Doublet Group distance statistics: 49222

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 1, 0, 0, 3, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.008, 0.015, 0.022, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.015 std_dev=0.007
C6	A	0, 0.007, 0.015, 0.022, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.015 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.004, 0.012, 0.020, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.012 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.006, 0.014, 0.022, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.014 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.007, 0.016, 0.026, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.016 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.012, 0.023, 0.034, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.023 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.011, 0.023, 0.035, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.023 std_dev=0.012
O2	A	0, 0.014, 0.035, 0.057, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.035 std_dev=0.022
N4	A	0, 0.023, 0.048, 0.072, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.048 std_dev=0.025
C2'	A	0, 0.032, 0.066, 0.100, 0.117 max_d=0.117 avg_d=0.066 std_dev=0.034
O4'	A	0, 0.038, 0.074, 0.111, 0.106 max_d=0.106 avg_d=0.074 std_dev=0.037
C4'	A	0, 0.043, 0.108, 0.172, 0.230 max_d=0.230 avg_d=0.108 std_dev=0.065
C5'	A	0, 0.069, 0.138, 0.207, 0.228 max_d=0.228 avg_d=0.138 std_dev=0.069
C3'	A	0, 0.062, 0.137, 0.212, 0.246 max_d=0.246 avg_d=0.137 std_dev=0.075
O2'	A	0, 0.060, 0.137, 0.215, 0.258 max_d=0.258 avg_d=0.137 std_dev=0.077
OP1	B	0, 0.081, 0.184, 0.287, 0.385 max_d=0.385 avg_d=0.184 std_dev=0.103
O5'	A	0, 0.118, 0.272, 0.426, 0.500 max_d=0.500 avg_d=0.272 std_dev=0.154
P	A	0, 0.143, 0.327, 0.511, 0.643 max_d=0.643 avg_d=0.327 std_dev=0.184
C3'	B	0, 0.156, 0.348, 0.539, 0.622 max_d=0.622 avg_d=0.348 std_dev=0.191
O3'	A	0, 0.133, 0.335, 0.537, 0.622 max_d=0.622 avg_d=0.335 std_dev=0.202
OP2	A	0, 0.176, 0.380, 0.584, 0.732 max_d=0.732 avg_d=0.380 std_dev=0.204
O3'	B	0, 0.158, 0.366, 0.574, 0.718 max_d=0.718 avg_d=0.366 std_dev=0.208
P	B	0, 0.245, 0.457, 0.670, 0.706 max_d=0.706 avg_d=0.457 std_dev=0.212
OP1	A	0, 0.124, 0.337, 0.550, 0.650 max_d=0.650 avg_d=0.337 std_dev=0.213
O5'	B	0, 0.255, 0.520, 0.785, 0.886 max_d=0.886 avg_d=0.520 std_dev=0.265
C5'	B	0, 0.284, 0.590, 0.897, 1.030 max_d=1.030 avg_d=0.590 std_dev=0.306
C4'	B	0, 0.250, 0.567, 0.884, 1.015 max_d=1.015 avg_d=0.567 std_dev=0.317
OP2	B	0, 0.343, 0.762, 1.182, 1.166 max_d=1.166 avg_d=0.762 std_dev=0.419
C2'	B	0, 0.236, 0.660, 1.083, 1.067 max_d=1.067 avg_d=0.660 std_dev=0.424
O2'	B	0, 0.295, 0.720, 1.144, 1.111 max_d=1.111 avg_d=0.720 std_dev=0.425
O4'	B	0, 0.276, 0.744, 1.212, 1.325 max_d=1.325 avg_d=0.744 std_dev=0.468
C1'	B	0, 0.341, 0.948, 1.555, 1.565 max_d=1.565 avg_d=0.948 std_dev=0.607
C4	B	0, 0.417, 1.038, 1.659, 1.728 max_d=1.728 avg_d=1.038 std_dev=0.621
C6	B	0, 0.521, 1.246, 1.970, 2.137 max_d=2.137 avg_d=1.246 std_dev=0.725
N9	B	0, 0.467, 1.389, 2.311, 2.242 max_d=2.242 avg_d=1.389 std_dev=0.922
C5	B	0, 0.569, 1.573, 2.577, 2.586 max_d=2.586 avg_d=1.573 std_dev=1.004
O6	B	0, 0.674, 1.757, 2.840, 2.945 max_d=2.945 avg_d=1.757 std_dev=1.083
N1	B	0, 0.683, 1.787, 2.890, 2.753 max_d=2.753 avg_d=1.787 std_dev=1.104
N3	B	0, 0.676, 2.048, 3.420, 3.175 max_d=3.175 avg_d=2.048 std_dev=1.372
C2	B	0, 0.849, 2.607, 4.366, 4.004 max_d=4.004 avg_d=2.607 std_dev=1.759
C8	B	0, 0.810, 2.832, 4.855, 4.517 max_d=4.517 avg_d=2.832 std_dev=2.022
N7	B	0, 0.877, 2.991, 5.105, 4.777 max_d=4.777 avg_d=2.991 std_dev=2.114
N2	B	0, 1.230, 4.174, 7.118, 6.517 max_d=6.517 avg_d=4.174 std_dev=2.944

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.02	0.03	0.01	0.07	0.07	0.09	0.07
C2	0.01	0.00	0.03	0.04	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.04	0.04	0.02	0.06	0.08	0.09	0.08
C2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.03	0.01	0.03	0.01	0.04	0.04	0.03	0.05
C3'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.06	0.01	0.06	0.02	0.05	0.04	0.05	0.06	0.04	0.02	0.01	0.01	0.07	0.05	0.05	0.07
C4	0.02	0.01	0.02	0.06	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.04	0.07	0.04	0.06	0.08	0.10	0.08
C4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.03	0.02	0.02	0.03	0.03	0.02	0.02	0.01	0.01	0.03	0.03	0.01
C5	0.02	0.01	0.02	0.06	0.01	0.03	0.00	0.06	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.07	0.04	0.06	0.08	0.12	0.08
C5'	0.02	0.04	0.02	0.02	0.05	0.01	0.06	0.00	0.05	0.04	0.05	0.05	0.04	0.03	0.01	0.02	0.01	0.05	0.03	0.01
C6	0.02	0.01	0.02	0.05	0.01	0.03	0.01	0.05	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.06	0.03	0.07	0.08	0.12	0.08
N1	0.01	0.01	0.02	0.04	0.02	0.02	0.01	0.04	0.00	0.00	0.02	0.02	0.01	0.03	0.04	0.02	0.06	0.07	0.09	0.07
N3	0.02	0.01	0.02	0.05	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.04	0.06	0.03	0.06	0.08	0.10	0.08
N4	0.03	0.02	0.02	0.06	0.01	0.03	0.02	0.05	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.04	0.08	0.05	0.05	0.08	0.11	0.08
O2	0.02	0.01	0.03	0.04	0.02	0.03	0.02	0.04	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.05	0.05	0.02	0.07	0.09	0.09	0.08
O2'	0.02	0.04	0.01	0.02	0.04	0.02	0.03	0.03	0.02	0.03	0.04	0.04	0.05	0.00	0.07	0.02	0.03	0.03	0.02	0.04
O3'	0.03	0.04	0.03	0.01	0.07	0.02	0.07	0.01	0.06	0.04	0.06	0.08	0.05	0.07	0.00	0.03	0.13	0.12	0.15	0.14
O4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.01	0.04	0.02	0.03	0.02	0.03	0.05	0.02	0.02	0.03	0.00	0.12	0.11	0.14	0.11
O5'	0.07	0.06	0.04	0.07	0.06	0.01	0.06	0.01	0.07	0.06	0.06	0.05	0.07	0.03	0.13	0.12	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.07	0.08	0.04	0.05	0.08	0.03	0.08	0.05	0.08	0.07	0.08	0.08	0.09	0.03	0.12	0.11	0.01	0.00	0.02	0.01
OP2	0.09	0.09	0.03	0.05	0.10	0.03	0.12	0.03	0.12	0.09	0.10	0.11	0.09	0.02	0.15	0.14	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.07	0.08	0.05	0.07	0.08	0.01	0.08	0.01	0.08	0.07	0.08	0.08	0.08	0.04	0.14	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.34	0.41	0.32	0.12	0.19	0.13	0.45	0.09	0.25	0.97	0.17	0.79	0.28	0.91	0.51	0.42	0.08	0.22	0.09	0.37	0.08	0.26	0.15
C2	0.33	0.84	0.33	0.10	0.11	0.09	0.53	0.07	0.22	1.30	0.44	1.44	0.63	1.24	0.58	0.40	0.06	0.17	0.06	0.46	0.05	0.31	0.14
C2'	0.25	0.36	0.26	0.07	0.16	0.06	0.39	0.05	0.22	0.82	0.15	0.69	0.25	0.78	0.41	0.37	0.05	0.14	0.04	0.34	0.05	0.23	0.10
C3'	0.13	0.29	0.16	0.03	0.07	0.05	0.22	0.10	0.11	0.53	0.15	0.52	0.22	0.49	0.25	0.27	0.06	0.05	0.07	0.18	0.05	0.13	0.03
C4	0.27	1.16	0.28	0.06	0.08	0.06	0.45	0.05	0.10	1.38	0.68	1.86	0.93	1.28	0.53	0.32	0.04	0.12	0.04	0.36	0.04	0.28	0.11
C4'	0.18	0.12	0.17	0.05	0.14	0.04	0.22	0.04	0.14	0.44	0.07	0.26	0.06	0.39	0.26	0.28	0.03	0.12	0.02	0.17	0.05	0.14	0.06
C5	0.25	1.06	0.26	0.07	0.11	0.07	0.35	0.06	0.06	1.22	0.64	1.64	0.87	1.08	0.46	0.29	0.05	0.12	0.04	0.24	0.05	0.21	0.10
C5'	0.05	0.11	0.05	0.03	0.06	0.04	0.07	0.07	0.08	0.13	0.11	0.16	0.08	0.10	0.07	0.14	0.05	0.04	0.07	0.09	0.05	0.04	0.02
C6	0.27	0.80	0.29	0.09	0.05	0.10	0.35	0.08	0.09	1.08	0.47	1.28	0.64	0.96	0.46	0.34	0.06	0.15	0.05	0.25	0.07	0.20	0.11
N1	0.31	0.70	0.32	0.10	0.10	0.10	0.45	0.08	0.18	1.13	0.37	1.19	0.53	1.05	0.52	0.39	0.06	0.18	0.07	0.36	0.06	0.26	0.13
N3	0.31	1.05	0.32	0.08	0.06	0.07	0.53	0.05	0.18	1.41	0.58	1.75	0.81	1.34	0.58	0.37	0.04	0.14	0.05	0.45	0.04	0.32	0.13
N4	0.25	1.34	0.26	0.05	0.14	0.04	0.44	0.04	0.07	1.44	0.80	2.13	1.07	1.34	0.52	0.29	0.03	0.09	0.05	0.35	0.06	0.28	0.10
O2	0.35	0.75	0.34	0.10	0.16	0.10	0.58	0.07	0.29	1.31	0.36	1.35	0.55	1.27	0.60	0.42	0.07	0.19	0.08	0.52	0.05	0.33	0.15
O2'	0.31	0.18	0.29	0.10	0.27	0.09	0.47	0.06	0.33	0.82	0.06	0.46	0.08	0.80	0.47	0.40	0.05	0.19	0.07	0.43	0.07	0.28	0.14
O3'	0.07	0.16	0.11	0.06	0.08	0.10	0.19	0.15	0.12	0.38	0.08	0.31	0.12	0.36	0.18	0.23	0.11	0.02	0.11	0.17	0.07	0.12	0.03
O4'	0.33	0.24	0.30	0.15	0.20	0.16	0.36	0.12	0.20	0.75	0.10	0.49	0.13	0.67	0.43	0.40	0.12	0.24	0.11	0.27	0.11	0.22	0.15
O5'	0.12	0.20	0.16	0.07	0.05	0.03	0.13	0.04	0.06	0.36	0.12	0.33	0.15	0.30	0.18	0.25	0.03	0.09	0.03	0.09	0.09	0.12	0.06
OP1	0.11	0.14	0.05	0.02	0.08	0.08	0.13	0.09	0.12	0.23	0.11	0.22	0.12	0.22	0.13	0.04	0.04	0.06	0.07	0.15	0.11	0.05	0.04
OP2	0.03	0.39	0.10	0.07	0.12	0.04	0.03	0.08	0.09	0.28	0.26	0.55	0.35	0.23	0.06	0.16	0.03	0.03	0.05	0.04	0.13	0.11	0.06
P	0.03	0.17	0.04	0.03	0.07	0.04	0.04	0.07	0.08	0.09	0.14	0.23	0.15	0.06	0.02	0.12	0.01	0.02	0.06	0.07	0.11	0.07	0.04

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.06	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.06	0.00	0.16	0.01	0.18	0.15	0.15
C2	0.02	0.00	0.43	0.47	0.01	0.46	0.01	0.83	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.16	0.13	0.26	1.12	0.01	1.44	1.80	1.49
C2'	0.01	0.43	0.00	0.00	0.19	0.01	0.06	0.08	0.16	0.30	0.32	0.53	0.42	0.18	0.05	0.01	0.03	0.02	0.12	0.11	0.19	0.13	0.14
C3'	0.01	0.47	0.00	0.00	0.19	0.01	0.05	0.01	0.15	0.30	0.34	0.61	0.45	0.20	0.04	0.04	0.01	0.01	0.03	0.09	0.10	0.02	0.02
C4	0.01	0.01	0.19	0.19	0.00	0.18	0.00	0.22	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.09	0.14	0.23	0.01	0.28	0.38	0.31
C4'	0.02	0.46	0.01	0.01	0.18	0.00	0.04	0.01	0.12	0.31	0.31	0.60	0.45	0.23	0.05	0.03	0.02	0.01	0.02	0.06	0.11	0.03	0.03
C5	0.01	0.01	0.06	0.05	0.00	0.04	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.11	0.08	0.06	0.23	0.01	0.24	0.23	0.24
C5'	0.06	0.83	0.08	0.01	0.22	0.01	0.12	0.00	0.13	0.71	0.52	1.17	0.78	0.59	0.19	0.07	0.03	0.02	0.02	0.11	0.11	0.03	0.03
C6	0.01	0.01	0.16	0.15	0.01	0.12	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.16	0.10	0.09	0.11	0.00	0.16	0.24	0.16
C8	0.02	0.01	0.30	0.30	0.00	0.31	0.01	0.71	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.04	0.15	1.10	0.01	1.23	1.40	1.27
N1	0.01	0.01	0.32	0.34	0.01	0.31	0.01	0.52	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.17	0.12	0.18	0.67	0.01	0.93	1.18	0.95
N2	0.03	0.01	0.53	0.61	0.01	0.60	0.01	1.17	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.17	0.14	0.32	1.60	0.02	2.18	2.67	2.21
N3	0.02	0.01	0.42	0.45	0.00	0.45	0.01	0.78	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.13	0.12	0.28	1.03	0.01	1.21	1.49	1.28
N7	0.01	0.01	0.18	0.20	0.01	0.23	0.00	0.59	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.06	0.06	0.10	0.91	0.01	1.09	1.26	1.12
N9	0.00	0.01	0.05	0.04	0.01	0.05	0.00	0.19	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.06	0.03	0.36	0.01	0.38	0.38	0.37
O2'	0.02	0.16	0.01	0.04	0.10	0.03	0.11	0.07	0.16	0.03	0.17	0.17	0.13	0.06	0.03	0.00	0.05	0.03	0.11	0.17	0.18	0.14	0.14
O3'	0.06	0.13	0.03	0.01	0.09	0.02	0.08	0.03	0.10	0.04	0.12	0.14	0.12	0.06	0.06	0.05	0.00	0.03	0.03	0.11	0.11	0.03	0.03
O4'	0.00	0.26	0.02	0.01	0.14	0.01	0.06	0.02	0.09	0.15	0.18	0.32	0.28	0.10	0.03	0.03	0.03	0.00	0.06	0.06	0.08	0.07	0.03
O5'	0.16	1.12	0.12	0.03	0.23	0.02	0.23	0.02	0.11	1.10	0.67	1.60	1.03	0.91	0.36	0.11	0.03	0.06	0.00	0.16	0.02	0.02	0.01
O6	0.01	0.01	0.11	0.09	0.01	0.06	0.01	0.11	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.17	0.11	0.06	0.16	0.00	0.15	0.10	0.15
OP1	0.18	1.44	0.19	0.10	0.28	0.11	0.24	0.11	0.16	1.23	0.93	2.18	1.21	1.09	0.38	0.18	0.11	0.08	0.02	0.15	0.00	0.01	0.01
OP2	0.15	1.80	0.13	0.02	0.38	0.03	0.23	0.03	0.24	1.40	1.18	2.67	1.49	1.26	0.38	0.14	0.03	0.07	0.02	0.10	0.01	0.00	0.01
P	0.15	1.49	0.14	0.02	0.31	0.03	0.24	0.03	0.16	1.27	0.95	2.21	1.28	1.12	0.37	0.14	0.03	0.03	0.01	0.15	0.01	0.01	0.00