Doublet Group distance statistics: 49274

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 6, 8, 6, 6, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.007, 0.011, 0.014, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.011 std_dev=0.003
N3	A	0, 0.011, 0.015, 0.020, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.015 std_dev=0.005
N1	A	0, 0.017, 0.026, 0.035, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.026 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.021, 0.033, 0.044, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.033 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.021, 0.033, 0.045, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.033 std_dev=0.012
C6	A	0, 0.018, 0.030, 0.042, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.030 std_dev=0.012
C2	A	0, 0.018, 0.031, 0.043, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.031 std_dev=0.013
O2	A	0, 0.045, 0.078, 0.111, 0.161 max_d=0.161 avg_d=0.078 std_dev=0.033
N4	A	0, 0.042, 0.083, 0.124, 0.183 max_d=0.183 avg_d=0.083 std_dev=0.041
P	B	0, 0.298, 0.458, 0.619, 0.768 max_d=0.768 avg_d=0.458 std_dev=0.161
OP2	B	0, 0.320, 0.481, 0.642, 0.766 max_d=0.766 avg_d=0.481 std_dev=0.161
O4'	A	0, -0.062, 0.101, 0.263, 0.950 max_d=0.950 avg_d=0.101 std_dev=0.162
C2'	A	0, 0.240, 0.403, 0.566, 1.139 max_d=1.139 avg_d=0.403 std_dev=0.163
C4'	A	0, 0.746, 0.960, 1.175, 1.388 max_d=1.388 avg_d=0.960 std_dev=0.215
C3'	B	0, 0.439, 0.708, 0.978, 1.853 max_d=1.853 avg_d=0.708 std_dev=0.270
C2'	B	0, 0.215, 0.505, 0.795, 1.752 max_d=1.752 avg_d=0.505 std_dev=0.290
C3'	A	0, 1.161, 1.477, 1.792, 1.978 max_d=1.978 avg_d=1.477 std_dev=0.315
O2'	A	0, 0.862, 1.181, 1.499, 2.000 max_d=2.000 avg_d=1.181 std_dev=0.318
OP1	B	0, 0.236, 0.565, 0.893, 1.941 max_d=1.941 avg_d=0.565 std_dev=0.328
O2'	B	0, 1.061, 1.397, 1.734, 1.940 max_d=1.940 avg_d=1.397 std_dev=0.336
C5'	A	0, 1.062, 1.407, 1.753, 2.330 max_d=2.330 avg_d=1.407 std_dev=0.346
O3'	B	0, 1.444, 1.808, 2.172, 2.471 max_d=2.471 avg_d=1.808 std_dev=0.364
P	A	0, 1.401, 1.770, 2.139, 2.254 max_d=2.254 avg_d=1.770 std_dev=0.369
O5'	B	0, 0.059, 0.434, 0.810, 2.167 max_d=2.167 avg_d=0.434 std_dev=0.375
O5'	A	0, 1.877, 2.337, 2.797, 2.845 max_d=2.845 avg_d=2.337 std_dev=0.460
C1'	B	0, 0.846, 1.320, 1.794, 3.135 max_d=3.135 avg_d=1.320 std_dev=0.474
C4'	B	0, 0.633, 1.121, 1.608, 3.259 max_d=3.259 avg_d=1.121 std_dev=0.487
C5'	B	0, 0.515, 1.019, 1.524, 3.264 max_d=3.264 avg_d=1.019 std_dev=0.505
OP2	A	0, 2.235, 2.769, 3.304, 3.310 max_d=3.310 avg_d=2.769 std_dev=0.535
O3'	A	0, 2.198, 2.741, 3.284, 3.437 max_d=3.437 avg_d=2.741 std_dev=0.543
O4'	B	0, 1.077, 1.644, 2.211, 3.891 max_d=3.891 avg_d=1.644 std_dev=0.567
N1	B	0, 1.989, 2.558, 3.126, 3.855 max_d=3.855 avg_d=2.558 std_dev=0.568
C6	B	0, 2.393, 3.029, 3.664, 4.423 max_d=4.423 avg_d=3.029 std_dev=0.636
OP1	A	0, 1.856, 2.528, 3.200, 3.209 max_d=3.209 avg_d=2.528 std_dev=0.672
O2	B	0, 2.553, 3.250, 3.947, 3.868 max_d=3.868 avg_d=3.250 std_dev=0.697
C2	B	0, 2.823, 3.550, 4.277, 4.233 max_d=4.233 avg_d=3.550 std_dev=0.727
C5	B	0, 3.650, 4.527, 5.404, 5.457 max_d=5.457 avg_d=4.527 std_dev=0.877
N3	B	0, 4.032, 5.014, 5.996, 5.657 max_d=5.657 avg_d=5.014 std_dev=0.982
C4	B	0, 4.545, 5.626, 6.707, 6.228 max_d=6.228 avg_d=5.626 std_dev=1.081
O4	B	0, 5.723, 7.072, 8.422, 7.800 max_d=7.800 avg_d=7.072 std_dev=1.350

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.06	0.09	0.22	0.10
C2	0.01	0.00	0.07	0.09	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.10	0.10	0.04	0.05	0.08	0.18	0.08
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.03	0.02	0.04	0.01	0.06	0.02	0.06	0.04	0.12	0.00	0.02	0.01	0.05	0.13	0.26	0.12
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.12	0.00	0.13	0.02	0.12	0.07	0.11	0.13	0.11	0.02	0.01	0.01	0.05	0.14	0.23	0.11
C4	0.01	0.01	0.03	0.12	0.00	0.09	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.13	0.03	0.10	0.09	0.15	0.10
C4'	0.01	0.04	0.02	0.00	0.09	0.00	0.11	0.01	0.10	0.05	0.06	0.10	0.03	0.07	0.02	0.00	0.01	0.08	0.14	0.05
C5	0.01	0.01	0.04	0.13	0.00	0.11	0.00	0.13	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.14	0.04	0.12	0.10	0.17	0.10
C5'	0.01	0.05	0.01	0.02	0.12	0.01	0.13	0.00	0.11	0.05	0.08	0.13	0.03	0.06	0.03	0.01	0.01	0.05	0.06	0.01
C6	0.01	0.01	0.06	0.12	0.01	0.10	0.00	0.11	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.12	0.05	0.08	0.10	0.21	0.10
N1	0.00	0.01	0.02	0.07	0.01	0.05	0.01	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.06	0.02	0.05	0.08	0.20	0.09
N3	0.01	0.00	0.06	0.11	0.01	0.06	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.09	0.12	0.04	0.07	0.08	0.15	0.09
N4	0.01	0.02	0.04	0.13	0.00	0.10	0.01	0.13	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.05	0.15	0.04	0.13	0.10	0.13	0.11
O2	0.02	0.00	0.12	0.11	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.16	0.13	0.05	0.05	0.08	0.18	0.09
O2'	0.01	0.10	0.00	0.02	0.05	0.07	0.03	0.06	0.04	0.03	0.09	0.05	0.16	0.00	0.04	0.05	0.04	0.14	0.23	0.09
O3'	0.02	0.10	0.02	0.01	0.13	0.02	0.14	0.03	0.12	0.06	0.12	0.15	0.13	0.04	0.00	0.02	0.07	0.16	0.22	0.12
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.05	0.02	0.04	0.04	0.05	0.05	0.02	0.00	0.07	0.06	0.17	0.09
O5'	0.06	0.05	0.05	0.05	0.10	0.01	0.12	0.01	0.08	0.05	0.07	0.13	0.05	0.04	0.07	0.07	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.09	0.08	0.13	0.14	0.09	0.08	0.10	0.05	0.10	0.08	0.08	0.10	0.08	0.14	0.16	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.22	0.18	0.26	0.23	0.15	0.14	0.17	0.06	0.21	0.20	0.15	0.13	0.18	0.23	0.22	0.17	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.10	0.08	0.12	0.11	0.10	0.05	0.10	0.01	0.10	0.09	0.09	0.11	0.09	0.09	0.12	0.09	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.18	0.38	0.12	0.11	0.57	0.13	0.52	0.15	0.39	0.32	0.50	0.32	0.16	0.11	0.65	0.14	0.17	0.30	0.15	0.14
C2	0.15	0.40	0.11	0.08	0.66	0.09	0.58	0.10	0.40	0.32	0.56	0.34	0.17	0.09	0.78	0.11	0.12	0.24	0.13	0.12
C2'	0.12	0.31	0.09	0.07	0.54	0.09	0.50	0.12	0.37	0.27	0.44	0.24	0.19	0.08	0.63	0.10	0.15	0.34	0.17	0.16
C3'	0.07	0.19	0.09	0.05	0.40	0.05	0.41	0.11	0.30	0.18	0.30	0.12	0.23	0.05	0.47	0.06	0.12	0.33	0.16	0.15
C4	0.15	0.41	0.12	0.10	0.70	0.09	0.66	0.09	0.46	0.33	0.57	0.33	0.15	0.12	0.81	0.12	0.10	0.19	0.12	0.10
C4'	0.07	0.16	0.07	0.08	0.31	0.08	0.32	0.14	0.25	0.16	0.23	0.11	0.19	0.08	0.35	0.07	0.14	0.29	0.13	0.11
C5	0.19	0.43	0.10	0.09	0.69	0.10	0.69	0.11	0.53	0.39	0.57	0.34	0.12	0.11	0.76	0.15	0.14	0.25	0.16	0.13
C5'	0.09	0.09	0.10	0.08	0.18	0.08	0.22	0.15	0.18	0.10	0.12	0.13	0.24	0.10	0.21	0.07	0.14	0.28	0.13	0.11
C6	0.20	0.43	0.10	0.09	0.66	0.12	0.64	0.15	0.51	0.39	0.56	0.34	0.12	0.08	0.72	0.16	0.18	0.29	0.16	0.15
N1	0.18	0.41	0.11	0.09	0.64	0.11	0.59	0.13	0.44	0.34	0.55	0.34	0.15	0.09	0.73	0.13	0.16	0.28	0.15	0.14
N3	0.14	0.40	0.12	0.09	0.68	0.09	0.61	0.09	0.40	0.31	0.57	0.33	0.17	0.10	0.81	0.11	0.09	0.20	0.12	0.10
N4	0.14	0.39	0.14	0.13	0.68	0.12	0.64	0.11	0.43	0.31	0.55	0.32	0.16	0.15	0.80	0.12	0.11	0.15	0.10	0.10
O2	0.15	0.39	0.12	0.08	0.64	0.09	0.54	0.10	0.36	0.30	0.55	0.35	0.19	0.09	0.77	0.11	0.11	0.24	0.12	0.11
O2'	0.13	0.33	0.08	0.08	0.55	0.09	0.50	0.13	0.37	0.28	0.46	0.27	0.16	0.06	0.64	0.10	0.15	0.33	0.17	0.15
O3'	0.07	0.14	0.10	0.06	0.35	0.07	0.37	0.13	0.28	0.14	0.24	0.10	0.25	0.06	0.42	0.07	0.12	0.34	0.17	0.16
O4'	0.15	0.28	0.12	0.14	0.41	0.15	0.39	0.17	0.31	0.25	0.36	0.24	0.15	0.15	0.46	0.13	0.18	0.27	0.14	0.13
O5'	0.12	0.10	0.18	0.05	0.15	0.03	0.19	0.12	0.14	0.07	0.10	0.18	0.31	0.01	0.19	0.07	0.12	0.27	0.13	0.11
OP1	0.13	0.14	0.13	0.04	0.10	0.07	0.15	0.13	0.13	0.09	0.10	0.25	0.25	0.02	0.12	0.09	0.13	0.31	0.14	0.13
OP2	0.09	0.16	0.06	0.07	0.32	0.18	0.37	0.28	0.32	0.19	0.22	0.11	0.11	0.02	0.34	0.15	0.25	0.28	0.17	0.15
P	0.05	0.06	0.09	0.02	0.17	0.07	0.22	0.15	0.18	0.06	0.09	0.13	0.19	0.01	0.19	0.04	0.13	0.30	0.14	0.12

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.02	0.02	0.00	0.08	0.09	0.18	0.11
C2	0.02	0.00	0.05	0.08	0.01	0.03	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00	0.10	0.05	0.01	0.03	0.21	0.12	0.41	0.28
C2'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.05	0.02	0.04	0.02	0.04	0.02	0.05	0.06	0.00	0.01	0.05	0.01	0.03	0.24	0.10	0.07
C3'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.15	0.00	0.16	0.02	0.14	0.09	0.11	0.06	0.02	0.01	0.15	0.01	0.03	0.28	0.10	0.11
C4	0.02	0.01	0.05	0.15	0.00	0.08	0.01	0.18	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.13	0.00	0.02	0.34	0.36	0.65	0.49
C4'	0.01	0.03	0.02	0.00	0.08	0.00	0.11	0.01	0.10	0.05	0.05	0.04	0.08	0.01	0.09	0.00	0.02	0.15	0.04	0.03
C5	0.02	0.01	0.04	0.16	0.01	0.11	0.00	0.21	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.16	0.01	0.02	0.36	0.41	0.66	0.52
C5'	0.02	0.09	0.02	0.02	0.18	0.01	0.21	0.00	0.19	0.11	0.13	0.06	0.07	0.02	0.19	0.02	0.01	0.11	0.02	0.03
C6	0.01	0.01	0.04	0.14	0.01	0.10	0.00	0.19	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.14	0.01	0.02	0.31	0.30	0.51	0.42
N1	0.01	0.01	0.02	0.09	0.01	0.05	0.01	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.06	0.02	0.01	0.21	0.13	0.37	0.28
N3	0.02	0.00	0.05	0.11	0.01	0.05	0.01	0.13	0.01	0.01	0.00	0.01	0.10	0.08	0.01	0.03	0.28	0.23	0.54	0.39
O2	0.04	0.00	0.06	0.06	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.13	0.08	0.02	0.04	0.16	0.09	0.33	0.21
O2'	0.01	0.10	0.00	0.02	0.08	0.08	0.05	0.07	0.03	0.05	0.10	0.13	0.00	0.05	0.09	0.07	0.05	0.28	0.08	0.06
O3'	0.02	0.05	0.01	0.01	0.13	0.01	0.16	0.02	0.14	0.06	0.08	0.08	0.05	0.00	0.14	0.01	0.04	0.37	0.15	0.17
O4	0.02	0.01	0.05	0.15	0.00	0.09	0.01	0.19	0.01	0.02	0.01	0.02	0.09	0.14	0.00	0.02	0.36	0.42	0.72	0.54
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.03	0.04	0.07	0.01	0.02	0.00	0.06	0.08	0.14	0.10
O5'	0.08	0.21	0.03	0.03	0.34	0.02	0.36	0.01	0.31	0.21	0.28	0.16	0.05	0.04	0.36	0.06	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.09	0.12	0.24	0.28	0.36	0.15	0.41	0.11	0.30	0.13	0.23	0.09	0.28	0.37	0.42	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.18	0.41	0.10	0.10	0.65	0.04	0.66	0.02	0.51	0.37	0.54	0.33	0.08	0.15	0.72	0.14	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.11	0.28	0.07	0.11	0.49	0.03	0.52	0.03	0.42	0.28	0.39	0.21	0.06	0.17	0.54	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00