Doublet Group distance statistics: 49241

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 2, 0, 0, 3, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.004, 0.007, 0.011, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.007 std_dev=0.004
C5	A	0, 0.004, 0.009, 0.014, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.009 std_dev=0.005
N1	A	0, 0.005, 0.015, 0.026, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.015 std_dev=0.011
C6	A	0, 0.000, 0.014, 0.027, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.014 std_dev=0.013
C2	A	0, 0.000, 0.014, 0.028, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.014 std_dev=0.014
C4	A	0, -0.001, 0.014, 0.030, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.014 std_dev=0.015
C1'	A	0, 0.003, 0.018, 0.034, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.018 std_dev=0.016
O2	A	0, 0.000, 0.038, 0.076, 0.122 max_d=0.122 avg_d=0.038 std_dev=0.038
N4	A	0, -0.009, 0.039, 0.087, 0.168 max_d=0.168 avg_d=0.039 std_dev=0.048
O4'	A	0, 0.076, 0.222, 0.368, 0.439 max_d=0.439 avg_d=0.222 std_dev=0.146
C4'	A	0, 0.088, 0.271, 0.454, 0.511 max_d=0.511 avg_d=0.271 std_dev=0.183
C2'	A	0, 0.124, 0.310, 0.496, 0.557 max_d=0.557 avg_d=0.310 std_dev=0.186
C3'	A	0, 0.089, 0.282, 0.475, 0.532 max_d=0.532 avg_d=0.282 std_dev=0.193
OP2	B	0, 0.165, 0.391, 0.617, 0.664 max_d=0.664 avg_d=0.391 std_dev=0.226
C5'	A	0, 0.113, 0.346, 0.580, 0.666 max_d=0.666 avg_d=0.346 std_dev=0.233
O3'	A	0, 0.260, 0.563, 0.865, 0.837 max_d=0.837 avg_d=0.563 std_dev=0.302
P	B	0, 0.095, 0.408, 0.721, 0.875 max_d=0.875 avg_d=0.408 std_dev=0.313
O5'	A	0, 0.202, 0.535, 0.867, 0.985 max_d=0.985 avg_d=0.535 std_dev=0.332
O5'	B	0, 0.204, 0.558, 0.911, 1.030 max_d=1.030 avg_d=0.558 std_dev=0.353
P	A	0, 0.229, 0.586, 0.943, 1.043 max_d=1.043 avg_d=0.586 std_dev=0.357
O2'	A	0, 0.258, 0.666, 1.074, 1.164 max_d=1.164 avg_d=0.666 std_dev=0.408
OP1	A	0, 0.263, 0.671, 1.079, 1.369 max_d=1.369 avg_d=0.671 std_dev=0.408
OP1	B	0, 0.242, 0.676, 1.109, 1.272 max_d=1.272 avg_d=0.676 std_dev=0.433
C5	B	0, 0.318, 0.764, 1.210, 1.324 max_d=1.324 avg_d=0.764 std_dev=0.446
C6	B	0, 0.280, 0.729, 1.178, 1.357 max_d=1.357 avg_d=0.729 std_dev=0.449
C5'	B	0, 0.238, 0.691, 1.145, 1.288 max_d=1.288 avg_d=0.691 std_dev=0.453
C3'	B	0, 0.346, 0.829, 1.311, 1.437 max_d=1.437 avg_d=0.829 std_dev=0.483
C4	B	0, 0.378, 0.863, 1.348, 1.372 max_d=1.372 avg_d=0.863 std_dev=0.485
N1	B	0, 0.348, 0.843, 1.338, 1.407 max_d=1.407 avg_d=0.843 std_dev=0.495
N3	B	0, 0.392, 0.897, 1.401, 1.403 max_d=1.403 avg_d=0.897 std_dev=0.505
C4'	B	0, 0.343, 0.864, 1.385, 1.491 max_d=1.491 avg_d=0.864 std_dev=0.521
C2	B	0, 0.398, 0.922, 1.446, 1.425 max_d=1.425 avg_d=0.922 std_dev=0.524
O4'	B	0, 0.340, 0.869, 1.398, 1.489 max_d=1.489 avg_d=0.869 std_dev=0.529
N4	B	0, 0.452, 0.991, 1.529, 1.432 max_d=1.432 avg_d=0.991 std_dev=0.538
C1'	B	0, 0.413, 0.976, 1.540, 1.560 max_d=1.560 avg_d=0.976 std_dev=0.563
C2'	B	0, 0.442, 1.025, 1.607, 1.682 max_d=1.682 avg_d=1.025 std_dev=0.583
O2	B	0, 0.468, 1.055, 1.643, 1.566 max_d=1.566 avg_d=1.055 std_dev=0.587
O3'	B	0, 0.515, 1.165, 1.815, 1.887 max_d=1.887 avg_d=1.165 std_dev=0.650
O2'	B	0, 0.628, 1.417, 2.205, 2.193 max_d=2.193 avg_d=1.417 std_dev=0.789
OP2	A	0, 0.699, 1.575, 2.450, 2.366 max_d=2.366 avg_d=1.575 std_dev=0.875

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.02	0.05	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.03	0.20	0.00	0.15	0.08	0.35	0.10
C2	0.02	0.00	0.08	0.05	0.01	0.02	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.05	0.18	0.02	0.19	0.10	0.48	0.14
C2'	0.00	0.08	0.00	0.01	0.04	0.02	0.09	0.15	0.10	0.02	0.05	0.05	0.17	0.00	0.05	0.02	0.24	0.33	0.18	0.15
C3'	0.02	0.05	0.01	0.00	0.04	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.05	0.04	0.08	0.04	0.01	0.01	0.21	0.22	0.19	0.12
C4	0.02	0.01	0.04	0.04	0.00	0.04	0.00	0.13	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.13	0.15	0.04	0.24	0.19	0.61	0.19
C4'	0.01	0.02	0.02	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.05	0.02	0.02	0.05	0.05	0.08	0.03	0.01	0.01	0.15	0.23	0.07
C5	0.02	0.01	0.09	0.02	0.00	0.05	0.00	0.14	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.16	0.12	0.04	0.25	0.19	0.64	0.20
C5'	0.05	0.08	0.15	0.01	0.13	0.01	0.14	0.00	0.13	0.09	0.10	0.14	0.04	0.08	0.14	0.01	0.00	0.21	0.21	0.02
C6	0.02	0.01	0.10	0.02	0.01	0.05	0.00	0.13	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.15	0.13	0.04	0.25	0.13	0.59	0.17
N1	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.07	0.17	0.02	0.20	0.09	0.48	0.14
N3	0.02	0.00	0.05	0.05	0.00	0.02	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.17	0.03	0.21	0.15	0.55	0.17
N4	0.02	0.01	0.05	0.04	0.00	0.05	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.15	0.15	0.04	0.24	0.22	0.63	0.21
O2	0.03	0.00	0.17	0.08	0.01	0.05	0.01	0.04	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.16	0.19	0.03	0.15	0.08	0.43	0.14
O2'	0.03	0.05	0.00	0.04	0.13	0.08	0.16	0.08	0.15	0.07	0.08	0.15	0.16	0.00	0.12	0.05	0.24	0.36	0.22	0.18
O3'	0.20	0.18	0.05	0.01	0.15	0.03	0.12	0.14	0.13	0.17	0.17	0.15	0.19	0.12	0.00	0.13	0.23	0.17	0.23	0.16
O4'	0.00	0.02	0.02	0.01	0.04	0.01	0.04	0.01	0.04	0.02	0.03	0.04	0.03	0.05	0.13	0.00	0.10	0.04	0.40	0.18
O5'	0.15	0.19	0.24	0.21	0.24	0.01	0.25	0.00	0.25	0.20	0.21	0.24	0.15	0.24	0.23	0.10	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.08	0.10	0.33	0.22	0.19	0.15	0.19	0.21	0.13	0.09	0.15	0.22	0.08	0.36	0.17	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.35	0.48	0.18	0.19	0.61	0.23	0.64	0.21	0.59	0.48	0.55	0.63	0.43	0.22	0.23	0.40	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.10	0.14	0.15	0.12	0.19	0.07	0.20	0.02	0.17	0.14	0.17	0.21	0.14	0.18	0.16	0.18	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.20	0.14	0.21	0.29	0.10	0.29	0.12	0.26	0.15	0.17	0.11	0.09	0.14	0.20	0.29	0.26	0.19	0.22	0.09	0.14
C2	0.10	0.07	0.10	0.19	0.14	0.20	0.12	0.18	0.09	0.07	0.12	0.19	0.06	0.10	0.22	0.17	0.14	0.16	0.06	0.10
C2'	0.15	0.16	0.15	0.19	0.12	0.19	0.10	0.17	0.10	0.13	0.15	0.12	0.18	0.15	0.19	0.17	0.13	0.21	0.20	0.16
C3'	0.20	0.16	0.21	0.29	0.11	0.29	0.11	0.28	0.13	0.16	0.14	0.10	0.19	0.21	0.32	0.24	0.20	0.25	0.10	0.16
C4	0.07	0.16	0.09	0.14	0.24	0.13	0.20	0.13	0.13	0.11	0.21	0.28	0.15	0.09	0.20	0.10	0.13	0.13	0.07	0.10
C4'	0.20	0.20	0.21	0.28	0.15	0.28	0.13	0.27	0.14	0.17	0.19	0.14	0.23	0.21	0.33	0.24	0.18	0.28	0.14	0.18
C5	0.08	0.18	0.10	0.15	0.24	0.14	0.20	0.15	0.14	0.13	0.23	0.26	0.18	0.11	0.20	0.10	0.13	0.17	0.07	0.11
C5'	0.25	0.28	0.25	0.24	0.21	0.25	0.17	0.24	0.18	0.23	0.25	0.20	0.33	0.27	0.30	0.23	0.17	0.30	0.24	0.21
C6	0.08	0.14	0.07	0.17	0.18	0.20	0.13	0.21	0.08	0.09	0.18	0.20	0.14	0.08	0.19	0.16	0.17	0.21	0.09	0.13
N1	0.11	0.05	0.11	0.22	0.09	0.23	0.06	0.22	0.06	0.06	0.09	0.13	0.06	0.11	0.23	0.19	0.17	0.19	0.07	0.12
N3	0.08	0.12	0.08	0.15	0.21	0.16	0.17	0.14	0.12	0.09	0.18	0.27	0.11	0.08	0.20	0.14	0.13	0.13	0.07	0.10
N4	0.12	0.20	0.12	0.14	0.28	0.13	0.26	0.13	0.19	0.17	0.25	0.32	0.19	0.12	0.21	0.12	0.14	0.13	0.12	0.13
O2	0.14	0.11	0.15	0.22	0.16	0.22	0.15	0.19	0.14	0.12	0.14	0.20	0.09	0.15	0.25	0.20	0.15	0.16	0.06	0.09
O2'	0.23	0.30	0.23	0.23	0.26	0.22	0.18	0.17	0.18	0.23	0.31	0.27	0.34	0.24	0.22	0.22	0.14	0.31	0.32	0.24
O3'	0.15	0.10	0.20	0.28	0.16	0.28	0.14	0.27	0.10	0.10	0.14	0.20	0.11	0.25	0.38	0.20	0.16	0.26	0.16	0.16
O4'	0.19	0.15	0.20	0.33	0.14	0.33	0.11	0.32	0.13	0.14	0.17	0.15	0.17	0.19	0.37	0.26	0.23	0.30	0.12	0.20
O5'	0.36	0.44	0.37	0.19	0.42	0.13	0.41	0.13	0.40	0.42	0.44	0.41	0.45	0.33	0.02	0.24	0.22	0.29	0.31	0.25
OP1	0.43	0.44	0.48	0.15	0.28	0.26	0.22	0.33	0.25	0.37	0.38	0.26	0.54	0.66	0.01	0.32	0.24	0.57	0.34	0.39
OP2	0.24	0.26	0.13	0.26	0.40	0.36	0.47	0.54	0.44	0.32	0.31	0.43	0.17	0.16	0.01	0.37	0.59	0.73	0.71	0.71
P	0.12	0.14	0.20	0.02	0.10	0.11	0.10	0.22	0.09	0.11	0.12	0.10	0.19	0.29	0.00	0.06	0.20	0.40	0.30	0.30

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.07	0.06	0.08	0.06
C2	0.01	0.00	0.06	0.05	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.09	0.06	0.01	0.10	0.10	0.17	0.13
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.04	0.03	0.02	0.03	0.02	0.02	0.06	0.05	0.08	0.00	0.02	0.01	0.07	0.07	0.12	0.08
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.05	0.00	0.06	0.03	0.07	0.03	0.05	0.06	0.07	0.01	0.01	0.00	0.09	0.08	0.11	0.09
C4	0.01	0.01	0.04	0.05	0.00	0.03	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.05	0.01	0.13	0.15	0.21	0.18
C4'	0.01	0.02	0.03	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.05	0.02	0.03	0.04	0.04	0.07	0.02	0.00	0.01	0.03	0.02	0.01
C5	0.01	0.01	0.02	0.06	0.00	0.05	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.07	0.02	0.14	0.17	0.21	0.19
C5'	0.03	0.05	0.03	0.03	0.09	0.01	0.12	0.00	0.11	0.06	0.06	0.10	0.04	0.07	0.05	0.02	0.00	0.03	0.02	0.01
C6	0.01	0.01	0.02	0.07	0.00	0.05	0.00	0.11	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.02	0.14	0.14	0.17	0.16
N1	0.01	0.00	0.02	0.03	0.01	0.02	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.02	0.00	0.11	0.10	0.14	0.12
N3	0.01	0.01	0.06	0.05	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.07	0.01	0.11	0.12	0.20	0.15
N4	0.01	0.01	0.05	0.06	0.00	0.04	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.06	0.01	0.13	0.16	0.23	0.20
O2	0.02	0.00	0.08	0.07	0.01	0.04	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.13	0.11	0.02	0.09	0.09	0.15	0.11
O2'	0.01	0.09	0.00	0.01	0.06	0.07	0.02	0.07	0.01	0.04	0.09	0.07	0.13	0.00	0.04	0.05	0.08	0.07	0.10	0.08
O3'	0.01	0.06	0.02	0.01	0.05	0.02	0.07	0.05	0.07	0.02	0.07	0.06	0.11	0.04	0.00	0.01	0.15	0.12	0.18	0.14
O4'	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.00	0.05	0.03	0.03	0.02
O5'	0.07	0.10	0.07	0.09	0.13	0.01	0.14	0.00	0.14	0.11	0.11	0.13	0.09	0.08	0.15	0.05	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.06	0.10	0.07	0.08	0.15	0.03	0.17	0.03	0.14	0.10	0.12	0.16	0.09	0.07	0.12	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.08	0.17	0.12	0.11	0.21	0.02	0.21	0.02	0.17	0.14	0.20	0.23	0.15	0.10	0.18	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.06	0.13	0.08	0.09	0.18	0.01	0.19	0.01	0.16	0.12	0.15	0.20	0.11	0.08	0.14	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00