Doublet Group distance statistics: 49190

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 2, 1, 1, 2, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.003, 0.008, 0.013, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.008 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.002, 0.010, 0.018, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.010 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.009, 0.018, 0.028, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.018 std_dev=0.010
C6	A	0, 0.008, 0.021, 0.033, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.021 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.010, 0.023, 0.035, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.023 std_dev=0.013
C2	A	0, 0.009, 0.022, 0.035, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.022 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.011, 0.024, 0.037, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.024 std_dev=0.013
O2	A	0, 0.022, 0.051, 0.080, 0.091 max_d=0.091 avg_d=0.051 std_dev=0.029
O4	A	0, 0.020, 0.086, 0.151, 0.207 max_d=0.207 avg_d=0.086 std_dev=0.065
C3'	A	0, 0.099, 0.204, 0.309, 0.355 max_d=0.355 avg_d=0.204 std_dev=0.105
O4'	A	0, 0.184, 0.333, 0.482, 0.522 max_d=0.522 avg_d=0.333 std_dev=0.149
C2'	A	0, 0.196, 0.350, 0.504, 0.547 max_d=0.547 avg_d=0.350 std_dev=0.154
C1'	B	0, 0.219, 0.425, 0.632, 0.715 max_d=0.715 avg_d=0.425 std_dev=0.207
O2	B	0, 0.232, 0.449, 0.665, 0.837 max_d=0.837 avg_d=0.449 std_dev=0.216
C4'	A	0, 0.263, 0.481, 0.699, 0.713 max_d=0.713 avg_d=0.481 std_dev=0.218
O2'	B	0, 0.251, 0.478, 0.704, 0.777 max_d=0.777 avg_d=0.478 std_dev=0.227
C2'	B	0, 0.264, 0.503, 0.742, 0.813 max_d=0.813 avg_d=0.503 std_dev=0.239
N1	B	0, 0.295, 0.540, 0.785, 0.887 max_d=0.887 avg_d=0.540 std_dev=0.245
C2	B	0, 0.273, 0.523, 0.773, 0.950 max_d=0.950 avg_d=0.523 std_dev=0.250
O4'	B	0, 0.278, 0.531, 0.784, 0.951 max_d=0.951 avg_d=0.531 std_dev=0.253
O3'	A	0, 0.291, 0.546, 0.802, 0.749 max_d=0.749 avg_d=0.546 std_dev=0.255
O2'	A	0, 0.367, 0.657, 0.946, 1.010 max_d=1.010 avg_d=0.657 std_dev=0.289
C3'	B	0, 0.342, 0.635, 0.929, 1.085 max_d=1.085 avg_d=0.635 std_dev=0.293
N3	B	0, 0.436, 0.752, 1.068, 1.270 max_d=1.270 avg_d=0.752 std_dev=0.316
C6	B	0, 0.456, 0.782, 1.108, 1.176 max_d=1.176 avg_d=0.782 std_dev=0.326
O3'	B	0, 0.381, 0.712, 1.043, 1.251 max_d=1.251 avg_d=0.712 std_dev=0.331
C5'	A	0, 0.425, 0.765, 1.105, 1.182 max_d=1.182 avg_d=0.765 std_dev=0.340
C4'	B	0, 0.388, 0.738, 1.088, 1.267 max_d=1.267 avg_d=0.738 std_dev=0.350
C4	B	0, 0.558, 0.930, 1.303, 1.490 max_d=1.490 avg_d=0.930 std_dev=0.372
C5	B	0, 0.573, 0.953, 1.334, 1.455 max_d=1.455 avg_d=0.953 std_dev=0.380
P	A	0, 0.510, 0.890, 1.271, 1.518 max_d=1.518 avg_d=0.890 std_dev=0.381
O5'	B	0, 0.529, 0.911, 1.293, 1.486 max_d=1.486 avg_d=0.911 std_dev=0.382
OP1	A	0, 0.452, 0.848, 1.244, 1.625 max_d=1.625 avg_d=0.848 std_dev=0.396
O5'	A	0, 0.524, 0.938, 1.353, 1.470 max_d=1.470 avg_d=0.938 std_dev=0.415
N4	B	0, 0.722, 1.172, 1.623, 1.832 max_d=1.832 avg_d=1.172 std_dev=0.450
OP2	A	0, 0.704, 1.163, 1.621, 1.782 max_d=1.782 avg_d=1.163 std_dev=0.458
P	B	0, 0.659, 1.156, 1.652, 1.830 max_d=1.830 avg_d=1.156 std_dev=0.497
OP2	B	0, 0.649, 1.179, 1.708, 1.919 max_d=1.919 avg_d=1.179 std_dev=0.529
OP1	B	0, 0.742, 1.322, 1.902, 2.090 max_d=2.090 avg_d=1.322 std_dev=0.580
C5'	B	0, 0.504, 1.165, 1.825, 2.443 max_d=2.443 avg_d=1.165 std_dev=0.660

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.13	0.02	0.00	0.07	0.05	0.23	0.13
C2	0.01	0.00	0.04	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.16	0.01	0.03	0.06	0.07	0.16	0.09
C2'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.04	0.01	0.05	0.04	0.05	0.02	0.03	0.07	0.00	0.07	0.04	0.01	0.07	0.12	0.31	0.20
C3'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.00	0.03	0.02	0.03	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.03	0.01	0.04	0.06	0.27	0.13
C4	0.01	0.01	0.04	0.03	0.00	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.02	0.06	0.13	0.00	0.02	0.05	0.11	0.09	0.08
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.05	0.01	0.02	0.05	0.01	0.04	0.03	0.01	0.02	0.08	0.17	0.05
C5	0.02	0.01	0.05	0.03	0.01	0.05	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.10	0.01	0.03	0.05	0.11	0.08	0.08
C5'	0.03	0.03	0.04	0.02	0.06	0.01	0.08	0.00	0.07	0.04	0.04	0.04	0.04	0.03	0.07	0.02	0.01	0.10	0.10	0.01
C6	0.01	0.01	0.05	0.03	0.01	0.05	0.01	0.07	0.00	0.01	0.01	0.01	0.08	0.09	0.01	0.04	0.05	0.09	0.12	0.09
N1	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.12	0.01	0.01	0.06	0.07	0.16	0.10
N3	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.15	0.01	0.03	0.06	0.09	0.12	0.09
O2	0.01	0.01	0.07	0.02	0.02	0.05	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.11	0.18	0.02	0.06	0.06	0.06	0.18	0.10
O2'	0.02	0.05	0.00	0.02	0.06	0.01	0.08	0.04	0.08	0.03	0.05	0.11	0.00	0.10	0.08	0.02	0.07	0.15	0.36	0.23
O3'	0.13	0.16	0.07	0.01	0.13	0.04	0.10	0.03	0.09	0.12	0.15	0.18	0.10	0.00	0.14	0.09	0.05	0.08	0.21	0.08
O4	0.02	0.01	0.04	0.03	0.00	0.03	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.02	0.08	0.14	0.00	0.02	0.05	0.11	0.08	0.08
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.04	0.01	0.03	0.06	0.02	0.09	0.02	0.00	0.07	0.06	0.18	0.08
O5'	0.07	0.06	0.07	0.04	0.05	0.02	0.05	0.01	0.05	0.06	0.06	0.06	0.07	0.05	0.05	0.07	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.05	0.07	0.12	0.06	0.11	0.08	0.11	0.10	0.09	0.07	0.09	0.06	0.15	0.08	0.11	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.23	0.16	0.31	0.27	0.09	0.17	0.08	0.10	0.12	0.16	0.12	0.18	0.36	0.21	0.08	0.18	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.13	0.09	0.20	0.13	0.08	0.05	0.08	0.01	0.09	0.10	0.09	0.10	0.23	0.08	0.08	0.08	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.09	0.10	0.12	0.10	0.11	0.22	0.12	0.34	0.11	0.10	0.10	0.12	0.13	0.15	0.11	0.14	0.10	0.14	0.13	0.09
C2	0.11	0.13	0.18	0.14	0.11	0.15	0.11	0.18	0.11	0.12	0.11	0.11	0.16	0.21	0.15	0.11	0.06	0.11	0.16	0.06
C2'	0.12	0.10	0.14	0.17	0.09	0.28	0.10	0.43	0.10	0.11	0.09	0.10	0.13	0.16	0.20	0.18	0.19	0.21	0.19	0.16
C3'	0.08	0.09	0.09	0.12	0.11	0.30	0.12	0.50	0.10	0.08	0.09	0.12	0.11	0.11	0.15	0.16	0.16	0.19	0.14	0.14
C4	0.14	0.12	0.23	0.22	0.10	0.11	0.11	0.10	0.13	0.13	0.11	0.09	0.13	0.26	0.23	0.11	0.12	0.13	0.20	0.11
C4'	0.09	0.10	0.09	0.11	0.15	0.29	0.16	0.48	0.15	0.11	0.12	0.16	0.12	0.10	0.12	0.17	0.13	0.19	0.14	0.14
C5	0.12	0.10	0.20	0.18	0.09	0.11	0.10	0.10	0.11	0.11	0.09	0.08	0.10	0.23	0.18	0.11	0.10	0.12	0.18	0.10
C5'	0.09	0.09	0.10	0.16	0.12	0.32	0.14	0.53	0.14	0.11	0.10	0.14	0.11	0.11	0.17	0.19	0.15	0.20	0.14	0.15
C6	0.10	0.09	0.15	0.12	0.09	0.15	0.10	0.19	0.10	0.10	0.09	0.10	0.11	0.18	0.13	0.11	0.06	0.11	0.15	0.07
N1	0.10	0.11	0.15	0.11	0.10	0.17	0.10	0.23	0.10	0.10	0.10	0.10	0.13	0.18	0.12	0.12	0.06	0.12	0.14	0.06
N3	0.13	0.13	0.21	0.19	0.11	0.12	0.11	0.11	0.12	0.13	0.12	0.10	0.16	0.24	0.20	0.11	0.09	0.12	0.18	0.09
O2	0.11	0.14	0.18	0.14	0.12	0.16	0.12	0.20	0.11	0.12	0.13	0.12	0.17	0.20	0.14	0.11	0.06	0.11	0.15	0.06
O2'	0.14	0.11	0.18	0.21	0.09	0.29	0.10	0.43	0.10	0.11	0.09	0.10	0.13	0.21	0.26	0.18	0.21	0.23	0.20	0.18
O3'	0.10	0.12	0.11	0.13	0.15	0.30	0.15	0.50	0.13	0.11	0.13	0.17	0.15	0.14	0.16	0.17	0.15	0.19	0.14	0.14
O4	0.16	0.14	0.26	0.28	0.14	0.14	0.15	0.16	0.16	0.16	0.13	0.13	0.14	0.28	0.29	0.13	0.16	0.15	0.23	0.15
O4'	0.10	0.11	0.11	0.08	0.14	0.24	0.16	0.36	0.14	0.12	0.12	0.16	0.13	0.13	0.08	0.15	0.10	0.16	0.13	0.11
O5'	0.13	0.16	0.12	0.17	0.16	0.32	0.15	0.50	0.15	0.15	0.17	0.17	0.17	0.11	0.17	0.20	0.19	0.18	0.19	0.15
OP1	0.10	0.10	0.16	0.25	0.10	0.34	0.11	0.64	0.11	0.10	0.10	0.10	0.11	0.17	0.30	0.14	0.22	0.16	0.12	0.09
OP2	0.08	0.09	0.10	0.15	0.08	0.30	0.08	0.59	0.08	0.08	0.09	0.08	0.12	0.12	0.19	0.12	0.19	0.10	0.11	0.03
P	0.08	0.09	0.11	0.17	0.08	0.31	0.08	0.56	0.08	0.08	0.09	0.08	0.11	0.12	0.20	0.13	0.17	0.12	0.12	0.05

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.01	0.00	0.02	0.02	0.03	0.02	0.03	0.01	0.14	0.14	0.12	0.08
C2	0.02	0.00	0.10	0.05	0.01	0.05	0.01	0.22	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.05	0.03	0.21	0.14	0.11	0.12
C2'	0.00	0.10	0.00	0.01	0.08	0.03	0.05	0.07	0.04	0.05	0.10	0.08	0.13	0.00	0.05	0.01	0.28	0.28	0.06	0.20
C3'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.06	0.01	0.08	0.03	0.09	0.03	0.06	0.06	0.09	0.03	0.01	0.02	0.37	0.36	0.07	0.29
C4	0.01	0.01	0.08	0.06	0.00	0.12	0.00	0.36	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.09	0.06	0.02	0.25	0.15	0.15	0.15
C4'	0.01	0.05	0.03	0.01	0.12	0.00	0.14	0.01	0.13	0.06	0.08	0.13	0.03	0.13	0.03	0.01	0.02	0.07	0.27	0.02
C5	0.01	0.01	0.05	0.08	0.00	0.14	0.00	0.39	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.05	0.09	0.05	0.26	0.16	0.15	0.15
C5'	0.08	0.22	0.07	0.03	0.36	0.01	0.39	0.00	0.33	0.22	0.29	0.39	0.14	0.08	0.06	0.02	0.01	0.15	0.43	0.01
C6	0.01	0.01	0.04	0.09	0.01	0.13	0.00	0.33	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.10	0.06	0.24	0.14	0.12	0.13
N1	0.00	0.01	0.05	0.03	0.01	0.06	0.00	0.22	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.04	0.01	0.21	0.14	0.11	0.11
N3	0.02	0.01	0.10	0.06	0.01	0.08	0.01	0.29	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.13	0.06	0.02	0.23	0.14	0.13	0.13
N4	0.02	0.01	0.08	0.06	0.00	0.13	0.01	0.39	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.10	0.07	0.02	0.26	0.16	0.17	0.16
O2	0.03	0.01	0.13	0.09	0.01	0.03	0.02	0.14	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.17	0.09	0.06	0.19	0.15	0.10	0.11
O2'	0.02	0.12	0.00	0.03	0.09	0.13	0.05	0.08	0.03	0.05	0.13	0.10	0.17	0.00	0.07	0.06	0.23	0.29	0.07	0.19
O3'	0.03	0.05	0.05	0.01	0.06	0.03	0.09	0.06	0.10	0.04	0.06	0.07	0.09	0.07	0.00	0.02	0.32	0.39	0.08	0.29
O4'	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.01	0.05	0.02	0.06	0.01	0.02	0.02	0.06	0.06	0.02	0.00	0.04	0.06	0.22	0.05
O5'	0.14	0.21	0.28	0.37	0.25	0.02	0.26	0.01	0.24	0.21	0.23	0.26	0.19	0.23	0.32	0.04	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.14	0.14	0.28	0.36	0.15	0.07	0.16	0.15	0.14	0.14	0.14	0.16	0.15	0.29	0.39	0.06	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.12	0.11	0.06	0.07	0.15	0.27	0.15	0.43	0.12	0.11	0.13	0.17	0.10	0.07	0.08	0.22	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.08	0.12	0.20	0.29	0.15	0.02	0.15	0.01	0.13	0.11	0.13	0.16	0.11	0.19	0.29	0.05	0.00	0.00	0.01	0.00