Doublet Group distance statistics: 49188

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 2, 1, 4, 3, 6, 3, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N1	A	0, 0.005, 0.013, 0.020, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.013 std_dev=0.007
N3	A	0, 0.004, 0.011, 0.019, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.011 std_dev=0.007
C4	A	0, 0.004, 0.012, 0.020, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.012 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.000, 0.009, 0.019, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.009 std_dev=0.009
C6	A	0, 0.003, 0.012, 0.022, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.012 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.008, 0.019, 0.031, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.019 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.003, 0.017, 0.030, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.017 std_dev=0.014
O2	A	0, 0.015, 0.044, 0.073, 0.121 max_d=0.121 avg_d=0.044 std_dev=0.029
O4	A	0, 0.009, 0.040, 0.071, 0.123 max_d=0.123 avg_d=0.040 std_dev=0.031
O4'	A	0, 0.026, 0.075, 0.124, 0.165 max_d=0.165 avg_d=0.075 std_dev=0.049
C2'	A	0, 0.042, 0.095, 0.149, 0.197 max_d=0.197 avg_d=0.095 std_dev=0.054
C4'	A	0, 0.038, 0.107, 0.177, 0.244 max_d=0.244 avg_d=0.107 std_dev=0.069
O2'	A	0, 0.099, 0.174, 0.248, 0.301 max_d=0.301 avg_d=0.174 std_dev=0.075
C3'	A	0, 0.092, 0.171, 0.250, 0.302 max_d=0.302 avg_d=0.171 std_dev=0.079
O3'	A	0, 0.174, 0.294, 0.414, 0.539 max_d=0.539 avg_d=0.294 std_dev=0.120
C5'	A	0, 0.058, 0.195, 0.332, 0.459 max_d=0.459 avg_d=0.195 std_dev=0.137
O5'	A	0, 0.107, 0.265, 0.424, 0.682 max_d=0.682 avg_d=0.265 std_dev=0.158
O2	B	0, 0.210, 0.401, 0.591, 0.732 max_d=0.732 avg_d=0.401 std_dev=0.191
O2'	B	0, 0.234, 0.433, 0.632, 0.815 max_d=0.815 avg_d=0.433 std_dev=0.199
P	A	0, 0.175, 0.375, 0.576, 0.781 max_d=0.781 avg_d=0.375 std_dev=0.200
C2	B	0, 0.227, 0.436, 0.644, 0.787 max_d=0.787 avg_d=0.436 std_dev=0.208
N3	B	0, 0.244, 0.465, 0.687, 0.834 max_d=0.834 avg_d=0.465 std_dev=0.222
C2'	B	0, 0.259, 0.482, 0.704, 0.907 max_d=0.907 avg_d=0.482 std_dev=0.223
C1'	B	0, 0.281, 0.513, 0.746, 0.959 max_d=0.959 avg_d=0.513 std_dev=0.233
N1	B	0, 0.282, 0.517, 0.753, 0.925 max_d=0.925 avg_d=0.517 std_dev=0.235
OP2	A	0, 0.237, 0.475, 0.714, 0.829 max_d=0.829 avg_d=0.475 std_dev=0.239
C4	B	0, 0.292, 0.541, 0.791, 0.942 max_d=0.942 avg_d=0.541 std_dev=0.249
OP1	A	0, 0.202, 0.463, 0.724, 0.942 max_d=0.942 avg_d=0.463 std_dev=0.261
N4	B	0, 0.310, 0.581, 0.851, 1.121 max_d=1.121 avg_d=0.581 std_dev=0.271
C3'	B	0, 0.289, 0.566, 0.843, 1.018 max_d=1.018 avg_d=0.566 std_dev=0.277
O4'	B	0, 0.307, 0.595, 0.883, 1.088 max_d=1.088 avg_d=0.595 std_dev=0.288
C5	B	0, 0.342, 0.640, 0.937, 1.091 max_d=1.091 avg_d=0.640 std_dev=0.297
C6	B	0, 0.341, 0.638, 0.936, 1.160 max_d=1.160 avg_d=0.638 std_dev=0.298
C4'	B	0, 0.349, 0.648, 0.947, 1.144 max_d=1.144 avg_d=0.648 std_dev=0.299
O3'	B	0, 0.334, 0.640, 0.946, 1.170 max_d=1.170 avg_d=0.640 std_dev=0.306
C5'	B	0, 0.427, 0.777, 1.126, 1.260 max_d=1.260 avg_d=0.777 std_dev=0.350
O5'	B	0, 0.385, 0.738, 1.090, 1.274 max_d=1.274 avg_d=0.738 std_dev=0.352
P	B	0, 0.496, 0.892, 1.288, 1.501 max_d=1.501 avg_d=0.892 std_dev=0.396
OP2	B	0, 0.535, 0.945, 1.355, 1.548 max_d=1.548 avg_d=0.945 std_dev=0.410
OP1	B	0, 0.548, 0.996, 1.443, 1.686 max_d=1.686 avg_d=0.996 std_dev=0.447

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.03	0.02	0.02	0.01	0.06	0.07	0.09	0.05
C2	0.03	0.00	0.05	0.05	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.06	0.01	0.03	0.09	0.08	0.13	0.08
C2'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.04	0.01	0.04	0.02	0.04	0.02	0.04	0.07	0.00	0.02	0.04	0.01	0.04	0.08	0.08	0.05
C3'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.06	0.01	0.06	0.03	0.06	0.04	0.06	0.07	0.02	0.01	0.07	0.01	0.05	0.09	0.07	0.06
C4	0.02	0.01	0.04	0.06	0.00	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.07	0.01	0.03	0.10	0.09	0.17	0.10
C4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.04	0.00	0.05	0.01	0.04	0.03	0.04	0.05	0.05	0.03	0.04	0.00	0.01	0.08	0.05	0.03
C5	0.02	0.01	0.04	0.06	0.01	0.05	0.00	0.07	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.07	0.01	0.04	0.11	0.09	0.17	0.10
C5'	0.01	0.05	0.02	0.03	0.07	0.01	0.07	0.00	0.06	0.04	0.06	0.05	0.05	0.05	0.07	0.01	0.01	0.08	0.05	0.02
C6	0.01	0.01	0.04	0.06	0.01	0.04	0.00	0.06	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.06	0.01	0.03	0.11	0.07	0.14	0.08
N1	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.04	0.01	0.02	0.08	0.07	0.12	0.07
N3	0.02	0.01	0.04	0.06	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.07	0.01	0.03	0.10	0.08	0.15	0.09
O2	0.04	0.01	0.07	0.07	0.02	0.05	0.02	0.05	0.02	0.02	0.01	0.00	0.08	0.08	0.02	0.04	0.09	0.09	0.13	0.08
O2'	0.03	0.05	0.00	0.02	0.04	0.05	0.04	0.05	0.03	0.03	0.05	0.08	0.00	0.05	0.04	0.05	0.04	0.07	0.08	0.05
O3'	0.02	0.06	0.02	0.01	0.07	0.03	0.07	0.05	0.06	0.04	0.07	0.08	0.05	0.00	0.09	0.02	0.09	0.14	0.08	0.08
O4	0.02	0.01	0.04	0.07	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.09	0.00	0.03	0.11	0.11	0.18	0.11
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.03	0.02	0.03	0.04	0.05	0.02	0.03	0.00	0.07	0.09	0.08	0.06
O5'	0.06	0.09	0.04	0.05	0.10	0.01	0.11	0.01	0.11	0.08	0.10	0.09	0.04	0.09	0.11	0.07	0.00	0.04	0.04	0.00
OP1	0.07	0.08	0.08	0.09	0.09	0.08	0.09	0.08	0.07	0.07	0.08	0.09	0.07	0.14	0.11	0.09	0.04	0.00	0.02	0.01
OP2	0.09	0.13	0.08	0.07	0.17	0.05	0.17	0.05	0.14	0.12	0.15	0.13	0.08	0.08	0.18	0.08	0.04	0.02	0.00	0.01
P	0.05	0.08	0.05	0.06	0.10	0.03	0.10	0.02	0.08	0.07	0.09	0.08	0.05	0.08	0.11	0.06	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.16	0.18	0.14	0.13	0.19	0.14	0.19	0.13	0.18	0.17	0.18	0.20	0.18	0.11	0.13	0.15	0.15	0.15	0.17	0.14
C2	0.16	0.19	0.13	0.13	0.21	0.13	0.21	0.15	0.20	0.19	0.20	0.22	0.20	0.10	0.12	0.15	0.19	0.18	0.20	0.18
C2'	0.15	0.17	0.14	0.14	0.19	0.13	0.20	0.13	0.19	0.17	0.19	0.21	0.18	0.12	0.15	0.15	0.15	0.17	0.17	0.14
C3'	0.15	0.14	0.16	0.17	0.16	0.16	0.18	0.16	0.18	0.16	0.15	0.17	0.15	0.15	0.19	0.15	0.17	0.20	0.18	0.15
C4	0.15	0.14	0.13	0.14	0.17	0.13	0.20	0.16	0.20	0.17	0.14	0.17	0.13	0.11	0.13	0.14	0.21	0.19	0.20	0.18
C4'	0.14	0.13	0.15	0.15	0.14	0.15	0.15	0.15	0.16	0.14	0.13	0.15	0.13	0.14	0.18	0.15	0.13	0.16	0.15	0.12
C5	0.15	0.14	0.13	0.13	0.15	0.12	0.18	0.13	0.18	0.16	0.13	0.15	0.13	0.10	0.12	0.14	0.17	0.16	0.17	0.14
C5'	0.15	0.12	0.16	0.18	0.13	0.18	0.15	0.19	0.16	0.14	0.12	0.12	0.12	0.16	0.21	0.17	0.16	0.20	0.18	0.16
C6	0.16	0.15	0.14	0.13	0.16	0.13	0.17	0.13	0.18	0.17	0.15	0.16	0.15	0.11	0.12	0.15	0.16	0.16	0.16	0.14
N1	0.16	0.17	0.13	0.13	0.18	0.13	0.19	0.13	0.19	0.17	0.17	0.19	0.18	0.11	0.12	0.15	0.17	0.16	0.17	0.15
N3	0.16	0.18	0.13	0.14	0.20	0.13	0.22	0.16	0.21	0.19	0.19	0.21	0.18	0.11	0.13	0.15	0.21	0.20	0.21	0.19
O2	0.16	0.21	0.13	0.13	0.24	0.13	0.23	0.15	0.21	0.20	0.23	0.26	0.22	0.10	0.12	0.16	0.20	0.19	0.21	0.19
O2'	0.16	0.19	0.14	0.14	0.22	0.14	0.21	0.14	0.20	0.18	0.22	0.24	0.20	0.12	0.15	0.15	0.16	0.16	0.18	0.14
O3'	0.16	0.14	0.17	0.19	0.17	0.19	0.19	0.19	0.19	0.16	0.15	0.18	0.14	0.17	0.23	0.16	0.20	0.25	0.21	0.18
O4	0.15	0.12	0.14	0.16	0.17	0.14	0.21	0.20	0.21	0.17	0.12	0.16	0.11	0.13	0.16	0.14	0.23	0.21	0.22	0.20
O4'	0.15	0.15	0.14	0.14	0.15	0.14	0.16	0.14	0.16	0.15	0.15	0.16	0.15	0.12	0.15	0.15	0.13	0.14	0.15	0.12
O5'	0.18	0.15	0.19	0.20	0.16	0.20	0.18	0.21	0.19	0.17	0.15	0.16	0.16	0.18	0.22	0.18	0.20	0.24	0.20	0.19
OP1	0.15	0.12	0.18	0.22	0.14	0.22	0.16	0.25	0.17	0.14	0.12	0.13	0.10	0.18	0.27	0.17	0.22	0.27	0.24	0.22
OP2	0.27	0.24	0.29	0.31	0.26	0.30	0.29	0.31	0.30	0.27	0.24	0.25	0.23	0.28	0.32	0.28	0.31	0.35	0.33	0.32
P	0.17	0.14	0.18	0.20	0.15	0.21	0.18	0.23	0.18	0.16	0.13	0.15	0.13	0.18	0.23	0.18	0.20	0.25	0.22	0.20

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.05	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.01	0.10	0.10	0.09	0.06
C2	0.02	0.00	0.06	0.05	0.01	0.04	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.05	0.03	0.13	0.10	0.12	0.09
C2'	0.00	0.06	0.00	0.01	0.04	0.01	0.04	0.03	0.04	0.02	0.06	0.05	0.08	0.01	0.03	0.01	0.15	0.17	0.11	0.11
C3'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.05	0.00	0.05	0.03	0.06	0.03	0.05	0.05	0.07	0.02	0.01	0.01	0.18	0.21	0.11	0.14
C4	0.02	0.01	0.04	0.05	0.00	0.08	0.01	0.20	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.05	0.03	0.18	0.13	0.15	0.14
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.08	0.00	0.09	0.01	0.08	0.05	0.06	0.08	0.03	0.04	0.03	0.01	0.01	0.08	0.15	0.02
C5	0.02	0.01	0.04	0.05	0.01	0.09	0.00	0.22	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.06	0.04	0.19	0.14	0.14	0.15
C5'	0.05	0.13	0.03	0.03	0.20	0.01	0.22	0.00	0.19	0.13	0.17	0.22	0.10	0.03	0.04	0.02	0.01	0.13	0.22	0.01
C6	0.01	0.01	0.04	0.06	0.01	0.08	0.00	0.19	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.06	0.04	0.19	0.13	0.10	0.13
N1	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.05	0.01	0.13	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.03	0.02	0.14	0.10	0.10	0.09
N3	0.02	0.01	0.06	0.05	0.00	0.06	0.01	0.17	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.06	0.03	0.15	0.11	0.14	0.12
N4	0.02	0.01	0.05	0.05	0.01	0.08	0.01	0.22	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.07	0.06	0.03	0.18	0.15	0.17	0.16
O2	0.03	0.01	0.08	0.07	0.01	0.03	0.02	0.10	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.10	0.08	0.04	0.11	0.09	0.12	0.08
O2'	0.02	0.07	0.01	0.02	0.06	0.04	0.04	0.03	0.03	0.03	0.07	0.07	0.10	0.00	0.05	0.04	0.08	0.11	0.11	0.07
O3'	0.02	0.05	0.03	0.01	0.05	0.03	0.06	0.04	0.06	0.03	0.06	0.06	0.08	0.05	0.00	0.03	0.14	0.22	0.12	0.13
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.03	0.01	0.04	0.02	0.04	0.02	0.03	0.03	0.04	0.04	0.03	0.00	0.05	0.08	0.10	0.05
O5'	0.10	0.13	0.15	0.18	0.18	0.01	0.19	0.01	0.19	0.14	0.15	0.18	0.11	0.08	0.14	0.05	0.00	0.03	0.02	0.01
OP1	0.10	0.10	0.17	0.21	0.13	0.08	0.14	0.13	0.13	0.10	0.11	0.15	0.09	0.11	0.22	0.08	0.03	0.00	0.01	0.01
OP2	0.09	0.12	0.11	0.11	0.15	0.15	0.14	0.22	0.10	0.10	0.14	0.17	0.12	0.11	0.12	0.10	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.06	0.09	0.11	0.14	0.14	0.02	0.15	0.01	0.13	0.09	0.12	0.16	0.08	0.07	0.13	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00