Doublet Group distance statistics: 49192

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.003, 0.009, 0.014, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.009 std_dev=0.006
C4	A	0, 0.007, 0.018, 0.030, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.018 std_dev=0.012
C6	A	0, 0.004, 0.017, 0.029, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.017 std_dev=0.013
N1	A	0, 0.006, 0.020, 0.035, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.020 std_dev=0.015
N3	A	0, 0.004, 0.019, 0.034, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.019 std_dev=0.015
C2	A	0, 0.000, 0.017, 0.033, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.017 std_dev=0.017
C1'	A	0, 0.008, 0.026, 0.045, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.026 std_dev=0.018
O4	A	0, 0.007, 0.033, 0.059, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.033 std_dev=0.026
O2	A	0, 0.007, 0.042, 0.077, 0.107 max_d=0.107 avg_d=0.042 std_dev=0.035
O4'	A	0, 0.024, 0.104, 0.184, 0.223 max_d=0.223 avg_d=0.104 std_dev=0.080
C2'	A	0, 0.041, 0.145, 0.249, 0.272 max_d=0.272 avg_d=0.145 std_dev=0.104
C3'	A	0, 0.039, 0.174, 0.309, 0.368 max_d=0.368 avg_d=0.174 std_dev=0.135
O2'	A	0, 0.028, 0.217, 0.405, 0.489 max_d=0.489 avg_d=0.217 std_dev=0.188
C4'	A	0, 0.035, 0.246, 0.457, 0.534 max_d=0.534 avg_d=0.246 std_dev=0.211
O3'	A	0, 0.058, 0.283, 0.508, 0.607 max_d=0.607 avg_d=0.283 std_dev=0.225
OP2	A	0, 0.184, 0.534, 0.883, 0.898 max_d=0.898 avg_d=0.534 std_dev=0.349
O2'	B	0, 0.235, 0.623, 1.010, 0.951 max_d=0.951 avg_d=0.623 std_dev=0.388
P	A	0, 0.203, 0.602, 1.001, 0.959 max_d=0.959 avg_d=0.602 std_dev=0.399
O3'	B	0, 0.208, 0.616, 1.025, 0.972 max_d=0.972 avg_d=0.616 std_dev=0.409
C1'	B	0, 0.219, 0.638, 1.056, 0.974 max_d=0.974 avg_d=0.638 std_dev=0.418
C5'	A	0, 0.107, 0.534, 0.961, 1.076 max_d=1.076 avg_d=0.534 std_dev=0.427
C6	B	0, 0.226, 0.664, 1.101, 1.056 max_d=1.056 avg_d=0.664 std_dev=0.437
C3'	B	0, 0.222, 0.663, 1.105, 1.068 max_d=1.068 avg_d=0.663 std_dev=0.441
C2'	B	0, 0.237, 0.681, 1.125, 1.074 max_d=1.074 avg_d=0.681 std_dev=0.444
O4'	B	0, 0.227, 0.688, 1.150, 1.081 max_d=1.081 avg_d=0.688 std_dev=0.462
N1	B	0, 0.239, 0.707, 1.175, 1.105 max_d=1.105 avg_d=0.707 std_dev=0.468
C5	B	0, 0.243, 0.715, 1.187, 1.158 max_d=1.158 avg_d=0.715 std_dev=0.472
C4'	B	0, 0.230, 0.711, 1.191, 1.152 max_d=1.152 avg_d=0.711 std_dev=0.481
OP1	A	0, 0.212, 0.724, 1.236, 1.291 max_d=1.291 avg_d=0.724 std_dev=0.512
C4	B	0, 0.272, 0.800, 1.329, 1.291 max_d=1.291 avg_d=0.800 std_dev=0.529
C2	B	0, 0.266, 0.798, 1.329, 1.262 max_d=1.262 avg_d=0.798 std_dev=0.532
O5'	A	0, 0.259, 0.805, 1.350, 1.284 max_d=1.284 avg_d=0.805 std_dev=0.546
N4	B	0, 0.287, 0.836, 1.384, 1.349 max_d=1.349 avg_d=0.836 std_dev=0.548
O2	B	0, 0.271, 0.821, 1.370, 1.292 max_d=1.292 avg_d=0.821 std_dev=0.549
N3	B	0, 0.282, 0.839, 1.396, 1.336 max_d=1.336 avg_d=0.839 std_dev=0.557
C5'	B	0, 0.278, 0.855, 1.432, 1.386 max_d=1.386 avg_d=0.855 std_dev=0.577
O5'	B	0, 0.286, 0.865, 1.444, 1.342 max_d=1.342 avg_d=0.865 std_dev=0.579
P	B	0, 0.317, 0.961, 1.606, 1.492 max_d=1.492 avg_d=0.961 std_dev=0.644
OP2	B	0, 0.332, 0.981, 1.631, 1.500 max_d=1.500 avg_d=0.981 std_dev=0.650
OP1	B	0, 0.345, 1.059, 1.774, 1.695 max_d=1.695 avg_d=1.059 std_dev=0.715

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.05	0.02	0.01	0.03	0.05	0.01	0.03	0.02	0.00	0.27	0.28	0.23	0.17
C2	0.03	0.00	0.09	0.05	0.00	0.02	0.00	0.12	0.01	0.01	0.00	0.01	0.12	0.07	0.01	0.03	0.40	0.35	0.25	0.26
C2'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.06	0.01	0.04	0.01	0.05	0.02	0.09	0.14	0.00	0.03	0.06	0.01	0.19	0.23	0.19	0.13
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.03	0.01	0.09	0.01	0.10	0.03	0.03	0.11	0.01	0.00	0.04	0.01	0.19	0.21	0.17	0.10
C4	0.02	0.00	0.06	0.03	0.00	0.09	0.01	0.26	0.02	0.01	0.00	0.01	0.07	0.02	0.01	0.04	0.45	0.42	0.21	0.31
C4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.09	0.00	0.14	0.01	0.13	0.04	0.03	0.08	0.03	0.01	0.10	0.00	0.01	0.16	0.18	0.01
C5	0.02	0.00	0.04	0.09	0.01	0.14	0.00	0.31	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.09	0.02	0.05	0.43	0.42	0.20	0.30
C5'	0.05	0.12	0.01	0.01	0.26	0.01	0.31	0.00	0.27	0.15	0.18	0.06	0.04	0.06	0.29	0.01	0.00	0.21	0.21	0.01
C6	0.02	0.01	0.05	0.10	0.02	0.13	0.01	0.27	0.00	0.00	0.02	0.02	0.04	0.10	0.03	0.04	0.40	0.39	0.19	0.26
N1	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.04	0.01	0.15	0.00	0.00	0.01	0.02	0.04	0.03	0.01	0.02	0.38	0.35	0.22	0.24
N3	0.03	0.00	0.09	0.03	0.00	0.03	0.00	0.18	0.02	0.01	0.00	0.01	0.12	0.05	0.02	0.03	0.44	0.39	0.23	0.29
O2	0.05	0.01	0.14	0.11	0.01	0.08	0.01	0.06	0.02	0.02	0.01	0.00	0.18	0.14	0.02	0.04	0.38	0.34	0.28	0.26
O2'	0.01	0.12	0.00	0.01	0.07	0.03	0.04	0.04	0.04	0.04	0.12	0.18	0.00	0.05	0.08	0.04	0.07	0.17	0.15	0.04
O3'	0.03	0.07	0.03	0.00	0.02	0.01	0.09	0.06	0.10	0.03	0.05	0.14	0.05	0.00	0.02	0.03	0.22	0.18	0.10	0.10
O4	0.02	0.01	0.06	0.04	0.01	0.10	0.02	0.29	0.03	0.01	0.02	0.02	0.08	0.02	0.00	0.05	0.45	0.43	0.21	0.33
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.04	0.00	0.05	0.01	0.04	0.02	0.03	0.04	0.04	0.03	0.05	0.00	0.27	0.26	0.27	0.18
O5'	0.27	0.40	0.19	0.19	0.45	0.01	0.43	0.00	0.40	0.38	0.44	0.38	0.07	0.22	0.45	0.27	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.28	0.35	0.23	0.21	0.42	0.16	0.42	0.21	0.39	0.35	0.39	0.34	0.17	0.18	0.43	0.26	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.23	0.25	0.19	0.17	0.21	0.18	0.20	0.21	0.19	0.22	0.23	0.28	0.15	0.10	0.21	0.27	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.17	0.26	0.13	0.10	0.31	0.01	0.30	0.01	0.26	0.24	0.29	0.26	0.04	0.10	0.33	0.18	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.19	0.18	0.17	0.16	0.21	0.21	0.21	0.22	0.19	0.19	0.20	0.23	0.15	0.17	0.11	0.23	0.24	0.21	0.26	0.23
C2	0.11	0.12	0.09	0.05	0.17	0.07	0.17	0.08	0.14	0.13	0.15	0.20	0.08	0.13	0.06	0.11	0.15	0.13	0.20	0.17
C2'	0.14	0.11	0.14	0.14	0.13	0.17	0.13	0.17	0.11	0.12	0.12	0.14	0.08	0.17	0.12	0.17	0.18	0.14	0.20	0.17
C3'	0.20	0.17	0.21	0.20	0.18	0.20	0.19	0.19	0.18	0.18	0.17	0.19	0.14	0.23	0.18	0.22	0.19	0.10	0.21	0.16
C4	0.13	0.12	0.12	0.11	0.20	0.09	0.21	0.06	0.17	0.15	0.15	0.23	0.10	0.17	0.17	0.06	0.10	0.07	0.19	0.13
C4'	0.35	0.31	0.34	0.34	0.32	0.36	0.32	0.35	0.31	0.33	0.32	0.32	0.28	0.32	0.31	0.37	0.33	0.22	0.33	0.29
C5	0.17	0.18	0.13	0.10	0.26	0.05	0.27	0.02	0.25	0.21	0.22	0.28	0.12	0.18	0.16	0.11	0.13	0.07	0.20	0.13
C5'	0.53	0.50	0.50	0.48	0.51	0.53	0.50	0.47	0.50	0.52	0.50	0.51	0.46	0.46	0.46	0.55	0.44	0.24	0.43	0.37
C6	0.20	0.20	0.15	0.10	0.26	0.11	0.27	0.12	0.25	0.22	0.23	0.27	0.15	0.18	0.09	0.20	0.19	0.14	0.23	0.18
N1	0.16	0.17	0.13	0.10	0.22	0.13	0.22	0.14	0.19	0.18	0.19	0.23	0.12	0.15	0.06	0.18	0.19	0.16	0.23	0.19
N3	0.10	0.10	0.09	0.06	0.16	0.03	0.17	0.02	0.13	0.12	0.13	0.19	0.08	0.15	0.12	0.05	0.11	0.09	0.19	0.14
O2	0.10	0.10	0.08	0.05	0.15	0.08	0.14	0.10	0.12	0.11	0.13	0.18	0.07	0.12	0.04	0.11	0.16	0.15	0.21	0.17
O2'	0.17	0.13	0.19	0.20	0.13	0.23	0.13	0.24	0.12	0.14	0.14	0.15	0.12	0.21	0.18	0.21	0.23	0.20	0.25	0.22
O3'	0.17	0.13	0.20	0.21	0.12	0.20	0.12	0.21	0.12	0.14	0.12	0.12	0.12	0.24	0.21	0.19	0.18	0.08	0.19	0.15
O4	0.18	0.14	0.17	0.18	0.18	0.17	0.19	0.15	0.16	0.16	0.14	0.21	0.15	0.21	0.22	0.15	0.13	0.12	0.21	0.16
O4'	0.23	0.23	0.22	0.22	0.25	0.27	0.24	0.27	0.23	0.23	0.24	0.26	0.20	0.18	0.15	0.29	0.28	0.23	0.29	0.26
O5'	0.15	0.19	0.04	0.08	0.21	0.19	0.20	0.19	0.20	0.18	0.20	0.21	0.20	0.08	0.03	0.23	0.18	0.24	0.17	0.21
OP1	0.06	0.07	0.06	0.03	0.06	0.15	0.06	0.13	0.06	0.06	0.06	0.06	0.09	0.13	0.00	0.13	0.14	0.25	0.10	0.18
OP2	0.04	0.08	0.10	0.09	0.04	0.10	0.01	0.12	0.03	0.04	0.07	0.04	0.12	0.17	0.03	0.08	0.17	0.27	0.14	0.20
P	0.07	0.09	0.02	0.01	0.08	0.11	0.08	0.08	0.08	0.08	0.08	0.08	0.11	0.09	0.00	0.12	0.11	0.20	0.07	0.14

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.02	0.02	0.04	0.04	0.07	0.01	0.07	0.01	0.04	0.04	0.10	0.06
C2	0.04	0.00	0.05	0.05	0.01	0.05	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.05	0.10	0.05	0.07	0.10	0.19	0.13
C2'	0.01	0.05	0.00	0.01	0.04	0.01	0.03	0.03	0.01	0.02	0.05	0.05	0.09	0.01	0.03	0.02	0.06	0.09	0.06	0.06
C3'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.05	0.01	0.03	0.02	0.02	0.02	0.06	0.06	0.09	0.01	0.01	0.01	0.07	0.13	0.05	0.09
C4	0.03	0.01	0.04	0.05	0.00	0.05	0.01	0.08	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.04	0.09	0.05	0.06	0.10	0.18	0.13
C4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.05	0.00	0.04	0.01	0.04	0.02	0.06	0.06	0.09	0.01	0.03	0.00	0.01	0.04	0.03	0.02
C5	0.03	0.01	0.03	0.03	0.01	0.04	0.00	0.07	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.05	0.08	0.05	0.07	0.09	0.18	0.12
C5'	0.02	0.07	0.03	0.02	0.08	0.01	0.07	0.00	0.06	0.05	0.08	0.09	0.09	0.03	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02
C6	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.04	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.05	0.08	0.05	0.08	0.09	0.17	0.12
N1	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.05	0.00	0.00	0.01	0.02	0.03	0.02	0.08	0.02	0.08	0.09	0.17	0.12
N3	0.04	0.00	0.05	0.06	0.01	0.06	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.05	0.10	0.05	0.05	0.11	0.19	0.13
N4	0.04	0.02	0.05	0.06	0.01	0.06	0.02	0.09	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.05	0.09	0.06	0.04	0.10	0.17	0.12
O2	0.07	0.01	0.09	0.09	0.01	0.09	0.02	0.09	0.02	0.03	0.01	0.01	0.00	0.09	0.13	0.09	0.05	0.10	0.19	0.12
O2'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.04	0.01	0.05	0.03	0.05	0.02	0.05	0.05	0.09	0.00	0.04	0.02	0.08	0.13	0.10	0.10
O3'	0.07	0.10	0.03	0.01	0.09	0.03	0.08	0.02	0.08	0.08	0.10	0.09	0.13	0.04	0.00	0.05	0.07	0.14	0.05	0.09
O4'	0.01	0.05	0.02	0.01	0.05	0.00	0.05	0.01	0.05	0.02	0.05	0.06	0.09	0.02	0.05	0.00	0.07	0.06	0.11	0.08
O5'	0.04	0.07	0.06	0.07	0.06	0.01	0.07	0.01	0.08	0.08	0.05	0.04	0.05	0.08	0.07	0.07	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.04	0.10	0.09	0.13	0.10	0.04	0.09	0.03	0.09	0.09	0.11	0.10	0.10	0.13	0.14	0.06	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.10	0.19	0.06	0.05	0.18	0.03	0.18	0.01	0.17	0.17	0.19	0.17	0.19	0.10	0.05	0.11	0.02	0.00	0.00	0.01
P	0.06	0.13	0.06	0.09	0.13	0.02	0.12	0.02	0.12	0.12	0.13	0.12	0.12	0.10	0.09	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00