Doublet Group distance statistics: 49253

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 2, 0, 4, 1, 3, 1, 0, 0, 3, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.003, 0.006, 0.010, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.006 std_dev=0.004
C4	A	0, 0.003, 0.008, 0.012, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.008 std_dev=0.005
C6	A	0, 0.001, 0.006, 0.011, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.006 std_dev=0.005
N1	A	0, 0.002, 0.007, 0.012, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.007 std_dev=0.005
C5	A	0, -0.002, 0.003, 0.009, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.003 std_dev=0.005
C2	A	0, 0.003, 0.010, 0.017, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.010 std_dev=0.007
C1'	A	0, 0.004, 0.012, 0.020, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.012 std_dev=0.008
O2	A	0, 0.009, 0.019, 0.030, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.019 std_dev=0.010
N4	A	0, 0.004, 0.019, 0.035, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.019 std_dev=0.015
C2'	A	0, 0.043, 0.162, 0.281, 0.459 max_d=0.459 avg_d=0.162 std_dev=0.119
O4'	A	0, 0.048, 0.167, 0.286, 0.501 max_d=0.501 avg_d=0.167 std_dev=0.119
O2'	A	0, 0.020, 0.161, 0.302, 0.497 max_d=0.497 avg_d=0.161 std_dev=0.141
C4'	A	0, 0.080, 0.258, 0.437, 0.743 max_d=0.743 avg_d=0.258 std_dev=0.178
C3'	A	0, 0.082, 0.270, 0.458, 0.756 max_d=0.756 avg_d=0.270 std_dev=0.188
O5'	B	0, 0.206, 0.442, 0.679, 0.898 max_d=0.898 avg_d=0.442 std_dev=0.236
O3'	A	0, 0.128, 0.383, 0.639, 1.001 max_d=1.001 avg_d=0.383 std_dev=0.256
O3'	B	0, 0.313, 0.578, 0.842, 0.937 max_d=0.937 avg_d=0.578 std_dev=0.265
C4'	B	0, 0.173, 0.449, 0.724, 1.136 max_d=1.136 avg_d=0.449 std_dev=0.275
C5'	A	0, 0.117, 0.448, 0.778, 1.430 max_d=1.430 avg_d=0.448 std_dev=0.331
P	B	0, 0.325, 0.670, 1.014, 1.262 max_d=1.262 avg_d=0.670 std_dev=0.344
C3'	B	0, 0.225, 0.576, 0.926, 1.412 max_d=1.412 avg_d=0.576 std_dev=0.351
O4'	B	0, 0.127, 0.497, 0.868, 1.881 max_d=1.881 avg_d=0.497 std_dev=0.370
O5'	A	0, 0.171, 0.546, 0.922, 1.734 max_d=1.734 avg_d=0.546 std_dev=0.375
C4	B	0, 0.134, 0.550, 0.966, 1.724 max_d=1.724 avg_d=0.550 std_dev=0.416
C5'	B	0, 0.096, 0.524, 0.952, 1.994 max_d=1.994 avg_d=0.524 std_dev=0.428
OP2	B	0, 0.320, 0.752, 1.183, 1.461 max_d=1.461 avg_d=0.752 std_dev=0.431
OP1	B	0, 0.450, 0.900, 1.350, 1.624 max_d=1.624 avg_d=0.900 std_dev=0.450
P	A	0, 0.219, 0.741, 1.263, 2.428 max_d=2.428 avg_d=0.741 std_dev=0.522
C6	B	0, 0.170, 0.693, 1.216, 1.906 max_d=1.906 avg_d=0.693 std_dev=0.523
C5	B	0, 0.087, 0.695, 1.304, 2.391 max_d=2.391 avg_d=0.695 std_dev=0.609
OP1	A	0, 0.231, 0.848, 1.466, 2.863 max_d=2.863 avg_d=0.848 std_dev=0.617
C1'	B	0, 0.030, 0.654, 1.279, 3.009 max_d=3.009 avg_d=0.654 std_dev=0.625
N6	B	0, 0.166, 0.832, 1.497, 2.725 max_d=2.725 avg_d=0.832 std_dev=0.666
OP2	A	0, 0.221, 0.895, 1.569, 3.254 max_d=3.254 avg_d=0.895 std_dev=0.674
N9	B	0, 0.017, 0.702, 1.387, 2.858 max_d=2.858 avg_d=0.702 std_dev=0.685
N3	B	0, -0.018, 0.718, 1.454, 3.126 max_d=3.126 avg_d=0.718 std_dev=0.736
C2'	B	0, -0.010, 0.749, 1.507, 3.590 max_d=3.590 avg_d=0.749 std_dev=0.758
N1	B	0, -0.023, 0.844, 1.712, 4.007 max_d=4.007 avg_d=0.844 std_dev=0.868
C2	B	0, -0.152, 0.912, 1.975, 4.557 max_d=4.557 avg_d=0.912 std_dev=1.063
O2'	B	0, -0.152, 1.027, 2.206, 5.498 max_d=5.498 avg_d=1.027 std_dev=1.179
N7	B	0, -0.254, 1.000, 2.255, 5.002 max_d=5.002 avg_d=1.000 std_dev=1.254
C8	B	0, -0.300, 1.008, 2.315, 4.790 max_d=4.790 avg_d=1.008 std_dev=1.308

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.07	0.17	0.23	0.20
C2	0.01	0.00	0.07	0.12	0.00	0.07	0.01	0.10	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.03	0.13	0.02	0.14	0.26	0.40	0.31
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.06	0.03	0.14	0.00	0.01	0.00	0.02	0.08	0.15	0.12
C3'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.07	0.00	0.06	0.02	0.07	0.03	0.12	0.07	0.19	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.11	0.06
C4	0.01	0.00	0.03	0.07	0.00	0.06	0.00	0.11	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.07	0.02	0.21	0.39	0.54	0.42
C4'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.06	0.00	0.05	0.00	0.05	0.03	0.07	0.06	0.10	0.02	0.01	0.00	0.00	0.04	0.08	0.06
C5	0.01	0.01	0.04	0.06	0.00	0.05	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.07	0.03	0.23	0.42	0.54	0.43
C5'	0.01	0.10	0.01	0.02	0.11	0.00	0.10	0.00	0.08	0.05	0.12	0.12	0.12	0.02	0.03	0.01	0.01	0.01	0.06	0.01
C6	0.01	0.00	0.05	0.07	0.01	0.05	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.08	0.03	0.20	0.35	0.45	0.38
N1	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.03	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.14	0.26	0.36	0.30
N3	0.01	0.00	0.06	0.12	0.00	0.07	0.00	0.12	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.13	0.02	0.18	0.32	0.48	0.37
N4	0.01	0.01	0.03	0.07	0.00	0.06	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.09	0.03	0.23	0.43	0.59	0.45
O2	0.02	0.00	0.14	0.19	0.01	0.10	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.07	0.21	0.02	0.12	0.21	0.35	0.26
O2'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.03	0.02	0.07	0.00	0.02	0.02	0.04	0.07	0.06	0.07
O3'	0.01	0.13	0.01	0.00	0.07	0.01	0.07	0.03	0.08	0.03	0.13	0.09	0.21	0.02	0.00	0.01	0.05	0.06	0.09	0.04
O4'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.02	0.03	0.02	0.02	0.01	0.00	0.08	0.16	0.20	0.18
O5'	0.07	0.14	0.02	0.01	0.21	0.00	0.23	0.01	0.20	0.14	0.18	0.23	0.12	0.04	0.05	0.08	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.17	0.26	0.08	0.03	0.39	0.04	0.42	0.01	0.35	0.26	0.32	0.43	0.21	0.07	0.06	0.16	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.23	0.40	0.15	0.11	0.54	0.08	0.54	0.06	0.45	0.36	0.48	0.59	0.35	0.06	0.09	0.20	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.20	0.31	0.12	0.06	0.42	0.06	0.43	0.01	0.38	0.30	0.37	0.45	0.26	0.07	0.04	0.18	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.37	0.52	0.39	0.16	0.30	0.20	0.45	0.22	0.35	0.70	0.43	0.36	0.51	0.76	0.43	0.54	0.18	0.30	0.14	0.30	0.31	0.23
C2	0.19	0.34	0.20	0.08	0.12	0.16	0.17	0.16	0.08	0.32	0.27	0.24	0.19	0.35	0.19	0.26	0.13	0.22	0.11	0.35	0.31	0.24
C2'	0.31	0.45	0.35	0.14	0.28	0.18	0.40	0.19	0.33	0.59	0.37	0.33	0.47	0.64	0.37	0.47	0.16	0.26	0.10	0.26	0.27	0.19
C3'	0.32	0.54	0.40	0.16	0.26	0.18	0.42	0.23	0.33	0.70	0.44	0.38	0.49	0.75	0.40	0.52	0.15	0.24	0.12	0.24	0.30	0.20
C4	0.16	0.37	0.21	0.11	0.14	0.16	0.22	0.17	0.27	0.33	0.35	0.26	0.29	0.34	0.18	0.22	0.14	0.18	0.11	0.37	0.30	0.25
C4'	0.40	0.66	0.48	0.21	0.28	0.23	0.49	0.29	0.37	0.87	0.54	0.45	0.57	0.92	0.48	0.65	0.18	0.28	0.17	0.29	0.36	0.26
C5	0.31	0.66	0.40	0.16	0.22	0.19	0.30	0.19	0.35	0.63	0.59	0.46	0.35	0.59	0.35	0.45	0.17	0.24	0.12	0.33	0.29	0.21
C5'	0.43	0.79	0.55	0.24	0.27	0.26	0.49	0.33	0.39	0.97	0.65	0.53	0.58	1.00	0.51	0.72	0.20	0.29	0.22	0.34	0.43	0.32
C6	0.37	0.68	0.44	0.18	0.27	0.21	0.42	0.23	0.36	0.77	0.60	0.45	0.43	0.78	0.45	0.55	0.19	0.28	0.14	0.29	0.30	0.21
N1	0.31	0.51	0.34	0.13	0.23	0.19	0.35	0.19	0.26	0.59	0.43	0.34	0.36	0.63	0.36	0.45	0.16	0.27	0.12	0.31	0.30	0.22
N3	0.14	0.25	0.14	0.09	0.08	0.16	0.22	0.19	0.18	0.32	0.19	0.17	0.28	0.37	0.17	0.16	0.14	0.19	0.12	0.37	0.32	0.26
N4	0.19	0.28	0.18	0.16	0.26	0.19	0.34	0.27	0.33	0.38	0.30	0.23	0.35	0.40	0.27	0.17	0.17	0.16	0.16	0.38	0.31	0.29
O2	0.16	0.37	0.16	0.09	0.15	0.16	0.16	0.17	0.12	0.27	0.31	0.27	0.17	0.31	0.16	0.22	0.13	0.22	0.11	0.35	0.32	0.24
O2'	0.34	0.42	0.36	0.15	0.33	0.20	0.45	0.20	0.39	0.60	0.37	0.33	0.54	0.66	0.41	0.50	0.18	0.29	0.11	0.26	0.27	0.20
O3'	0.31	0.50	0.39	0.16	0.26	0.18	0.41	0.22	0.33	0.67	0.40	0.36	0.49	0.72	0.39	0.51	0.15	0.22	0.12	0.21	0.28	0.18
O4'	0.41	0.69	0.47	0.20	0.29	0.23	0.50	0.29	0.38	0.88	0.56	0.45	0.58	0.95	0.50	0.64	0.18	0.30	0.17	0.31	0.35	0.26
O5'	0.62	0.76	0.72	0.33	0.38	0.32	0.66	0.32	0.47	1.24	0.63	0.48	0.70	1.25	0.72	0.95	0.28	0.43	0.37	0.52	0.56	0.48
OP1	0.85	0.71	0.95	0.46	0.48	0.39	0.83	0.26	0.57	1.58	0.64	0.34	0.82	1.54	0.96	1.27	0.38	0.58	0.60	0.77	0.76	0.73
OP2	0.89	0.61	1.06	0.61	0.49	0.54	0.78	0.45	0.46	1.51	0.50	0.32	0.70	1.45	0.96	1.27	0.47	0.66	0.69	0.85	0.92	0.84
P	0.82	0.67	0.94	0.47	0.46	0.41	0.79	0.31	0.51	1.50	0.57	0.34	0.75	1.47	0.92	1.20	0.37	0.58	0.57	0.74	0.76	0.70

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.16	0.00	0.14	0.28	0.14	0.15
C2	0.02	0.00	0.40	0.61	0.00	0.38	0.00	0.67	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.33	0.42	0.14	0.64	0.71	0.43	0.64
C2'	0.00	0.40	0.00	0.00	0.21	0.01	0.09	0.10	0.18	0.21	0.31	0.40	0.11	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.42	0.55	0.35	0.44
C3'	0.01	0.61	0.00	0.00	0.35	0.00	0.28	0.01	0.39	0.12	0.53	0.57	0.34	0.12	0.12	0.01	0.00	0.00	0.25	0.21	0.26	0.22
C4	0.01	0.00	0.21	0.35	0.00	0.21	0.00	0.31	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.15	0.17	0.07	0.25	0.23	0.17	0.21
C4'	0.00	0.38	0.01	0.00	0.21	0.00	0.15	0.00	0.22	0.07	0.32	0.36	0.19	0.05	0.06	0.14	0.01	0.00	0.01	0.10	0.10	0.05
C5	0.01	0.00	0.09	0.28	0.00	0.15	0.00	0.22	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.14	0.14	0.03	0.18	0.38	0.14	0.22
C5'	0.02	0.67	0.10	0.01	0.31	0.00	0.22	0.00	0.35	0.16	0.55	0.60	0.30	0.09	0.06	0.04	0.10	0.01	0.01	0.20	0.25	0.01
C6	0.01	0.00	0.18	0.39	0.00	0.22	0.00	0.35	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.16	0.25	0.06	0.30	0.35	0.17	0.27
C8	0.01	0.00	0.21	0.12	0.00	0.07	0.00	0.16	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.33	0.14	0.06	0.38	0.80	0.32	0.51
N1	0.01	0.00	0.31	0.53	0.00	0.32	0.00	0.55	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.25	0.37	0.10	0.52	0.56	0.33	0.49
N3	0.02	0.00	0.40	0.57	0.00	0.36	0.00	0.60	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.31	0.35	0.14	0.55	0.53	0.36	0.52
N6	0.01	0.00	0.11	0.34	0.00	0.19	0.00	0.30	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.16	0.22	0.04	0.24	0.40	0.15	0.25
N7	0.00	0.00	0.11	0.12	0.00	0.05	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.27	0.05	0.03	0.28	0.75	0.29	0.44
N9	0.00	0.01	0.01	0.12	0.00	0.06	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.11	0.05	0.01	0.16	0.40	0.16	0.22
O2'	0.01	0.33	0.00	0.01	0.15	0.14	0.14	0.04	0.16	0.33	0.25	0.31	0.16	0.27	0.11	0.00	0.02	0.11	0.37	0.55	0.31	0.39
O3'	0.16	0.42	0.01	0.00	0.17	0.01	0.14	0.10	0.25	0.14	0.37	0.35	0.22	0.05	0.05	0.02	0.00	0.12	0.12	0.08	0.13	0.08
O4'	0.00	0.14	0.01	0.00	0.07	0.00	0.03	0.01	0.06	0.06	0.10	0.14	0.04	0.03	0.01	0.11	0.12	0.00	0.09	0.08	0.16	0.12
O5'	0.14	0.64	0.42	0.25	0.25	0.01	0.18	0.01	0.30	0.38	0.52	0.55	0.24	0.28	0.16	0.37	0.12	0.09	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.28	0.71	0.55	0.21	0.23	0.10	0.38	0.20	0.35	0.80	0.56	0.53	0.40	0.75	0.40	0.55	0.08	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.14	0.43	0.35	0.26	0.17	0.10	0.14	0.25	0.17	0.32	0.33	0.36	0.15	0.29	0.16	0.31	0.13	0.16	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.15	0.64	0.44	0.22	0.21	0.05	0.22	0.01	0.27	0.51	0.49	0.52	0.25	0.44	0.22	0.39	0.08	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00