Doublet Group distance statistics: 49167

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.001, 0.003, 0.005, 0.005 max_d=0.005 avg_d=0.003 std_dev=0.002
C5	A	0, -0.001, 0.005, 0.011, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.005 std_dev=0.006
N1	A	0, -0.001, 0.010, 0.022, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.010 std_dev=0.011
C2	A	0, -0.001, 0.014, 0.029, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.014 std_dev=0.015
C4	A	0, -0.002, 0.013, 0.029, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.013 std_dev=0.016
C1'	A	0, -0.002, 0.014, 0.030, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.014 std_dev=0.016
C6	A	0, -0.003, 0.014, 0.031, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.014 std_dev=0.017
O2	A	0, -0.001, 0.030, 0.061, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.030 std_dev=0.031
O4	A	0, -0.014, 0.060, 0.133, 0.163 max_d=0.163 avg_d=0.060 std_dev=0.073
C3'	B	0, 0.089, 0.333, 0.576, 0.576 max_d=0.576 avg_d=0.333 std_dev=0.243
C4'	B	0, 0.092, 0.354, 0.616, 0.626 max_d=0.626 avg_d=0.354 std_dev=0.262
C2'	A	0, -0.068, 0.236, 0.540, 0.665 max_d=0.665 avg_d=0.236 std_dev=0.304
O4'	A	0, -0.078, 0.232, 0.543, 0.671 max_d=0.671 avg_d=0.232 std_dev=0.311
O3'	B	0, 0.067, 0.385, 0.703, 0.779 max_d=0.779 avg_d=0.385 std_dev=0.318
C2'	B	0, 0.052, 0.395, 0.739, 0.838 max_d=0.838 avg_d=0.395 std_dev=0.344
O2'	B	0, -0.006, 0.362, 0.730, 0.866 max_d=0.866 avg_d=0.362 std_dev=0.368
C1'	B	0, 0.053, 0.423, 0.793, 0.901 max_d=0.901 avg_d=0.423 std_dev=0.370
O4'	B	0, 0.060, 0.437, 0.814, 0.920 max_d=0.920 avg_d=0.437 std_dev=0.377
C5'	B	0, 0.120, 0.514, 0.909, 0.960 max_d=0.960 avg_d=0.514 std_dev=0.395
C3'	A	0, -0.090, 0.340, 0.770, 0.946 max_d=0.946 avg_d=0.340 std_dev=0.430
C4'	A	0, -0.103, 0.331, 0.765, 0.944 max_d=0.944 avg_d=0.331 std_dev=0.434
N9	B	0, 0.065, 0.524, 0.984, 1.119 max_d=1.119 avg_d=0.524 std_dev=0.460
O5'	B	0, 0.153, 0.650, 1.147, 1.207 max_d=1.207 avg_d=0.650 std_dev=0.497
C8	B	0, 0.119, 0.622, 1.125, 1.232 max_d=1.232 avg_d=0.622 std_dev=0.503
O2'	A	0, -0.116, 0.399, 0.915, 1.127 max_d=1.127 avg_d=0.399 std_dev=0.515
O3'	A	0, -0.057, 0.468, 0.993, 1.201 max_d=1.201 avg_d=0.468 std_dev=0.525
OP2	A	0, -0.065, 0.497, 1.060, 1.283 max_d=1.283 avg_d=0.497 std_dev=0.562
OP1	B	0, 0.198, 0.763, 1.329, 1.352 max_d=1.352 avg_d=0.763 std_dev=0.566
O5'	A	0, -0.109, 0.462, 1.033, 1.266 max_d=1.266 avg_d=0.462 std_dev=0.571
C4	B	0, -0.004, 0.584, 1.172, 1.389 max_d=1.389 avg_d=0.584 std_dev=0.588
N3	B	0, -0.061, 0.572, 1.204, 1.453 max_d=1.453 avg_d=0.572 std_dev=0.633
N7	B	0, 0.089, 0.727, 1.366, 1.554 max_d=1.554 avg_d=0.727 std_dev=0.638
P	A	0, -0.101, 0.570, 1.241, 1.512 max_d=1.512 avg_d=0.570 std_dev=0.671
P	B	0, 0.192, 0.870, 1.547, 1.654 max_d=1.654 avg_d=0.870 std_dev=0.678
C5'	A	0, -0.164, 0.523, 1.210, 1.493 max_d=1.493 avg_d=0.523 std_dev=0.687
C5	B	0, 0.007, 0.706, 1.405, 1.658 max_d=1.658 avg_d=0.706 std_dev=0.699
C2	B	0, -0.082, 0.698, 1.478, 1.786 max_d=1.786 avg_d=0.698 std_dev=0.780
OP2	B	0, 0.203, 1.049, 1.895, 2.072 max_d=2.072 avg_d=1.049 std_dev=0.846
OP1	A	0, -0.141, 0.724, 1.590, 1.941 max_d=1.941 avg_d=0.724 std_dev=0.865
C6	B	0, -0.059, 0.819, 1.696, 2.036 max_d=2.036 avg_d=0.819 std_dev=0.878
N1	B	0, -0.094, 0.812, 1.718, 2.076 max_d=2.076 avg_d=0.812 std_dev=0.906
N6	B	0, -0.067, 0.966, 1.999, 2.398 max_d=2.398 avg_d=0.966 std_dev=1.033

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.01	0.00	0.00	0.07	0.04	0.15	0.07
C2	0.00	0.00	0.09	0.14	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.13	0.00	0.04	0.02	0.03	0.12	0.07
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.03	0.03	0.09	0.03	0.10	0.01	0.05	0.19	0.00	0.01	0.04	0.01	0.14	0.12	0.29	0.17
C3'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.08	0.00	0.02	0.03	0.01	0.06	0.13	0.18	0.01	0.00	0.08	0.01	0.09	0.07	0.16	0.10
C4	0.01	0.00	0.03	0.08	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.11	0.07	0.00	0.02	0.03	0.06	0.13	0.08
C4'	0.01	0.03	0.03	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.04	0.02	0.04	0.02	0.16	0.05	0.05	0.00	0.01	0.04	0.04	0.01
C5	0.01	0.00	0.09	0.02	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.12	0.02	0.00	0.07	0.04	0.09	0.17	0.10
C5'	0.02	0.01	0.03	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.12	0.05	0.01	0.00	0.00	0.05	0.01	0.02
C6	0.01	0.01	0.10	0.01	0.00	0.04	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.09	0.02	0.00	0.08	0.06	0.09	0.19	0.11
N1	0.00	0.00	0.01	0.06	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.05	0.00	0.01	0.05	0.05	0.16	0.09
N3	0.00	0.00	0.05	0.13	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.07	0.12	0.00	0.02	0.02	0.04	0.12	0.07
O2	0.01	0.00	0.19	0.18	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.07	0.19	0.00	0.08	0.01	0.01	0.11	0.05
O2'	0.04	0.01	0.00	0.01	0.11	0.16	0.12	0.12	0.09	0.04	0.07	0.07	0.00	0.02	0.14	0.13	0.05	0.00	0.24	0.06
O3'	0.01	0.13	0.01	0.00	0.07	0.05	0.02	0.05	0.02	0.05	0.12	0.19	0.02	0.00	0.07	0.03	0.05	0.04	0.14	0.06
O4	0.00	0.00	0.04	0.08	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.14	0.07	0.00	0.03	0.03	0.06	0.12	0.08
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.07	0.00	0.08	0.01	0.02	0.08	0.13	0.03	0.03	0.00	0.02	0.05	0.03	0.03
O5'	0.07	0.02	0.14	0.09	0.03	0.01	0.04	0.00	0.06	0.05	0.02	0.01	0.05	0.05	0.03	0.02	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.04	0.03	0.12	0.07	0.06	0.04	0.09	0.05	0.09	0.05	0.04	0.01	0.00	0.04	0.06	0.05	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.15	0.12	0.29	0.16	0.13	0.04	0.17	0.01	0.19	0.16	0.12	0.11	0.24	0.14	0.12	0.03	0.02	0.00	0.00	0.00
P	0.07	0.07	0.17	0.10	0.08	0.01	0.10	0.02	0.11	0.09	0.07	0.05	0.06	0.06	0.08	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.18	0.53	0.27	0.15	0.19	0.14	0.26	0.16	0.43	0.02	0.56	0.32	0.47	0.12	0.02	0.31	0.11	0.17	0.14	0.08	0.05	0.11
C2	0.24	0.24	0.28	0.14	0.05	0.16	0.07	0.19	0.18	0.13	0.26	0.10	0.21	0.05	0.14	0.34	0.21	0.25	0.21	0.14	0.17	0.20
C2'	0.01	0.69	0.07	0.03	0.38	0.05	0.47	0.03	0.65	0.22	0.75	0.46	0.70	0.37	0.19	0.09	0.25	0.02	0.06	0.11	0.16	0.09
C3'	0.18	0.42	0.22	0.15	0.13	0.13	0.21	0.15	0.38	0.02	0.48	0.22	0.43	0.11	0.04	0.16	0.09	0.17	0.14	0.04	0.02	0.09
C4	0.22	0.15	0.23	0.11	0.06	0.16	0.05	0.20	0.08	0.16	0.14	0.07	0.08	0.10	0.15	0.32	0.26	0.26	0.22	0.16	0.20	0.22
C4'	0.29	0.36	0.37	0.26	0.03	0.24	0.07	0.24	0.25	0.19	0.39	0.17	0.28	0.07	0.17	0.30	0.03	0.27	0.24	0.15	0.14	0.19
C5	0.18	0.30	0.24	0.12	0.09	0.15	0.09	0.18	0.18	0.11	0.27	0.22	0.17	0.03	0.08	0.33	0.21	0.22	0.17	0.10	0.11	0.15
C5'	0.29	0.27	0.36	0.26	0.04	0.23	0.03	0.23	0.12	0.28	0.26	0.13	0.13	0.18	0.21	0.22	0.04	0.26	0.25	0.14	0.15	0.18
C6	0.17	0.43	0.26	0.13	0.15	0.15	0.17	0.17	0.29	0.06	0.41	0.31	0.30	0.04	0.04	0.33	0.15	0.19	0.15	0.08	0.07	0.12
N1	0.21	0.41	0.27	0.14	0.12	0.15	0.16	0.17	0.30	0.07	0.41	0.24	0.32	0.05	0.07	0.33	0.16	0.21	0.17	0.10	0.10	0.15
N3	0.25	0.13	0.26	0.12	0.08	0.16	0.06	0.20	0.09	0.17	0.15	0.05	0.11	0.10	0.17	0.33	0.25	0.27	0.23	0.17	0.22	0.23
O2	0.26	0.19	0.29	0.15	0.06	0.16	0.06	0.20	0.16	0.14	0.24	0.06	0.20	0.06	0.16	0.35	0.21	0.26	0.22	0.15	0.20	0.22
O2'	0.11	0.95	0.03	0.07	0.56	0.12	0.70	0.13	0.93	0.39	1.06	0.65	1.02	0.58	0.34	0.11	0.25	0.14	0.19	0.19	0.30	0.21
O3'	0.12	0.46	0.17	0.12	0.19	0.09	0.30	0.10	0.48	0.07	0.57	0.25	0.56	0.20	0.03	0.10	0.08	0.11	0.08	0.03	0.05	0.02
O4	0.19	0.07	0.19	0.10	0.08	0.15	0.08	0.21	0.05	0.18	0.06	0.04	0.05	0.14	0.16	0.28	0.30	0.25	0.24	0.19	0.24	0.25
O4'	0.32	0.39	0.42	0.29	0.03	0.27	0.07	0.28	0.25	0.22	0.40	0.20	0.28	0.08	0.18	0.43	0.04	0.30	0.27	0.20	0.18	0.23
O5'	0.28	0.26	0.34	0.26	0.04	0.22	0.05	0.23	0.09	0.29	0.23	0.14	0.10	0.19	0.22	0.18	0.05	0.24	0.25	0.13	0.14	0.18
OP1	0.15	0.17	0.17	0.15	0.06	0.11	0.12	0.13	0.05	0.29	0.12	0.11	0.07	0.26	0.17	0.13	0.04	0.13	0.16	0.09	0.09	0.09
OP2	0.13	0.23	0.21	0.19	0.05	0.12	0.11	0.14	0.05	0.33	0.15	0.20	0.07	0.28	0.17	0.18	0.06	0.11	0.19	0.10	0.12	0.13
P	0.19	0.22	0.26	0.20	0.05	0.15	0.10	0.16	0.04	0.32	0.16	0.15	0.05	0.26	0.20	0.06	0.05	0.16	0.20	0.09	0.11	0.13

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.08	0.01	0.04	0.12	0.15	0.09
C2	0.01	0.00	0.04	0.05	0.00	0.02	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.20	0.14	0.03	0.20	0.14	0.24	0.22
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.02	0.03	0.02	0.02	0.08	0.02	0.05	0.02	0.06	0.03	0.00	0.02	0.01	0.08	0.22	0.25	0.18
C3'	0.02	0.05	0.00	0.00	0.12	0.00	0.20	0.02	0.18	0.29	0.11	0.02	0.23	0.28	0.16	0.01	0.00	0.01	0.02	0.13	0.07	0.08
C4	0.01	0.00	0.01	0.12	0.00	0.04	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.13	0.02	0.02	0.16	0.10	0.13	0.15
C4'	0.01	0.02	0.02	0.00	0.04	0.00	0.09	0.00	0.08	0.13	0.04	0.03	0.10	0.13	0.06	0.13	0.08	0.01	0.00	0.04	0.05	0.02
C5	0.00	0.00	0.03	0.20	0.00	0.09	0.00	0.17	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.12	0.16	0.01	0.23	0.21	0.24	0.24
C5'	0.01	0.12	0.02	0.02	0.12	0.00	0.17	0.00	0.18	0.13	0.16	0.09	0.21	0.17	0.09	0.10	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01
C6	0.01	0.00	0.02	0.18	0.00	0.08	0.00	0.18	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.16	0.12	0.02	0.26	0.26	0.33	0.31
C8	0.01	0.00	0.08	0.29	0.00	0.13	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.33	0.01	0.13	0.12	0.03	0.10
N1	0.01	0.00	0.02	0.11	0.00	0.04	0.00	0.16	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.19	0.03	0.02	0.25	0.22	0.32	0.29
N3	0.01	0.00	0.05	0.02	0.00	0.03	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.18	0.16	0.03	0.15	0.07	0.14	0.15
N6	0.01	0.00	0.02	0.23	0.00	0.10	0.00	0.21	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.15	0.20	0.02	0.30	0.33	0.41	0.37
N7	0.00	0.00	0.06	0.28	0.00	0.13	0.00	0.17	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.06	0.33	0.01	0.21	0.23	0.20	0.22
N9	0.00	0.00	0.03	0.16	0.00	0.06	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.10	0.01	0.09	0.04	0.01	0.05
O2'	0.01	0.20	0.00	0.01	0.13	0.13	0.12	0.10	0.16	0.02	0.19	0.18	0.15	0.06	0.06	0.00	0.11	0.12	0.02	0.17	0.21	0.12
O3'	0.08	0.14	0.02	0.00	0.02	0.08	0.16	0.01	0.12	0.33	0.03	0.16	0.20	0.33	0.10	0.11	0.00	0.09	0.12	0.15	0.16	0.13
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.12	0.09	0.00	0.05	0.06	0.11	0.06
O5'	0.04	0.20	0.08	0.02	0.16	0.00	0.23	0.01	0.26	0.13	0.25	0.15	0.30	0.21	0.09	0.02	0.12	0.05	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.12	0.14	0.22	0.13	0.10	0.04	0.21	0.02	0.26	0.12	0.22	0.07	0.33	0.23	0.04	0.17	0.15	0.06	0.02	0.00	0.00	0.00
OP2	0.15	0.24	0.25	0.07	0.13	0.05	0.24	0.00	0.33	0.03	0.32	0.14	0.41	0.20	0.01	0.21	0.16	0.11	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.09	0.22	0.18	0.08	0.15	0.02	0.24	0.01	0.31	0.10	0.29	0.15	0.37	0.22	0.05	0.12	0.13	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00