Doublet Group distance statistics: 49174

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.000, 0.012, 0.023, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.012 std_dev=0.012
C5	A	0, 0.000, 0.012, 0.024, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.012 std_dev=0.012
C6	A	0, 0.000, 0.017, 0.034, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.017 std_dev=0.017
C1'	A	0, 0.000, 0.017, 0.034, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.017 std_dev=0.017
N1	A	0, 0.000, 0.018, 0.036, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.018 std_dev=0.018
C2	A	0, 0.000, 0.020, 0.039, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.020 std_dev=0.020
C4	A	0, 0.000, 0.020, 0.040, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.020 std_dev=0.020
O2	A	0, 0.000, 0.038, 0.077, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.038 std_dev=0.038
O4	A	0, 0.000, 0.039, 0.079, 0.079 max_d=0.079 avg_d=0.039 std_dev=0.039
O3'	B	0, 0.000, 0.209, 0.417, 0.417 max_d=0.417 avg_d=0.209 std_dev=0.209
P	A	0, 0.000, 0.212, 0.423, 0.423 max_d=0.423 avg_d=0.212 std_dev=0.212
O4'	B	0, 0.000, 0.217, 0.434, 0.434 max_d=0.434 avg_d=0.217 std_dev=0.217
O3'	A	0, 0.000, 0.220, 0.440, 0.440 max_d=0.440 avg_d=0.220 std_dev=0.220
OP2	A	0, 0.000, 0.234, 0.469, 0.469 max_d=0.469 avg_d=0.234 std_dev=0.234
C1'	B	0, 0.000, 0.249, 0.498, 0.498 max_d=0.498 avg_d=0.249 std_dev=0.249
C2	B	0, 0.000, 0.257, 0.514, 0.514 max_d=0.514 avg_d=0.257 std_dev=0.257
N3	B	0, 0.000, 0.261, 0.523, 0.523 max_d=0.523 avg_d=0.261 std_dev=0.261
C4'	B	0, 0.000, 0.264, 0.529, 0.529 max_d=0.529 avg_d=0.264 std_dev=0.264
N1	B	0, 0.000, 0.277, 0.555, 0.555 max_d=0.555 avg_d=0.277 std_dev=0.277
C4	B	0, 0.000, 0.278, 0.556, 0.556 max_d=0.556 avg_d=0.278 std_dev=0.278
N9	B	0, 0.000, 0.281, 0.562, 0.562 max_d=0.562 avg_d=0.281 std_dev=0.281
O5'	A	0, 0.000, 0.281, 0.562, 0.562 max_d=0.562 avg_d=0.281 std_dev=0.281
O4'	A	0, 0.000, 0.297, 0.593, 0.593 max_d=0.593 avg_d=0.297 std_dev=0.297
C3'	B	0, 0.000, 0.299, 0.597, 0.597 max_d=0.597 avg_d=0.299 std_dev=0.299
C5	B	0, 0.000, 0.322, 0.644, 0.644 max_d=0.644 avg_d=0.322 std_dev=0.322
C2'	B	0, 0.000, 0.326, 0.652, 0.652 max_d=0.652 avg_d=0.326 std_dev=0.326
C6	B	0, 0.000, 0.330, 0.660, 0.660 max_d=0.660 avg_d=0.330 std_dev=0.330
C8	B	0, 0.000, 0.337, 0.674, 0.674 max_d=0.674 avg_d=0.337 std_dev=0.337
O2'	B	0, 0.000, 0.353, 0.706, 0.706 max_d=0.706 avg_d=0.353 std_dev=0.353
C2'	A	0, 0.000, 0.363, 0.726, 0.726 max_d=0.726 avg_d=0.363 std_dev=0.363
N7	B	0, 0.000, 0.368, 0.736, 0.736 max_d=0.736 avg_d=0.368 std_dev=0.368
N6	B	0, 0.000, 0.383, 0.766, 0.766 max_d=0.766 avg_d=0.383 std_dev=0.383
C3'	A	0, 0.000, 0.389, 0.777, 0.777 max_d=0.777 avg_d=0.389 std_dev=0.389
C5'	B	0, 0.000, 0.392, 0.785, 0.785 max_d=0.785 avg_d=0.392 std_dev=0.392
OP1	A	0, 0.000, 0.412, 0.823, 0.823 max_d=0.823 avg_d=0.412 std_dev=0.412
C4'	A	0, 0.000, 0.499, 0.998, 0.998 max_d=0.998 avg_d=0.499 std_dev=0.499
O5'	B	0, 0.000, 0.520, 1.041, 1.041 max_d=1.041 avg_d=0.520 std_dev=0.520
O2'	A	0, 0.000, 0.598, 1.196, 1.196 max_d=1.196 avg_d=0.598 std_dev=0.598
P	B	0, 0.000, 0.828, 1.655, 1.655 max_d=1.655 avg_d=0.828 std_dev=0.828
C5'	A	0, 0.000, 0.849, 1.698, 1.698 max_d=1.698 avg_d=0.849 std_dev=0.849
OP2	B	0, 0.000, 0.977, 1.953, 1.953 max_d=1.953 avg_d=0.977 std_dev=0.977
OP1	B	0, 0.000, 1.054, 2.108, 2.108 max_d=2.108 avg_d=1.054 std_dev=1.054

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.07	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.17	0.15	0.05	0.08
C2	0.01	0.00	0.07	0.02	0.01	0.04	0.02	0.04	0.01	0.00	0.00	0.00	0.16	0.01	0.00	0.07	0.14	0.07	0.10	0.02
C2'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.05	0.00	0.00	0.04	0.03	0.02	0.08	0.10	0.00	0.01	0.06	0.01	0.44	0.42	0.20	0.34
C3'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.04	0.00	0.04	0.01	0.03	0.02	0.03	0.02	0.03	0.00	0.05	0.00	0.31	0.36	0.09	0.26
C4	0.01	0.01	0.05	0.04	0.00	0.03	0.00	0.15	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.02	0.00	0.01	0.12	0.02	0.13	0.02
C4'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.03	0.00	0.08	0.01	0.10	0.03	0.02	0.08	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.06	0.17	0.01
C5	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.08	0.00	0.22	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.03	0.14	0.02	0.12	0.01
C5'	0.07	0.04	0.04	0.01	0.15	0.01	0.22	0.00	0.23	0.12	0.07	0.02	0.02	0.02	0.14	0.03	0.00	0.06	0.28	0.02
C6	0.00	0.01	0.03	0.03	0.01	0.10	0.00	0.23	0.00	0.01	0.01	0.00	0.08	0.01	0.01	0.06	0.16	0.03	0.10	0.02
N1	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.03	0.01	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.00	0.01	0.00	0.16	0.08	0.08	0.04
N3	0.01	0.00	0.08	0.03	0.00	0.02	0.00	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.16	0.02	0.00	0.06	0.13	0.02	0.12	0.00
O2	0.02	0.00	0.10	0.02	0.01	0.08	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.25	0.01	0.01	0.10	0.11	0.08	0.10	0.02
O2'	0.01	0.16	0.00	0.03	0.08	0.01	0.03	0.02	0.08	0.04	0.16	0.25	0.00	0.01	0.10	0.01	0.48	0.54	0.32	0.43
O3'	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.18	0.30	0.05	0.18
O4	0.01	0.00	0.06	0.05	0.00	0.02	0.01	0.14	0.01	0.01	0.00	0.01	0.10	0.03	0.00	0.02	0.12	0.04	0.13	0.03
O4'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.03	0.06	0.00	0.06	0.10	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.01	0.20	0.08
O5'	0.17	0.14	0.44	0.31	0.12	0.00	0.14	0.00	0.16	0.16	0.13	0.11	0.48	0.18	0.12	0.04	0.00	0.01	0.03	0.01
OP1	0.15	0.07	0.42	0.36	0.02	0.06	0.02	0.06	0.03	0.08	0.02	0.08	0.54	0.30	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.05	0.10	0.20	0.09	0.13	0.17	0.12	0.28	0.10	0.08	0.12	0.10	0.32	0.05	0.13	0.20	0.03	0.01	0.00	0.01
P	0.08	0.02	0.34	0.26	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.04	0.00	0.02	0.43	0.18	0.03	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.10	0.00	0.11	0.02	0.07	0.03	0.07	0.07	0.04	0.11	0.01	0.04	0.03	0.10	0.10	0.11	0.03	0.03	0.00	0.00	0.16	0.02
C2	0.08	0.01	0.07	0.01	0.04	0.06	0.03	0.12	0.00	0.07	0.01	0.03	0.01	0.05	0.07	0.07	0.06	0.04	0.05	0.12	0.07	0.07
C2'	0.20	0.05	0.26	0.16	0.13	0.05	0.12	0.01	0.05	0.20	0.03	0.06	0.03	0.17	0.19	0.31	0.12	0.03	0.09	0.17	0.28	0.14
C3'	0.05	0.19	0.12	0.06	0.03	0.04	0.04	0.08	0.10	0.05	0.17	0.10	0.11	0.02	0.03	0.17	0.03	0.09	0.02	0.08	0.15	0.04
C4	0.02	0.09	0.01	0.06	0.05	0.10	0.06	0.17	0.09	0.02	0.10	0.07	0.10	0.04	0.02	0.00	0.07	0.08	0.12	0.22	0.05	0.17
C4'	0.14	0.31	0.09	0.11	0.22	0.18	0.22	0.22	0.26	0.15	0.29	0.26	0.26	0.18	0.17	0.07	0.13	0.23	0.20	0.13	0.08	0.16
C5	0.04	0.11	0.04	0.02	0.05	0.07	0.05	0.13	0.08	0.00	0.10	0.08	0.09	0.03	0.01	0.03	0.05	0.08	0.09	0.14	0.00	0.11
C5'	0.38	0.58	0.28	0.26	0.51	0.35	0.50	0.39	0.54	0.41	0.56	0.55	0.52	0.45	0.43	0.24	0.22	0.45	0.42	0.29	0.32	0.37
C6	0.08	0.07	0.09	0.01	0.01	0.04	0.01	0.09	0.03	0.06	0.06	0.03	0.03	0.04	0.05	0.08	0.03	0.05	0.03	0.05	0.08	0.03
N1	0.09	0.02	0.10	0.01	0.05	0.04	0.05	0.09	0.01	0.09	0.01	0.02	0.00	0.07	0.08	0.09	0.04	0.04	0.02	0.05	0.11	0.02
N3	0.05	0.05	0.03	0.05	0.01	0.09	0.02	0.16	0.05	0.02	0.06	0.02	0.06	0.01	0.02	0.02	0.07	0.07	0.09	0.20	0.01	0.14
O2	0.08	0.01	0.07	0.02	0.05	0.06	0.04	0.12	0.02	0.07	0.01	0.04	0.01	0.06	0.07	0.06	0.07	0.04	0.04	0.12	0.08	0.07
O2'	0.38	0.32	0.43	0.29	0.41	0.17	0.42	0.14	0.38	0.46	0.32	0.37	0.35	0.45	0.43	0.48	0.20	0.19	0.28	0.35	0.52	0.34
O3'	0.09	0.04	0.14	0.06	0.06	0.02	0.07	0.05	0.03	0.12	0.02	0.01	0.02	0.10	0.09	0.16	0.01	0.04	0.02	0.11	0.22	0.08
O4	0.00	0.11	0.02	0.07	0.08	0.12	0.10	0.20	0.12	0.06	0.12	0.08	0.14	0.08	0.05	0.02	0.06	0.09	0.16	0.30	0.12	0.23
O4'	0.07	0.18	0.04	0.09	0.11	0.14	0.11	0.17	0.13	0.06	0.16	0.15	0.14	0.08	0.08	0.05	0.13	0.16	0.15	0.13	0.02	0.13
O5'	0.15	0.12	0.16	0.09	0.18	0.07	0.21	0.07	0.19	0.22	0.15	0.13	0.19	0.23	0.19	0.13	0.02	0.07	0.08	0.13	0.20	0.12
OP1	0.08	0.01	0.08	0.11	0.02	0.13	0.08	0.12	0.10	0.05	0.07	0.03	0.13	0.09	0.01	0.08	0.15	0.13	0.14	0.03	0.02	0.08
OP2	0.04	0.10	0.05	0.02	0.01	0.09	0.06	0.07	0.03	0.11	0.03	0.11	0.06	0.12	0.03	0.10	0.09	0.12	0.06	0.06	0.07	0.01
P	0.01	0.02	0.02	0.03	0.04	0.07	0.09	0.06	0.08	0.11	0.04	0.03	0.11	0.13	0.05	0.02	0.09	0.08	0.07	0.01	0.05	0.02

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.06	0.00	0.03	0.03
C2	0.00	0.00	0.03	0.04	0.00	0.08	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.03	0.10	0.08	0.01	0.09	0.23	0.08
C2'	0.01	0.03	0.00	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.06	0.08	0.05	0.02	0.07	0.08	0.05	0.00	0.00	0.02	0.08	0.01	0.04	0.05
C3'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.06	0.01	0.04	0.03	0.06	0.02	0.01	0.00	0.01	0.10	0.09	0.08	0.10
C4	0.01	0.00	0.04	0.01	0.00	0.05	0.01	0.06	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.06	0.05	0.06	0.01	0.11	0.19	0.08
C4'	0.01	0.08	0.01	0.01	0.05	0.00	0.03	0.03	0.04	0.02	0.06	0.08	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.00	0.05	0.09	0.03	0.08
C5	0.00	0.00	0.07	0.03	0.01	0.03	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.11	0.02	0.04	0.05	0.20	0.26	0.14
C5'	0.04	0.09	0.01	0.01	0.06	0.03	0.04	0.00	0.05	0.00	0.07	0.09	0.03	0.00	0.04	0.01	0.03	0.01	0.01	0.06	0.03	0.06
C6	0.00	0.00	0.06	0.01	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.10	0.04	0.06	0.05	0.21	0.30	0.16
C8	0.00	0.01	0.08	0.06	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.12	0.04	0.00	0.03	0.21	0.17	0.12
N1	0.00	0.00	0.05	0.01	0.01	0.06	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.07	0.07	0.04	0.16	0.28	0.13
N3	0.01	0.00	0.02	0.04	0.00	0.08	0.00	0.09	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.11	0.09	0.01	0.05	0.18	0.04
N6	0.00	0.01	0.07	0.03	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.12	0.02	0.05	0.08	0.27	0.35	0.20
N7	0.01	0.01	0.08	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.14	0.03	0.01	0.06	0.27	0.26	0.17
N9	0.00	0.00	0.05	0.02	0.00	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.06	0.02	0.03	0.01	0.11	0.13	0.05
O2'	0.01	0.03	0.00	0.01	0.06	0.01	0.11	0.01	0.10	0.12	0.07	0.01	0.12	0.14	0.06	0.00	0.03	0.02	0.07	0.04	0.01	0.01
O3'	0.03	0.10	0.00	0.00	0.05	0.03	0.02	0.03	0.04	0.04	0.07	0.11	0.02	0.03	0.02	0.03	0.00	0.06	0.10	0.10	0.08	0.10
O4'	0.01	0.08	0.02	0.01	0.06	0.00	0.04	0.01	0.06	0.00	0.07	0.09	0.05	0.01	0.03	0.02	0.06	0.00	0.01	0.00	0.08	0.01
O5'	0.06	0.01	0.08	0.10	0.01	0.05	0.05	0.01	0.05	0.03	0.04	0.01	0.08	0.06	0.01	0.07	0.10	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.00	0.09	0.01	0.09	0.11	0.09	0.20	0.06	0.21	0.21	0.16	0.05	0.27	0.27	0.11	0.04	0.10	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00
OP2	0.03	0.23	0.04	0.08	0.19	0.03	0.26	0.03	0.30	0.17	0.28	0.18	0.35	0.26	0.13	0.01	0.08	0.08	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.03	0.08	0.05	0.10	0.08	0.08	0.14	0.06	0.16	0.12	0.13	0.04	0.20	0.17	0.05	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00