Doublet Group distance statistics: 49272

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 15, 7, 6, 3, 0, 1, 1, 2, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.008, 0.013, 0.018, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.013 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.001, 0.008, 0.015, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.008 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.000, 0.009, 0.018, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.009 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.003, 0.012, 0.021, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.012 std_dev=0.009
C6	A	0, 0.001, 0.010, 0.020, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.010 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.002, 0.011, 0.021, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.011 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.001, 0.013, 0.025, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.013 std_dev=0.012
N4	A	0, 0.021, 0.041, 0.062, 0.090 max_d=0.090 avg_d=0.041 std_dev=0.020
O2	A	0, 0.007, 0.035, 0.063, 0.114 max_d=0.114 avg_d=0.035 std_dev=0.028
O4'	A	0, 0.022, 0.076, 0.130, 0.275 max_d=0.275 avg_d=0.076 std_dev=0.054
C2'	A	0, 0.017, 0.100, 0.182, 0.391 max_d=0.391 avg_d=0.100 std_dev=0.082
C4'	A	0, 0.019, 0.118, 0.216, 0.484 max_d=0.484 avg_d=0.118 std_dev=0.098
C3'	A	0, 0.021, 0.142, 0.263, 0.667 max_d=0.667 avg_d=0.142 std_dev=0.121
O2'	A	0, 0.001, 0.144, 0.286, 0.646 max_d=0.646 avg_d=0.144 std_dev=0.142
C5'	A	0, 0.041, 0.211, 0.381, 0.666 max_d=0.666 avg_d=0.211 std_dev=0.170
OP1	B	0, 0.070, 0.267, 0.464, 0.812 max_d=0.812 avg_d=0.267 std_dev=0.197
O5'	A	0, 0.012, 0.233, 0.454, 0.925 max_d=0.925 avg_d=0.233 std_dev=0.221
P	B	0, 0.053, 0.283, 0.513, 1.063 max_d=1.063 avg_d=0.283 std_dev=0.230
O3'	A	0, 0.011, 0.255, 0.498, 1.460 max_d=1.460 avg_d=0.255 std_dev=0.244
O5'	B	0, 0.041, 0.330, 0.619, 1.184 max_d=1.184 avg_d=0.330 std_dev=0.289
C3'	B	0, 0.057, 0.355, 0.652, 1.354 max_d=1.354 avg_d=0.355 std_dev=0.297
OP2	B	0, 0.066, 0.370, 0.674, 1.379 max_d=1.379 avg_d=0.370 std_dev=0.304
O3'	B	0, 0.066, 0.398, 0.730, 1.409 max_d=1.409 avg_d=0.398 std_dev=0.332
C5'	B	0, 0.009, 0.377, 0.744, 1.882 max_d=1.882 avg_d=0.377 std_dev=0.368
P	A	0, -0.003, 0.365, 0.734, 1.463 max_d=1.463 avg_d=0.365 std_dev=0.369
C4'	B	0, 0.022, 0.410, 0.798, 1.530 max_d=1.530 avg_d=0.410 std_dev=0.388
C2'	B	0, 0.042, 0.445, 0.847, 1.658 max_d=1.658 avg_d=0.445 std_dev=0.402
O2'	B	0, 0.071, 0.523, 0.975, 1.807 max_d=1.807 avg_d=0.523 std_dev=0.452
OP2	A	0, 0.006, 0.471, 0.935, 2.025 max_d=2.025 avg_d=0.471 std_dev=0.464
O4'	B	0, -0.031, 0.532, 1.094, 2.176 max_d=2.176 avg_d=0.532 std_dev=0.562
OP1	A	0, -0.085, 0.487, 1.059, 2.776 max_d=2.776 avg_d=0.487 std_dev=0.572
C1'	B	0, -0.031, 0.557, 1.145, 2.381 max_d=2.381 avg_d=0.557 std_dev=0.588
N1	B	0, -0.127, 0.656, 1.439, 2.974 max_d=2.974 avg_d=0.656 std_dev=0.783
C6	B	0, -0.180, 0.668, 1.516, 3.070 max_d=3.070 avg_d=0.668 std_dev=0.848
C2	B	0, -0.185, 0.777, 1.739, 3.722 max_d=3.722 avg_d=0.777 std_dev=0.962
O2	B	0, -0.169, 0.823, 1.815, 3.942 max_d=3.942 avg_d=0.823 std_dev=0.992
C5	B	0, -0.277, 0.777, 1.832, 3.645 max_d=3.645 avg_d=0.777 std_dev=1.054
N3	B	0, -0.261, 0.879, 2.020, 4.244 max_d=4.244 avg_d=0.879 std_dev=1.140
C4	B	0, -0.310, 0.886, 2.081, 4.180 max_d=4.180 avg_d=0.886 std_dev=1.195
O4	B	0, -0.378, 0.997, 2.372, 4.777 max_d=4.777 avg_d=0.997 std_dev=1.375

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.05	0.07	0.13	0.06
C2	0.02	0.00	0.04	0.07	0.01	0.03	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.05	0.08	0.02	0.10	0.14	0.27	0.13
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.05	0.01	0.05	0.01	0.05	0.03	0.05	0.05	0.06	0.01	0.02	0.01	0.04	0.13	0.15	0.08
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.09	0.00	0.10	0.02	0.08	0.05	0.08	0.10	0.07	0.01	0.01	0.01	0.06	0.16	0.16	0.09
C4	0.01	0.01	0.05	0.09	0.00	0.06	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.14	0.03	0.14	0.17	0.32	0.17
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.06	0.00	0.07	0.00	0.06	0.03	0.04	0.07	0.03	0.03	0.02	0.00	0.01	0.07	0.10	0.03
C5	0.01	0.01	0.05	0.10	0.00	0.07	0.00	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.13	0.04	0.13	0.15	0.27	0.14
C5'	0.02	0.07	0.01	0.02	0.12	0.00	0.13	0.00	0.10	0.07	0.09	0.13	0.05	0.04	0.02	0.01	0.01	0.04	0.10	0.01
C6	0.01	0.01	0.05	0.08	0.01	0.06	0.00	0.10	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.10	0.04	0.11	0.11	0.20	0.10
N1	0.00	0.01	0.03	0.05	0.00	0.03	0.01	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.06	0.02	0.09	0.10	0.20	0.10
N3	0.01	0.00	0.05	0.08	0.01	0.04	0.00	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.11	0.02	0.13	0.16	0.32	0.16
N4	0.01	0.02	0.05	0.10	0.01	0.07	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.05	0.16	0.04	0.16	0.19	0.36	0.19
O2	0.02	0.01	0.06	0.07	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.07	0.08	0.03	0.10	0.14	0.26	0.13
O2'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.04	0.03	0.03	0.04	0.03	0.02	0.05	0.05	0.07	0.00	0.05	0.04	0.04	0.13	0.15	0.08
O3'	0.01	0.08	0.02	0.01	0.14	0.02	0.13	0.02	0.10	0.06	0.11	0.16	0.08	0.05	0.00	0.02	0.10	0.24	0.27	0.16
O4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.02	0.02	0.04	0.03	0.04	0.02	0.00	0.06	0.06	0.09	0.06
O5'	0.05	0.10	0.04	0.06	0.14	0.01	0.13	0.01	0.11	0.09	0.13	0.16	0.10	0.04	0.10	0.06	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.07	0.14	0.13	0.16	0.17	0.07	0.15	0.04	0.11	0.10	0.16	0.19	0.14	0.13	0.24	0.06	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.13	0.27	0.15	0.16	0.32	0.10	0.27	0.10	0.20	0.20	0.32	0.36	0.26	0.15	0.27	0.09	0.02	0.02	0.00	0.00
P	0.06	0.13	0.08	0.09	0.17	0.03	0.14	0.01	0.10	0.10	0.16	0.19	0.13	0.08	0.16	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.28	0.39	0.30	0.16	0.54	0.18	0.58	0.27	0.52	0.39	0.46	0.36	0.41	0.07	0.56	0.24	0.25	0.16	0.19	0.15
C2	0.32	0.48	0.32	0.13	0.68	0.17	0.71	0.27	0.61	0.47	0.58	0.42	0.42	0.08	0.72	0.27	0.28	0.16	0.26	0.17
C2'	0.24	0.34	0.28	0.17	0.49	0.18	0.55	0.29	0.48	0.35	0.41	0.31	0.37	0.07	0.51	0.22	0.28	0.17	0.24	0.19
C3'	0.19	0.27	0.25	0.16	0.38	0.16	0.43	0.27	0.38	0.27	0.31	0.28	0.31	0.08	0.38	0.17	0.25	0.13	0.21	0.17
C4	0.31	0.46	0.29	0.12	0.64	0.17	0.67	0.26	0.58	0.45	0.55	0.40	0.36	0.13	0.67	0.29	0.28	0.16	0.27	0.19
C4'	0.16	0.25	0.20	0.13	0.32	0.13	0.36	0.21	0.32	0.22	0.29	0.29	0.31	0.06	0.33	0.13	0.16	0.13	0.13	0.09
C5	0.29	0.40	0.29	0.12	0.53	0.18	0.56	0.28	0.51	0.41	0.46	0.35	0.34	0.12	0.54	0.28	0.28	0.15	0.20	0.16
C5'	0.14	0.24	0.17	0.12	0.24	0.13	0.23	0.17	0.20	0.17	0.25	0.31	0.26	0.11	0.25	0.12	0.11	0.17	0.14	0.10
C6	0.28	0.38	0.30	0.14	0.51	0.19	0.55	0.29	0.50	0.39	0.44	0.34	0.38	0.08	0.51	0.26	0.26	0.16	0.19	0.15
N1	0.30	0.43	0.31	0.14	0.59	0.18	0.63	0.28	0.56	0.43	0.50	0.38	0.41	0.07	0.61	0.26	0.27	0.16	0.22	0.16
N3	0.32	0.50	0.31	0.12	0.70	0.17	0.73	0.26	0.62	0.48	0.60	0.43	0.39	0.11	0.75	0.28	0.28	0.16	0.28	0.19
N4	0.30	0.47	0.28	0.13	0.65	0.17	0.66	0.23	0.56	0.44	0.56	0.41	0.32	0.15	0.69	0.29	0.27	0.16	0.29	0.20
O2	0.33	0.51	0.33	0.14	0.73	0.17	0.75	0.26	0.64	0.49	0.62	0.44	0.44	0.07	0.78	0.27	0.28	0.17	0.27	0.18
O2'	0.23	0.34	0.27	0.16	0.49	0.17	0.54	0.28	0.47	0.34	0.40	0.33	0.37	0.07	0.51	0.20	0.27	0.17	0.22	0.18
O3'	0.18	0.24	0.23	0.19	0.32	0.18	0.37	0.28	0.33	0.23	0.27	0.29	0.27	0.14	0.32	0.17	0.26	0.16	0.23	0.20
O4'	0.24	0.34	0.26	0.16	0.44	0.18	0.48	0.25	0.43	0.33	0.39	0.34	0.40	0.10	0.45	0.21	0.20	0.16	0.14	0.11
O5'	0.11	0.20	0.16	0.07	0.22	0.09	0.24	0.13	0.21	0.16	0.21	0.23	0.23	0.02	0.22	0.07	0.10	0.18	0.09	0.08
OP1	0.19	0.28	0.33	0.12	0.30	0.10	0.30	0.10	0.27	0.25	0.30	0.29	0.40	0.04	0.31	0.11	0.12	0.22	0.14	0.13
OP2	0.14	0.09	0.05	0.15	0.10	0.27	0.12	0.29	0.13	0.11	0.08	0.09	0.16	0.03	0.10	0.24	0.26	0.41	0.30	0.32
P	0.03	0.09	0.12	0.02	0.11	0.09	0.13	0.10	0.12	0.07	0.10	0.13	0.19	0.01	0.12	0.07	0.08	0.23	0.11	0.12

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.11	0.02	0.00	0.08	0.07	0.15	0.10
C2	0.01	0.00	0.06	0.04	0.01	0.05	0.01	0.09	0.01	0.00	0.00	0.01	0.14	0.13	0.01	0.07	0.11	0.16	0.29	0.20
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.05	0.01	0.08	0.08	0.10	0.02	0.04	0.12	0.00	0.02	0.06	0.01	0.22	0.23	0.19	0.20
C3'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.08	0.01	0.10	0.03	0.09	0.05	0.05	0.05	0.02	0.01	0.08	0.01	0.12	0.16	0.06	0.10
C4	0.01	0.01	0.05	0.08	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.17	0.05	0.01	0.03	0.14	0.26	0.38	0.26
C4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.05	0.00	0.07	0.01	0.07	0.02	0.04	0.08	0.10	0.02	0.05	0.00	0.02	0.07	0.11	0.02
C5	0.01	0.01	0.08	0.10	0.00	0.07	0.00	0.12	0.00	0.01	0.01	0.01	0.19	0.05	0.01	0.06	0.14	0.26	0.36	0.25
C5'	0.04	0.09	0.08	0.03	0.10	0.01	0.12	0.00	0.12	0.07	0.10	0.12	0.05	0.08	0.11	0.01	0.01	0.06	0.14	0.01
C6	0.01	0.01	0.10	0.09	0.01	0.07	0.00	0.12	0.00	0.01	0.01	0.01	0.17	0.05	0.01	0.08	0.13	0.20	0.30	0.21
N1	0.00	0.00	0.02	0.05	0.01	0.02	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.07	0.01	0.01	0.10	0.13	0.25	0.16
N3	0.01	0.00	0.04	0.05	0.00	0.04	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.16	0.10	0.01	0.06	0.12	0.21	0.35	0.24
O2	0.02	0.01	0.12	0.05	0.01	0.08	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00	0.22	0.19	0.01	0.13	0.12	0.14	0.28	0.20
O2'	0.02	0.14	0.00	0.02	0.17	0.10	0.19	0.05	0.17	0.08	0.16	0.22	0.00	0.04	0.20	0.06	0.21	0.25	0.24	0.21
O3'	0.11	0.13	0.02	0.01	0.05	0.02	0.05	0.08	0.05	0.07	0.10	0.19	0.04	0.00	0.06	0.07	0.10	0.17	0.08	0.10
O4	0.02	0.01	0.06	0.08	0.01	0.05	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.20	0.06	0.00	0.04	0.14	0.29	0.40	0.28
O4'	0.00	0.07	0.01	0.01	0.03	0.00	0.06	0.01	0.08	0.01	0.06	0.13	0.06	0.07	0.04	0.00	0.07	0.07	0.18	0.12
O5'	0.08	0.11	0.22	0.12	0.14	0.02	0.14	0.01	0.13	0.10	0.12	0.12	0.21	0.10	0.14	0.07	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.07	0.16	0.23	0.16	0.26	0.07	0.26	0.06	0.20	0.13	0.21	0.14	0.25	0.17	0.29	0.07	0.01	0.00	0.02	0.01
OP2	0.15	0.29	0.19	0.06	0.38	0.11	0.36	0.14	0.30	0.25	0.35	0.28	0.24	0.08	0.40	0.18	0.02	0.02	0.00	0.00
P	0.10	0.20	0.20	0.10	0.26	0.02	0.25	0.01	0.21	0.16	0.24	0.20	0.21	0.10	0.28	0.12	0.00	0.01	0.00	0.00