Doublet Group distance statistics: 49169

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, -0.001, 0.001, 0.003, 0.004 max_d=0.004 avg_d=0.001 std_dev=0.002
C5	A	0, -0.001, 0.003, 0.007, 0.009 max_d=0.009 avg_d=0.003 std_dev=0.004
N1	A	0, -0.004, 0.010, 0.024, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.010 std_dev=0.014
C2	A	0, -0.005, 0.013, 0.032, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.013 std_dev=0.018
C1'	A	0, -0.005, 0.013, 0.032, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.013 std_dev=0.019
C4	A	0, -0.006, 0.014, 0.033, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.014 std_dev=0.019
C6	A	0, -0.006, 0.014, 0.033, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.014 std_dev=0.019
O2	A	0, -0.012, 0.030, 0.072, 0.090 max_d=0.090 avg_d=0.030 std_dev=0.042
O4	A	0, -0.030, 0.072, 0.174, 0.216 max_d=0.216 avg_d=0.072 std_dev=0.102
O4'	A	0, -0.096, 0.232, 0.560, 0.695 max_d=0.695 avg_d=0.232 std_dev=0.328
C2'	B	0, -0.108, 0.261, 0.630, 0.783 max_d=0.783 avg_d=0.261 std_dev=0.369
C4'	A	0, -0.112, 0.271, 0.655, 0.814 max_d=0.814 avg_d=0.271 std_dev=0.384
C3'	B	0, -0.119, 0.287, 0.693, 0.861 max_d=0.861 avg_d=0.287 std_dev=0.406
N3	B	0, -0.126, 0.305, 0.736, 0.915 max_d=0.915 avg_d=0.305 std_dev=0.431
C2	B	0, -0.126, 0.305, 0.737, 0.916 max_d=0.916 avg_d=0.305 std_dev=0.432
C2'	A	0, -0.130, 0.313, 0.756, 0.940 max_d=0.940 avg_d=0.313 std_dev=0.443
C1'	B	0, -0.137, 0.330, 0.797, 0.990 max_d=0.990 avg_d=0.330 std_dev=0.467
O2'	B	0, -0.138, 0.333, 0.804, 0.999 max_d=0.999 avg_d=0.333 std_dev=0.471
OP1	A	0, -0.139, 0.336, 0.812, 1.009 max_d=1.009 avg_d=0.336 std_dev=0.476
N1	B	0, -0.144, 0.348, 0.839, 1.043 max_d=1.043 avg_d=0.348 std_dev=0.492
C4	B	0, -0.147, 0.356, 0.859, 1.068 max_d=1.068 avg_d=0.356 std_dev=0.503
O5'	B	0, -0.150, 0.363, 0.876, 1.088 max_d=1.088 avg_d=0.363 std_dev=0.513
C4'	B	0, -0.150, 0.363, 0.877, 1.090 max_d=1.090 avg_d=0.363 std_dev=0.514
N9	B	0, -0.153, 0.370, 0.892, 1.109 max_d=1.109 avg_d=0.370 std_dev=0.523
C5'	B	0, -0.154, 0.373, 0.900, 1.118 max_d=1.118 avg_d=0.373 std_dev=0.527
O4'	B	0, -0.159, 0.385, 0.930, 1.155 max_d=1.155 avg_d=0.385 std_dev=0.544
C6	B	0, -0.166, 0.401, 0.969, 1.204 max_d=1.204 avg_d=0.401 std_dev=0.567
C5	B	0, -0.169, 0.409, 0.987, 1.226 max_d=1.226 avg_d=0.409 std_dev=0.578
C8	B	0, -0.179, 0.433, 1.046, 1.299 max_d=1.299 avg_d=0.433 std_dev=0.613
P	A	0, -0.181, 0.437, 1.054, 1.310 max_d=1.310 avg_d=0.437 std_dev=0.618
N6	B	0, -0.185, 0.446, 1.077, 1.339 max_d=1.339 avg_d=0.446 std_dev=0.631
N7	B	0, -0.191, 0.460, 1.112, 1.381 max_d=1.381 avg_d=0.460 std_dev=0.651
C3'	A	0, -0.203, 0.490, 1.182, 1.469 max_d=1.469 avg_d=0.490 std_dev=0.693
P	B	0, -0.206, 0.496, 1.198, 1.489 max_d=1.489 avg_d=0.496 std_dev=0.702
O2'	A	0, -0.217, 0.525, 1.267, 1.575 max_d=1.575 avg_d=0.525 std_dev=0.742
O3'	B	0, -0.218, 0.527, 1.271, 1.580 max_d=1.580 avg_d=0.527 std_dev=0.745
OP2	B	0, -0.227, 0.548, 1.322, 1.643 max_d=1.643 avg_d=0.548 std_dev=0.774
C5'	A	0, -0.227, 0.549, 1.325, 1.647 max_d=1.647 avg_d=0.549 std_dev=0.776
O5'	A	0, -0.240, 0.581, 1.402, 1.742 max_d=1.742 avg_d=0.581 std_dev=0.821
OP2	A	0, -0.248, 0.599, 1.446, 1.796 max_d=1.796 avg_d=0.599 std_dev=0.847
OP1	B	0, -0.252, 0.609, 1.471, 1.828 max_d=1.828 avg_d=0.609 std_dev=0.862
O3'	A	0, -0.357, 0.863, 2.083, 2.589 max_d=2.589 avg_d=0.863 std_dev=1.220

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.09	0.01	0.01	0.11	0.01	0.54	0.17
C2	0.00	0.00	0.11	0.00	0.00	0.02	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.25	0.13	0.01	0.05	0.34	0.11	0.31	0.02
C2'	0.00	0.11	0.00	0.01	0.06	0.00	0.15	0.00	0.17	0.03	0.05	0.25	0.00	0.06	0.06	0.00	0.31	0.28	0.27	0.09
C3'	0.01	0.00	0.01	0.00	0.23	0.00	0.35	0.01	0.34	0.14	0.09	0.16	0.00	0.00	0.25	0.00	0.41	0.44	0.09	0.26
C4	0.01	0.00	0.06	0.23	0.00	0.11	0.00	0.26	0.00	0.00	0.00	0.00	0.09	0.20	0.00	0.00	0.57	0.22	0.01	0.21
C4'	0.02	0.02	0.00	0.00	0.11	0.00	0.16	0.00	0.15	0.06	0.06	0.05	0.03	0.02	0.12	0.01	0.00	0.13	0.45	0.09
C5	0.00	0.00	0.15	0.35	0.00	0.16	0.00	0.29	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.37	0.00	0.04	0.63	0.23	0.01	0.23
C5'	0.00	0.11	0.00	0.01	0.26	0.00	0.29	0.00	0.25	0.13	0.19	0.04	0.03	0.06	0.28	0.01	0.00	0.14	0.36	0.00
C6	0.00	0.00	0.17	0.34	0.00	0.15	0.00	0.25	0.00	0.00	0.00	0.01	0.06	0.33	0.01	0.06	0.54	0.17	0.23	0.11
N1	0.00	0.00	0.03	0.14	0.00	0.06	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.07	0.06	0.01	0.00	0.35	0.10	0.37	0.01
N3	0.00	0.00	0.05	0.09	0.00	0.06	0.00	0.19	0.00	0.00	0.00	0.00	0.21	0.00	0.00	0.04	0.46	0.17	0.16	0.12
O2	0.01	0.00	0.25	0.16	0.00	0.05	0.01	0.04	0.01	0.00	0.00	0.00	0.43	0.36	0.01	0.08	0.23	0.07	0.38	0.05
O2'	0.02	0.25	0.00	0.00	0.09	0.03	0.03	0.03	0.06	0.07	0.21	0.43	0.00	0.15	0.10	0.04	0.20	0.31	0.29	0.05
O3'	0.09	0.13	0.06	0.00	0.20	0.02	0.37	0.06	0.33	0.06	0.00	0.36	0.15	0.00	0.23	0.04	0.41	0.73	0.16	0.44
O4	0.01	0.01	0.06	0.25	0.00	0.12	0.00	0.28	0.01	0.01	0.00	0.01	0.10	0.23	0.00	0.01	0.60	0.25	0.10	0.26
O4'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.01	0.06	0.00	0.04	0.08	0.04	0.04	0.01	0.00	0.11	0.15	0.75	0.35
O5'	0.11	0.34	0.31	0.41	0.57	0.00	0.63	0.00	0.54	0.35	0.46	0.23	0.20	0.41	0.60	0.11	0.00	0.01	0.00	0.00
OP1	0.01	0.11	0.28	0.44	0.22	0.13	0.23	0.14	0.17	0.10	0.17	0.07	0.31	0.73	0.25	0.15	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.54	0.31	0.27	0.09	0.01	0.45	0.01	0.36	0.23	0.37	0.16	0.38	0.29	0.16	0.10	0.75	0.00	0.00	0.00	0.00
P	0.17	0.02	0.09	0.26	0.21	0.09	0.23	0.00	0.11	0.01	0.12	0.05	0.05	0.44	0.26	0.35	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.26	0.01	0.26	0.37	0.13	0.39	0.12	0.37	0.05	0.22	0.01	0.07	0.04	0.17	0.21	0.33	0.62	0.32	0.32	0.63	0.37	0.42
C2	0.12	0.12	0.16	0.35	0.01	0.36	0.02	0.34	0.07	0.06	0.12	0.06	0.08	0.02	0.06	0.17	0.67	0.21	0.25	0.52	0.25	0.32
C2'	0.00	0.19	0.04	0.07	0.12	0.17	0.16	0.16	0.21	0.09	0.22	0.13	0.22	0.14	0.07	0.06	0.31	0.13	0.07	0.31	0.06	0.13
C3'	0.12	0.03	0.25	0.18	0.10	0.04	0.11	0.04	0.08	0.15	0.04	0.06	0.08	0.14	0.13	0.15	0.02	0.02	0.08	0.13	0.04	0.01
C4	0.07	0.27	0.03	0.29	0.20	0.27	0.19	0.26	0.23	0.11	0.26	0.24	0.22	0.14	0.13	0.02	0.66	0.03	0.15	0.44	0.15	0.23
C4'	0.21	0.21	0.10	0.14	0.24	0.21	0.26	0.22	0.25	0.26	0.23	0.22	0.25	0.27	0.24	0.16	0.26	0.25	0.23	0.51	0.35	0.36
C5	0.01	0.23	0.09	0.33	0.14	0.32	0.13	0.31	0.17	0.03	0.22	0.20	0.16	0.07	0.06	0.06	0.66	0.13	0.22	0.54	0.26	0.34
C5'	0.20	0.44	0.01	0.01	0.41	0.08	0.48	0.12	0.53	0.38	0.51	0.37	0.56	0.46	0.33	0.00	0.00	0.20	0.20	0.46	0.42	0.36
C6	0.17	0.14	0.20	0.36	0.00	0.37	0.01	0.35	0.07	0.11	0.13	0.08	0.07	0.05	0.09	0.24	0.64	0.26	0.29	0.61	0.34	0.41
N1	0.19	0.09	0.21	0.37	0.05	0.38	0.03	0.36	0.03	0.13	0.08	0.02	0.03	0.09	0.13	0.25	0.65	0.28	0.29	0.59	0.33	0.39
N3	0.01	0.21	0.09	0.31	0.12	0.30	0.13	0.28	0.17	0.04	0.21	0.17	0.17	0.08	0.05	0.06	0.67	0.11	0.18	0.45	0.17	0.25
O2	0.15	0.05	0.18	0.35	0.04	0.37	0.02	0.35	0.03	0.10	0.06	0.00	0.03	0.06	0.09	0.18	0.67	0.24	0.26	0.51	0.25	0.31
O2'	0.00	0.39	0.01	0.12	0.24	0.23	0.32	0.20	0.42	0.18	0.46	0.26	0.47	0.28	0.14	0.14	0.42	0.13	0.06	0.31	0.02	0.10
O3'	0.37	0.36	0.49	0.44	0.47	0.26	0.54	0.28	0.52	0.54	0.44	0.37	0.55	0.57	0.47	0.30	0.25	0.24	0.38	0.20	0.42	0.34
O4	0.21	0.36	0.06	0.22	0.31	0.14	0.31	0.15	0.34	0.23	0.36	0.34	0.33	0.27	0.26	0.13	0.63	0.15	0.03	0.33	0.03	0.11
O4'	0.48	0.30	0.43	0.49	0.44	0.50	0.45	0.49	0.39	0.52	0.32	0.36	0.39	0.50	0.49	0.47	0.65	0.49	0.51	0.83	0.64	0.65
O5'	0.36	0.26	0.42	0.42	0.26	0.41	0.18	0.39	0.16	0.19	0.19	0.32	0.11	0.15	0.28	0.33	0.31	0.37	0.33	0.05	0.09	0.13
OP1	0.06	0.08	0.05	0.12	0.15	0.06	0.23	0.01	0.22	0.26	0.14	0.07	0.26	0.29	0.16	0.01	0.19	0.04	0.09	0.44	0.38	0.32
OP2	0.06	0.32	0.19	0.30	0.24	0.16	0.24	0.16	0.28	0.11	0.31	0.28	0.27	0.16	0.15	0.05	0.35	0.01	0.09	0.13	0.09	0.05
P	0.02	0.08	0.15	0.20	0.09	0.15	0.15	0.13	0.15	0.12	0.12	0.05	0.18	0.16	0.07	0.06	0.22	0.05	0.04	0.30	0.21	0.16

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.08	0.00	0.03	0.28	0.14	0.15
C2	0.02	0.00	0.04	0.02	0.00	0.11	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.09	0.13	0.07	0.19	0.05	0.08
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.03	0.02	0.03	0.02	0.03	0.00	0.04	0.03	0.03	0.02	0.01	0.00	0.05	0.01	0.06	0.41	0.23	0.25
C3'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.07	0.00	0.11	0.02	0.10	0.17	0.06	0.01	0.12	0.16	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.30	0.09	0.16
C4	0.01	0.00	0.03	0.07	0.00	0.04	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.07	0.03	0.19	0.07	0.08
C4'	0.01	0.11	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.03	0.10	0.08	0.10	0.01	0.07	0.02	0.09	0.05	0.01	0.01	0.13	0.04	0.06
C5	0.01	0.00	0.03	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.09	0.05	0.01	0.12	0.02	0.03
C5'	0.02	0.12	0.02	0.02	0.04	0.00	0.00	0.00	0.03	0.10	0.08	0.11	0.02	0.07	0.01	0.07	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02
C6	0.01	0.00	0.03	0.10	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.07	0.07	0.01	0.10	0.00	0.02
C8	0.00	0.00	0.00	0.17	0.00	0.10	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.19	0.04	0.08	0.14	0.07	0.04
N1	0.01	0.00	0.04	0.06	0.00	0.08	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.11	0.04	0.14	0.02	0.04
N3	0.02	0.00	0.03	0.01	0.00	0.10	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.11	0.12	0.07	0.23	0.08	0.10
N6	0.01	0.00	0.03	0.12	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.12	0.07	0.01	0.05	0.03	0.02
N7	0.00	0.00	0.02	0.16	0.00	0.07	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.19	0.01	0.07	0.08	0.01	0.00
N9	0.00	0.00	0.01	0.09	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.04	0.01	0.00	0.21	0.10	0.10
O2'	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.09	0.03	0.07	0.03	0.04	0.01	0.00	0.03	0.04	0.02	0.00	0.15	0.08	0.00	0.37	0.19	0.19
O3'	0.08	0.09	0.05	0.01	0.00	0.05	0.09	0.02	0.07	0.19	0.01	0.11	0.12	0.19	0.04	0.15	0.00	0.07	0.08	0.09	0.06	0.01
O4'	0.00	0.13	0.01	0.01	0.07	0.01	0.05	0.00	0.07	0.04	0.11	0.12	0.07	0.01	0.01	0.08	0.07	0.00	0.01	0.15	0.06	0.06
O5'	0.03	0.07	0.06	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.04	0.07	0.01	0.07	0.00	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00
OP1	0.28	0.19	0.41	0.30	0.19	0.13	0.12	0.02	0.10	0.14	0.14	0.23	0.05	0.08	0.21	0.37	0.09	0.15	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.14	0.05	0.23	0.09	0.07	0.04	0.02	0.02	0.00	0.07	0.02	0.08	0.03	0.01	0.10	0.19	0.06	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00
P	0.15	0.08	0.25	0.16	0.08	0.06	0.03	0.02	0.02	0.04	0.04	0.10	0.02	0.00	0.10	0.19	0.01	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00