Doublet Group distance statistics: 49184

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 8, 28, 10, 7, 2, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.002, 0.011, 0.020, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.011 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.014, 0.023, 0.032, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.023 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.013, 0.022, 0.031, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.022 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.014, 0.023, 0.033, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.023 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.006, 0.017, 0.027, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.017 std_dev=0.010
C5	A	0, -0.002, 0.009, 0.020, 0.081 max_d=0.081 avg_d=0.009 std_dev=0.011
C6	A	0, 0.010, 0.022, 0.034, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.022 std_dev=0.012
O2	A	0, 0.036, 0.058, 0.080, 0.112 max_d=0.112 avg_d=0.058 std_dev=0.022
O4	A	0, 0.033, 0.085, 0.136, 0.190 max_d=0.190 avg_d=0.085 std_dev=0.052
C2'	A	0, 0.395, 0.504, 0.613, 0.801 max_d=0.801 avg_d=0.504 std_dev=0.109
O4'	A	0, 0.337, 0.452, 0.567, 0.780 max_d=0.780 avg_d=0.452 std_dev=0.115
C2'	B	0, 0.243, 0.384, 0.524, 0.923 max_d=0.923 avg_d=0.384 std_dev=0.140
O2'	B	0, 0.276, 0.418, 0.560, 0.895 max_d=0.895 avg_d=0.418 std_dev=0.142
C4'	A	0, 0.417, 0.570, 0.722, 0.983 max_d=0.983 avg_d=0.570 std_dev=0.152
C3'	A	0, 0.212, 0.385, 0.558, 1.403 max_d=1.403 avg_d=0.385 std_dev=0.173
O2'	A	0, 0.657, 0.859, 1.062, 1.555 max_d=1.555 avg_d=0.859 std_dev=0.202
O5'	A	0, 0.642, 0.887, 1.133, 2.116 max_d=2.116 avg_d=0.887 std_dev=0.246
C5'	A	0, 0.912, 1.174, 1.436, 1.888 max_d=1.888 avg_d=1.174 std_dev=0.262
C1'	B	0, 0.095, 0.359, 0.623, 2.154 max_d=2.154 avg_d=0.359 std_dev=0.264
P	A	0, 0.287, 0.569, 0.852, 1.840 max_d=1.840 avg_d=0.569 std_dev=0.283
C3'	B	0, 0.122, 0.410, 0.698, 2.159 max_d=2.159 avg_d=0.410 std_dev=0.288
OP1	A	0, 0.178, 0.475, 0.772, 1.881 max_d=1.881 avg_d=0.475 std_dev=0.297
O3'	A	0, -0.111, 0.241, 0.593, 2.830 max_d=2.830 avg_d=0.241 std_dev=0.352
N1	B	0, 0.001, 0.357, 0.714, 2.859 max_d=2.859 avg_d=0.357 std_dev=0.356
C6	B	0, -0.061, 0.356, 0.772, 3.238 max_d=3.238 avg_d=0.356 std_dev=0.417
O4'	B	0, -0.047, 0.371, 0.790, 3.388 max_d=3.388 avg_d=0.371 std_dev=0.419
C4'	B	0, -0.037, 0.394, 0.825, 3.437 max_d=3.437 avg_d=0.394 std_dev=0.431
O3'	B	0, 0.006, 0.462, 0.917, 3.487 max_d=3.487 avg_d=0.462 std_dev=0.455
C2	B	0, -0.051, 0.425, 0.901, 3.848 max_d=3.848 avg_d=0.425 std_dev=0.476
OP2	A	0, 0.250, 0.749, 1.248, 4.122 max_d=4.122 avg_d=0.749 std_dev=0.499
C5	B	0, -0.124, 0.381, 0.886, 3.875 max_d=3.875 avg_d=0.381 std_dev=0.505
O2	B	0, -0.019, 0.487, 0.993, 4.091 max_d=4.091 avg_d=0.487 std_dev=0.506
C4	B	0, -0.182, 0.418, 1.018, 4.710 max_d=4.710 avg_d=0.418 std_dev=0.600
N3	B	0, -0.155, 0.457, 1.069, 4.909 max_d=4.909 avg_d=0.457 std_dev=0.612
O5'	B	0, -0.114, 0.525, 1.165, 5.018 max_d=5.018 avg_d=0.525 std_dev=0.639
C5'	B	0, -0.207, 0.440, 1.086, 5.090 max_d=5.090 avg_d=0.440 std_dev=0.646
N4	B	0, -0.275, 0.465, 1.205, 5.748 max_d=5.748 avg_d=0.465 std_dev=0.740
P	B	0, -0.324, 0.520, 1.364, 6.553 max_d=6.553 avg_d=0.520 std_dev=0.844
OP2	B	0, -0.398, 0.554, 1.507, 7.407 max_d=7.407 avg_d=0.554 std_dev=0.952
OP1	B	0, -0.353, 0.693, 1.738, 8.236 max_d=8.236 avg_d=0.693 std_dev=1.046

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.03	0.01	0.11	0.01	0.00	0.05	0.13	0.08	0.05
C2	0.01	0.00	0.05	0.08	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.10	0.07	0.01	0.03	0.06	0.18	0.19	0.08
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.03	0.01	0.05	0.06	0.06	0.01	0.04	0.09	0.00	0.02	0.04	0.01	0.14	0.20	0.09	0.15
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.11	0.00	0.12	0.01	0.10	0.07	0.10	0.06	0.01	0.01	0.12	0.01	0.04	0.09	0.06	0.08
C4	0.01	0.01	0.03	0.11	0.00	0.06	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.14	0.05	0.00	0.02	0.10	0.23	0.30	0.14
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.06	0.00	0.07	0.01	0.07	0.03	0.03	0.04	0.09	0.02	0.06	0.00	0.01	0.07	0.08	0.03
C5	0.02	0.01	0.05	0.12	0.01	0.07	0.00	0.09	0.00	0.01	0.01	0.02	0.13	0.07	0.01	0.04	0.11	0.23	0.29	0.15
C5'	0.02	0.03	0.06	0.01	0.07	0.01	0.09	0.00	0.07	0.03	0.05	0.04	0.04	0.06	0.08	0.01	0.01	0.11	0.13	0.01
C6	0.02	0.01	0.06	0.10	0.01	0.07	0.00	0.07	0.00	0.01	0.01	0.02	0.11	0.04	0.01	0.05	0.08	0.21	0.21	0.11
N1	0.00	0.01	0.01	0.07	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.05	0.01	0.01	0.06	0.18	0.16	0.08
N3	0.01	0.00	0.04	0.10	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.12	0.06	0.01	0.03	0.08	0.21	0.25	0.12
O2	0.03	0.01	0.09	0.06	0.01	0.04	0.02	0.04	0.02	0.01	0.01	0.00	0.11	0.12	0.02	0.06	0.05	0.16	0.15	0.06
O2'	0.01	0.10	0.00	0.01	0.14	0.09	0.13	0.04	0.11	0.07	0.12	0.11	0.00	0.04	0.16	0.07	0.11	0.18	0.08	0.13
O3'	0.11	0.07	0.02	0.01	0.05	0.02	0.07	0.06	0.04	0.05	0.06	0.12	0.04	0.00	0.07	0.08	0.07	0.18	0.10	0.12
O4	0.01	0.01	0.04	0.12	0.00	0.06	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.02	0.16	0.07	0.00	0.03	0.11	0.24	0.34	0.16
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.03	0.06	0.07	0.08	0.03	0.00	0.04	0.08	0.09	0.05
O5'	0.05	0.06	0.14	0.04	0.10	0.01	0.11	0.01	0.08	0.06	0.08	0.05	0.11	0.07	0.11	0.04	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.13	0.18	0.20	0.09	0.23	0.07	0.23	0.11	0.21	0.18	0.21	0.16	0.18	0.18	0.24	0.08	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.08	0.19	0.09	0.06	0.30	0.08	0.29	0.13	0.21	0.16	0.25	0.15	0.08	0.10	0.34	0.09	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.05	0.08	0.15	0.08	0.14	0.03	0.15	0.01	0.11	0.08	0.12	0.06	0.13	0.12	0.16	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.23	0.25	0.12	0.08	0.27	0.16	0.27	0.17	0.27	0.25	0.26	0.28	0.23	0.11	0.12	0.28	0.19	0.33	0.08	0.18
C2	0.22	0.32	0.10	0.07	0.32	0.06	0.28	0.09	0.24	0.26	0.34	0.34	0.33	0.10	0.19	0.19	0.09	0.13	0.20	0.08
C2'	0.26	0.24	0.19	0.17	0.26	0.24	0.28	0.26	0.28	0.26	0.24	0.26	0.21	0.17	0.12	0.30	0.26	0.42	0.12	0.26
C3'	0.11	0.12	0.13	0.12	0.11	0.14	0.12	0.19	0.13	0.11	0.12	0.11	0.15	0.17	0.16	0.16	0.17	0.37	0.11	0.20
C4	0.24	0.37	0.11	0.12	0.36	0.12	0.29	0.18	0.26	0.30	0.39	0.37	0.40	0.11	0.25	0.17	0.12	0.11	0.25	0.14
C4'	0.14	0.10	0.11	0.10	0.13	0.19	0.18	0.26	0.19	0.14	0.10	0.14	0.11	0.15	0.15	0.24	0.25	0.46	0.17	0.29
C5	0.26	0.32	0.11	0.08	0.32	0.09	0.29	0.09	0.28	0.29	0.33	0.32	0.31	0.11	0.22	0.27	0.12	0.18	0.10	0.09
C5'	0.12	0.10	0.12	0.09	0.11	0.22	0.17	0.34	0.18	0.11	0.10	0.12	0.14	0.18	0.14	0.26	0.31	0.55	0.26	0.37
C6	0.25	0.27	0.12	0.07	0.29	0.14	0.28	0.14	0.28	0.27	0.28	0.29	0.26	0.12	0.17	0.29	0.17	0.27	0.07	0.15
N1	0.23	0.28	0.11	0.06	0.29	0.11	0.28	0.10	0.26	0.26	0.29	0.30	0.27	0.10	0.16	0.25	0.14	0.24	0.09	0.11
N3	0.22	0.36	0.11	0.10	0.35	0.11	0.28	0.17	0.24	0.28	0.39	0.38	0.39	0.11	0.23	0.15	0.12	0.11	0.28	0.15
O2	0.20	0.32	0.10	0.08	0.32	0.07	0.27	0.10	0.24	0.26	0.34	0.35	0.34	0.11	0.19	0.17	0.10	0.12	0.24	0.09
O2'	0.37	0.37	0.30	0.26	0.38	0.31	0.38	0.30	0.38	0.38	0.38	0.38	0.37	0.29	0.19	0.39	0.31	0.45	0.16	0.29
O3'	0.11	0.16	0.16	0.13	0.12	0.11	0.10	0.16	0.11	0.11	0.16	0.12	0.21	0.20	0.18	0.13	0.15	0.34	0.09	0.18
O4	0.23	0.43	0.13	0.17	0.39	0.22	0.30	0.31	0.25	0.31	0.46	0.42	0.48	0.13	0.29	0.13	0.21	0.20	0.36	0.25
O4'	0.21	0.19	0.10	0.09	0.23	0.19	0.26	0.23	0.26	0.22	0.20	0.24	0.16	0.12	0.17	0.30	0.24	0.41	0.13	0.25
O5'	0.10	0.10	0.12	0.09	0.09	0.21	0.13	0.32	0.14	0.09	0.10	0.10	0.16	0.18	0.13	0.23	0.28	0.51	0.23	0.33
OP1	0.30	0.13	0.18	0.32	0.17	0.54	0.29	0.66	0.33	0.25	0.12	0.15	0.11	0.13	0.27	0.49	0.59	0.81	0.58	0.65
OP2	0.30	0.43	0.45	0.30	0.33	0.09	0.23	0.19	0.21	0.31	0.42	0.34	0.52	0.54	0.36	0.12	0.14	0.45	0.17	0.26
P	0.08	0.16	0.16	0.06	0.11	0.22	0.07	0.35	0.09	0.08	0.17	0.12	0.24	0.22	0.10	0.21	0.30	0.56	0.29	0.37

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.06	0.07	0.04
C2	0.01	0.00	0.04	0.04	0.02	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.04	0.05	0.02	0.06	0.14	0.17	0.08
C2'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.04	0.04	0.08	0.00	0.01	0.01	0.03	0.07	0.09	0.04
C3'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.06	0.02	0.04	0.05	0.07	0.01	0.00	0.01	0.04	0.10	0.09	0.05
C4	0.02	0.02	0.03	0.04	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.04	0.04	0.03	0.09	0.22	0.28	0.12
C4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.04	0.00	0.04	0.00	0.04	0.02	0.02	0.04	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.09	0.06	0.01
C5	0.02	0.01	0.03	0.06	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.06	0.03	0.10	0.22	0.27	0.12
C5'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.06	0.00	0.07	0.00	0.06	0.03	0.05	0.07	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.12	0.10	0.01
C6	0.01	0.00	0.04	0.06	0.01	0.04	0.01	0.06	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.03	0.06	0.03	0.08	0.16	0.19	0.09
N1	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.03	0.00	0.00	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.01	0.06	0.12	0.14	0.07
N3	0.01	0.01	0.04	0.04	0.01	0.02	0.00	0.05	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.04	0.04	0.02	0.08	0.18	0.23	0.10
N4	0.03	0.03	0.04	0.05	0.01	0.04	0.01	0.07	0.02	0.03	0.02	0.00	0.03	0.05	0.06	0.04	0.10	0.25	0.32	0.14
O2	0.02	0.01	0.08	0.07	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.08	0.09	0.03	0.05	0.11	0.14	0.07
O2'	0.01	0.04	0.00	0.01	0.04	0.02	0.03	0.02	0.03	0.02	0.04	0.05	0.08	0.00	0.03	0.02	0.03	0.09	0.07	0.04
O3'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.04	0.01	0.06	0.02	0.06	0.02	0.04	0.06	0.09	0.03	0.00	0.01	0.05	0.17	0.10	0.07
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.02	0.04	0.03	0.02	0.01	0.00	0.04	0.05	0.07	0.04
O5'	0.03	0.06	0.03	0.04	0.09	0.01	0.10	0.01	0.08	0.06	0.08	0.10	0.05	0.03	0.05	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.06	0.14	0.07	0.10	0.22	0.09	0.22	0.12	0.16	0.12	0.18	0.25	0.11	0.09	0.17	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.07	0.17	0.09	0.09	0.28	0.06	0.27	0.10	0.19	0.14	0.23	0.32	0.14	0.07	0.10	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.04	0.08	0.04	0.05	0.12	0.01	0.12	0.01	0.09	0.07	0.10	0.14	0.07	0.04	0.07	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00