Doublet Group distance statistics: 49204

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.000, 0.007, 0.013, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.007 std_dev=0.007
C6	A	0, 0.000, 0.008, 0.015, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.008 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.000, 0.013, 0.025, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.013 std_dev=0.013
C2	A	0, 0.000, 0.015, 0.029, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.015 std_dev=0.015
C4	A	0, 0.000, 0.015, 0.030, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.015 std_dev=0.015
O4	A	0, 0.000, 0.015, 0.031, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.015 std_dev=0.015
N1	A	0, 0.000, 0.017, 0.034, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.017 std_dev=0.017
C1'	A	0, 0.000, 0.018, 0.037, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.018 std_dev=0.018
O4'	A	0, 0.000, 0.036, 0.071, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.036 std_dev=0.036
O2	A	0, 0.000, 0.037, 0.075, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.037 std_dev=0.037
C2'	A	0, 0.000, 0.091, 0.182, 0.182 max_d=0.182 avg_d=0.091 std_dev=0.091
C4'	A	0, 0.000, 0.103, 0.205, 0.205 max_d=0.205 avg_d=0.103 std_dev=0.103
P	B	0, 0.000, 0.114, 0.227, 0.227 max_d=0.227 avg_d=0.114 std_dev=0.114
O2'	A	0, 0.000, 0.114, 0.228, 0.228 max_d=0.228 avg_d=0.114 std_dev=0.114
C3'	A	0, 0.000, 0.119, 0.239, 0.239 max_d=0.239 avg_d=0.119 std_dev=0.119
O3'	A	0, 0.000, 0.126, 0.251, 0.251 max_d=0.251 avg_d=0.126 std_dev=0.126
OP1	B	0, 0.000, 0.132, 0.263, 0.263 max_d=0.263 avg_d=0.132 std_dev=0.132
O5'	B	0, 0.000, 0.141, 0.283, 0.283 max_d=0.283 avg_d=0.141 std_dev=0.141
OP2	B	0, 0.000, 0.145, 0.290, 0.290 max_d=0.290 avg_d=0.145 std_dev=0.145
C1'	B	0, 0.000, 0.150, 0.301, 0.301 max_d=0.301 avg_d=0.150 std_dev=0.150
C2'	B	0, 0.000, 0.162, 0.325, 0.325 max_d=0.325 avg_d=0.162 std_dev=0.162
O2'	B	0, 0.000, 0.164, 0.329, 0.329 max_d=0.329 avg_d=0.164 std_dev=0.164
C5'	B	0, 0.000, 0.166, 0.332, 0.332 max_d=0.332 avg_d=0.166 std_dev=0.166
C4'	B	0, 0.000, 0.171, 0.343, 0.343 max_d=0.343 avg_d=0.171 std_dev=0.171
O4'	B	0, 0.000, 0.173, 0.347, 0.347 max_d=0.347 avg_d=0.173 std_dev=0.173
C3'	B	0, 0.000, 0.177, 0.355, 0.355 max_d=0.355 avg_d=0.177 std_dev=0.177
O5'	A	0, 0.000, 0.179, 0.358, 0.358 max_d=0.358 avg_d=0.179 std_dev=0.179
N1	B	0, 0.000, 0.187, 0.373, 0.373 max_d=0.373 avg_d=0.187 std_dev=0.187
C5'	A	0, 0.000, 0.187, 0.375, 0.375 max_d=0.375 avg_d=0.187 std_dev=0.187
O3'	B	0, 0.000, 0.193, 0.386, 0.386 max_d=0.386 avg_d=0.193 std_dev=0.193
C2	B	0, 0.000, 0.207, 0.414, 0.414 max_d=0.414 avg_d=0.207 std_dev=0.207
O2	B	0, 0.000, 0.207, 0.415, 0.415 max_d=0.415 avg_d=0.207 std_dev=0.207
P	A	0, 0.000, 0.211, 0.422, 0.422 max_d=0.422 avg_d=0.211 std_dev=0.211
C6	B	0, 0.000, 0.233, 0.467, 0.467 max_d=0.467 avg_d=0.233 std_dev=0.233
OP1	A	0, 0.000, 0.237, 0.474, 0.474 max_d=0.474 avg_d=0.237 std_dev=0.237
N3	B	0, 0.000, 0.247, 0.495, 0.495 max_d=0.495 avg_d=0.247 std_dev=0.247
OP2	A	0, 0.000, 0.248, 0.496, 0.496 max_d=0.496 avg_d=0.248 std_dev=0.248
C5	B	0, 0.000, 0.281, 0.562, 0.562 max_d=0.562 avg_d=0.281 std_dev=0.281
C4	B	0, 0.000, 0.282, 0.564, 0.564 max_d=0.564 avg_d=0.282 std_dev=0.282
N4	B	0, 0.000, 0.330, 0.660, 0.660 max_d=0.660 avg_d=0.330 std_dev=0.330

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.02	0.00	0.02	0.00	0.02	0.02
C2	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.04	0.04	0.05
C2'	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.01	0.05	0.03	0.05	0.01	0.02	0.04	0.00	0.01	0.04	0.00	0.04	0.05	0.07	0.06
C3'	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.05	0.02	0.02	0.04	0.00	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.05	0.04
C4	0.02	0.00	0.04	0.04	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.04	0.00	0.02	0.11	0.11	0.11	0.11
C4'	0.00	0.01	0.01	0.00	0.05	0.00	0.05	0.00	0.05	0.02	0.03	0.03	0.01	0.01	0.05	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00
C5	0.01	0.01	0.05	0.05	0.00	0.05	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.05	0.00	0.01	0.12	0.10	0.11	0.11
C5'	0.02	0.04	0.03	0.00	0.10	0.00	0.11	0.00	0.09	0.05	0.07	0.00	0.03	0.00	0.10	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01
C6	0.02	0.01	0.05	0.05	0.01	0.05	0.00	0.09	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.06	0.01	0.01	0.09	0.06	0.08	0.08
N1	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.05	0.03	0.04	0.04
N3	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.08	0.08	0.08	0.09
O2	0.03	0.00	0.04	0.04	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.05	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02
O2'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.01	0.04	0.03	0.04	0.01	0.00	0.05	0.00	0.00	0.03	0.00	0.05	0.08	0.09	0.09
O3'	0.03	0.01	0.01	0.00	0.04	0.01	0.05	0.00	0.06	0.03	0.02	0.03	0.00	0.00	0.04	0.04	0.01	0.03	0.04	0.04
O4	0.02	0.01	0.04	0.04	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.04	0.00	0.02	0.11	0.12	0.12	0.12
O4'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.04	0.02	0.00	0.03	0.05	0.03	0.03
O5'	0.02	0.05	0.04	0.01	0.11	0.01	0.12	0.00	0.09	0.05	0.08	0.01	0.05	0.01	0.11	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00
OP1	0.00	0.04	0.05	0.02	0.11	0.01	0.10	0.01	0.06	0.03	0.08	0.02	0.08	0.03	0.12	0.05	0.00	0.00	0.00	0.01
OP2	0.02	0.04	0.07	0.05	0.11	0.01	0.11	0.00	0.08	0.04	0.08	0.01	0.09	0.04	0.12	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00
P	0.02	0.05	0.06	0.04	0.11	0.00	0.11	0.01	0.08	0.04	0.09	0.02	0.09	0.04	0.12	0.03	0.00	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.06	0.10	0.05	0.06	0.09	0.05	0.06	0.05	0.04	0.07	0.11	0.09	0.11	0.04	0.05	0.07	0.08	0.07	0.02	0.03
C2	0.06	0.09	0.05	0.05	0.06	0.04	0.03	0.04	0.02	0.06	0.09	0.06	0.11	0.04	0.04	0.06	0.07	0.06	0.01	0.02
C2'	0.03	0.07	0.02	0.02	0.06	0.02	0.04	0.02	0.02	0.04	0.07	0.07	0.07	0.02	0.01	0.04	0.12	0.11	0.02	0.07
C3'	0.02	0.07	0.02	0.02	0.07	0.01	0.04	0.01	0.02	0.04	0.08	0.08	0.07	0.01	0.01	0.03	0.13	0.13	0.03	0.08
C4	0.04	0.08	0.03	0.02	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.08	0.05	0.11	0.02	0.01	0.03	0.09	0.09	0.02	0.05
C4'	0.02	0.07	0.01	0.02	0.07	0.01	0.04	0.01	0.02	0.04	0.08	0.08	0.07	0.01	0.01	0.02	0.13	0.12	0.02	0.08
C5	0.06	0.11	0.05	0.05	0.08	0.03	0.05	0.02	0.04	0.08	0.10	0.08	0.12	0.04	0.03	0.06	0.08	0.08	0.01	0.04
C5'	0.04	0.01	0.04	0.03	0.02	0.05	0.00	0.04	0.03	0.02	0.03	0.04	0.01	0.05	0.03	0.04	0.17	0.16	0.06	0.12
C6	0.08	0.12	0.07	0.07	0.10	0.05	0.07	0.05	0.06	0.09	0.12	0.10	0.12	0.06	0.06	0.08	0.07	0.07	0.02	0.02
N1	0.06	0.10	0.06	0.06	0.08	0.05	0.05	0.05	0.04	0.07	0.10	0.08	0.11	0.05	0.05	0.07	0.07	0.06	0.02	0.02
N3	0.04	0.08	0.03	0.03	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00	0.04	0.07	0.04	0.10	0.02	0.01	0.04	0.08	0.08	0.01	0.04
O2	0.05	0.08	0.04	0.05	0.05	0.04	0.02	0.05	0.02	0.05	0.08	0.05	0.10	0.03	0.04	0.06	0.07	0.05	0.02	0.02
O2'	0.03	0.07	0.02	0.02	0.06	0.02	0.03	0.01	0.02	0.04	0.07	0.07	0.07	0.02	0.00	0.04	0.11	0.12	0.03	0.07
O3'	0.02	0.07	0.01	0.01	0.06	0.01	0.03	0.00	0.01	0.03	0.07	0.07	0.07	0.01	0.00	0.02	0.13	0.13	0.03	0.09
O4	0.02	0.07	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.06	0.02	0.10	0.01	0.00	0.01	0.08	0.08	0.03	0.05
O4'	0.06	0.11	0.06	0.07	0.10	0.06	0.07	0.06	0.05	0.08	0.12	0.11	0.12	0.05	0.07	0.07	0.07	0.06	0.04	0.02
O5'	0.04	0.01	0.04	0.02	0.04	0.04	0.02	0.03	0.00	0.01	0.03	0.06	0.00	0.05	0.03	0.03	0.15	0.13	0.03	0.09
OP1	0.04	0.01	0.05	0.03	0.08	0.04	0.08	0.02	0.04	0.01	0.04	0.10	0.02	0.07	0.03	0.03	0.10	0.08	0.02	0.02
OP2	0.05	0.01	0.06	0.05	0.07	0.07	0.06	0.07	0.01	0.01	0.04	0.10	0.02	0.07	0.06	0.06	0.16	0.16	0.03	0.11
P	0.03	0.02	0.04	0.03	0.07	0.04	0.06	0.03	0.03	0.01	0.04	0.09	0.01	0.06	0.03	0.03	0.13	0.11	0.01	0.06

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02
C2	0.02	0.00	0.04	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.06	0.02	0.01	0.06	0.04	0.04	0.06
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.08	0.00	0.00	0.00	0.06	0.03	0.01	0.04
C3'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.05	0.02	0.01	0.03	0.06	0.00	0.01	0.00	0.09	0.05	0.00	0.06
C4	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.04	0.01	0.10	0.09	0.11	0.11
C4'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.04	0.01
C5	0.01	0.00	0.01	0.05	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.07	0.01	0.10	0.10	0.12	0.12
C5'	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.00	0.07	0.00	0.06	0.03	0.03	0.06	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.04	0.01
C6	0.01	0.00	0.02	0.05	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.07	0.01	0.09	0.08	0.07	0.09
N1	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.06	0.04	0.03	0.06
N3	0.02	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.05	0.01	0.01	0.08	0.06	0.07	0.08
N4	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.02	0.04	0.01	0.11	0.11	0.13	0.12
O2	0.03	0.00	0.08	0.06	0.01	0.05	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.10	0.08	0.02	0.03	0.01	0.01	0.03
O2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.05	0.02	0.10	0.00	0.01	0.02	0.04	0.03	0.01	0.04
O3'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.04	0.01	0.07	0.02	0.07	0.02	0.01	0.04	0.08	0.01	0.00	0.01	0.12	0.09	0.02	0.09
O4'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.04	0.03	0.05	0.02
O5'	0.02	0.06	0.06	0.09	0.10	0.01	0.10	0.00	0.09	0.06	0.08	0.11	0.03	0.04	0.12	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01
OP1	0.00	0.04	0.03	0.05	0.09	0.00	0.10	0.02	0.08	0.04	0.06	0.11	0.01	0.03	0.09	0.03	0.00	0.00	0.01	0.01
OP2	0.01	0.04	0.01	0.00	0.11	0.04	0.12	0.04	0.07	0.03	0.07	0.13	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.02	0.06	0.04	0.06	0.11	0.01	0.12	0.01	0.09	0.06	0.08	0.12	0.03	0.04	0.09	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00