Doublet Group distance statistics: 49170

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.002, 0.008, 0.014, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.008 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.002, 0.008, 0.015, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.008 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.002, 0.009, 0.016, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.009 std_dev=0.007
C4	A	0, 0.003, 0.012, 0.021, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.012 std_dev=0.009
C6	A	0, 0.001, 0.010, 0.020, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.010 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.003, 0.013, 0.023, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.013 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.004, 0.016, 0.027, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.016 std_dev=0.012
O2	A	0, 0.009, 0.034, 0.060, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.034 std_dev=0.025
O4	A	0, 0.010, 0.048, 0.086, 0.094 max_d=0.094 avg_d=0.048 std_dev=0.038
O4'	B	0, 0.062, 0.359, 0.657, 0.728 max_d=0.728 avg_d=0.359 std_dev=0.297
C2'	B	0, 0.090, 0.403, 0.715, 0.761 max_d=0.761 avg_d=0.403 std_dev=0.312
C3'	B	0, 0.012, 0.327, 0.641, 0.751 max_d=0.751 avg_d=0.327 std_dev=0.314
O4'	A	0, 0.128, 0.454, 0.781, 0.755 max_d=0.755 avg_d=0.454 std_dev=0.327
C2'	A	0, 0.131, 0.479, 0.828, 0.820 max_d=0.820 avg_d=0.479 std_dev=0.349
C4'	B	0, 0.180, 0.615, 1.051, 0.946 max_d=0.946 avg_d=0.615 std_dev=0.436
O5'	A	0, 0.184, 0.647, 1.111, 1.059 max_d=1.059 avg_d=0.647 std_dev=0.463
O2'	B	0, 0.215, 0.765, 1.314, 1.265 max_d=1.265 avg_d=0.765 std_dev=0.549
C4'	A	0, 0.229, 0.797, 1.365, 1.279 max_d=1.279 avg_d=0.797 std_dev=0.568
C5'	A	0, 0.220, 0.802, 1.384, 1.365 max_d=1.365 avg_d=0.802 std_dev=0.582
O3'	B	0, 0.181, 0.774, 1.367, 1.442 max_d=1.442 avg_d=0.774 std_dev=0.593
OP2	A	0, 0.270, 0.928, 1.586, 1.456 max_d=1.456 avg_d=0.928 std_dev=0.658
P	A	0, 0.271, 0.941, 1.611, 1.507 max_d=1.507 avg_d=0.941 std_dev=0.670
C3'	A	0, 0.293, 1.005, 1.717, 1.560 max_d=1.560 avg_d=1.005 std_dev=0.712
O2'	A	0, 0.304, 1.040, 1.775, 1.590 max_d=1.590 avg_d=1.040 std_dev=0.736
C1'	B	0, 0.306, 1.055, 1.804, 1.665 max_d=1.665 avg_d=1.055 std_dev=0.749
OP1	A	0, 0.331, 1.158, 1.986, 1.882 max_d=1.882 avg_d=1.158 std_dev=0.828
C5'	B	0, 0.430, 1.504, 2.578, 2.441 max_d=2.441 avg_d=1.504 std_dev=1.074
O3'	A	0, 0.530, 1.812, 3.093, 2.748 max_d=2.748 avg_d=1.812 std_dev=1.281
O5'	B	0, 0.542, 1.892, 3.241, 3.057 max_d=3.057 avg_d=1.892 std_dev=1.350
N9	B	0, 0.594, 2.028, 3.462, 3.052 max_d=3.052 avg_d=2.028 std_dev=1.434
C8	B	0, 0.761, 2.603, 4.445, 3.986 max_d=3.986 avg_d=2.603 std_dev=1.842
P	B	0, 0.878, 3.038, 5.198, 4.838 max_d=4.838 avg_d=3.038 std_dev=2.160
C4	B	0, 0.910, 3.107, 5.305, 4.678 max_d=4.678 avg_d=3.107 std_dev=2.197
OP1	B	0, 0.977, 3.378, 5.778, 5.362 max_d=5.362 avg_d=3.378 std_dev=2.401
OP2	B	0, 1.045, 3.598, 6.151, 5.657 max_d=5.657 avg_d=3.598 std_dev=2.553
N3	B	0, 1.077, 3.678, 6.279, 5.576 max_d=5.576 avg_d=3.678 std_dev=2.601
N7	B	0, 1.077, 3.679, 6.282, 5.605 max_d=5.605 avg_d=3.679 std_dev=2.602
C5	B	0, 1.141, 3.898, 6.655, 5.903 max_d=5.903 avg_d=3.898 std_dev=2.757
C2	B	0, 1.405, 4.802, 8.199, 7.327 max_d=7.327 avg_d=4.802 std_dev=3.397
C6	B	0, 1.476, 5.042, 8.608, 7.666 max_d=7.666 avg_d=5.042 std_dev=3.566
N1	B	0, 1.582, 5.407, 9.232, 8.246 max_d=8.246 avg_d=5.407 std_dev=3.825
N6	B	0, 1.747, 5.970, 10.193, 9.093 max_d=9.093 avg_d=5.970 std_dev=4.223

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.00	0.00	0.02	0.03	0.01	0.17	0.01	0.00	0.13	0.11	0.24	0.18
C2	0.02	0.00	0.09	0.14	0.01	0.02	0.02	0.04	0.02	0.01	0.00	0.01	0.13	0.10	0.02	0.04	0.08	0.14	0.27	0.20
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.04	0.01	0.06	0.11	0.07	0.02	0.07	0.16	0.00	0.01	0.05	0.00	0.25	0.19	0.33	0.27
C3'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.22	0.00	0.23	0.01	0.20	0.14	0.18	0.11	0.01	0.00	0.23	0.02	0.04	0.10	0.10	0.07
C4	0.01	0.01	0.04	0.22	0.00	0.07	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.02	0.21	0.10	0.00	0.02	0.06	0.17	0.27	0.19
C4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.07	0.00	0.10	0.00	0.10	0.04	0.03	0.05	0.20	0.01	0.07	0.00	0.01	0.05	0.02	0.00
C5	0.01	0.02	0.06	0.23	0.01	0.10	0.00	0.07	0.00	0.01	0.01	0.03	0.20	0.16	0.01	0.04	0.07	0.17	0.28	0.18
C5'	0.05	0.04	0.11	0.01	0.05	0.00	0.07	0.00	0.06	0.03	0.03	0.06	0.08	0.13	0.06	0.00	0.00	0.04	0.01	0.01
C6	0.00	0.02	0.07	0.20	0.01	0.10	0.00	0.06	0.00	0.01	0.01	0.03	0.17	0.12	0.01	0.06	0.07	0.15	0.28	0.19
N1	0.00	0.01	0.02	0.14	0.01	0.04	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.02	0.12	0.03	0.01	0.01	0.09	0.14	0.27	0.20
N3	0.02	0.00	0.07	0.18	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.18	0.06	0.01	0.03	0.06	0.15	0.27	0.20
O2	0.03	0.01	0.16	0.11	0.02	0.05	0.03	0.06	0.03	0.02	0.01	0.00	0.12	0.20	0.02	0.07	0.10	0.13	0.26	0.20
O2'	0.01	0.13	0.00	0.01	0.21	0.20	0.20	0.08	0.17	0.12	0.18	0.12	0.00	0.04	0.22	0.14	0.15	0.07	0.33	0.17
O3'	0.17	0.10	0.01	0.00	0.10	0.01	0.16	0.13	0.12	0.03	0.06	0.20	0.04	0.00	0.12	0.13	0.19	0.40	0.30	0.27
O4	0.01	0.02	0.05	0.23	0.00	0.07	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.02	0.22	0.12	0.00	0.02	0.06	0.18	0.26	0.19
O4'	0.00	0.04	0.00	0.02	0.02	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.03	0.07	0.14	0.13	0.02	0.00	0.05	0.05	0.13	0.10
O5'	0.13	0.08	0.25	0.04	0.06	0.01	0.07	0.00	0.07	0.09	0.06	0.10	0.15	0.19	0.06	0.05	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.11	0.14	0.19	0.10	0.17	0.05	0.17	0.04	0.15	0.14	0.15	0.13	0.07	0.40	0.18	0.05	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.24	0.27	0.33	0.10	0.27	0.02	0.28	0.01	0.28	0.27	0.27	0.26	0.33	0.30	0.26	0.13	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.18	0.20	0.27	0.07	0.19	0.00	0.18	0.01	0.19	0.20	0.20	0.20	0.17	0.27	0.19	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.41	1.67	0.09	0.03	1.14	0.24	1.22	0.42	1.51	0.70	1.72	1.37	1.56	0.96	0.75	0.07	0.07	0.15	0.17	0.46	0.06	0.25
C2	0.43	1.67	0.12	0.05	1.09	0.24	1.10	0.50	1.37	0.56	1.63	1.41	1.37	0.79	0.69	0.09	0.16	0.19	0.31	0.65	0.27	0.44
C2'	0.47	1.74	0.18	0.07	1.25	0.17	1.42	0.28	1.71	0.90	1.86	1.40	1.80	1.20	0.87	0.03	0.14	0.19	0.05	0.20	0.22	0.03
C3'	0.02	1.15	0.29	0.37	0.72	0.57	0.92	0.63	1.21	0.45	1.32	0.81	1.33	0.74	0.38	0.42	0.31	0.27	0.34	0.49	0.13	0.34
C4	0.42	1.26	0.17	0.13	0.84	0.23	0.76	0.55	0.95	0.35	1.16	1.14	0.89	0.49	0.54	0.11	0.25	0.20	0.41	0.73	0.43	0.55
C4'	0.13	1.15	0.16	0.23	0.76	0.42	0.89	0.52	1.14	0.47	1.26	0.88	1.23	0.71	0.45	0.25	0.20	0.12	0.26	0.43	0.12	0.29
C5	0.43	1.17	0.15	0.07	0.83	0.24	0.76	0.48	0.92	0.38	1.10	1.08	0.88	0.52	0.55	0.10	0.16	0.16	0.30	0.56	0.29	0.40
C5'	0.14	0.92	0.15	0.21	0.64	0.37	0.76	0.43	0.95	0.44	1.02	0.71	1.03	0.64	0.41	0.18	0.22	0.09	0.18	0.30	0.07	0.19
C6	0.42	1.34	0.12	0.01	0.96	0.24	0.95	0.44	1.13	0.52	1.31	1.20	1.12	0.71	0.65	0.06	0.08	0.14	0.21	0.47	0.16	0.30
N1	0.43	1.60	0.11	0.01	1.08	0.24	1.10	0.45	1.36	0.60	1.57	1.36	1.36	0.83	0.71	0.07	0.10	0.16	0.23	0.53	0.16	0.33
N3	0.42	1.51	0.15	0.10	0.98	0.23	0.94	0.54	1.18	0.45	1.43	1.31	1.15	0.64	0.62	0.10	0.22	0.20	0.39	0.74	0.39	0.54
O2	0.42	1.79	0.11	0.04	1.14	0.23	1.18	0.50	1.50	0.60	1.78	1.46	1.52	0.87	0.71	0.10	0.16	0.19	0.31	0.67	0.27	0.45
O2'	0.73	2.21	0.38	0.26	1.63	0.10	1.84	0.04	2.20	1.24	2.39	1.78	2.32	1.59	1.19	0.16	0.28	0.48	0.31	0.02	0.48	0.24
O3'	0.18	0.97	0.46	0.47	0.54	0.63	0.76	0.67	1.07	0.31	1.18	0.61	1.22	0.60	0.22	0.60	0.38	0.36	0.40	0.53	0.22	0.40
O4	0.39	1.09	0.20	0.18	0.70	0.21	0.59	0.59	0.75	0.26	0.98	1.00	0.68	0.35	0.43	0.13	0.33	0.20	0.51	0.85	0.58	0.69
O4'	0.28	1.37	0.06	0.13	0.91	0.33	0.98	0.49	1.24	0.51	1.42	1.11	1.28	0.75	0.57	0.15	0.11	0.05	0.25	0.51	0.19	0.34
O5'	0.14	0.83	0.14	0.21	0.61	0.35	0.71	0.40	0.86	0.43	0.91	0.67	0.91	0.60	0.40	0.16	0.24	0.08	0.16	0.24	0.07	0.15
OP1	0.14	0.32	0.10	0.13	0.33	0.16	0.45	0.14	0.47	0.42	0.41	0.26	0.54	0.49	0.30	0.11	0.19	0.04	0.15	0.22	0.31	0.22
OP2	0.16	0.36	0.08	0.13	0.32	0.16	0.35	0.16	0.37	0.29	0.38	0.33	0.39	0.33	0.26	0.07	0.19	0.04	0.09	0.11	0.16	0.12
P	0.16	0.50	0.09	0.14	0.41	0.21	0.47	0.23	0.53	0.35	0.55	0.42	0.57	0.43	0.31	0.05	0.19	0.02	0.08	0.07	0.14	0.08

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.19	0.00	0.08	0.15	0.09	0.10
C2	0.02	0.00	0.12	0.05	0.01	0.08	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.27	0.13	0.04	0.07	0.06	0.01
C2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.07	0.01	0.04	0.11	0.07	0.06	0.10	0.11	0.06	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.23	0.35	0.27	0.29
C3'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.10	0.01	0.18	0.02	0.17	0.24	0.11	0.03	0.21	0.25	0.13	0.02	0.01	0.01	0.05	0.10	0.12	0.03
C4	0.01	0.01	0.07	0.10	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.09	0.14	0.07	0.01	0.05	0.06	0.02
C4'	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.04	0.00	0.02	0.13	0.05	0.08	0.04	0.11	0.05	0.20	0.02	0.00	0.01	0.02	0.05	0.00
C5	0.01	0.00	0.04	0.18	0.00	0.04	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.17	0.02	0.03	0.06	0.05	0.13	0.09
C5'	0.03	0.09	0.11	0.02	0.03	0.00	0.03	0.00	0.00	0.11	0.05	0.09	0.03	0.10	0.02	0.09	0.15	0.01	0.00	0.05	0.03	0.01
C6	0.02	0.00	0.07	0.17	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.15	0.06	0.06	0.05	0.05	0.15	0.10
C8	0.00	0.01	0.06	0.24	0.00	0.13	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.23	0.13	0.07	0.11	0.06	0.09	0.10
N1	0.02	0.00	0.10	0.11	0.01	0.05	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.17	0.10	0.01	0.02	0.11	0.05
N3	0.02	0.01	0.11	0.03	0.00	0.08	0.00	0.09	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.29	0.12	0.05	0.10	0.04	0.03
N6	0.02	0.00	0.06	0.21	0.01	0.04	0.01	0.03	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.19	0.01	0.05	0.09	0.10	0.20	0.15
N7	0.01	0.01	0.03	0.25	0.00	0.11	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.24	0.12	0.04	0.13	0.11	0.16	0.15
N9	0.00	0.01	0.01	0.13	0.00	0.05	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.13	0.06	0.00	0.02	0.06	0.03	0.02
O2'	0.02	0.01	0.00	0.02	0.09	0.20	0.17	0.09	0.15	0.23	0.08	0.01	0.19	0.24	0.13	0.00	0.02	0.13	0.15	0.30	0.33	0.26
O3'	0.19	0.27	0.01	0.01	0.14	0.02	0.02	0.15	0.06	0.13	0.17	0.29	0.01	0.12	0.06	0.02	0.00	0.12	0.19	0.23	0.34	0.25
O4'	0.00	0.13	0.01	0.01	0.07	0.00	0.03	0.01	0.06	0.07	0.10	0.12	0.05	0.04	0.00	0.13	0.12	0.00	0.02	0.03	0.02	0.02
O5'	0.08	0.04	0.23	0.05	0.01	0.01	0.06	0.00	0.05	0.11	0.01	0.05	0.09	0.13	0.02	0.15	0.19	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.15	0.07	0.35	0.10	0.05	0.02	0.05	0.05	0.05	0.06	0.02	0.10	0.10	0.11	0.06	0.30	0.23	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.09	0.06	0.27	0.12	0.06	0.05	0.13	0.03	0.15	0.09	0.11	0.04	0.20	0.16	0.03	0.33	0.34	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.10	0.01	0.29	0.03	0.02	0.00	0.09	0.01	0.10	0.10	0.05	0.03	0.15	0.15	0.02	0.26	0.25	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00