11	0.06	0.05	0.11	0.13	0.05	0.03	0.08	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00