Doublet Group distance statistics: 49225

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.002, 0.007, 0.011, 0.012 max_d=0.012 avg_d=0.007 std_dev=0.005
C2	A	0, 0.002, 0.007, 0.012, 0.011 max_d=0.011 avg_d=0.007 std_dev=0.005
N3	A	0, -0.001, 0.004, 0.009, 0.011 max_d=0.011 avg_d=0.004 std_dev=0.005
N1	A	0, 0.002, 0.007, 0.012, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.007 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.001, 0.007, 0.012, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.007 std_dev=0.006
C1'	A	0, 0.002, 0.008, 0.014, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.008 std_dev=0.006
C4	A	0, 0.002, 0.008, 0.015, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.008 std_dev=0.007
N4	A	0, 0.006, 0.021, 0.036, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.021 std_dev=0.015
O2	A	0, 0.002, 0.025, 0.047, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.025 std_dev=0.022
C2'	A	0, 0.021, 0.097, 0.173, 0.185 max_d=0.185 avg_d=0.097 std_dev=0.076
O2'	A	0, 0.001, 0.086, 0.171, 0.201 max_d=0.201 avg_d=0.086 std_dev=0.085
O4'	A	0, 0.006, 0.115, 0.223, 0.261 max_d=0.261 avg_d=0.115 std_dev=0.109
C3'	A	0, 0.065, 0.266, 0.468, 0.487 max_d=0.487 avg_d=0.266 std_dev=0.201
C4'	A	0, 0.060, 0.279, 0.497, 0.533 max_d=0.533 avg_d=0.279 std_dev=0.218
P	B	0, 0.047, 0.271, 0.496, 0.550 max_d=0.550 avg_d=0.271 std_dev=0.224
O3'	A	0, 0.120, 0.428, 0.735, 0.709 max_d=0.709 avg_d=0.428 std_dev=0.307
O5'	B	0, 0.090, 0.411, 0.732, 0.783 max_d=0.783 avg_d=0.411 std_dev=0.321
C5'	A	0, 0.057, 0.397, 0.737, 0.831 max_d=0.831 avg_d=0.397 std_dev=0.340
OP2	B	0, 0.115, 0.495, 0.875, 0.924 max_d=0.924 avg_d=0.495 std_dev=0.380
OP1	B	0, 0.158, 0.544, 0.930, 0.853 max_d=0.853 avg_d=0.544 std_dev=0.386
P	A	0, 0.173, 0.606, 1.039, 0.983 max_d=0.983 avg_d=0.606 std_dev=0.433
OP2	A	0, 0.197, 0.730, 1.263, 1.256 max_d=1.256 avg_d=0.730 std_dev=0.533
O5'	A	0, 0.221, 0.791, 1.362, 1.324 max_d=1.324 avg_d=0.791 std_dev=0.571
C2'	B	0, 0.238, 0.898, 1.557, 1.564 max_d=1.564 avg_d=0.898 std_dev=0.659
O2'	B	0, -0.065, 0.659, 1.383, 1.668 max_d=1.668 avg_d=0.659 std_dev=0.724
C5'	B	0, -0.115, 0.683, 1.481, 1.802 max_d=1.802 avg_d=0.683 std_dev=0.798
C4'	B	0, 0.075, 0.879, 1.682, 1.942 max_d=1.942 avg_d=0.879 std_dev=0.803
OP1	A	0, 0.326, 1.149, 1.972, 1.883 max_d=1.883 avg_d=1.149 std_dev=0.823
C3'	B	0, 0.217, 1.060, 1.903, 2.063 max_d=2.063 avg_d=1.060 std_dev=0.843
C1'	B	0, -0.011, 0.979, 1.968, 2.334 max_d=2.334 avg_d=0.979 std_dev=0.990
O4'	B	0, -0.064, 0.989, 2.043, 2.449 max_d=2.449 avg_d=0.989 std_dev=1.054
O3'	B	0, 0.446, 1.587, 2.727, 2.631 max_d=2.631 avg_d=1.587 std_dev=1.141
N9	B	0, -0.207, 1.201, 2.609, 3.177 max_d=3.177 avg_d=1.201 std_dev=1.408
C8	B	0, -0.291, 1.312, 2.915, 3.569 max_d=3.569 avg_d=1.312 std_dev=1.603
C4	B	0, -0.188, 1.523, 3.234, 3.912 max_d=3.912 avg_d=1.523 std_dev=1.711
N3	B	0, -0.064, 1.647, 3.358, 4.005 max_d=4.005 avg_d=1.647 std_dev=1.711
N7	B	0, -0.309, 1.671, 3.650, 4.452 max_d=4.452 avg_d=1.671 std_dev=1.980
C5	B	0, -0.272, 1.764, 3.800, 4.617 max_d=4.617 avg_d=1.764 std_dev=2.036
C2	B	0, -0.063, 1.981, 4.025, 4.795 max_d=4.795 avg_d=1.981 std_dev=2.044
N2	B	0, 0.029, 2.176, 4.323, 5.098 max_d=5.098 avg_d=2.176 std_dev=2.147
N1	B	0, -0.149, 2.192, 4.532, 5.436 max_d=5.436 avg_d=2.192 std_dev=2.341
C6	B	0, -0.248, 2.124, 4.495, 5.433 max_d=5.433 avg_d=2.124 std_dev=2.371
O6	B	0, -0.277, 2.390, 5.057, 6.112 max_d=6.112 avg_d=2.390 std_dev=2.667

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.12	0.04	0.22	0.16
C2	0.01	0.00	0.03	0.06	0.01	0.03	0.01	0.06	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.03	0.05	0.01	0.23	0.13	0.23	0.19
C2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.03	0.03	0.04	0.00	0.01	0.00	0.05	0.10	0.28	0.14
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.07	0.00	0.06	0.02	0.04	0.04	0.07	0.08	0.06	0.03	0.00	0.00	0.07	0.17	0.29	0.14
C4	0.01	0.01	0.02	0.07	0.00	0.05	0.00	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.08	0.01	0.31	0.26	0.35	0.26
C4'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.05	0.00	0.05	0.01	0.05	0.03	0.04	0.05	0.02	0.04	0.01	0.00	0.02	0.17	0.18	0.08
C5	0.00	0.01	0.02	0.06	0.00	0.05	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.02	0.32	0.28	0.36	0.27
C5'	0.02	0.06	0.02	0.02	0.10	0.01	0.10	0.00	0.09	0.06	0.08	0.11	0.04	0.04	0.02	0.01	0.00	0.17	0.06	0.01
C6	0.00	0.00	0.02	0.04	0.00	0.05	0.00	0.09	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.02	0.29	0.20	0.29	0.23
N1	0.00	0.00	0.01	0.04	0.01	0.03	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.22	0.12	0.24	0.19
N3	0.01	0.00	0.03	0.07	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.07	0.01	0.28	0.20	0.29	0.23
N4	0.02	0.02	0.03	0.08	0.01	0.05	0.01	0.11	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.09	0.02	0.33	0.30	0.39	0.27
O2	0.02	0.01	0.04	0.06	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.05	0.04	0.18	0.07	0.20	0.15
O2'	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.04	0.02	0.01	0.02	0.01	0.04	0.00	0.04	0.04	0.03	0.22	0.32	0.15
O3'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.08	0.01	0.07	0.02	0.05	0.03	0.07	0.09	0.05	0.04	0.00	0.01	0.14	0.34	0.43	0.22
O4'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.04	0.04	0.01	0.00	0.13	0.05	0.18	0.15
O5'	0.12	0.23	0.05	0.07	0.31	0.02	0.32	0.00	0.29	0.22	0.28	0.33	0.18	0.03	0.14	0.13	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.04	0.13	0.10	0.17	0.26	0.17	0.28	0.17	0.20	0.12	0.20	0.30	0.07	0.22	0.34	0.05	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.22	0.23	0.28	0.29	0.35	0.18	0.36	0.06	0.29	0.24	0.29	0.39	0.20	0.32	0.43	0.18	0.02	0.00	0.00	0.00
P	0.16	0.19	0.14	0.14	0.26	0.08	0.27	0.01	0.23	0.19	0.23	0.27	0.15	0.15	0.22	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.30	0.39	0.21	0.31	0.52	0.42	0.67	0.65	0.65	0.74	0.52	0.27	0.36	0.81	0.53	0.62	0.57	0.51	0.05	0.71	0.30	0.26	0.06
C2	0.43	0.58	0.20	0.32	0.70	0.47	0.88	0.69	0.87	0.92	0.73	0.46	0.53	1.02	0.69	0.55	0.56	0.68	0.08	0.94	0.17	0.27	0.05
C2'	0.15	0.19	0.24	0.20	0.33	0.28	0.48	0.55	0.45	0.56	0.32	0.12	0.17	0.62	0.35	0.64	0.47	0.32	0.04	0.51	0.34	0.23	0.09
C3'	0.12	0.13	0.25	0.13	0.13	0.18	0.24	0.47	0.20	0.33	0.12	0.23	0.13	0.37	0.16	0.63	0.37	0.16	0.08	0.24	0.38	0.20	0.12
C4	0.51	0.64	0.16	0.30	0.73	0.51	0.88	0.67	0.87	0.94	0.76	0.54	0.59	1.01	0.73	0.41	0.48	0.79	0.16	0.93	0.10	0.26	0.09
C4'	0.09	0.10	0.18	0.15	0.19	0.26	0.29	0.52	0.25	0.38	0.16	0.15	0.09	0.41	0.22	0.63	0.40	0.23	0.14	0.28	0.38	0.22	0.12
C5	0.46	0.53	0.16	0.30	0.63	0.52	0.74	0.70	0.71	0.82	0.63	0.45	0.51	0.85	0.65	0.42	0.49	0.75	0.05	0.74	0.26	0.27	0.03
C5'	0.11	0.19	0.14	0.09	0.06	0.22	0.08	0.49	0.07	0.18	0.13	0.29	0.17	0.17	0.06	0.60	0.27	0.12	0.18	0.06	0.37	0.24	0.14
C6	0.38	0.44	0.19	0.32	0.55	0.49	0.67	0.70	0.63	0.74	0.54	0.34	0.42	0.78	0.57	0.52	0.55	0.63	0.03	0.67	0.31	0.26	0.06
N1	0.37	0.47	0.20	0.32	0.60	0.46	0.75	0.69	0.72	0.81	0.60	0.36	0.44	0.88	0.60	0.57	0.57	0.61	0.01	0.78	0.27	0.26	0.04
N3	0.50	0.66	0.18	0.31	0.76	0.50	0.94	0.68	0.94	0.98	0.81	0.54	0.60	1.08	0.75	0.48	0.53	0.76	0.15	1.02	0.09	0.26	0.09
N4	0.55	0.70	0.14	0.26	0.77	0.50	0.93	0.60	0.92	0.96	0.82	0.61	0.65	1.04	0.76	0.34	0.43	0.83	0.23	0.98	0.11	0.24	0.16
O2	0.41	0.57	0.21	0.31	0.70	0.45	0.90	0.68	0.90	0.94	0.75	0.44	0.52	1.05	0.68	0.59	0.55	0.64	0.07	0.99	0.16	0.26	0.05
O2'	0.13	0.18	0.22	0.18	0.33	0.26	0.51	0.55	0.48	0.59	0.33	0.11	0.16	0.67	0.35	0.67	0.44	0.30	0.05	0.56	0.32	0.25	0.09
O3'	0.22	0.26	0.27	0.17	0.11	0.09	0.10	0.36	0.09	0.19	0.16	0.40	0.26	0.23	0.07	0.60	0.28	0.06	0.11	0.11	0.41	0.17	0.15
O4'	0.27	0.33	0.21	0.33	0.45	0.44	0.57	0.64	0.54	0.64	0.43	0.22	0.31	0.68	0.47	0.63	0.58	0.47	0.12	0.57	0.33	0.26	0.07
O5'	0.25	0.32	0.29	0.24	0.23	0.18	0.20	0.49	0.23	0.21	0.27	0.38	0.30	0.20	0.20	0.60	0.02	0.17	0.32	0.23	0.45	0.37	0.32
OP1	0.46	0.57	0.33	0.17	0.45	0.42	0.43	0.54	0.47	0.38	0.53	0.65	0.54	0.38	0.42	0.50	0.02	0.43	0.31	0.46	0.25	0.56	0.30
OP2	0.05	0.16	0.05	0.03	0.06	0.26	0.11	0.64	0.08	0.24	0.10	0.26	0.14	0.23	0.11	0.12	0.02	0.17	0.46	0.10	0.11	0.66	0.35
P	0.18	0.30	0.11	0.01	0.17	0.22	0.14	0.49	0.18	0.14	0.24	0.38	0.28	0.14	0.13	0.25	0.00	0.11	0.12	0.18	0.16	0.48	0.13

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.25	0.00	0.23	0.03	0.08	0.72	0.22
C2	0.01	0.00	0.21	0.09	0.01	0.03	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.12	0.26	0.11	0.29	0.01	0.17	0.68	0.23
C2'	0.01	0.21	0.00	0.01	0.09	0.00	0.04	0.19	0.04	0.17	0.13	0.27	0.22	0.14	0.05	0.00	0.02	0.02	0.69	0.05	0.56	0.07	0.38
C3'	0.01	0.09	0.01	0.00	0.12	0.00	0.15	0.01	0.13	0.17	0.12	0.08	0.09	0.18	0.11	0.01	0.00	0.02	0.41	0.14	0.40	0.36	0.16
C4	0.00	0.01	0.09	0.12	0.00	0.01	0.01	0.11	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.10	0.19	0.06	0.32	0.03	0.19	0.69	0.22
C4'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.04	0.06	0.02	0.04	0.03	0.06	0.02	0.24	0.02	0.00	0.01	0.05	0.06	0.62	0.16
C5	0.00	0.01	0.04	0.15	0.01	0.03	0.00	0.14	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.22	0.17	0.03	0.36	0.03	0.29	0.65	0.23
C5'	0.07	0.11	0.19	0.01	0.11	0.01	0.14	0.00	0.15	0.15	0.13	0.10	0.10	0.15	0.11	0.04	0.19	0.01	0.01	0.18	0.10	0.37	0.02
C6	0.01	0.01	0.04	0.13	0.02	0.04	0.02	0.15	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.21	0.19	0.06	0.36	0.01	0.30	0.61	0.23
C8	0.01	0.01	0.17	0.17	0.01	0.06	0.01	0.15	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.29	0.16	0.05	0.39	0.04	0.28	0.68	0.21
N1	0.01	0.00	0.13	0.12	0.01	0.02	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.11	0.22	0.09	0.32	0.01	0.24	0.65	0.24
N2	0.02	0.00	0.27	0.08	0.01	0.04	0.00	0.10	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.21	0.31	0.14	0.26	0.01	0.12	0.68	0.23
N3	0.02	0.00	0.22	0.09	0.01	0.03	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.13	0.26	0.11	0.28	0.02	0.13	0.69	0.22
N7	0.01	0.01	0.14	0.18	0.01	0.06	0.01	0.15	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.31	0.17	0.02	0.39	0.05	0.35	0.62	0.23
N9	0.01	0.01	0.05	0.11	0.00	0.02	0.00	0.11	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.15	0.17	0.01	0.33	0.04	0.17	0.71	0.21
O2'	0.02	0.12	0.00	0.01	0.10	0.24	0.22	0.04	0.21	0.29	0.11	0.21	0.13	0.31	0.15	0.00	0.06	0.15	0.46	0.28	0.51	0.08	0.27
O3'	0.25	0.26	0.02	0.00	0.19	0.02	0.17	0.19	0.19	0.16	0.22	0.31	0.26	0.17	0.17	0.06	0.00	0.18	0.16	0.20	0.29	0.44	0.06
O4'	0.00	0.11	0.02	0.02	0.06	0.00	0.03	0.01	0.06	0.05	0.09	0.14	0.11	0.02	0.01	0.15	0.18	0.00	0.13	0.07	0.34	1.01	0.51
O5'	0.23	0.29	0.69	0.41	0.32	0.01	0.36	0.01	0.36	0.39	0.32	0.26	0.28	0.39	0.33	0.46	0.16	0.13	0.00	0.39	0.00	0.01	0.01
O6	0.03	0.01	0.05	0.14	0.03	0.05	0.03	0.18	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.05	0.04	0.28	0.20	0.07	0.39	0.00	0.33	0.54	0.22
OP1	0.08	0.17	0.56	0.40	0.19	0.06	0.29	0.10	0.30	0.28	0.24	0.12	0.13	0.35	0.17	0.51	0.29	0.34	0.00	0.33	0.00	0.00	0.00
OP2	0.72	0.68	0.07	0.36	0.69	0.62	0.65	0.37	0.61	0.68	0.65	0.68	0.69	0.62	0.71	0.08	0.44	1.01	0.01	0.54	0.00	0.00	0.00
P	0.22	0.23	0.38	0.16	0.22	0.16	0.23	0.02	0.23	0.21	0.24	0.23	0.22	0.23	0.21	0.27	0.06	0.51	0.01	0.22	0.00	0.00	0.00