Doublet Group distance statistics: 49255

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 0, 1, 1, 3, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.011, 0.017, 0.024, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.017 std_dev=0.007
C6	A	0, 0.009, 0.018, 0.027, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.018 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.015, 0.025, 0.034, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.025 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.009, 0.019, 0.029, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.019 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.017, 0.028, 0.040, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.028 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.016, 0.029, 0.042, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.029 std_dev=0.013
C2	A	0, 0.016, 0.031, 0.045, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.031 std_dev=0.014
O2	A	0, 0.034, 0.065, 0.095, 0.111 max_d=0.111 avg_d=0.065 std_dev=0.030
N4	A	0, 0.019, 0.056, 0.092, 0.121 max_d=0.121 avg_d=0.056 std_dev=0.037
O4'	A	0, 0.170, 0.355, 0.539, 0.564 max_d=0.564 avg_d=0.355 std_dev=0.185
C2'	A	0, 0.225, 0.425, 0.625, 0.670 max_d=0.670 avg_d=0.425 std_dev=0.200
OP2	B	0, 0.162, 0.405, 0.649, 0.750 max_d=0.750 avg_d=0.405 std_dev=0.243
O2'	A	0, 0.287, 0.549, 0.811, 0.878 max_d=0.878 avg_d=0.549 std_dev=0.262
C4'	A	0, 0.288, 0.570, 0.852, 0.918 max_d=0.918 avg_d=0.570 std_dev=0.282
P	B	0, 0.177, 0.486, 0.796, 1.021 max_d=1.021 avg_d=0.486 std_dev=0.309
C3'	A	0, 0.315, 0.625, 0.934, 1.000 max_d=1.000 avg_d=0.625 std_dev=0.310
OP2	A	0, 0.204, 0.571, 0.938, 1.042 max_d=1.042 avg_d=0.571 std_dev=0.367
OP1	B	0, 0.209, 0.576, 0.944, 1.207 max_d=1.207 avg_d=0.576 std_dev=0.368
O5'	B	0, 0.161, 0.537, 0.913, 1.199 max_d=1.199 avg_d=0.537 std_dev=0.376
C8	B	0, 0.383, 0.767, 1.151, 1.219 max_d=1.219 avg_d=0.767 std_dev=0.384
C5'	B	0, 0.279, 0.671, 1.064, 1.315 max_d=1.315 avg_d=0.671 std_dev=0.392
P	A	0, 0.241, 0.673, 1.104, 1.164 max_d=1.164 avg_d=0.673 std_dev=0.431
C3'	B	0, 0.344, 0.777, 1.210, 1.402 max_d=1.402 avg_d=0.777 std_dev=0.433
O3'	B	0, 0.387, 0.824, 1.261, 1.446 max_d=1.446 avg_d=0.824 std_dev=0.437
C4'	B	0, 0.336, 0.777, 1.218, 1.430 max_d=1.430 avg_d=0.777 std_dev=0.441
O3'	A	0, 0.454, 0.907, 1.360, 1.461 max_d=1.461 avg_d=0.907 std_dev=0.453
O5'	A	0, 0.368, 0.826, 1.285, 1.429 max_d=1.429 avg_d=0.826 std_dev=0.459
C5'	A	0, 0.481, 0.961, 1.440, 1.527 max_d=1.527 avg_d=0.961 std_dev=0.479
C2'	B	0, 0.432, 0.914, 1.396, 1.520 max_d=1.520 avg_d=0.914 std_dev=0.482
N7	B	0, 0.468, 0.952, 1.435, 1.559 max_d=1.559 avg_d=0.952 std_dev=0.484
N9	B	0, 0.424, 0.912, 1.399, 1.506 max_d=1.506 avg_d=0.912 std_dev=0.488
O4'	B	0, 0.304, 0.796, 1.289, 1.480 max_d=1.480 avg_d=0.796 std_dev=0.492
C1'	B	0, 0.399, 0.900, 1.401, 1.536 max_d=1.536 avg_d=0.900 std_dev=0.501
OP1	A	0, 0.195, 0.719, 1.243, 1.410 max_d=1.410 avg_d=0.719 std_dev=0.524
O2'	B	0, 0.520, 1.051, 1.581, 1.640 max_d=1.640 avg_d=1.051 std_dev=0.531
C5	B	0, 0.620, 1.245, 1.870, 1.901 max_d=1.901 avg_d=1.245 std_dev=0.625
C4	B	0, 0.646, 1.300, 1.954, 1.937 max_d=1.937 avg_d=1.300 std_dev=0.654
C6	B	0, 0.746, 1.595, 2.445, 2.700 max_d=2.700 avg_d=1.595 std_dev=0.850
N3	B	0, 0.790, 1.703, 2.615, 2.708 max_d=2.708 avg_d=1.703 std_dev=0.913
N6	B	0, 0.706, 1.639, 2.571, 3.058 max_d=3.058 avg_d=1.639 std_dev=0.932
N1	B	0, 0.861, 1.959, 3.058, 3.389 max_d=3.389 avg_d=1.959 std_dev=1.099
C2	B	0, 0.873, 1.994, 3.115, 3.402 max_d=3.402 avg_d=1.994 std_dev=1.121

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.07	0.08	0.12	0.06
C2	0.01	0.00	0.05	0.05	0.01	0.02	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.05	0.01	0.13	0.12	0.23	0.14
C2'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.02	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.04	0.02	0.10	0.01	0.01	0.01	0.06	0.09	0.13	0.07
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.05	0.00	0.09	0.01	0.10	0.04	0.04	0.06	0.09	0.02	0.01	0.01	0.09	0.11	0.10	0.09
C4	0.01	0.01	0.02	0.05	0.00	0.06	0.01	0.14	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.06	0.03	0.19	0.19	0.30	0.21
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.06	0.00	0.09	0.01	0.09	0.03	0.04	0.07	0.04	0.06	0.01	0.00	0.01	0.09	0.03	0.02
C5	0.02	0.01	0.04	0.09	0.01	0.09	0.00	0.17	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.11	0.04	0.22	0.20	0.29	0.21
C5'	0.02	0.07	0.01	0.01	0.14	0.01	0.17	0.00	0.16	0.08	0.10	0.16	0.04	0.06	0.03	0.01	0.01	0.10	0.05	0.02
C6	0.02	0.01	0.05	0.10	0.01	0.09	0.00	0.16	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.03	0.11	0.04	0.21	0.15	0.22	0.16
N1	0.00	0.01	0.01	0.04	0.01	0.03	0.01	0.08	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.04	0.01	0.14	0.10	0.19	0.11
N3	0.01	0.00	0.04	0.04	0.00	0.04	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.05	0.02	0.16	0.16	0.28	0.18
N4	0.02	0.01	0.02	0.06	0.01	0.07	0.02	0.16	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.03	0.06	0.04	0.21	0.22	0.33	0.23
O2	0.02	0.01	0.10	0.09	0.01	0.04	0.02	0.04	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.10	0.11	0.02	0.10	0.09	0.21	0.12
O2'	0.02	0.06	0.01	0.02	0.03	0.06	0.02	0.06	0.03	0.02	0.06	0.03	0.10	0.00	0.02	0.05	0.04	0.10	0.09	0.04
O3'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.06	0.01	0.11	0.03	0.11	0.04	0.05	0.06	0.11	0.02	0.00	0.01	0.12	0.16	0.10	0.11
O4'	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.02	0.04	0.02	0.05	0.01	0.00	0.10	0.14	0.11	0.10
O5'	0.07	0.13	0.06	0.09	0.19	0.01	0.22	0.01	0.21	0.14	0.16	0.21	0.10	0.04	0.12	0.10	0.00	0.04	0.03	0.00
OP1	0.08	0.12	0.09	0.11	0.19	0.09	0.20	0.10	0.15	0.10	0.16	0.22	0.09	0.10	0.16	0.14	0.04	0.00	0.02	0.01
OP2	0.12	0.23	0.13	0.10	0.30	0.03	0.29	0.05	0.22	0.19	0.28	0.33	0.21	0.09	0.10	0.11	0.03	0.02	0.00	0.01
P	0.06	0.14	0.07	0.09	0.21	0.02	0.21	0.02	0.16	0.11	0.18	0.23	0.12	0.04	0.11	0.10	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.43	0.87	0.37	0.25	0.67	0.29	0.80	0.27	0.87	0.68	0.85	0.78	0.95	0.84	0.55	0.38	0.17	0.40	0.28	0.25	0.23	0.25
C2	0.35	1.05	0.33	0.18	0.56	0.20	0.61	0.19	0.69	0.57	0.85	0.90	0.77	0.73	0.40	0.37	0.15	0.31	0.21	0.22	0.22	0.21
C2'	0.38	0.90	0.31	0.20	0.64	0.22	0.77	0.20	0.88	0.64	0.91	0.77	0.98	0.80	0.51	0.31	0.14	0.34	0.23	0.21	0.20	0.20
C3'	0.28	0.75	0.23	0.16	0.52	0.16	0.63	0.16	0.72	0.54	0.75	0.64	0.81	0.67	0.41	0.20	0.14	0.24	0.18	0.19	0.17	0.16
C4	0.30	1.13	0.32	0.18	0.62	0.14	0.45	0.14	0.62	0.36	0.97	0.97	0.45	0.43	0.31	0.34	0.18	0.21	0.16	0.20	0.21	0.19
C4'	0.32	0.69	0.27	0.22	0.56	0.21	0.68	0.21	0.75	0.58	0.73	0.60	0.83	0.71	0.46	0.22	0.15	0.29	0.21	0.18	0.16	0.17
C5	0.27	0.84	0.29	0.17	0.49	0.15	0.35	0.16	0.41	0.44	0.65	0.79	0.31	0.46	0.29	0.30	0.18	0.24	0.21	0.22	0.23	0.23
C5'	0.23	0.50	0.21	0.18	0.42	0.16	0.53	0.17	0.58	0.49	0.55	0.43	0.65	0.57	0.36	0.14	0.15	0.19	0.15	0.13	0.07	0.09
C6	0.33	0.70	0.29	0.17	0.48	0.22	0.51	0.22	0.48	0.58	0.54	0.69	0.51	0.65	0.41	0.30	0.15	0.33	0.26	0.24	0.23	0.25
N1	0.37	0.85	0.32	0.20	0.57	0.24	0.66	0.22	0.69	0.62	0.72	0.79	0.76	0.76	0.46	0.35	0.15	0.34	0.25	0.24	0.23	0.24
N3	0.32	1.20	0.33	0.17	0.59	0.16	0.48	0.15	0.64	0.45	1.01	1.00	0.57	0.57	0.34	0.36	0.16	0.25	0.17	0.20	0.21	0.19
N4	0.31	1.22	0.34	0.22	0.74	0.15	0.62	0.14	0.89	0.21	1.19	1.03	0.72	0.24	0.37	0.35	0.20	0.17	0.13	0.18	0.19	0.16
O2	0.37	1.05	0.33	0.19	0.58	0.22	0.67	0.20	0.79	0.59	0.90	0.88	0.94	0.77	0.43	0.39	0.15	0.33	0.22	0.22	0.22	0.21
O2'	0.44	1.00	0.37	0.24	0.72	0.26	0.87	0.23	1.03	0.69	1.07	0.84	1.15	0.87	0.57	0.38	0.17	0.38	0.25	0.22	0.21	0.22
O3'	0.26	0.78	0.22	0.15	0.53	0.14	0.65	0.15	0.76	0.53	0.81	0.64	0.85	0.66	0.40	0.17	0.15	0.22	0.15	0.19	0.17	0.14
O4'	0.42	0.70	0.37	0.30	0.63	0.32	0.74	0.31	0.78	0.65	0.72	0.66	0.85	0.78	0.54	0.36	0.22	0.40	0.30	0.28	0.24	0.27
O5'	0.16	0.36	0.14	0.10	0.26	0.08	0.36	0.11	0.36	0.42	0.34	0.31	0.43	0.45	0.26	0.12	0.02	0.14	0.16	0.13	0.08	0.08
OP1	0.07	0.29	0.11	0.02	0.16	0.09	0.18	0.14	0.22	0.19	0.27	0.25	0.25	0.20	0.11	0.14	0.02	0.06	0.19	0.27	0.15	0.19
OP2	0.10	0.38	0.07	0.08	0.22	0.14	0.20	0.20	0.25	0.23	0.33	0.34	0.24	0.22	0.14	0.06	0.02	0.14	0.24	0.24	0.20	0.21
P	0.03	0.27	0.06	0.01	0.13	0.05	0.16	0.10	0.19	0.22	0.23	0.24	0.21	0.23	0.10	0.08	0.00	0.03	0.16	0.18	0.11	0.12

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.06	0.01	0.01	0.03	0.01	0.03	0.06	0.04	0.03	0.05	0.06	0.04	0.03	0.01	0.02	0.02	0.01	0.14	0.14	0.20	0.15
C2	0.06	0.00	0.13	0.17	0.02	0.09	0.03	0.27	0.02	0.03	0.01	0.01	0.02	0.03	0.03	0.19	0.19	0.04	0.50	0.63	0.88	0.67
C2'	0.01	0.13	0.00	0.01	0.08	0.02	0.10	0.03	0.10	0.10	0.11	0.13	0.12	0.11	0.06	0.01	0.03	0.01	0.13	0.14	0.22	0.15
C3'	0.01	0.17	0.01	0.00	0.08	0.00	0.07	0.02	0.08	0.14	0.12	0.17	0.08	0.12	0.05	0.02	0.01	0.02	0.12	0.13	0.15	0.11
C4	0.03	0.02	0.08	0.08	0.00	0.07	0.01	0.24	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.11	0.09	0.02	0.41	0.47	0.62	0.51
C4'	0.01	0.09	0.02	0.00	0.07	0.00	0.08	0.01	0.08	0.08	0.09	0.09	0.09	0.08	0.05	0.04	0.02	0.01	0.02	0.06	0.04	0.02
C5	0.03	0.03	0.10	0.07	0.01	0.08	0.00	0.27	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.11	0.11	0.03	0.42	0.52	0.66	0.57
C5'	0.06	0.27	0.03	0.02	0.24	0.01	0.27	0.00	0.30	0.20	0.30	0.24	0.31	0.25	0.17	0.04	0.04	0.01	0.01	0.06	0.04	0.02
C6	0.04	0.02	0.10	0.08	0.02	0.08	0.01	0.30	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.14	0.13	0.03	0.47	0.62	0.82	0.67
C8	0.03	0.03	0.10	0.14	0.01	0.08	0.01	0.20	0.02	0.00	0.02	0.02	0.03	0.01	0.01	0.05	0.16	0.05	0.23	0.27	0.26	0.29
N1	0.05	0.01	0.11	0.12	0.01	0.09	0.01	0.30	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.02	0.18	0.16	0.03	0.51	0.67	0.91	0.71
N3	0.06	0.01	0.13	0.17	0.01	0.09	0.02	0.24	0.02	0.02	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.18	0.18	0.04	0.44	0.53	0.74	0.56
N6	0.04	0.02	0.12	0.08	0.02	0.09	0.02	0.31	0.01	0.03	0.02	0.02	0.00	0.02	0.03	0.14	0.14	0.04	0.46	0.65	0.80	0.69
N7	0.03	0.03	0.11	0.12	0.02	0.08	0.01	0.25	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.00	0.02	0.08	0.15	0.05	0.32	0.41	0.43	0.45
N9	0.01	0.03	0.06	0.05	0.01	0.05	0.02	0.17	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.00	0.04	0.06	0.01	0.27	0.29	0.35	0.31
O2'	0.02	0.19	0.01	0.02	0.11	0.04	0.11	0.04	0.14	0.05	0.18	0.18	0.14	0.08	0.04	0.00	0.04	0.06	0.09	0.10	0.18	0.09
O3'	0.02	0.19	0.03	0.01	0.09	0.02	0.11	0.04	0.13	0.16	0.16	0.18	0.14	0.15	0.06	0.04	0.00	0.03	0.12	0.11	0.11	0.08
O4'	0.01	0.04	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.01	0.03	0.05	0.03	0.04	0.04	0.05	0.01	0.06	0.03	0.00	0.07	0.05	0.07	0.06
O5'	0.14	0.50	0.13	0.12	0.41	0.02	0.42	0.01	0.47	0.23	0.51	0.44	0.46	0.32	0.27	0.09	0.12	0.07	0.00	0.03	0.02	0.01
OP1	0.14	0.63	0.14	0.13	0.47	0.06	0.52	0.06	0.62	0.27	0.67	0.53	0.65	0.41	0.29	0.10	0.11	0.05	0.03	0.00	0.03	0.02
OP2	0.20	0.88	0.22	0.15	0.62	0.04	0.66	0.04	0.82	0.26	0.91	0.74	0.80	0.43	0.35	0.18	0.11	0.07	0.02	0.03	0.00	0.02
P	0.15	0.67	0.15	0.11	0.51	0.02	0.57	0.02	0.67	0.29	0.71	0.56	0.69	0.45	0.31	0.09	0.08	0.06	0.01	0.02	0.02	0.00