Doublet Group distance statistics: 49229

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.000, 0.002, 0.003, 0.003 max_d=0.003 avg_d=0.002 std_dev=0.002
N3	A	0, 0.000, 0.004, 0.007, 0.007 max_d=0.007 avg_d=0.004 std_dev=0.004
N1	A	0, 0.000, 0.012, 0.025, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.012 std_dev=0.012
C6	A	0, 0.000, 0.016, 0.033, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.016 std_dev=0.016
C4	A	0, 0.000, 0.018, 0.035, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.018 std_dev=0.018
C1'	A	0, 0.000, 0.018, 0.037, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.018 std_dev=0.018
C2	A	0, 0.000, 0.020, 0.040, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.020 std_dev=0.020
O2	A	0, 0.000, 0.041, 0.081, 0.081 max_d=0.081 avg_d=0.041 std_dev=0.041
N4	A	0, 0.000, 0.060, 0.119, 0.119 max_d=0.119 avg_d=0.060 std_dev=0.060
N9	B	0, 0.000, 0.353, 0.707, 0.707 max_d=0.707 avg_d=0.353 std_dev=0.353
O4'	A	0, 0.000, 0.365, 0.730, 0.730 max_d=0.730 avg_d=0.365 std_dev=0.365
C1'	B	0, 0.000, 0.477, 0.954, 0.954 max_d=0.954 avg_d=0.477 std_dev=0.477
C2'	A	0, 0.000, 0.479, 0.958, 0.958 max_d=0.958 avg_d=0.479 std_dev=0.479
C5	B	0, 0.000, 0.481, 0.962, 0.962 max_d=0.962 avg_d=0.481 std_dev=0.481
O4'	B	0, 0.000, 0.520, 1.039, 1.039 max_d=1.039 avg_d=0.520 std_dev=0.520
C3'	A	0, 0.000, 0.589, 1.177, 1.177 max_d=1.177 avg_d=0.589 std_dev=0.589
P	B	0, 0.000, 0.596, 1.192, 1.192 max_d=1.192 avg_d=0.596 std_dev=0.596
C4'	A	0, 0.000, 0.640, 1.280, 1.280 max_d=1.280 avg_d=0.640 std_dev=0.640
C5'	B	0, 0.000, 0.649, 1.299, 1.299 max_d=1.299 avg_d=0.649 std_dev=0.649
O5'	B	0, 0.000, 0.657, 1.313, 1.313 max_d=1.313 avg_d=0.657 std_dev=0.657
O6	B	0, 0.000, 0.696, 1.391, 1.391 max_d=1.391 avg_d=0.696 std_dev=0.696
OP2	B	0, 0.000, 0.701, 1.402, 1.402 max_d=1.402 avg_d=0.701 std_dev=0.701
C2'	B	0, 0.000, 0.707, 1.414, 1.414 max_d=1.414 avg_d=0.707 std_dev=0.707
C4'	B	0, 0.000, 0.722, 1.445, 1.445 max_d=1.445 avg_d=0.722 std_dev=0.722
OP1	B	0, 0.000, 0.738, 1.475, 1.475 max_d=1.475 avg_d=0.738 std_dev=0.738
O2'	B	0, 0.000, 0.789, 1.577, 1.577 max_d=1.577 avg_d=0.789 std_dev=0.789
O3'	A	0, 0.000, 0.810, 1.620, 1.620 max_d=1.620 avg_d=0.810 std_dev=0.810
C3'	B	0, 0.000, 0.876, 1.752, 1.752 max_d=1.752 avg_d=0.876 std_dev=0.876
O2'	A	0, 0.000, 0.930, 1.860, 1.860 max_d=1.860 avg_d=0.930 std_dev=0.930
C4	B	0, 0.000, 1.086, 2.171, 2.171 max_d=2.171 avg_d=1.086 std_dev=1.086
N7	B	0, 0.000, 1.090, 2.180, 2.180 max_d=2.180 avg_d=1.090 std_dev=1.090
C6	B	0, 0.000, 1.100, 2.200, 2.200 max_d=2.200 avg_d=1.100 std_dev=1.100
O3'	B	0, 0.000, 1.105, 2.210, 2.210 max_d=2.210 avg_d=1.105 std_dev=1.105
C5'	A	0, 0.000, 1.131, 2.263, 2.263 max_d=2.263 avg_d=1.131 std_dev=1.131
C8	B	0, 0.000, 1.183, 2.366, 2.366 max_d=2.366 avg_d=1.183 std_dev=1.183
O5'	A	0, 0.000, 1.235, 2.470, 2.470 max_d=2.470 avg_d=1.235 std_dev=1.235
P	A	0, 0.000, 1.760, 3.519, 3.519 max_d=3.519 avg_d=1.760 std_dev=1.760
OP1	A	0, 0.000, 1.764, 3.528, 3.528 max_d=3.528 avg_d=1.764 std_dev=1.764
OP2	A	0, 0.000, 2.359, 4.719, 4.719 max_d=4.719 avg_d=2.359 std_dev=2.359
N3	B	0, 0.000, 2.380, 4.760, 4.760 max_d=4.760 avg_d=2.380 std_dev=2.380
N1	B	0, 0.000, 2.443, 4.886, 4.886 max_d=4.886 avg_d=2.443 std_dev=2.443
C2	B	0, 0.000, 3.036, 6.072, 6.072 max_d=6.072 avg_d=3.036 std_dev=3.036
N2	B	0, 0.000, 4.362, 8.725, 8.725 max_d=8.725 avg_d=4.362 std_dev=4.362

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.16	0.00	0.10	0.04	0.57	0.22
C2	0.01	0.00	0.14	0.14	0.00	0.00	0.00	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.10	0.04	0.19	0.08	0.80	0.38
C2'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.01	0.01	0.08	0.02	0.11	0.01	0.10	0.00	0.25	0.00	0.00	0.03	0.07	0.09	0.43	0.14
C3'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.18	0.00	0.17	0.03	0.15	0.12	0.16	0.19	0.11	0.02	0.00	0.02	0.03	0.19	0.03	0.06
C4	0.01	0.00	0.01	0.18	0.00	0.06	0.00	0.19	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.20	0.00	0.01	0.14	0.28	0.96	0.49
C4'	0.01	0.00	0.01	0.00	0.06	0.00	0.10	0.00	0.10	0.04	0.02	0.07	0.05	0.16	0.01	0.00	0.00	0.18	0.11	0.03
C5	0.00	0.00	0.08	0.17	0.00	0.10	0.00	0.24	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.25	0.04	0.05	0.07	0.33	0.95	0.48
C5'	0.02	0.07	0.02	0.03	0.19	0.00	0.24	0.00	0.23	0.11	0.11	0.21	0.01	0.11	0.11	0.03	0.00	0.11	0.10	0.01
C6	0.00	0.01	0.11	0.15	0.00	0.10	0.00	0.23	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.22	0.03	0.07	0.06	0.26	0.86	0.41
N1	0.00	0.01	0.01	0.12	0.00	0.04	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.11	0.06	0.00	0.13	0.11	0.77	0.35
N3	0.01	0.00	0.10	0.16	0.00	0.02	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.11	0.06	0.03	0.19	0.18	0.90	0.46
N4	0.01	0.00	0.00	0.19	0.00	0.07	0.00	0.21	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.23	0.01	0.01	0.14	0.33	1.00	0.53
O2	0.02	0.00	0.25	0.11	0.00	0.05	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.14	0.17	0.07	0.23	0.03	0.71	0.33
O2'	0.02	0.03	0.00	0.02	0.20	0.16	0.25	0.11	0.22	0.11	0.11	0.23	0.14	0.00	0.04	0.11	0.17	0.50	0.16	0.19
O3'	0.16	0.10	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.11	0.03	0.06	0.06	0.01	0.17	0.04	0.00	0.06	0.18	0.66	0.39	0.42
O4'	0.00	0.04	0.03	0.02	0.01	0.00	0.05	0.03	0.07	0.00	0.03	0.01	0.07	0.11	0.06	0.00	0.12	0.04	0.56	0.25
O5'	0.10	0.19	0.07	0.03	0.14	0.00	0.07	0.00	0.06	0.13	0.19	0.14	0.23	0.17	0.18	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00
OP1	0.04	0.08	0.09	0.19	0.28	0.18	0.33	0.11	0.26	0.11	0.18	0.33	0.03	0.50	0.66	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00
OP2	0.57	0.80	0.43	0.03	0.96	0.11	0.95	0.10	0.86	0.77	0.90	1.00	0.71	0.16	0.39	0.56	0.00	0.00	0.00	0.00
P	0.22	0.38	0.14	0.06	0.49	0.03	0.48	0.01	0.41	0.35	0.46	0.53	0.33	0.19	0.42	0.25	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.15	0.05	0.23	0.34	0.08	0.29	0.08	0.31	0.02	0.18	0.07	0.10	0.03	0.15	0.14	0.17	0.37	0.21	0.24	0.06	0.20	0.21	0.21
C2	0.07	0.59	0.12	0.22	0.16	0.19	0.08	0.22	0.33	0.29	0.60	0.75	0.39	0.25	0.07	0.07	0.23	0.13	0.12	0.30	0.10	0.08	0.11
C2'	0.11	0.01	0.16	0.26	0.04	0.23	0.01	0.25	0.05	0.07	0.05	0.02	0.03	0.03	0.08	0.13	0.29	0.17	0.16	0.10	0.10	0.11	0.11
C3'	0.29	0.29	0.39	0.56	0.24	0.52	0.14	0.59	0.10	0.14	0.20	0.33	0.31	0.08	0.23	0.33	0.61	0.39	0.53	0.02	0.56	0.57	0.55
C4	0.09	0.29	0.13	0.22	0.10	0.22	0.12	0.23	0.25	0.12	0.32	0.32	0.18	0.03	0.05	0.12	0.25	0.16	0.09	0.26	0.02	0.05	0.03
C4'	0.19	0.26	0.30	0.48	0.17	0.43	0.07	0.50	0.07	0.04	0.19	0.33	0.25	0.01	0.14	0.22	0.53	0.29	0.47	0.05	0.50	0.51	0.49
C5	0.16	0.30	0.23	0.34	0.16	0.32	0.00	0.33	0.02	0.09	0.20	0.36	0.29	0.18	0.09	0.21	0.38	0.24	0.24	0.12	0.12	0.05	0.13
C5'	0.32	0.62	0.45	0.68	0.34	0.63	0.16	0.73	0.22	0.02	0.50	0.80	0.55	0.07	0.23	0.37	0.76	0.45	0.71	0.02	0.79	0.77	0.75
C6	0.17	0.31	0.25	0.37	0.18	0.33	0.06	0.34	0.08	0.02	0.23	0.37	0.29	0.09	0.12	0.21	0.40	0.24	0.27	0.06	0.18	0.16	0.19
N1	0.13	0.11	0.20	0.31	0.03	0.27	0.02	0.30	0.10	0.15	0.16	0.16	0.03	0.11	0.11	0.15	0.33	0.19	0.21	0.16	0.16	0.15	0.17
N3	0.04	0.70	0.08	0.17	0.24	0.15	0.15	0.19	0.41	0.29	0.69	0.85	0.50	0.23	0.04	0.05	0.18	0.10	0.06	0.34	0.03	0.01	0.04
N4	0.06	0.35	0.09	0.15	0.17	0.17	0.18	0.17	0.28	0.09	0.36	0.39	0.26	0.01	0.00	0.10	0.18	0.13	0.03	0.26	0.08	0.19	0.09
O2	0.04	0.84	0.08	0.18	0.24	0.15	0.10	0.19	0.41	0.38	0.81	1.10	0.58	0.34	0.06	0.02	0.18	0.09	0.09	0.33	0.09	0.09	0.10
O2'	0.04	0.22	0.01	0.05	0.07	0.03	0.01	0.06	0.07	0.09	0.18	0.30	0.17	0.11	0.01	0.02	0.06	0.05	0.14	0.02	0.20	0.15	0.19
O3'	0.12	0.01	0.24	0.43	0.04	0.36	0.02	0.46	0.08	0.04	0.05	0.02	0.06	0.01	0.07	0.16	0.48	0.21	0.42	0.17	0.54	0.54	0.50
O4'	0.16	0.19	0.26	0.41	0.14	0.35	0.07	0.40	0.05	0.06	0.13	0.22	0.19	0.01	0.12	0.18	0.45	0.23	0.36	0.05	0.35	0.35	0.34
O5'	0.05	0.35	0.09	0.32	0.00	0.26	0.16	0.36	0.07	0.34	0.25	0.56	0.23	0.41	0.12	0.01	0.39	0.08	0.36	0.24	0.44	0.42	0.40
OP1	0.41	0.18	0.36	0.16	0.28	0.14	0.45	0.06	0.26	0.74	0.10	0.45	0.00	0.77	0.47	0.43	0.11	0.25	0.08	0.38	0.13	0.11	0.10
OP2	1.06	0.23	0.94	0.67	0.91	0.69	1.18	0.55	0.92	1.56	0.38	0.19	0.49	1.63	1.18	1.02	0.58	0.88	0.54	1.11	0.40	0.45	0.45
P	0.56	0.07	0.46	0.22	0.44	0.24	0.64	0.12	0.45	0.93	0.03	0.39	0.12	0.99	0.64	0.54	0.15	0.40	0.12	0.62	0.06	0.08	0.08

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00	0.03	0.00	0.02	0.02	0.04	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.11	0.01	0.20	0.25	0.17
C2	0.03	0.00	0.45	0.79	0.00	0.39	0.00	0.55	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.12	0.80	0.02	0.73	0.01	1.08	0.97	0.91
C2'	0.00	0.45	0.00	0.00	0.22	0.01	0.09	0.01	0.19	0.22	0.34	0.55	0.45	0.12	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.14	0.15	0.17	0.10
C3'	0.00	0.79	0.00	0.00	0.36	0.01	0.17	0.00	0.34	0.34	0.61	0.98	0.74	0.18	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.26	0.07	0.02	0.00
C4	0.02	0.00	0.22	0.36	0.00	0.18	0.00	0.21	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.34	0.00	0.21	0.01	0.21	0.11	0.17
C4'	0.01	0.39	0.01	0.01	0.18	0.00	0.09	0.00	0.18	0.17	0.31	0.48	0.37	0.09	0.01	0.05	0.02	0.00	0.01	0.14	0.05	0.02	0.00
C5	0.00	0.00	0.09	0.17	0.00	0.09	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.17	0.01	0.00	0.02	0.11	0.20	0.11
C5'	0.03	0.55	0.01	0.00	0.21	0.00	0.07	0.00	0.21	0.32	0.42	0.71	0.49	0.22	0.05	0.04	0.05	0.01	0.01	0.14	0.04	0.03	0.02
C6	0.00	0.00	0.19	0.34	0.01	0.18	0.01	0.21	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.05	0.35	0.02	0.21	0.00	0.23	0.16	0.19
C8	0.02	0.00	0.22	0.34	0.00	0.17	0.00	0.32	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.31	0.03	0.56	0.03	0.91	0.98	0.81
N1	0.02	0.00	0.34	0.61	0.01	0.31	0.01	0.42	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.09	0.62	0.00	0.54	0.01	0.78	0.73	0.66
N2	0.04	0.00	0.55	0.98	0.00	0.48	0.00	0.71	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.15	1.03	0.03	0.95	0.01	1.56	1.38	1.28
N3	0.04	0.00	0.45	0.74	0.00	0.37	0.00	0.49	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.11	0.71	0.02	0.62	0.00	0.85	0.71	0.72
N7	0.01	0.00	0.12	0.18	0.00	0.09	0.00	0.22	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.17	0.02	0.42	0.03	0.76	0.88	0.68
N9	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.05	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.17	0.02	0.31	0.37	0.27
O2'	0.01	0.12	0.00	0.01	0.05	0.05	0.02	0.04	0.05	0.06	0.09	0.15	0.11	0.04	0.00	0.00	0.02	0.02	0.01	0.04	0.07	0.13	0.04
O3'	0.01	0.80	0.01	0.01	0.34	0.02	0.17	0.05	0.35	0.31	0.62	1.03	0.71	0.17	0.01	0.02	0.00	0.02	0.14	0.27	0.08	0.09	0.12
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.03	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.00	0.10	0.02	0.13	0.15	0.10
O5'	0.11	0.73	0.02	0.07	0.21	0.01	0.00	0.01	0.21	0.56	0.54	0.95	0.62	0.42	0.17	0.01	0.14	0.10	0.00	0.11	0.01	0.01	0.00
O6	0.01	0.01	0.14	0.26	0.01	0.14	0.02	0.14	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.04	0.27	0.02	0.11	0.00	0.06	0.01	0.04
OP1	0.20	1.08	0.15	0.07	0.21	0.05	0.11	0.04	0.23	0.91	0.78	1.56	0.85	0.76	0.31	0.07	0.08	0.13	0.01	0.06	0.00	0.00	0.01
OP2	0.25	0.97	0.17	0.02	0.11	0.02	0.20	0.03	0.16	0.98	0.73	1.38	0.71	0.88	0.37	0.13	0.09	0.15	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.17	0.91	0.10	0.00	0.17	0.00	0.11	0.02	0.19	0.81	0.66	1.28	0.72	0.68	0.27	0.04	0.12	0.10	0.00	0.04	0.01	0.00	0.00