Doublet Group distance statistics: 49234

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 5, 5, 3, 1, 7, 4, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.002, 0.008, 0.014, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.008 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.001, 0.009, 0.017, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.009 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.006, 0.017, 0.028, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.017 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.014, 0.026, 0.037, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.026 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.015, 0.026, 0.038, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.026 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.014, 0.027, 0.040, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.027 std_dev=0.013
C6	A	0, 0.011, 0.025, 0.040, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.025 std_dev=0.014
O2	A	0, 0.034, 0.066, 0.098, 0.144 max_d=0.144 avg_d=0.066 std_dev=0.032
N4	A	0, 0.048, 0.089, 0.130, 0.176 max_d=0.176 avg_d=0.089 std_dev=0.041
O4'	A	0, 0.030, 0.187, 0.343, 0.449 max_d=0.449 avg_d=0.187 std_dev=0.157
O5'	B	0, 0.221, 0.397, 0.574, 0.787 max_d=0.787 avg_d=0.397 std_dev=0.176
C2'	A	0, 0.036, 0.224, 0.411, 0.600 max_d=0.600 avg_d=0.224 std_dev=0.188
P	B	0, 0.268, 0.475, 0.681, 0.797 max_d=0.797 avg_d=0.475 std_dev=0.207
C3'	B	0, 0.199, 0.408, 0.617, 0.810 max_d=0.810 avg_d=0.408 std_dev=0.209
C5'	B	0, 0.241, 0.456, 0.671, 1.001 max_d=1.001 avg_d=0.456 std_dev=0.215
C4'	B	0, 0.232, 0.460, 0.688, 1.005 max_d=1.005 avg_d=0.460 std_dev=0.228
O4'	B	0, 0.236, 0.466, 0.697, 0.960 max_d=0.960 avg_d=0.466 std_dev=0.231
N1	B	0, 0.212, 0.447, 0.681, 1.024 max_d=1.024 avg_d=0.447 std_dev=0.234
C6	B	0, 0.206, 0.456, 0.706, 1.062 max_d=1.062 avg_d=0.456 std_dev=0.250
C1'	B	0, 0.222, 0.479, 0.735, 1.069 max_d=1.069 avg_d=0.479 std_dev=0.256
O3'	B	0, 0.241, 0.501, 0.762, 1.053 max_d=1.053 avg_d=0.501 std_dev=0.260
OP1	B	0, 0.283, 0.546, 0.808, 1.127 max_d=1.127 avg_d=0.546 std_dev=0.262
C2'	B	0, 0.210, 0.481, 0.752, 1.055 max_d=1.055 avg_d=0.481 std_dev=0.271
C4	B	0, 0.294, 0.570, 0.845, 1.257 max_d=1.257 avg_d=0.570 std_dev=0.275
O5'	A	0, 0.138, 0.417, 0.696, 0.947 max_d=0.947 avg_d=0.417 std_dev=0.279
C5	B	0, 0.239, 0.520, 0.801, 1.230 max_d=1.230 avg_d=0.520 std_dev=0.281
OP2	A	0, 0.229, 0.523, 0.817, 1.080 max_d=1.080 avg_d=0.523 std_dev=0.294
P	A	0, 0.182, 0.477, 0.773, 1.003 max_d=1.003 avg_d=0.477 std_dev=0.295
OP2	B	0, 0.243, 0.553, 0.863, 1.518 max_d=1.518 avg_d=0.553 std_dev=0.310
C5'	A	0, 0.083, 0.409, 0.734, 0.927 max_d=0.927 avg_d=0.409 std_dev=0.325
N4	B	0, 0.367, 0.700, 1.034, 1.479 max_d=1.479 avg_d=0.700 std_dev=0.333
C2	B	0, 0.302, 0.642, 0.982, 1.431 max_d=1.431 avg_d=0.642 std_dev=0.340
C4'	A	0, 0.017, 0.361, 0.704, 0.948 max_d=0.948 avg_d=0.361 std_dev=0.344
N3	B	0, 0.336, 0.683, 1.030, 1.524 max_d=1.524 avg_d=0.683 std_dev=0.347
O2'	B	0, 0.266, 0.642, 1.017, 1.519 max_d=1.519 avg_d=0.642 std_dev=0.376
OP1	A	0, 0.239, 0.627, 1.015, 1.290 max_d=1.290 avg_d=0.627 std_dev=0.388
O2	B	0, 0.353, 0.857, 1.360, 2.135 max_d=2.135 avg_d=0.857 std_dev=0.503
C3'	A	0, -0.029, 0.496, 1.021, 1.417 max_d=1.417 avg_d=0.496 std_dev=0.525
O2'	A	0, -0.084, 0.512, 1.108, 1.592 max_d=1.592 avg_d=0.512 std_dev=0.596
O3'	A	0, -0.149, 0.941, 2.032, 2.830 max_d=2.830 avg_d=0.941 std_dev=1.090

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.06	0.02	0.01	0.02	0.02	0.04	0.01	0.33	0.01	0.17	0.17	0.22	0.17
C2	0.02	0.00	0.09	0.18	0.01	0.04	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.25	0.23	0.05	0.11	0.11	0.17	0.12
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.03	0.01	0.08	0.18	0.10	0.01	0.06	0.03	0.18	0.00	0.04	0.02	0.34	0.38	0.45	0.36
C3'	0.01	0.18	0.00	0.00	0.33	0.00	0.37	0.03	0.33	0.20	0.25	0.36	0.11	0.02	0.00	0.02	0.13	0.14	0.16	0.14
C4	0.02	0.01	0.03	0.33	0.00	0.12	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.36	0.09	0.04	0.13	0.13	0.18	0.13
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.12	0.00	0.16	0.01	0.16	0.07	0.07	0.14	0.05	0.27	0.02	0.00	0.02	0.08	0.04	0.03
C5	0.02	0.01	0.08	0.37	0.01	0.16	0.00	0.15	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.33	0.20	0.06	0.14	0.13	0.17	0.13
C5'	0.06	0.04	0.18	0.03	0.11	0.01	0.15	0.00	0.11	0.04	0.07	0.14	0.06	0.10	0.22	0.01	0.01	0.09	0.02	0.02
C6	0.02	0.01	0.10	0.33	0.01	0.16	0.00	0.11	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.26	0.15	0.07	0.11	0.10	0.16	0.11
N1	0.01	0.01	0.01	0.20	0.01	0.07	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.21	0.11	0.02	0.11	0.11	0.18	0.12
N3	0.02	0.00	0.06	0.25	0.00	0.07	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.32	0.12	0.04	0.11	0.11	0.17	0.12
N4	0.02	0.01	0.03	0.36	0.00	0.14	0.02	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.39	0.14	0.05	0.16	0.17	0.22	0.17
O2	0.04	0.00	0.18	0.11	0.01	0.05	0.01	0.06	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.17	0.43	0.09	0.13	0.14	0.18	0.14
O2'	0.01	0.25	0.00	0.02	0.36	0.27	0.33	0.10	0.26	0.21	0.32	0.39	0.17	0.00	0.07	0.19	0.21	0.23	0.48	0.26
O3'	0.33	0.23	0.04	0.00	0.09	0.02	0.20	0.22	0.15	0.11	0.12	0.14	0.43	0.07	0.00	0.23	0.35	0.50	0.41	0.41
O4'	0.01	0.05	0.02	0.02	0.04	0.00	0.06	0.01	0.07	0.02	0.04	0.05	0.09	0.19	0.23	0.00	0.11	0.11	0.13	0.11
O5'	0.17	0.11	0.34	0.13	0.13	0.02	0.14	0.01	0.11	0.11	0.11	0.16	0.13	0.21	0.35	0.11	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.17	0.11	0.38	0.14	0.13	0.08	0.13	0.09	0.10	0.11	0.11	0.17	0.14	0.23	0.50	0.11	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.22	0.17	0.45	0.16	0.18	0.04	0.17	0.02	0.16	0.18	0.17	0.22	0.18	0.48	0.41	0.13	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.17	0.12	0.36	0.14	0.13	0.03	0.13	0.02	0.11	0.12	0.12	0.17	0.14	0.26	0.41	0.11	0.01	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.17	0.35	0.21	0.16	0.33	0.15	0.28	0.16	0.20	0.16	0.41	0.43	0.47	0.26	0.16	0.15	0.17	0.26	0.24	0.19
C2	0.20	0.31	0.23	0.17	0.28	0.17	0.22	0.15	0.18	0.19	0.36	0.39	0.39	0.26	0.15	0.20	0.17	0.25	0.23	0.19
C2'	0.18	0.37	0.19	0.23	0.32	0.23	0.27	0.28	0.22	0.19	0.42	0.41	0.50	0.22	0.25	0.22	0.29	0.36	0.36	0.31
C3'	0.10	0.38	0.12	0.14	0.35	0.15	0.26	0.23	0.22	0.14	0.46	0.46	0.51	0.17	0.16	0.10	0.24	0.41	0.29	0.29
C4	0.18	0.25	0.21	0.16	0.26	0.15	0.18	0.15	0.15	0.18	0.29	0.33	0.29	0.21	0.14	0.20	0.16	0.25	0.23	0.18
C4'	0.14	0.44	0.12	0.07	0.44	0.07	0.34	0.11	0.26	0.23	0.51	0.52	0.55	0.18	0.12	0.10	0.11	0.25	0.17	0.14
C5	0.14	0.24	0.18	0.14	0.26	0.14	0.20	0.15	0.13	0.14	0.29	0.32	0.28	0.18	0.13	0.17	0.16	0.26	0.26	0.19
C5'	0.16	0.39	0.14	0.08	0.40	0.08	0.34	0.11	0.29	0.24	0.45	0.46	0.48	0.16	0.11	0.11	0.13	0.23	0.17	0.14
C6	0.14	0.29	0.18	0.14	0.29	0.14	0.23	0.16	0.16	0.15	0.34	0.35	0.35	0.20	0.13	0.15	0.17	0.26	0.25	0.20
N1	0.16	0.31	0.21	0.16	0.29	0.15	0.24	0.15	0.17	0.14	0.36	0.39	0.40	0.24	0.14	0.16	0.17	0.26	0.24	0.19
N3	0.21	0.29	0.23	0.17	0.27	0.17	0.19	0.15	0.19	0.21	0.33	0.35	0.34	0.25	0.14	0.22	0.16	0.25	0.22	0.18
N4	0.20	0.25	0.21	0.17	0.28	0.16	0.22	0.15	0.19	0.20	0.29	0.34	0.26	0.20	0.15	0.22	0.16	0.24	0.21	0.18
O2	0.23	0.34	0.25	0.18	0.31	0.18	0.26	0.16	0.21	0.21	0.39	0.43	0.44	0.29	0.16	0.22	0.17	0.25	0.23	0.19
O2'	0.20	0.40	0.24	0.15	0.33	0.17	0.31	0.28	0.22	0.19	0.43	0.45	0.59	0.36	0.16	0.17	0.36	0.50	0.59	0.47
O3'	0.19	0.69	0.12	0.14	0.76	0.14	0.50	0.27	0.34	0.37	0.86	0.93	0.79	0.17	0.31	0.09	0.22	0.50	0.26	0.29
O4'	0.14	0.38	0.18	0.15	0.42	0.14	0.35	0.14	0.25	0.19	0.47	0.50	0.48	0.25	0.18	0.14	0.14	0.23	0.19	0.16
O5'	0.16	0.37	0.16	0.07	0.36	0.05	0.29	0.09	0.24	0.22	0.41	0.41	0.44	0.16	0.03	0.10	0.15	0.24	0.21	0.16
OP1	0.08	0.27	0.13	0.02	0.26	0.08	0.20	0.17	0.16	0.13	0.31	0.31	0.36	0.16	0.02	0.03	0.17	0.26	0.16	0.17
OP2	0.11	0.21	0.05	0.08	0.25	0.19	0.25	0.28	0.23	0.15	0.25	0.29	0.24	0.05	0.02	0.17	0.24	0.32	0.18	0.23
P	0.04	0.23	0.08	0.01	0.23	0.07	0.20	0.14	0.17	0.11	0.27	0.28	0.30	0.10	0.01	0.03	0.16	0.23	0.16	0.15

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.02	0.00	0.08	0.07	0.12	0.08
C2	0.02	0.00	0.12	0.13	0.01	0.04	0.00	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.10	0.15	0.04	0.19	0.20	0.28	0.19
C2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.06	0.01	0.07	0.02	0.09	0.03	0.10	0.07	0.20	0.00	0.02	0.01	0.06	0.08	0.11	0.07
C3'	0.01	0.13	0.00	0.00	0.11	0.00	0.11	0.02	0.11	0.06	0.13	0.13	0.18	0.02	0.01	0.01	0.09	0.10	0.12	0.08
C4	0.02	0.01	0.06	0.11	0.00	0.07	0.00	0.16	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.13	0.03	0.26	0.33	0.40	0.30
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.07	0.00	0.08	0.01	0.08	0.04	0.06	0.08	0.05	0.03	0.02	0.00	0.01	0.06	0.04	0.02
C5	0.01	0.00	0.07	0.11	0.00	0.08	0.00	0.18	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.13	0.05	0.27	0.33	0.38	0.30
C5'	0.03	0.09	0.02	0.02	0.16	0.01	0.18	0.00	0.16	0.09	0.13	0.18	0.07	0.03	0.03	0.01	0.01	0.07	0.02	0.01
C6	0.01	0.01	0.09	0.11	0.01	0.08	0.00	0.16	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.12	0.06	0.23	0.25	0.28	0.23
N1	0.01	0.01	0.03	0.06	0.01	0.04	0.01	0.09	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.03	0.06	0.01	0.17	0.17	0.23	0.16
N3	0.02	0.00	0.10	0.13	0.00	0.06	0.01	0.13	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.16	0.04	0.23	0.27	0.36	0.25
N4	0.02	0.01	0.07	0.13	0.00	0.08	0.01	0.18	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.07	0.16	0.03	0.28	0.38	0.46	0.33
O2	0.03	0.00	0.20	0.18	0.01	0.05	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.18	0.21	0.07	0.16	0.15	0.26	0.16
O2'	0.01	0.10	0.00	0.02	0.05	0.03	0.06	0.03	0.07	0.03	0.09	0.07	0.18	0.00	0.04	0.03	0.04	0.06	0.08	0.04
O3'	0.02	0.15	0.02	0.01	0.13	0.02	0.13	0.03	0.12	0.06	0.16	0.16	0.21	0.04	0.00	0.02	0.13	0.14	0.15	0.11
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.03	0.00	0.05	0.01	0.06	0.01	0.04	0.03	0.07	0.03	0.02	0.00	0.09	0.08	0.10	0.07
O5'	0.08	0.19	0.06	0.09	0.26	0.01	0.27	0.01	0.23	0.17	0.23	0.28	0.16	0.04	0.13	0.09	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.07	0.20	0.08	0.10	0.33	0.06	0.33	0.07	0.25	0.17	0.27	0.38	0.15	0.06	0.14	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.12	0.28	0.11	0.12	0.40	0.04	0.38	0.02	0.28	0.23	0.36	0.46	0.26	0.08	0.15	0.10	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.08	0.19	0.07	0.08	0.30	0.02	0.30	0.01	0.23	0.16	0.25	0.33	0.16	0.04	0.11	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00