Doublet Group distance statistics: 49228

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N1	A	0, 0.000, 0.009, 0.017, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.009 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.000, 0.009, 0.018, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.009 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.000, 0.010, 0.020, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.010 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.000, 0.012, 0.024, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.012 std_dev=0.012
C6	A	0, 0.000, 0.012, 0.025, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.012 std_dev=0.012
C5	A	0, 0.000, 0.012, 0.025, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.012 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.000, 0.012, 0.025, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.012 std_dev=0.012
O2	A	0, 0.000, 0.023, 0.046, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.023 std_dev=0.023
N4	A	0, 0.000, 0.032, 0.064, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.032 std_dev=0.032
C2'	A	0, 0.000, 0.225, 0.449, 0.449 max_d=0.449 avg_d=0.225 std_dev=0.225
OP2	B	0, 0.000, 0.287, 0.573, 0.573 max_d=0.573 avg_d=0.287 std_dev=0.287
O5'	B	0, 0.000, 0.287, 0.574, 0.574 max_d=0.574 avg_d=0.287 std_dev=0.287
P	B	0, 0.000, 0.298, 0.595, 0.595 max_d=0.595 avg_d=0.298 std_dev=0.298
O4'	A	0, 0.000, 0.304, 0.607, 0.607 max_d=0.607 avg_d=0.304 std_dev=0.304
C4'	A	0, 0.000, 0.359, 0.718, 0.718 max_d=0.718 avg_d=0.359 std_dev=0.359
C5'	B	0, 0.000, 0.363, 0.725, 0.725 max_d=0.725 avg_d=0.363 std_dev=0.363
C4'	B	0, 0.000, 0.401, 0.802, 0.802 max_d=0.802 avg_d=0.401 std_dev=0.401
O2'	A	0, 0.000, 0.411, 0.822, 0.822 max_d=0.822 avg_d=0.411 std_dev=0.411
C3'	A	0, 0.000, 0.411, 0.822, 0.822 max_d=0.822 avg_d=0.411 std_dev=0.411
OP1	B	0, 0.000, 0.473, 0.945, 0.945 max_d=0.945 avg_d=0.473 std_dev=0.473
O4'	B	0, 0.000, 0.564, 1.127, 1.127 max_d=1.127 avg_d=0.564 std_dev=0.564
C3'	B	0, 0.000, 0.619, 1.239, 1.239 max_d=1.239 avg_d=0.619 std_dev=0.619
O5'	A	0, 0.000, 0.636, 1.272, 1.272 max_d=1.272 avg_d=0.636 std_dev=0.636
O3'	A	0, 0.000, 0.676, 1.352, 1.352 max_d=1.352 avg_d=0.676 std_dev=0.676
C5'	A	0, 0.000, 0.700, 1.401, 1.401 max_d=1.401 avg_d=0.700 std_dev=0.700
C1'	B	0, 0.000, 0.741, 1.482, 1.482 max_d=1.482 avg_d=0.741 std_dev=0.741
C2'	B	0, 0.000, 0.973, 1.946, 1.946 max_d=1.946 avg_d=0.973 std_dev=0.973
P	A	0, 0.000, 0.975, 1.951, 1.951 max_d=1.951 avg_d=0.975 std_dev=0.975
O3'	B	0, 0.000, 1.013, 2.026, 2.026 max_d=2.026 avg_d=1.013 std_dev=1.013
C8	B	0, 0.000, 1.060, 2.119, 2.119 max_d=2.119 avg_d=1.060 std_dev=1.060
OP2	A	0, 0.000, 1.068, 2.135, 2.135 max_d=2.135 avg_d=1.068 std_dev=1.068
OP1	A	0, 0.000, 1.197, 2.393, 2.393 max_d=2.393 avg_d=1.197 std_dev=1.197
N9	B	0, 0.000, 1.325, 2.651, 2.651 max_d=2.651 avg_d=1.325 std_dev=1.325
O2'	B	0, 0.000, 1.436, 2.872, 2.872 max_d=2.872 avg_d=1.436 std_dev=1.436
N7	B	0, 0.000, 1.739, 3.479, 3.479 max_d=3.479 avg_d=1.739 std_dev=1.739
C4	B	0, 0.000, 2.432, 4.863, 4.863 max_d=4.863 avg_d=2.432 std_dev=2.432
C5	B	0, 0.000, 2.632, 5.265, 5.265 max_d=5.265 avg_d=2.632 std_dev=2.632
N3	B	0, 0.000, 3.213, 6.427, 6.427 max_d=6.427 avg_d=3.213 std_dev=3.213
C6	B	0, 0.000, 3.743, 7.486, 7.486 max_d=7.486 avg_d=3.743 std_dev=3.743
O6	B	0, 0.000, 4.093, 8.186, 8.186 max_d=8.186 avg_d=4.093 std_dev=4.093
C2	B	0, 0.000, 4.269, 8.539, 8.539 max_d=8.539 avg_d=4.269 std_dev=4.269
N1	B	0, 0.000, 4.522, 9.043, 9.043 max_d=9.043 avg_d=4.522 std_dev=4.522
N2	B	0, 0.000, 5.190, 10.380, 10.380 max_d=10.380 avg_d=5.190 std_dev=5.190

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.06	0.00	0.03	0.03	0.08	0.04
C2	0.01	0.00	0.08	0.03	0.00	0.01	0.01	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.17	0.10	0.03	0.04	0.04	0.14	0.06
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.05	0.01	0.00	0.03	0.02	0.02	0.07	0.05	0.11	0.00	0.00	0.02	0.06	0.07	0.13	0.08
C3'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.03	0.00	0.09	0.01	0.11	0.03	0.02	0.02	0.08	0.00	0.00	0.00	0.03	0.00	0.02	0.02
C4	0.00	0.00	0.05	0.03	0.00	0.02	0.01	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.14	0.01	0.01	0.00	0.02	0.08	0.03
C4'	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.05	0.03	0.01	0.02	0.00	0.05	0.03	0.00	0.00	0.01	0.03	0.00
C5	0.01	0.01	0.00	0.09	0.01	0.04	0.00	0.10	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.10	0.04	0.05	0.05	0.03	0.05
C5'	0.02	0.05	0.03	0.01	0.07	0.00	0.10	0.00	0.11	0.07	0.06	0.07	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.02	0.01
C6	0.01	0.00	0.02	0.11	0.00	0.05	0.00	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.10	0.05	0.07	0.06	0.05	0.06
N1	0.00	0.00	0.02	0.03	0.00	0.03	0.01	0.07	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.07	0.01	0.00	0.00	0.00	0.06	0.01
N3	0.01	0.00	0.07	0.02	0.00	0.01	0.01	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.18	0.06	0.02	0.03	0.05	0.14	0.06
N4	0.00	0.00	0.05	0.02	0.00	0.02	0.01	0.07	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.15	0.02	0.02	0.01	0.04	0.10	0.04
O2	0.02	0.00	0.11	0.08	0.00	0.00	0.01	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.22	0.19	0.07	0.06	0.07	0.18	0.08
O2'	0.00	0.17	0.00	0.00	0.14	0.05	0.07	0.01	0.03	0.07	0.18	0.15	0.22	0.00	0.03	0.05	0.04	0.04	0.16	0.07
O3'	0.06	0.10	0.00	0.00	0.01	0.03	0.10	0.01	0.10	0.01	0.06	0.02	0.19	0.03	0.00	0.05	0.12	0.13	0.14	0.14
O4'	0.00	0.03	0.02	0.00	0.01	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.02	0.02	0.07	0.05	0.05	0.00	0.08	0.05	0.11	0.07
O5'	0.03	0.04	0.06	0.03	0.00	0.00	0.05	0.00	0.07	0.00	0.03	0.01	0.06	0.04	0.12	0.08	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.03	0.04	0.07	0.00	0.02	0.01	0.05	0.02	0.06	0.00	0.05	0.04	0.07	0.04	0.13	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.08	0.14	0.13	0.02	0.08	0.03	0.03	0.02	0.05	0.06	0.14	0.10	0.18	0.16	0.14	0.11	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.04	0.06	0.08	0.02	0.03	0.00	0.05	0.01	0.06	0.01	0.06	0.04	0.08	0.07	0.14	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.50	2.57	0.34	0.17	1.61	0.19	1.61	0.10	2.10	0.60	2.54	2.95	2.09	1.02	0.91	0.14	0.00	0.38	0.00	2.09	0.29	0.12	0.15
C2	0.44	2.66	0.10	0.11	1.69	0.17	1.82	0.08	2.43	0.65	2.82	2.95	2.09	1.17	0.92	0.45	0.02	0.38	0.01	2.50	0.25	0.11	0.14
C2'	0.42	2.32	0.33	0.16	1.47	0.13	1.52	0.06	1.99	0.60	2.36	2.66	1.87	1.01	0.84	0.07	0.04	0.29	0.02	2.03	0.30	0.09	0.16
C3'	0.27	1.92	0.30	0.06	1.17	0.00	1.19	0.05	1.59	0.41	1.92	2.24	1.54	0.75	0.63	0.02	0.05	0.13	0.13	1.61	0.38	0.17	0.25
C4	0.35	2.15	0.11	0.04	1.51	0.14	1.74	0.06	2.22	0.68	2.38	2.25	1.71	1.23	0.85	0.59	0.03	0.35	0.01	2.33	0.22	0.12	0.13
C4'	0.36	1.89	0.42	0.15	1.16	0.12	1.12	0.07	1.46	0.39	1.81	2.21	1.57	0.68	0.65	0.12	0.03	0.24	0.05	1.44	0.27	0.13	0.16
C5	0.38	1.97	0.07	0.03	1.49	0.14	1.63	0.05	1.96	0.71	2.11	2.02	1.65	1.17	0.89	0.53	0.07	0.36	0.02	1.98	0.29	0.16	0.17
C5'	0.18	1.25	0.35	0.09	0.76	0.06	0.71	0.04	0.95	0.20	1.19	1.47	1.06	0.40	0.39	0.16	0.06	0.10	0.10	0.93	0.23	0.16	0.17
C6	0.46	2.21	0.14	0.09	1.58	0.16	1.61	0.07	1.98	0.67	2.24	2.32	1.87	1.09	0.93	0.39	0.08	0.38	0.02	1.95	0.32	0.15	0.18
N1	0.47	2.55	0.19	0.12	1.66	0.18	1.71	0.09	2.21	0.65	2.60	2.80	2.07	1.11	0.94	0.34	0.04	0.38	0.00	2.21	0.29	0.13	0.16
N3	0.39	2.48	0.03	0.07	1.62	0.16	1.82	0.08	2.43	0.66	2.71	2.68	1.93	1.22	0.88	0.56	0.02	0.37	0.02	2.56	0.21	0.10	0.12
N4	0.28	1.88	0.21	0.01	1.33	0.13	1.62	0.06	2.08	0.66	2.15	1.96	1.47	1.21	0.75	0.63	0.01	0.33	0.03	2.27	0.13	0.07	0.07
O2	0.44	2.81	0.13	0.12	1.71	0.17	1.84	0.09	2.51	0.62	2.97	3.20	2.17	1.16	0.92	0.42	0.01	0.38	0.01	2.61	0.24	0.10	0.13
O2'	0.45	2.54	0.33	0.17	1.58	0.14	1.67	0.09	2.22	0.66	2.62	2.94	2.01	1.12	0.90	0.09	0.03	0.32	0.03	2.30	0.25	0.01	0.10
O3'	0.21	1.90	0.28	0.02	1.12	0.12	1.17	0.17	1.59	0.38	1.92	2.26	1.49	0.73	0.57	0.07	0.14	0.02	0.23	1.64	0.50	0.23	0.34
O4'	0.55	2.31	0.49	0.26	1.47	0.29	1.40	0.20	1.78	0.54	2.19	2.66	1.96	0.87	0.87	0.01	0.04	0.44	0.07	1.73	0.18	0.06	0.07
O5'	0.15	1.12	0.28	0.09	0.74	0.02	0.75	0.02	0.96	0.28	1.12	1.26	0.94	0.49	0.41	0.10	0.01	0.06	0.08	0.96	0.20	0.10	0.14
OP1	0.15	0.16	0.19	0.01	0.08	0.11	0.13	0.01	0.20	0.01	0.21	0.18	0.09	0.09	0.01	0.31	0.01	0.22	0.08	0.24	0.04	0.03	0.06
OP2	0.21	0.37	0.05	0.15	0.23	0.32	0.35	0.18	0.48	0.12	0.48	0.38	0.23	0.29	0.06	0.01	0.02	0.32	0.18	0.55	0.11	0.02	0.12
P	0.11	0.42	0.12	0.02	0.26	0.12	0.32	0.02	0.43	0.10	0.47	0.45	0.30	0.23	0.10	0.13	0.01	0.17	0.10	0.47	0.07	0.04	0.08

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.06	0.01	0.01	0.02	0.04	0.03	0.01	0.00	0.01	0.20	0.00	0.05	0.00	0.04	0.03	0.03
C2	0.03	0.00	0.46	0.34	0.00	0.14	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.36	0.04	0.42	0.24	0.00	0.49	0.89	0.48
C2'	0.00	0.46	0.00	0.00	0.23	0.01	0.11	0.20	0.21	0.23	0.36	0.55	0.45	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.40	0.16	0.34	0.42	0.41
C3'	0.01	0.34	0.00	0.00	0.27	0.00	0.29	0.03	0.35	0.14	0.37	0.34	0.28	0.23	0.16	0.01	0.01	0.01	0.15	0.37	0.14	0.12	0.15
C4	0.02	0.00	0.23	0.27	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.00	0.21	0.26	0.00	0.41	0.69	0.42
C4'	0.00	0.14	0.01	0.00	0.00	0.00	0.11	0.01	0.07	0.26	0.05	0.23	0.15	0.24	0.09	0.17	0.01	0.00	0.01	0.12	0.06	0.02	0.03
C5	0.01	0.00	0.11	0.29	0.00	0.11	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.13	0.05	0.07	0.42	0.01	0.63	0.93	0.64
C5'	0.06	0.14	0.20	0.03	0.01	0.01	0.13	0.00	0.10	0.28	0.03	0.23	0.16	0.28	0.06	0.04	0.11	0.01	0.00	0.18	0.02	0.01	0.01
C6	0.01	0.00	0.21	0.35	0.00	0.07	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.10	0.15	0.46	0.00	0.75	1.14	0.75
C8	0.01	0.00	0.23	0.14	0.00	0.26	0.00	0.28	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.45	0.03	0.26	0.39	0.02	0.42	0.49	0.44
N1	0.02	0.00	0.36	0.37	0.00	0.05	0.01	0.03	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.18	0.09	0.31	0.37	0.00	0.67	1.08	0.65
N2	0.04	0.00	0.55	0.34	0.00	0.23	0.01	0.23	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.52	0.04	0.51	0.18	0.01	0.44	0.88	0.43
N3	0.03	0.00	0.45	0.28	0.00	0.15	0.00	0.16	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.36	0.01	0.41	0.16	0.00	0.34	0.67	0.34
N7	0.01	0.01	0.11	0.23	0.00	0.24	0.00	0.28	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.38	0.04	0.15	0.50	0.02	0.64	0.84	0.67
N9	0.00	0.00	0.01	0.16	0.00	0.09	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.15	0.06	0.01	0.20	0.01	0.26	0.39	0.27
O2'	0.01	0.36	0.00	0.01	0.06	0.17	0.13	0.04	0.03	0.45	0.18	0.52	0.36	0.38	0.15	0.00	0.06	0.16	0.38	0.11	0.39	0.63	0.48
O3'	0.20	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.11	0.10	0.03	0.09	0.04	0.01	0.04	0.06	0.06	0.00	0.14	0.05	0.13	0.03	0.05	0.02
O4'	0.00	0.42	0.01	0.01	0.21	0.00	0.07	0.01	0.15	0.26	0.31	0.51	0.41	0.15	0.01	0.16	0.14	0.00	0.09	0.09	0.03	0.15	0.09
O5'	0.05	0.24	0.40	0.15	0.26	0.01	0.42	0.00	0.46	0.39	0.37	0.18	0.16	0.50	0.20	0.38	0.05	0.09	0.00	0.54	0.00	0.01	0.00
O6	0.00	0.00	0.16	0.37	0.00	0.12	0.01	0.18	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.11	0.13	0.09	0.54	0.00	0.88	1.28	0.87
OP1	0.04	0.49	0.34	0.14	0.41	0.06	0.63	0.02	0.75	0.42	0.67	0.44	0.34	0.64	0.26	0.39	0.03	0.03	0.00	0.88	0.00	0.00	0.00
OP2	0.03	0.89	0.42	0.12	0.69	0.02	0.93	0.01	1.14	0.49	1.08	0.88	0.67	0.84	0.39	0.63	0.05	0.15	0.01	1.28	0.00	0.00	0.00
P	0.03	0.48	0.41	0.15	0.42	0.03	0.64	0.01	0.75	0.44	0.65	0.43	0.34	0.67	0.27	0.48	0.02	0.09	0.00	0.87	0.00	0.00	0.00