Doublet Group distance statistics: 49194

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.008, 0.017, 0.026, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.017 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.010, 0.023, 0.035, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.023 std_dev=0.013
C6	A	0, 0.009, 0.022, 0.036, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.022 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.014, 0.029, 0.044, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.029 std_dev=0.015
C2	A	0, 0.016, 0.036, 0.056, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.036 std_dev=0.020
C1'	A	0, 0.015, 0.036, 0.058, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.036 std_dev=0.021
N1	A	0, 0.018, 0.040, 0.062, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.040 std_dev=0.022
O4	A	0, 0.020, 0.049, 0.079, 0.081 max_d=0.081 avg_d=0.049 std_dev=0.030
O2	A	0, 0.040, 0.088, 0.135, 0.136 max_d=0.136 avg_d=0.088 std_dev=0.047
O2'	B	0, 0.286, 0.590, 0.895, 0.854 max_d=0.854 avg_d=0.590 std_dev=0.304
O4'	A	0, 0.484, 0.978, 1.472, 1.308 max_d=1.308 avg_d=0.978 std_dev=0.494
C2'	A	0, 0.511, 1.024, 1.537, 1.322 max_d=1.322 avg_d=1.024 std_dev=0.513
C2'	B	0, 0.473, 1.003, 1.533, 1.494 max_d=1.494 avg_d=1.003 std_dev=0.530
O2'	A	0, 0.639, 1.279, 1.919, 1.618 max_d=1.618 avg_d=1.279 std_dev=0.640
C4'	A	0, 0.662, 1.333, 2.005, 1.755 max_d=1.755 avg_d=1.333 std_dev=0.671
C3'	A	0, 0.760, 1.530, 2.300, 2.014 max_d=2.014 avg_d=1.530 std_dev=0.770
O3'	B	0, 0.811, 1.638, 2.465, 2.207 max_d=2.207 avg_d=1.638 std_dev=0.827
C3'	B	0, 0.791, 1.660, 2.529, 2.414 max_d=2.414 avg_d=1.660 std_dev=0.869
C1'	B	0, 0.881, 1.785, 2.690, 2.422 max_d=2.422 avg_d=1.785 std_dev=0.904
O5'	A	0, 0.891, 1.852, 2.814, 2.614 max_d=2.614 avg_d=1.852 std_dev=0.962
C4'	B	0, 0.856, 1.823, 2.790, 2.692 max_d=2.692 avg_d=1.823 std_dev=0.967
O3'	A	0, 1.038, 2.095, 3.153, 2.781 max_d=2.781 avg_d=2.095 std_dev=1.057
O2	B	0, 1.132, 2.266, 3.399, 2.877 max_d=2.877 avg_d=2.266 std_dev=1.133
O4'	B	0, 1.163, 2.381, 3.598, 3.301 max_d=3.301 avg_d=2.381 std_dev=1.217
C5'	A	0, 1.222, 2.464, 3.706, 3.269 max_d=3.269 avg_d=2.464 std_dev=1.242
O5'	B	0, 1.191, 2.520, 3.849, 3.685 max_d=3.685 avg_d=2.520 std_dev=1.329
OP2	A	0, 1.230, 2.578, 3.925, 3.677 max_d=3.677 avg_d=2.578 std_dev=1.347
N1	B	0, 1.424, 2.864, 4.303, 3.790 max_d=3.790 avg_d=2.864 std_dev=1.440
C2	B	0, 1.531, 3.067, 4.603, 3.954 max_d=3.954 avg_d=3.067 std_dev=1.536
C5'	B	0, 1.415, 2.967, 4.519, 4.280 max_d=4.280 avg_d=2.967 std_dev=1.552
P	A	0, 1.761, 3.582, 5.403, 4.845 max_d=4.845 avg_d=3.582 std_dev=1.821
C6	B	0, 1.853, 3.733, 5.612, 5.000 max_d=5.000 avg_d=3.733 std_dev=1.879
OP1	B	0, 1.765, 3.707, 5.649, 5.331 max_d=5.331 avg_d=3.707 std_dev=1.942
P	B	0, 1.848, 3.826, 5.805, 5.403 max_d=5.403 avg_d=3.826 std_dev=1.978
N3	B	0, 2.071, 4.146, 6.221, 5.322 max_d=5.322 avg_d=4.146 std_dev=2.075
OP2	B	0, 2.292, 4.687, 7.082, 6.469 max_d=6.469 avg_d=4.687 std_dev=2.395
C5	B	0, 2.380, 4.781, 7.182, 6.330 max_d=6.330 avg_d=4.781 std_dev=2.401
C4	B	0, 2.484, 4.979, 7.473, 6.480 max_d=6.480 avg_d=4.979 std_dev=2.494
OP1	A	0, 2.590, 5.208, 7.827, 6.825 max_d=6.825 avg_d=5.208 std_dev=2.618
N4	B	0, 3.015, 6.039, 9.063, 7.844 max_d=7.844 avg_d=6.039 std_dev=3.024

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.44	0.14	0.17
C2	0.02	0.00	0.07	0.07	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.08	0.01	0.05	0.05	0.65	0.19	0.25
C2'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.04	0.01	0.08	0.01	0.09	0.01	0.05	0.13	0.00	0.01	0.04	0.01	0.06	0.40	0.07	0.12
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.01	0.00	0.07	0.01	0.09	0.02	0.06	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.29	0.06	0.07
C4	0.01	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.02	0.00	0.01	0.07	0.69	0.25	0.29
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.02	0.00	0.02	0.04	0.05	0.01	0.02	0.01	0.00	0.18	0.04	0.06
C5	0.01	0.01	0.08	0.07	0.01	0.03	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.10	0.01	0.04	0.08	0.63	0.25	0.28
C5'	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.00	0.07	0.00	0.06	0.01	0.02	0.04	0.05	0.01	0.06	0.01	0.00	0.04	0.00	0.01
C6	0.01	0.01	0.09	0.09	0.01	0.02	0.01	0.06	0.00	0.01	0.02	0.01	0.06	0.11	0.02	0.06	0.06	0.57	0.21	0.24
N1	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.05	0.57	0.18	0.22
N3	0.02	0.00	0.05	0.06	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.06	0.07	0.01	0.03	0.06	0.70	0.22	0.28
O2	0.04	0.00	0.13	0.12	0.01	0.04	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.11	0.15	0.01	0.09	0.05	0.62	0.17	0.23
O2'	0.01	0.06	0.00	0.01	0.05	0.05	0.06	0.05	0.06	0.02	0.06	0.11	0.00	0.03	0.06	0.03	0.04	0.32	0.05	0.09
O3'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.02	0.01	0.10	0.01	0.11	0.02	0.07	0.15	0.03	0.00	0.02	0.02	0.15	0.15	0.12	0.02
O4	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.02	0.01	0.06	0.02	0.01	0.01	0.01	0.06	0.02	0.00	0.01	0.07	0.70	0.26	0.30
O4'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.06	0.00	0.03	0.09	0.03	0.02	0.01	0.00	0.09	0.32	0.15	0.14
O5'	0.04	0.05	0.06	0.11	0.07	0.00	0.08	0.00	0.06	0.05	0.06	0.05	0.04	0.15	0.07	0.09	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.44	0.65	0.40	0.29	0.69	0.18	0.63	0.04	0.57	0.57	0.70	0.62	0.32	0.15	0.70	0.32	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.14	0.19	0.07	0.06	0.25	0.04	0.25	0.00	0.21	0.18	0.22	0.17	0.05	0.12	0.26	0.15	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.17	0.25	0.12	0.07	0.29	0.06	0.28	0.01	0.24	0.22	0.28	0.23	0.09	0.02	0.30	0.14	0.00	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.20	0.14	0.07	0.08	0.16	0.19	0.20	0.23	0.21	0.18	0.13	0.15	0.12	0.09	0.25	0.33	0.19	0.23	0.13	0.24
C2	0.25	0.26	0.04	0.01	0.31	0.23	0.33	0.30	0.31	0.28	0.28	0.32	0.22	0.11	0.17	0.37	0.25	0.29	0.22	0.31
C2'	0.24	0.15	0.08	0.05	0.14	0.26	0.19	0.29	0.21	0.20	0.13	0.12	0.14	0.13	0.13	0.35	0.25	0.30	0.15	0.29
C3'	0.17	0.03	0.06	0.04	0.05	0.24	0.06	0.27	0.11	0.08	0.08	0.09	0.06	0.09	0.14	0.32	0.24	0.29	0.10	0.27
C4	0.27	0.30	0.02	0.04	0.35	0.22	0.36	0.28	0.34	0.31	0.32	0.36	0.26	0.12	0.12	0.36	0.24	0.27	0.21	0.29
C4'	0.11	0.07	0.16	0.16	0.08	0.15	0.05	0.19	0.07	0.03	0.11	0.12	0.09	0.10	0.31	0.26	0.16	0.22	0.04	0.20
C5	0.23	0.19	0.04	0.03	0.22	0.20	0.24	0.23	0.24	0.22	0.19	0.21	0.16	0.09	0.18	0.32	0.19	0.22	0.13	0.23
C5'	0.02	0.21	0.25	0.24	0.24	0.09	0.15	0.14	0.08	0.10	0.28	0.30	0.24	0.16	0.38	0.19	0.11	0.20	0.04	0.16
C6	0.20	0.14	0.06	0.06	0.16	0.19	0.20	0.22	0.21	0.18	0.13	0.15	0.12	0.08	0.23	0.31	0.18	0.21	0.11	0.22
N1	0.22	0.18	0.05	0.05	0.21	0.21	0.24	0.26	0.25	0.22	0.18	0.21	0.15	0.09	0.22	0.34	0.21	0.25	0.16	0.27
N3	0.27	0.32	0.04	0.03	0.38	0.23	0.39	0.30	0.36	0.32	0.35	0.39	0.27	0.13	0.14	0.37	0.26	0.30	0.25	0.32
O2	0.25	0.27	0.05	0.01	0.34	0.24	0.35	0.31	0.33	0.29	0.30	0.35	0.23	0.12	0.17	0.38	0.27	0.31	0.25	0.34
O2'	0.26	0.21	0.10	0.06	0.20	0.24	0.23	0.27	0.24	0.23	0.20	0.19	0.21	0.14	0.15	0.35	0.24	0.27	0.15	0.28
O3'	0.19	0.04	0.03	0.01	0.08	0.27	0.05	0.29	0.10	0.08	0.11	0.14	0.06	0.13	0.08	0.33	0.26	0.32	0.11	0.28
O4	0.31	0.39	0.06	0.09	0.45	0.23	0.44	0.29	0.41	0.38	0.42	0.46	0.34	0.13	0.06	0.37	0.26	0.28	0.25	0.31
O4'	0.13	0.03	0.16	0.18	0.05	0.13	0.11	0.19	0.13	0.09	0.01	0.04	0.03	0.15	0.36	0.28	0.14	0.19	0.07	0.20
O5'	0.01	0.22	0.25	0.25	0.24	0.07	0.16	0.11	0.10	0.11	0.28	0.29	0.24	0.16	0.39	0.16	0.08	0.16	0.07	0.12
OP1	0.59	0.90	0.77	0.64	0.89	0.30	0.74	0.18	0.65	0.72	0.97	0.95	0.97	0.66	0.65	0.34	0.23	0.07	0.37	0.15
OP2	0.25	0.47	0.46	0.42	0.48	0.11	0.38	0.06	0.31	0.36	0.53	0.52	0.50	0.36	0.52	0.07	0.08	0.11	0.20	0.06
P	0.28	0.56	0.51	0.45	0.57	0.10	0.45	0.03	0.36	0.41	0.63	0.63	0.60	0.40	0.54	0.09	0.05	0.12	0.20	0.04

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.11	0.01
C2	0.01	0.00	0.03	0.05	0.01	0.03	0.02	0.08	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.03	0.05	0.02	0.09	0.06	0.14	0.07
C2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.02	0.01	0.05	0.01	0.05	0.01	0.02	0.02	0.06	0.00	0.00	0.01	0.09	0.06	0.05	0.06
C3'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.05	0.02	0.06	0.04	0.07	0.01	0.01	0.01	0.14	0.09	0.03	0.10
C4	0.01	0.01	0.02	0.04	0.00	0.05	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.03	0.02	0.13	0.12	0.18	0.13
C4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.05	0.00	0.06	0.01	0.05	0.03	0.04	0.06	0.02	0.03	0.01	0.00	0.01	0.02	0.11	0.02
C5	0.01	0.02	0.05	0.04	0.01	0.06	0.00	0.14	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.04	0.05	0.02	0.15	0.13	0.17	0.14
C5'	0.02	0.08	0.01	0.01	0.13	0.01	0.14	0.00	0.12	0.08	0.11	0.15	0.06	0.03	0.03	0.01	0.01	0.03	0.14	0.01
C6	0.01	0.01	0.05	0.05	0.01	0.05	0.00	0.12	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.04	0.06	0.03	0.13	0.09	0.13	0.10
N1	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.08	0.05	0.12	0.06
N3	0.01	0.00	0.02	0.06	0.01	0.04	0.02	0.11	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.05	0.02	0.11	0.09	0.16	0.10
N4	0.02	0.02	0.02	0.04	0.01	0.06	0.02	0.15	0.02	0.02	0.02	0.00	0.02	0.04	0.04	0.03	0.15	0.16	0.21	0.16
O2	0.03	0.01	0.06	0.07	0.01	0.02	0.02	0.06	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.05	0.08	0.04	0.07	0.04	0.13	0.06
O2'	0.01	0.03	0.00	0.01	0.03	0.03	0.04	0.03	0.04	0.02	0.03	0.04	0.05	0.00	0.02	0.02	0.02	0.03	0.07	0.01
O3'	0.01	0.05	0.00	0.01	0.03	0.01	0.05	0.03	0.06	0.01	0.05	0.04	0.08	0.02	0.00	0.01	0.13	0.11	0.04	0.11
O4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.02	0.03	0.04	0.02	0.01	0.00	0.06	0.05	0.15	0.06
O5'	0.03	0.09	0.09	0.14	0.13	0.01	0.15	0.01	0.13	0.08	0.11	0.15	0.07	0.02	0.13	0.06	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.01	0.06	0.06	0.09	0.12	0.02	0.13	0.03	0.09	0.05	0.09	0.16	0.04	0.03	0.11	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.11	0.14	0.05	0.03	0.18	0.11	0.17	0.14	0.13	0.12	0.16	0.21	0.13	0.07	0.04	0.15	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.01	0.07	0.06	0.10	0.13	0.02	0.14	0.01	0.10	0.06	0.10	0.16	0.06	0.01	0.11	0.06	0.00	0.01	0.01	0.00