Doublet Group distance statistics: 49224

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N1	A	0, 0.004, 0.016, 0.028, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.016 std_dev=0.012
C5	A	0, 0.001, 0.013, 0.026, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.013 std_dev=0.012
N3	A	0, 0.006, 0.019, 0.031, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.019 std_dev=0.013
C6	A	0, 0.008, 0.024, 0.039, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.024 std_dev=0.015
C4	A	0, 0.008, 0.025, 0.041, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.025 std_dev=0.016
C2	A	0, 0.009, 0.026, 0.043, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.026 std_dev=0.017
C1'	A	0, 0.008, 0.026, 0.044, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.026 std_dev=0.018
O4'	A	0, 0.017, 0.058, 0.099, 0.119 max_d=0.119 avg_d=0.058 std_dev=0.041
N4	A	0, 0.021, 0.063, 0.105, 0.100 max_d=0.100 avg_d=0.063 std_dev=0.042
O2	A	0, 0.031, 0.093, 0.154, 0.147 max_d=0.147 avg_d=0.093 std_dev=0.061
C2'	A	0, 0.036, 0.100, 0.163, 0.164 max_d=0.164 avg_d=0.100 std_dev=0.064
O2'	A	0, 0.049, 0.168, 0.288, 0.299 max_d=0.299 avg_d=0.168 std_dev=0.120
C3'	A	0, 0.045, 0.272, 0.498, 0.532 max_d=0.532 avg_d=0.272 std_dev=0.226
P	B	0, 0.026, 0.276, 0.526, 0.697 max_d=0.697 avg_d=0.276 std_dev=0.250
O5'	B	0, 0.073, 0.355, 0.638, 0.634 max_d=0.634 avg_d=0.355 std_dev=0.282
OP1	B	0, 0.048, 0.339, 0.630, 0.807 max_d=0.807 avg_d=0.339 std_dev=0.291
C4'	A	0, 0.038, 0.352, 0.666, 0.723 max_d=0.723 avg_d=0.352 std_dev=0.314
O3'	A	0, 0.056, 0.380, 0.704, 0.770 max_d=0.770 avg_d=0.380 std_dev=0.324
OP2	B	0, 0.020, 0.345, 0.670, 0.885 max_d=0.885 avg_d=0.345 std_dev=0.325
C5'	B	0, 0.066, 0.414, 0.762, 0.827 max_d=0.827 avg_d=0.414 std_dev=0.348
O4'	B	0, 0.126, 0.552, 0.978, 0.978 max_d=0.978 avg_d=0.552 std_dev=0.426
C4'	B	0, 0.069, 0.499, 0.928, 1.017 max_d=1.017 avg_d=0.499 std_dev=0.430
C3'	B	0, 0.111, 0.556, 1.001, 1.045 max_d=1.045 avg_d=0.556 std_dev=0.445
C8	B	0, 0.100, 0.557, 1.013, 1.205 max_d=1.205 avg_d=0.557 std_dev=0.457
N7	B	0, 0.128, 0.604, 1.081, 1.159 max_d=1.159 avg_d=0.604 std_dev=0.476
C5	B	0, 0.132, 0.624, 1.116, 1.130 max_d=1.130 avg_d=0.624 std_dev=0.492
N9	B	0, 0.127, 0.624, 1.120, 1.218 max_d=1.218 avg_d=0.624 std_dev=0.497
C1'	B	0, 0.151, 0.671, 1.190, 1.114 max_d=1.114 avg_d=0.671 std_dev=0.519
C6	B	0, 0.141, 0.676, 1.211, 1.168 max_d=1.168 avg_d=0.676 std_dev=0.535
C4	B	0, 0.141, 0.679, 1.216, 1.218 max_d=1.218 avg_d=0.679 std_dev=0.538
O3'	B	0, 0.080, 0.619, 1.157, 1.259 max_d=1.259 avg_d=0.619 std_dev=0.538
O5'	A	0, 0.135, 0.698, 1.260, 1.268 max_d=1.268 avg_d=0.698 std_dev=0.563
OP2	A	0, 0.102, 0.684, 1.266, 1.507 max_d=1.507 avg_d=0.684 std_dev=0.582
N1	B	0, 0.144, 0.737, 1.329, 1.312 max_d=1.312 avg_d=0.737 std_dev=0.592
O6	B	0, 0.138, 0.742, 1.346, 1.358 max_d=1.358 avg_d=0.742 std_dev=0.604
C2'	B	0, 0.169, 0.788, 1.408, 1.357 max_d=1.357 avg_d=0.788 std_dev=0.620
N3	B	0, 0.163, 0.812, 1.461, 1.389 max_d=1.389 avg_d=0.812 std_dev=0.649
C2	B	0, 0.160, 0.826, 1.491, 1.460 max_d=1.460 avg_d=0.826 std_dev=0.665
P	A	0, 0.168, 0.852, 1.535, 1.553 max_d=1.553 avg_d=0.852 std_dev=0.684
C5'	A	0, 0.020, 0.711, 1.402, 1.549 max_d=1.549 avg_d=0.711 std_dev=0.691
N2	B	0, 0.170, 0.972, 1.773, 1.793 max_d=1.793 avg_d=0.972 std_dev=0.801
OP1	A	0, 0.204, 1.046, 1.887, 1.931 max_d=1.931 avg_d=1.046 std_dev=0.842
O2'	B	0, 0.187, 1.059, 1.931, 1.915 max_d=1.915 avg_d=1.059 std_dev=0.872

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.13	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.00	0.29	0.13	0.09	0.17
C2	0.02	0.00	0.03	0.01	0.01	0.04	0.02	0.28	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.05	0.07	0.06	0.23	0.12	0.06	0.12
C2'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.04	0.01	0.04	0.15	0.03	0.03	0.04	0.04	0.02	0.00	0.02	0.03	0.40	0.24	0.22	0.29
C3'	0.02	0.01	0.01	0.00	0.08	0.01	0.12	0.05	0.12	0.05	0.03	0.08	0.05	0.02	0.02	0.01	0.22	0.11	0.25	0.17
C4	0.02	0.01	0.04	0.08	0.00	0.15	0.00	0.51	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.09	0.02	0.05	0.19	0.03	0.13	0.04
C4'	0.02	0.04	0.01	0.01	0.15	0.00	0.20	0.01	0.19	0.09	0.09	0.16	0.05	0.01	0.03	0.01	0.02	0.14	0.28	0.08
C5	0.01	0.02	0.04	0.12	0.00	0.20	0.00	0.58	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.11	0.03	0.03	0.19	0.04	0.16	0.05
C5'	0.13	0.28	0.15	0.05	0.51	0.01	0.58	0.00	0.54	0.35	0.38	0.54	0.14	0.13	0.05	0.03	0.01	0.20	0.41	0.01
C6	0.01	0.01	0.03	0.12	0.01	0.19	0.00	0.54	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.10	0.05	0.03	0.22	0.06	0.15	0.09
N1	0.01	0.00	0.03	0.05	0.01	0.09	0.01	0.35	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.02	0.04	0.24	0.08	0.09	0.11
N3	0.02	0.00	0.04	0.03	0.01	0.09	0.01	0.38	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.07	0.06	0.06	0.21	0.09	0.09	0.09
N4	0.02	0.01	0.04	0.08	0.00	0.16	0.01	0.54	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.10	0.03	0.05	0.18	0.02	0.13	0.03
O2	0.02	0.01	0.02	0.05	0.02	0.05	0.03	0.14	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.03	0.12	0.07	0.24	0.18	0.05	0.16
O2'	0.02	0.05	0.00	0.02	0.09	0.01	0.11	0.13	0.10	0.06	0.07	0.10	0.03	0.00	0.03	0.01	0.39	0.28	0.28	0.31
O3'	0.02	0.07	0.02	0.02	0.02	0.03	0.03	0.05	0.05	0.02	0.06	0.03	0.12	0.03	0.00	0.11	0.10	0.16	0.29	0.15
O4'	0.00	0.06	0.03	0.01	0.05	0.01	0.03	0.03	0.03	0.04	0.06	0.05	0.07	0.01	0.11	0.00	0.26	0.21	0.04	0.20
O5'	0.29	0.23	0.40	0.22	0.19	0.02	0.19	0.01	0.22	0.24	0.21	0.18	0.24	0.39	0.10	0.26	0.00	0.02	0.03	0.01
OP1	0.13	0.12	0.24	0.11	0.03	0.14	0.04	0.20	0.06	0.08	0.09	0.02	0.18	0.28	0.16	0.21	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.09	0.06	0.22	0.25	0.13	0.28	0.16	0.41	0.15	0.09	0.09	0.13	0.05	0.28	0.29	0.04	0.03	0.01	0.00	0.01
P	0.17	0.12	0.29	0.17	0.04	0.08	0.05	0.01	0.09	0.11	0.09	0.03	0.16	0.31	0.15	0.20	0.01	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.11	0.22	0.16	0.06	0.15	0.12	0.18	0.12	0.24	0.13	0.26	0.25	0.16	0.16	0.13	0.16	0.06	0.11	0.09	0.29	0.07	0.07	0.06
C2	0.07	0.10	0.11	0.02	0.13	0.09	0.17	0.11	0.15	0.18	0.11	0.08	0.11	0.19	0.14	0.09	0.03	0.07	0.07	0.15	0.05	0.06	0.05
C2'	0.09	0.20	0.15	0.06	0.14	0.11	0.19	0.10	0.27	0.12	0.27	0.23	0.14	0.17	0.11	0.15	0.05	0.12	0.09	0.35	0.04	0.05	0.03
C3'	0.12	0.25	0.13	0.09	0.14	0.14	0.15	0.12	0.23	0.10	0.28	0.32	0.17	0.11	0.11	0.15	0.09	0.16	0.11	0.27	0.06	0.06	0.07
C4	0.04	0.08	0.07	0.03	0.03	0.10	0.10	0.12	0.07	0.15	0.04	0.13	0.06	0.18	0.06	0.05	0.04	0.10	0.08	0.11	0.04	0.05	0.05
C4'	0.18	0.29	0.16	0.14	0.17	0.20	0.17	0.17	0.22	0.17	0.31	0.39	0.21	0.17	0.16	0.18	0.14	0.24	0.16	0.22	0.14	0.14	0.14
C5	0.11	0.14	0.14	0.07	0.12	0.13	0.16	0.12	0.20	0.13	0.16	0.15	0.12	0.18	0.10	0.14	0.06	0.14	0.10	0.25	0.07	0.07	0.07
C5'	0.46	0.28	0.40	0.49	0.38	0.51	0.41	0.51	0.33	0.53	0.30	0.33	0.29	0.52	0.45	0.37	0.49	0.55	0.52	0.34	0.55	0.56	0.55
C6	0.12	0.18	0.16	0.07	0.15	0.13	0.19	0.12	0.26	0.14	0.23	0.18	0.14	0.19	0.12	0.16	0.06	0.13	0.10	0.33	0.08	0.08	0.08
N1	0.09	0.17	0.14	0.06	0.13	0.11	0.17	0.12	0.22	0.14	0.21	0.18	0.13	0.17	0.12	0.14	0.05	0.11	0.09	0.26	0.07	0.07	0.06
N3	0.05	0.04	0.07	0.01	0.12	0.08	0.17	0.11	0.13	0.19	0.07	0.06	0.06	0.21	0.13	0.05	0.02	0.06	0.07	0.13	0.03	0.05	0.03
N4	0.04	0.18	0.04	0.06	0.07	0.10	0.08	0.11	0.04	0.16	0.11	0.25	0.17	0.18	0.05	0.04	0.06	0.11	0.07	0.06	0.02	0.07	0.03
O2	0.10	0.17	0.13	0.04	0.19	0.07	0.21	0.11	0.20	0.21	0.18	0.15	0.18	0.22	0.18	0.12	0.05	0.04	0.07	0.19	0.04	0.06	0.05
O2'	0.14	0.20	0.21	0.11	0.19	0.13	0.25	0.14	0.31	0.23	0.26	0.19	0.16	0.28	0.18	0.19	0.09	0.09	0.14	0.39	0.17	0.19	0.16
O3'	0.12	0.25	0.15	0.07	0.15	0.13	0.14	0.12	0.20	0.09	0.26	0.33	0.19	0.10	0.11	0.16	0.06	0.13	0.09	0.21	0.04	0.03	0.04
O4'	0.15	0.28	0.20	0.09	0.19	0.15	0.18	0.13	0.25	0.12	0.31	0.34	0.22	0.13	0.15	0.22	0.10	0.16	0.10	0.27	0.08	0.09	0.07
O5'	0.11	0.27	0.20	0.18	0.15	0.15	0.14	0.22	0.21	0.08	0.28	0.35	0.21	0.08	0.11	0.20	0.18	0.06	0.23	0.22	0.28	0.29	0.28
OP1	0.10	0.27	0.17	0.10	0.13	0.13	0.12	0.16	0.20	0.10	0.29	0.37	0.18	0.10	0.10	0.21	0.09	0.11	0.15	0.22	0.18	0.16	0.16
OP2	0.22	0.29	0.25	0.16	0.24	0.21	0.23	0.20	0.28	0.23	0.32	0.34	0.24	0.23	0.23	0.30	0.13	0.24	0.18	0.30	0.15	0.13	0.14
P	0.11	0.30	0.18	0.11	0.15	0.13	0.14	0.16	0.23	0.10	0.32	0.39	0.21	0.10	0.11	0.23	0.10	0.11	0.15	0.25	0.16	0.15	0.15

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.13	0.00	0.03	0.05	0.01	0.01	0.02	0.04	0.06	0.09	0.18	0.13	0.04	0.01	0.01	0.05	0.00	0.05	0.02	0.10	0.08	0.05
C2	0.13	0.00	0.06	0.14	0.02	0.24	0.01	0.22	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.08	0.13	0.26	0.15	0.01	0.15	0.06	0.11
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.03	0.01	0.07	0.03	0.06	0.11	0.02	0.13	0.08	0.11	0.04	0.00	0.04	0.01	0.07	0.09	0.12	0.05	0.05
C3'	0.03	0.14	0.00	0.00	0.03	0.00	0.06	0.02	0.04	0.16	0.06	0.23	0.16	0.16	0.03	0.02	0.01	0.02	0.04	0.08	0.13	0.09	0.08
C4	0.05	0.02	0.03	0.03	0.00	0.06	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.03	0.11	0.03	0.01	0.06	0.05	0.02
C4'	0.01	0.24	0.01	0.00	0.06	0.00	0.05	0.00	0.05	0.20	0.14	0.36	0.23	0.17	0.05	0.06	0.03	0.00	0.01	0.06	0.06	0.05	0.03
C5	0.01	0.01	0.07	0.06	0.00	0.05	0.00	0.11	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.07	0.04	0.16	0.01	0.11	0.16	0.15
C5'	0.02	0.22	0.03	0.02	0.03	0.00	0.11	0.00	0.08	0.29	0.12	0.35	0.21	0.27	0.09	0.04	0.09	0.02	0.01	0.14	0.02	0.01	0.02
C6	0.04	0.01	0.06	0.04	0.01	0.05	0.00	0.08	0.00	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.04	0.05	0.10	0.12	0.00	0.13	0.18	0.15
C8	0.06	0.02	0.11	0.16	0.01	0.20	0.01	0.29	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.09	0.14	0.11	0.33	0.03	0.16	0.18	0.23
N1	0.09	0.01	0.02	0.06	0.01	0.14	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.03	0.02	0.02	0.02	0.03	0.05	0.19	0.06	0.01	0.06	0.08	0.05
N2	0.18	0.00	0.13	0.23	0.02	0.36	0.01	0.35	0.02	0.02	0.03	0.00	0.02	0.01	0.06	0.15	0.22	0.35	0.26	0.03	0.24	0.12	0.20
N3	0.13	0.01	0.08	0.16	0.01	0.23	0.01	0.21	0.02	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.04	0.08	0.13	0.26	0.15	0.02	0.19	0.11	0.14
N7	0.04	0.01	0.11	0.16	0.01	0.17	0.00	0.27	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.09	0.15	0.06	0.33	0.03	0.23	0.28	0.29
N9	0.01	0.03	0.04	0.03	0.01	0.05	0.00	0.09	0.01	0.01	0.02	0.06	0.04	0.01	0.00	0.04	0.05	0.01	0.12	0.01	0.04	0.06	0.04
O2'	0.01	0.08	0.00	0.02	0.03	0.06	0.06	0.04	0.04	0.09	0.03	0.15	0.08	0.09	0.04	0.00	0.10	0.03	0.04	0.06	0.12	0.05	0.05
O3'	0.05	0.13	0.04	0.01	0.03	0.03	0.07	0.09	0.05	0.14	0.05	0.22	0.13	0.15	0.05	0.10	0.00	0.05	0.09	0.09	0.24	0.17	0.17
O4'	0.00	0.26	0.01	0.02	0.11	0.00	0.04	0.02	0.10	0.11	0.19	0.35	0.26	0.06	0.01	0.03	0.05	0.00	0.04	0.08	0.10	0.11	0.07
O5'	0.05	0.15	0.07	0.04	0.03	0.01	0.16	0.01	0.12	0.33	0.06	0.26	0.15	0.33	0.12	0.04	0.09	0.04	0.00	0.19	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.01	0.09	0.08	0.01	0.06	0.01	0.14	0.00	0.03	0.01	0.03	0.02	0.03	0.01	0.06	0.09	0.08	0.19	0.00	0.23	0.29	0.25
OP1	0.10	0.15	0.12	0.13	0.06	0.06	0.11	0.02	0.13	0.16	0.06	0.24	0.19	0.23	0.04	0.12	0.24	0.10	0.02	0.23	0.00	0.01	0.00
OP2	0.08	0.06	0.05	0.09	0.05	0.05	0.16	0.01	0.18	0.18	0.08	0.12	0.11	0.28	0.06	0.05	0.17	0.11	0.02	0.29	0.01	0.00	0.00
P	0.05	0.11	0.05	0.08	0.02	0.03	0.15	0.02	0.15	0.23	0.05	0.20	0.14	0.29	0.04	0.05	0.17	0.07	0.01	0.25	0.00	0.00	0.00