Doublet Group distance statistics: 49220

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 1, 1, 0, 3, 5, 1, 1, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C4	A	0, 0.011, 0.022, 0.033, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.022 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.006, 0.018, 0.031, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.018 std_dev=0.013
C2	A	0, 0.011, 0.025, 0.039, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.025 std_dev=0.014
N1	A	0, 0.007, 0.022, 0.036, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.022 std_dev=0.014
C6	A	0, 0.008, 0.023, 0.039, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.023 std_dev=0.016
C1'	A	0, 0.015, 0.031, 0.047, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.031 std_dev=0.016
N3	A	0, 0.005, 0.028, 0.050, 0.098 max_d=0.098 avg_d=0.028 std_dev=0.022
N4	A	0, 0.023, 0.052, 0.081, 0.110 max_d=0.110 avg_d=0.052 std_dev=0.029
O2	A	0, 0.020, 0.059, 0.097, 0.131 max_d=0.131 avg_d=0.059 std_dev=0.039
C2'	A	0, 0.018, 0.132, 0.246, 0.373 max_d=0.373 avg_d=0.132 std_dev=0.114
O4'	A	0, 0.017, 0.133, 0.250, 0.437 max_d=0.437 avg_d=0.133 std_dev=0.117
C4'	A	0, 0.093, 0.260, 0.427, 0.662 max_d=0.662 avg_d=0.260 std_dev=0.167
C3'	A	0, 0.060, 0.228, 0.397, 0.647 max_d=0.647 avg_d=0.228 std_dev=0.169
O2'	A	0, 0.052, 0.229, 0.407, 0.589 max_d=0.589 avg_d=0.229 std_dev=0.177
O3'	A	0, 0.123, 0.365, 0.606, 0.987 max_d=0.987 avg_d=0.365 std_dev=0.242
C3'	B	0, 0.225, 0.487, 0.749, 0.910 max_d=0.910 avg_d=0.487 std_dev=0.262
OP2	A	0, 0.306, 0.572, 0.838, 1.029 max_d=1.029 avg_d=0.572 std_dev=0.266
P	A	0, 0.221, 0.497, 0.774, 1.044 max_d=1.044 avg_d=0.497 std_dev=0.276
O5'	B	0, 0.223, 0.527, 0.831, 1.199 max_d=1.199 avg_d=0.527 std_dev=0.304
P	B	0, 0.199, 0.506, 0.812, 1.101 max_d=1.101 avg_d=0.506 std_dev=0.306
OP1	B	0, 0.398, 0.710, 1.021, 1.132 max_d=1.132 avg_d=0.710 std_dev=0.312
C5'	A	0, 0.149, 0.464, 0.778, 1.070 max_d=1.070 avg_d=0.464 std_dev=0.314
C2'	B	0, 0.246, 0.562, 0.878, 1.159 max_d=1.159 avg_d=0.562 std_dev=0.316
OP2	B	0, 0.214, 0.531, 0.848, 1.153 max_d=1.153 avg_d=0.531 std_dev=0.317
O5'	A	0, 0.155, 0.486, 0.816, 1.008 max_d=1.008 avg_d=0.486 std_dev=0.331
C4'	B	0, 0.247, 0.578, 0.909, 1.207 max_d=1.207 avg_d=0.578 std_dev=0.331
OP1	A	0, 0.284, 0.661, 1.039, 1.433 max_d=1.433 avg_d=0.661 std_dev=0.378
O2'	B	0, 0.299, 0.727, 1.155, 1.590 max_d=1.590 avg_d=0.727 std_dev=0.428
C1'	B	0, 0.196, 0.639, 1.082, 1.667 max_d=1.667 avg_d=0.639 std_dev=0.443
C8	B	0, 0.231, 0.676, 1.121, 1.719 max_d=1.719 avg_d=0.676 std_dev=0.445
O4'	B	0, 0.200, 0.645, 1.091, 1.684 max_d=1.684 avg_d=0.645 std_dev=0.445
N7	B	0, 0.272, 0.734, 1.196, 1.825 max_d=1.825 avg_d=0.734 std_dev=0.462
N9	B	0, 0.211, 0.676, 1.141, 1.768 max_d=1.768 avg_d=0.676 std_dev=0.465
O3'	B	0, 0.099, 0.581, 1.063, 2.116 max_d=2.116 avg_d=0.581 std_dev=0.482
C5	B	0, 0.270, 0.764, 1.259, 1.939 max_d=1.939 avg_d=0.764 std_dev=0.495
C5'	B	0, 0.178, 0.675, 1.171, 1.739 max_d=1.739 avg_d=0.675 std_dev=0.496
C4	B	0, 0.241, 0.752, 1.262, 1.909 max_d=1.909 avg_d=0.752 std_dev=0.511
C6	B	0, 0.294, 0.833, 1.373, 2.066 max_d=2.066 avg_d=0.833 std_dev=0.539
O6	B	0, 0.332, 0.876, 1.419, 2.106 max_d=2.106 avg_d=0.876 std_dev=0.543
N3	B	0, 0.254, 0.831, 1.408, 1.992 max_d=1.992 avg_d=0.831 std_dev=0.577
N1	B	0, 0.304, 0.903, 1.502, 2.166 max_d=2.166 avg_d=0.903 std_dev=0.599
C2	B	0, 0.290, 0.913, 1.537, 2.146 max_d=2.146 avg_d=0.913 std_dev=0.623
N2	B	0, 0.313, 1.041, 1.770, 2.319 max_d=2.319 avg_d=1.041 std_dev=0.728

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.04	0.01	0.04	0.03	0.04	0.02	0.03	0.05	0.06	0.03	0.02	0.01	0.08	0.10	0.18	0.12
C2	0.03	0.00	0.07	0.07	0.02	0.05	0.01	0.11	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.09	0.08	0.03	0.12	0.14	0.14	0.14
C2'	0.01	0.07	0.00	0.01	0.06	0.03	0.05	0.03	0.06	0.03	0.07	0.07	0.14	0.01	0.02	0.03	0.04	0.14	0.13	0.06
C3'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.06	0.01	0.08	0.02	0.08	0.04	0.06	0.07	0.13	0.02	0.01	0.02	0.08	0.19	0.11	0.07
C4	0.04	0.02	0.06	0.06	0.00	0.08	0.02	0.18	0.03	0.03	0.01	0.01	0.03	0.07	0.07	0.06	0.18	0.19	0.16	0.18
C4'	0.01	0.05	0.03	0.01	0.08	0.00	0.10	0.01	0.09	0.05	0.06	0.08	0.08	0.07	0.03	0.01	0.04	0.10	0.10	0.05
C5	0.04	0.01	0.05	0.08	0.02	0.10	0.00	0.21	0.01	0.02	0.03	0.02	0.02	0.04	0.09	0.07	0.19	0.18	0.16	0.18
C5'	0.03	0.11	0.03	0.02	0.18	0.01	0.21	0.00	0.18	0.11	0.15	0.19	0.10	0.07	0.04	0.02	0.01	0.11	0.05	0.03
C6	0.04	0.02	0.06	0.08	0.03	0.09	0.01	0.18	0.00	0.01	0.04	0.03	0.02	0.05	0.09	0.07	0.14	0.14	0.14	0.14
N1	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.05	0.02	0.11	0.01	0.00	0.03	0.03	0.03	0.04	0.04	0.03	0.10	0.12	0.15	0.13
N3	0.03	0.01	0.07	0.06	0.01	0.06	0.03	0.15	0.04	0.03	0.00	0.03	0.03	0.09	0.08	0.05	0.15	0.17	0.15	0.16
N4	0.05	0.03	0.07	0.07	0.01	0.08	0.02	0.19	0.03	0.03	0.03	0.00	0.05	0.08	0.08	0.07	0.19	0.21	0.19	0.20
O2	0.06	0.01	0.14	0.13	0.03	0.08	0.02	0.10	0.02	0.03	0.03	0.05	0.00	0.16	0.15	0.05	0.11	0.14	0.15	0.14
O2'	0.03	0.09	0.01	0.02	0.07	0.07	0.04	0.07	0.05	0.04	0.09	0.08	0.16	0.00	0.04	0.11	0.04	0.17	0.11	0.07
O3'	0.02	0.08	0.02	0.01	0.07	0.03	0.09	0.04	0.09	0.04	0.08	0.08	0.15	0.04	0.00	0.03	0.12	0.29	0.14	0.12
O4'	0.01	0.03	0.03	0.02	0.06	0.01	0.07	0.02	0.07	0.03	0.05	0.07	0.05	0.11	0.03	0.00	0.18	0.17	0.25	0.20
O5'	0.08	0.12	0.04	0.08	0.18	0.04	0.19	0.01	0.14	0.10	0.15	0.19	0.11	0.04	0.12	0.18	0.00	0.04	0.03	0.02
OP1	0.10	0.14	0.14	0.19	0.19	0.10	0.18	0.11	0.14	0.12	0.17	0.21	0.14	0.17	0.29	0.17	0.04	0.00	0.02	0.01
OP2	0.18	0.14	0.13	0.11	0.16	0.10	0.16	0.05	0.14	0.15	0.15	0.19	0.15	0.11	0.14	0.25	0.03	0.02	0.00	0.02
P	0.12	0.14	0.06	0.07	0.18	0.05	0.18	0.03	0.14	0.13	0.16	0.20	0.14	0.07	0.12	0.20	0.02	0.01	0.02	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.21	0.18	0.24	0.16	0.19	0.16	0.23	0.22	0.20	0.31	0.17	0.21	0.18	0.31	0.23	0.37	0.34	0.16	0.18	0.23	0.16	0.12	0.13
C2	0.16	0.13	0.21	0.14	0.16	0.19	0.21	0.29	0.19	0.30	0.14	0.15	0.14	0.30	0.21	0.32	0.42	0.17	0.14	0.21	0.14	0.10	0.11
C2'	0.14	0.15	0.17	0.08	0.12	0.12	0.16	0.19	0.14	0.24	0.13	0.21	0.15	0.24	0.15	0.29	0.25	0.10	0.12	0.17	0.14	0.13	0.12
C3'	0.10	0.17	0.12	0.07	0.11	0.11	0.11	0.19	0.11	0.16	0.14	0.22	0.16	0.15	0.10	0.25	0.19	0.08	0.08	0.13	0.11	0.13	0.11
C4	0.19	0.17	0.20	0.16	0.21	0.23	0.25	0.32	0.23	0.31	0.20	0.17	0.18	0.31	0.24	0.26	0.46	0.24	0.18	0.25	0.14	0.13	0.14
C4'	0.11	0.17	0.11	0.08	0.11	0.12	0.11	0.21	0.12	0.16	0.14	0.22	0.16	0.16	0.10	0.25	0.17	0.09	0.09	0.13	0.12	0.12	0.11
C5	0.21	0.19	0.23	0.18	0.22	0.23	0.25	0.31	0.24	0.31	0.21	0.19	0.20	0.31	0.25	0.28	0.47	0.23	0.16	0.25	0.09	0.12	0.09
C5'	0.13	0.21	0.17	0.19	0.16	0.18	0.16	0.28	0.17	0.14	0.19	0.24	0.20	0.14	0.13	0.27	0.14	0.14	0.10	0.17	0.14	0.15	0.15
C6	0.20	0.16	0.24	0.17	0.20	0.20	0.23	0.27	0.21	0.31	0.18	0.17	0.17	0.30	0.23	0.31	0.43	0.19	0.16	0.23	0.10	0.13	0.09
N1	0.18	0.14	0.22	0.15	0.17	0.18	0.21	0.26	0.19	0.30	0.15	0.17	0.15	0.30	0.22	0.33	0.40	0.17	0.15	0.21	0.12	0.10	0.10
N3	0.15	0.12	0.18	0.13	0.16	0.21	0.21	0.31	0.19	0.29	0.14	0.14	0.13	0.29	0.20	0.27	0.45	0.20	0.16	0.22	0.16	0.13	0.14
N4	0.24	0.23	0.22	0.19	0.26	0.25	0.30	0.33	0.28	0.34	0.25	0.22	0.23	0.35	0.28	0.26	0.47	0.29	0.24	0.31	0.20	0.21	0.22
O2	0.18	0.15	0.23	0.15	0.18	0.19	0.23	0.29	0.20	0.32	0.16	0.18	0.16	0.32	0.22	0.36	0.41	0.17	0.15	0.23	0.16	0.11	0.12
O2'	0.13	0.17	0.14	0.10	0.13	0.14	0.18	0.24	0.16	0.26	0.15	0.24	0.16	0.27	0.16	0.26	0.22	0.11	0.14	0.19	0.14	0.12	0.11
O3'	0.12	0.23	0.13	0.11	0.15	0.13	0.13	0.19	0.15	0.13	0.19	0.28	0.21	0.14	0.11	0.24	0.16	0.12	0.09	0.15	0.12	0.15	0.13
O4'	0.24	0.18	0.24	0.18	0.19	0.16	0.21	0.18	0.18	0.29	0.16	0.22	0.19	0.27	0.23	0.37	0.32	0.18	0.23	0.20	0.21	0.18	0.19
O5'	0.13	0.19	0.20	0.20	0.15	0.11	0.16	0.21	0.16	0.16	0.18	0.22	0.18	0.16	0.14	0.31	0.02	0.09	0.11	0.17	0.11	0.14	0.13
OP1	0.46	0.45	0.47	0.20	0.47	0.30	0.48	0.26	0.48	0.47	0.47	0.44	0.45	0.48	0.47	0.62	0.03	0.41	0.22	0.48	0.27	0.15	0.22
OP2	0.17	0.12	0.07	0.13	0.15	0.20	0.18	0.19	0.16	0.22	0.14	0.14	0.12	0.21	0.18	0.18	0.03	0.26	0.15	0.18	0.12	0.10	0.14
P	0.15	0.15	0.16	0.02	0.14	0.12	0.15	0.13	0.15	0.17	0.15	0.18	0.15	0.16	0.15	0.28	0.01	0.18	0.12	0.16	0.14	0.13	0.13

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.07	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.08	0.03	0.02	0.06	0.09	0.06	0.02	0.01	0.02	0.19	0.01	0.18	0.04	0.23	0.19	0.20
C2	0.07	0.00	0.15	0.08	0.02	0.11	0.02	0.09	0.02	0.03	0.01	0.00	0.01	0.02	0.04	0.26	0.29	0.16	0.22	0.03	0.32	0.25	0.26
C2'	0.01	0.15	0.00	0.01	0.08	0.03	0.06	0.16	0.09	0.09	0.12	0.17	0.14	0.06	0.02	0.01	0.04	0.03	0.29	0.09	0.25	0.27	0.26
C3'	0.02	0.08	0.01	0.00	0.04	0.01	0.06	0.03	0.06	0.11	0.07	0.13	0.08	0.10	0.04	0.02	0.01	0.02	0.24	0.08	0.22	0.22	0.21
C4	0.02	0.02	0.08	0.04	0.00	0.05	0.01	0.12	0.02	0.01	0.03	0.02	0.01	0.02	0.01	0.15	0.20	0.09	0.21	0.02	0.29	0.24	0.25
C4'	0.01	0.11	0.03	0.01	0.05	0.00	0.05	0.01	0.06	0.10	0.08	0.16	0.11	0.08	0.04	0.04	0.04	0.01	0.03	0.07	0.10	0.06	0.04
C5	0.02	0.02	0.06	0.06	0.01	0.05	0.00	0.18	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.14	0.15	0.07	0.21	0.03	0.28	0.25	0.26
C5'	0.08	0.09	0.16	0.03	0.12	0.01	0.18	0.00	0.17	0.25	0.12	0.11	0.08	0.25	0.15	0.12	0.13	0.02	0.01	0.21	0.11	0.12	0.02
C6	0.03	0.02	0.09	0.06	0.02	0.06	0.01	0.17	0.00	0.03	0.01	0.03	0.03	0.03	0.03	0.17	0.18	0.09	0.21	0.01	0.30	0.26	0.27
C8	0.02	0.03	0.09	0.11	0.01	0.10	0.02	0.25	0.03	0.00	0.03	0.03	0.03	0.01	0.01	0.15	0.11	0.06	0.21	0.05	0.25	0.26	0.27
N1	0.06	0.01	0.12	0.07	0.03	0.08	0.02	0.12	0.01	0.03	0.00	0.02	0.02	0.03	0.04	0.22	0.24	0.13	0.22	0.02	0.32	0.26	0.27
N2	0.09	0.00	0.17	0.13	0.02	0.16	0.02	0.11	0.03	0.03	0.02	0.00	0.02	0.03	0.05	0.31	0.35	0.20	0.25	0.04	0.35	0.27	0.27
N3	0.06	0.01	0.14	0.08	0.01	0.11	0.02	0.08	0.03	0.03	0.02	0.02	0.00	0.02	0.03	0.25	0.29	0.15	0.23	0.03	0.32	0.25	0.26
N7	0.02	0.02	0.06	0.10	0.02	0.08	0.01	0.25	0.03	0.01	0.03	0.03	0.02	0.00	0.01	0.15	0.11	0.05	0.21	0.05	0.26	0.27	0.27
N9	0.01	0.04	0.02	0.04	0.01	0.04	0.02	0.15	0.03	0.01	0.04	0.05	0.03	0.01	0.00	0.08	0.15	0.03	0.20	0.04	0.26	0.23	0.24
O2'	0.02	0.26	0.01	0.02	0.15	0.04	0.14	0.12	0.17	0.15	0.22	0.31	0.25	0.15	0.08	0.00	0.09	0.02	0.29	0.18	0.27	0.30	0.28
O3'	0.19	0.29	0.04	0.01	0.20	0.04	0.15	0.13	0.18	0.11	0.24	0.35	0.29	0.11	0.15	0.09	0.00	0.15	0.34	0.16	0.34	0.41	0.38
O4'	0.01	0.16	0.03	0.02	0.09	0.01	0.07	0.02	0.09	0.06	0.13	0.20	0.15	0.05	0.03	0.02	0.15	0.00	0.13	0.09	0.25	0.17	0.18
O5'	0.18	0.22	0.29	0.24	0.21	0.03	0.21	0.01	0.21	0.21	0.22	0.25	0.23	0.21	0.20	0.29	0.34	0.13	0.00	0.21	0.02	0.03	0.01
O6	0.04	0.03	0.09	0.08	0.02	0.07	0.03	0.21	0.01	0.05	0.02	0.04	0.03	0.05	0.04	0.18	0.16	0.09	0.21	0.00	0.30	0.27	0.27
OP1	0.23	0.32	0.25	0.22	0.29	0.10	0.28	0.11	0.30	0.25	0.32	0.35	0.32	0.26	0.26	0.27	0.34	0.25	0.02	0.30	0.00	0.03	0.02
OP2	0.19	0.25	0.27	0.22	0.24	0.06	0.25	0.12	0.26	0.26	0.26	0.27	0.25	0.27	0.23	0.30	0.41	0.17	0.03	0.27	0.03	0.00	0.02
P	0.20	0.26	0.26	0.21	0.25	0.04	0.26	0.02	0.27	0.27	0.27	0.27	0.26	0.27	0.24	0.28	0.38	0.18	0.01	0.27	0.02	0.02	0.00