Doublet Group distance statistics: 49254

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 2, 2, 1, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C4	A	0, 0.003, 0.009, 0.016, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.009 std_dev=0.006
C1'	A	0, 0.001, 0.011, 0.020, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.011 std_dev=0.010
N3	A	0, -0.003, 0.007, 0.017, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.007 std_dev=0.010
C5	A	0, -0.003, 0.007, 0.018, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.007 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.001, 0.011, 0.021, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.011 std_dev=0.010
C6	A	0, -0.001, 0.010, 0.022, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.010 std_dev=0.012
N1	A	0, -0.005, 0.010, 0.024, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.010 std_dev=0.015
N4	A	0, 0.006, 0.026, 0.046, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.026 std_dev=0.020
O2	A	0, 0.003, 0.026, 0.050, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.026 std_dev=0.024
O2'	A	0, 0.055, 0.150, 0.245, 0.343 max_d=0.343 avg_d=0.150 std_dev=0.095
C2'	A	0, 0.039, 0.175, 0.310, 0.507 max_d=0.507 avg_d=0.175 std_dev=0.136
O4'	A	0, 0.038, 0.186, 0.333, 0.561 max_d=0.561 avg_d=0.186 std_dev=0.147
P	B	0, 0.193, 0.432, 0.670, 0.803 max_d=0.803 avg_d=0.432 std_dev=0.239
OP2	B	0, 0.229, 0.473, 0.717, 0.941 max_d=0.941 avg_d=0.473 std_dev=0.244
C3'	A	0, 0.059, 0.305, 0.551, 0.926 max_d=0.926 avg_d=0.305 std_dev=0.246
C4'	A	0, 0.052, 0.299, 0.545, 0.933 max_d=0.933 avg_d=0.299 std_dev=0.247
O3'	A	0, 0.115, 0.454, 0.794, 1.302 max_d=1.302 avg_d=0.454 std_dev=0.340
OP1	B	0, 0.294, 0.655, 1.015, 1.186 max_d=1.186 avg_d=0.655 std_dev=0.360
C3'	B	0, 0.298, 0.668, 1.039, 1.435 max_d=1.435 avg_d=0.668 std_dev=0.370
C2'	B	0, 0.285, 0.656, 1.027, 1.363 max_d=1.363 avg_d=0.656 std_dev=0.371
OP2	A	0, 0.276, 0.652, 1.028, 1.455 max_d=1.455 avg_d=0.652 std_dev=0.376
C8	B	0, 0.277, 0.662, 1.047, 1.359 max_d=1.359 avg_d=0.662 std_dev=0.385
C5'	A	0, 0.076, 0.480, 0.885, 1.503 max_d=1.503 avg_d=0.480 std_dev=0.404
N9	B	0, 0.237, 0.684, 1.132, 1.517 max_d=1.517 avg_d=0.684 std_dev=0.447
O3'	B	0, 0.393, 0.842, 1.292, 1.584 max_d=1.584 avg_d=0.842 std_dev=0.450
N7	B	0, 0.329, 0.786, 1.243, 1.712 max_d=1.712 avg_d=0.786 std_dev=0.457
C1'	B	0, 0.184, 0.660, 1.137, 1.553 max_d=1.553 avg_d=0.660 std_dev=0.476
O5'	B	0, 0.300, 0.777, 1.254, 1.581 max_d=1.581 avg_d=0.777 std_dev=0.477
O2'	B	0, 0.328, 0.810, 1.292, 1.573 max_d=1.573 avg_d=0.810 std_dev=0.482
P	A	0, 0.096, 0.594, 1.092, 1.576 max_d=1.576 avg_d=0.594 std_dev=0.498
C4'	B	0, 0.252, 0.755, 1.258, 1.812 max_d=1.812 avg_d=0.755 std_dev=0.503
O5'	A	0, 0.105, 0.624, 1.143, 1.715 max_d=1.715 avg_d=0.624 std_dev=0.519
C5'	B	0, 0.286, 0.827, 1.367, 2.045 max_d=2.045 avg_d=0.827 std_dev=0.541
O4'	B	0, 0.147, 0.691, 1.236, 1.804 max_d=1.804 avg_d=0.691 std_dev=0.545
C5	B	0, 0.368, 0.960, 1.552, 2.050 max_d=2.050 avg_d=0.960 std_dev=0.592
C4	B	0, 0.330, 0.944, 1.559, 2.010 max_d=2.010 avg_d=0.944 std_dev=0.615
OP1	A	0, 0.118, 0.856, 1.595, 2.447 max_d=2.447 avg_d=0.856 std_dev=0.738
C6	B	0, 0.456, 1.252, 2.049, 2.555 max_d=2.555 avg_d=1.252 std_dev=0.796
N3	B	0, 0.399, 1.232, 2.065, 2.686 max_d=2.686 avg_d=1.232 std_dev=0.833
N6	B	0, 0.490, 1.333, 2.177, 2.866 max_d=2.866 avg_d=1.333 std_dev=0.844
N1	B	0, 0.514, 1.521, 2.528, 3.071 max_d=3.071 avg_d=1.521 std_dev=1.007
C2	B	0, 0.491, 1.505, 2.520, 3.206 max_d=3.206 avg_d=1.505 std_dev=1.014

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.08	0.11	0.20	0.12
C2	0.02	0.00	0.08	0.12	0.01	0.06	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.12	0.01	0.14	0.19	0.31	0.21
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.07	0.04	0.14	0.00	0.01	0.01	0.02	0.11	0.26	0.09
C3'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.08	0.00	0.05	0.01	0.07	0.04	0.12	0.09	0.16	0.02	0.00	0.01	0.05	0.14	0.28	0.10
C4	0.01	0.01	0.03	0.08	0.00	0.06	0.00	0.10	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.09	0.02	0.16	0.25	0.33	0.26
C4'	0.00	0.06	0.01	0.00	0.06	0.00	0.04	0.00	0.04	0.03	0.07	0.06	0.08	0.02	0.00	0.00	0.01	0.09	0.15	0.04
C5	0.01	0.01	0.03	0.05	0.00	0.04	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.02	0.06	0.04	0.14	0.22	0.28	0.23
C5'	0.02	0.09	0.01	0.01	0.10	0.00	0.08	0.00	0.06	0.06	0.11	0.12	0.09	0.02	0.01	0.02	0.00	0.09	0.09	0.01
C6	0.02	0.01	0.05	0.07	0.01	0.04	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.07	0.04	0.13	0.17	0.22	0.19
N1	0.00	0.01	0.01	0.04	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.11	0.15	0.25	0.18
N3	0.01	0.00	0.07	0.12	0.00	0.07	0.00	0.11	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.13	0.01	0.16	0.24	0.34	0.25
N4	0.01	0.00	0.04	0.09	0.00	0.06	0.00	0.12	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.10	0.03	0.16	0.29	0.35	0.27
O2	0.03	0.01	0.14	0.16	0.01	0.08	0.02	0.09	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.09	0.18	0.03	0.13	0.17	0.31	0.20
O2'	0.01	0.05	0.00	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.03	0.01	0.05	0.03	0.09	0.00	0.03	0.03	0.02	0.12	0.25	0.07
O3'	0.01	0.12	0.01	0.00	0.09	0.00	0.06	0.01	0.07	0.03	0.13	0.10	0.18	0.03	0.00	0.00	0.09	0.20	0.32	0.13
O4'	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.02	0.04	0.01	0.01	0.03	0.03	0.03	0.00	0.00	0.11	0.13	0.15	0.13
O5'	0.08	0.14	0.02	0.05	0.16	0.01	0.14	0.00	0.13	0.11	0.16	0.16	0.13	0.02	0.09	0.11	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.11	0.19	0.11	0.14	0.25	0.09	0.22	0.09	0.17	0.15	0.24	0.29	0.17	0.12	0.20	0.13	0.02	0.00	0.00	0.00
OP2	0.20	0.31	0.26	0.28	0.33	0.15	0.28	0.09	0.22	0.25	0.34	0.35	0.31	0.25	0.32	0.15	0.02	0.00	0.00	0.00
P	0.12	0.21	0.09	0.10	0.26	0.04	0.23	0.01	0.19	0.18	0.25	0.27	0.20	0.07	0.13	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.12	1.31	0.19	0.18	0.65	0.16	0.65	0.22	1.04	0.25	1.35	0.98	1.00	0.27	0.20	0.31	0.25	0.12	0.24	0.28	0.12	0.10
C2	0.16	1.05	0.24	0.19	0.56	0.14	0.65	0.19	1.02	0.26	1.18	0.76	1.10	0.31	0.21	0.30	0.22	0.15	0.21	0.21	0.11	0.09
C2'	0.13	1.34	0.15	0.11	0.66	0.12	0.65	0.22	1.04	0.24	1.38	1.01	1.02	0.27	0.22	0.28	0.17	0.10	0.25	0.27	0.11	0.08
C3'	0.17	1.32	0.16	0.06	0.70	0.09	0.68	0.22	1.01	0.25	1.32	1.04	0.98	0.32	0.29	0.28	0.11	0.10	0.27	0.32	0.10	0.10
C4	0.14	0.80	0.23	0.23	0.52	0.16	0.64	0.21	0.86	0.17	0.91	0.61	0.95	0.42	0.23	0.26	0.27	0.14	0.23	0.22	0.13	0.12
C4'	0.18	1.32	0.13	0.13	0.73	0.13	0.67	0.24	0.96	0.26	1.27	1.07	0.90	0.34	0.32	0.25	0.22	0.11	0.27	0.33	0.17	0.13
C5	0.19	0.86	0.25	0.23	0.61	0.19	0.70	0.24	0.87	0.22	0.93	0.70	0.90	0.46	0.31	0.27	0.26	0.18	0.28	0.25	0.12	0.10
C5'	0.27	1.18	0.25	0.16	0.73	0.14	0.67	0.25	0.88	0.29	1.12	1.01	0.83	0.39	0.39	0.31	0.21	0.17	0.29	0.35	0.19	0.15
C6	0.17	1.04	0.23	0.19	0.68	0.18	0.73	0.24	0.96	0.20	1.09	0.85	0.94	0.39	0.31	0.28	0.22	0.16	0.27	0.29	0.12	0.10
N1	0.14	1.14	0.22	0.19	0.63	0.15	0.69	0.21	1.03	0.22	1.22	0.86	1.03	0.30	0.21	0.30	0.23	0.13	0.23	0.26	0.10	0.09
N3	0.16	0.89	0.24	0.21	0.51	0.14	0.63	0.18	0.94	0.22	1.02	0.65	1.05	0.36	0.21	0.28	0.25	0.15	0.20	0.22	0.13	0.12
N4	0.14	0.66	0.23	0.25	0.45	0.18	0.58	0.22	0.75	0.20	0.77	0.50	0.86	0.44	0.23	0.24	0.31	0.14	0.23	0.28	0.19	0.18
O2	0.19	1.09	0.25	0.19	0.53	0.14	0.60	0.18	1.02	0.32	1.24	0.77	1.12	0.31	0.22	0.33	0.22	0.17	0.19	0.20	0.11	0.09
O2'	0.11	1.39	0.14	0.15	0.62	0.14	0.59	0.22	1.01	0.25	1.41	1.02	0.99	0.24	0.18	0.28	0.22	0.10	0.25	0.27	0.11	0.09
O3'	0.19	1.37	0.17	0.08	0.71	0.10	0.68	0.22	1.02	0.25	1.35	1.07	0.99	0.32	0.30	0.27	0.10	0.11	0.28	0.33	0.10	0.11
O4'	0.13	1.32	0.14	0.19	0.71	0.16	0.67	0.24	0.98	0.26	1.28	1.05	0.90	0.32	0.26	0.29	0.30	0.10	0.25	0.32	0.18	0.14
O5'	0.35	0.97	0.41	0.14	0.63	0.08	0.60	0.15	0.78	0.36	0.95	0.83	0.74	0.39	0.40	0.48	0.01	0.20	0.25	0.38	0.14	0.14
OP1	0.16	0.71	0.23	0.02	0.40	0.11	0.39	0.28	0.55	0.17	0.70	0.58	0.55	0.22	0.19	0.36	0.01	0.05	0.29	0.47	0.19	0.25
OP2	0.13	0.65	0.06	0.12	0.41	0.35	0.43	0.55	0.57	0.16	0.66	0.54	0.57	0.27	0.21	0.12	0.01	0.30	0.53	0.50	0.33	0.41
P	0.09	0.69	0.18	0.01	0.41	0.12	0.40	0.27	0.55	0.14	0.68	0.57	0.54	0.22	0.17	0.26	0.00	0.05	0.30	0.44	0.16	0.21

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.08	0.24	0.29	0.11
C2	0.01	0.00	0.35	0.39	0.01	0.09	0.00	0.15	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.22	0.48	0.16	0.20	0.35	0.38	0.28
C2'	0.00	0.35	0.00	0.00	0.20	0.01	0.11	0.01	0.18	0.13	0.28	0.35	0.14	0.05	0.03	0.01	0.02	0.01	0.04	0.39	0.18	0.11
C3'	0.01	0.39	0.00	0.00	0.25	0.00	0.22	0.01	0.29	0.08	0.36	0.35	0.27	0.11	0.10	0.01	0.01	0.01	0.10	0.43	0.15	0.16
C4	0.00	0.01	0.20	0.25	0.00	0.08	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.09	0.28	0.09	0.19	0.30	0.40	0.28
C4'	0.01	0.09	0.01	0.00	0.08	0.00	0.12	0.00	0.12	0.12	0.11	0.08	0.14	0.13	0.06	0.04	0.02	0.00	0.01	0.26	0.16	0.03
C5	0.01	0.00	0.11	0.22	0.00	0.12	0.00	0.21	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.05	0.26	0.03	0.26	0.41	0.49	0.39
C5'	0.02	0.15	0.01	0.01	0.14	0.00	0.21	0.00	0.21	0.24	0.18	0.12	0.25	0.26	0.13	0.04	0.01	0.01	0.01	0.19	0.10	0.01
C6	0.01	0.00	0.18	0.29	0.00	0.12	0.00	0.21	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.09	0.36	0.07	0.27	0.47	0.50	0.40
C8	0.01	0.01	0.13	0.08	0.00	0.12	0.00	0.24	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.11	0.08	0.12	0.28	0.32	0.52	0.38
N1	0.01	0.00	0.28	0.36	0.00	0.11	0.00	0.18	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.16	0.46	0.13	0.24	0.43	0.44	0.35
N3	0.01	0.00	0.35	0.35	0.00	0.08	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.22	0.41	0.16	0.17	0.28	0.35	0.23
N6	0.01	0.01	0.14	0.27	0.00	0.14	0.00	0.25	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.34	0.05	0.30	0.56	0.55	0.47
N7	0.01	0.00	0.05	0.11	0.01	0.13	0.00	0.26	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.12	0.07	0.31	0.43	0.58	0.46
N9	0.00	0.01	0.03	0.10	0.01	0.06	0.01	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.09	0.00	0.17	0.25	0.38	0.24
O2'	0.01	0.22	0.01	0.01	0.09	0.04	0.05	0.04	0.09	0.11	0.16	0.22	0.06	0.08	0.03	0.00	0.05	0.06	0.03	0.39	0.19	0.07
O3'	0.02	0.48	0.02	0.01	0.28	0.02	0.26	0.01	0.36	0.08	0.46	0.41	0.34	0.12	0.09	0.05	0.00	0.02	0.14	0.50	0.17	0.21
O4'	0.00	0.16	0.01	0.01	0.09	0.00	0.03	0.01	0.07	0.12	0.13	0.16	0.05	0.07	0.00	0.06	0.02	0.00	0.10	0.16	0.29	0.10
O5'	0.08	0.20	0.04	0.10	0.19	0.01	0.26	0.01	0.27	0.28	0.24	0.17	0.30	0.31	0.17	0.03	0.14	0.10	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.24	0.35	0.39	0.43	0.30	0.26	0.41	0.19	0.47	0.32	0.43	0.28	0.56	0.43	0.25	0.39	0.50	0.16	0.02	0.00	0.00	0.01
OP2	0.29	0.38	0.18	0.15	0.40	0.16	0.49	0.10	0.50	0.52	0.44	0.35	0.55	0.58	0.38	0.19	0.17	0.29	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.11	0.28	0.11	0.16	0.28	0.03	0.39	0.01	0.40	0.38	0.35	0.23	0.47	0.46	0.24	0.07	0.21	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00