Doublet Group distance statistics: 49278

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 1, 3, 2, 5, 0, 1, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.001, 0.003, 0.005, 0.008 max_d=0.008 avg_d=0.003 std_dev=0.002
N3	A	0, 0.000, 0.003, 0.006, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.003 std_dev=0.003
N1	A	0, -0.001, 0.006, 0.013, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.006 std_dev=0.007
C4	A	0, 0.000, 0.008, 0.015, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.008 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.000, 0.008, 0.015, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.008 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.000, 0.008, 0.015, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.008 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.000, 0.008, 0.017, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.008 std_dev=0.008
O2	A	0, 0.001, 0.018, 0.036, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.018 std_dev=0.018
N4	A	0, 0.001, 0.025, 0.050, 0.099 max_d=0.099 avg_d=0.025 std_dev=0.025
O3'	A	0, 0.001, 0.101, 0.201, 0.407 max_d=0.407 avg_d=0.101 std_dev=0.100
C4'	A	0, 0.000, 0.111, 0.222, 0.496 max_d=0.496 avg_d=0.111 std_dev=0.111
C3'	A	0, -0.017, 0.095, 0.207, 0.424 max_d=0.424 avg_d=0.095 std_dev=0.112
O4'	A	0, -0.024, 0.091, 0.206, 0.498 max_d=0.498 avg_d=0.091 std_dev=0.115
C2'	A	0, -0.039, 0.098, 0.235, 0.536 max_d=0.536 avg_d=0.098 std_dev=0.137
P	B	0, 0.252, 0.462, 0.671, 0.779 max_d=0.779 avg_d=0.462 std_dev=0.210
O5'	B	0, 0.256, 0.483, 0.711, 1.002 max_d=1.002 avg_d=0.483 std_dev=0.228
O2'	A	0, -0.056, 0.172, 0.401, 0.900 max_d=0.900 avg_d=0.172 std_dev=0.228
C5'	A	0, -0.020, 0.211, 0.442, 0.988 max_d=0.988 avg_d=0.211 std_dev=0.231
OP1	B	0, 0.280, 0.534, 0.789, 0.945 max_d=0.945 avg_d=0.534 std_dev=0.255
OP2	B	0, 0.222, 0.494, 0.766, 1.078 max_d=1.078 avg_d=0.494 std_dev=0.272
O3'	B	0, 0.186, 0.501, 0.817, 1.486 max_d=1.486 avg_d=0.501 std_dev=0.316
P	A	0, 0.082, 0.406, 0.729, 1.539 max_d=1.539 avg_d=0.406 std_dev=0.324
OP2	A	0, 0.173, 0.525, 0.876, 1.684 max_d=1.684 avg_d=0.525 std_dev=0.351
C5'	B	0, 0.259, 0.621, 0.983, 1.538 max_d=1.538 avg_d=0.621 std_dev=0.362
C3'	B	0, 0.190, 0.575, 0.960, 1.878 max_d=1.878 avg_d=0.575 std_dev=0.385
OP1	A	0, 0.039, 0.440, 0.840, 1.865 max_d=1.865 avg_d=0.440 std_dev=0.400
C2'	B	0, 0.309, 0.723, 1.136, 1.953 max_d=1.953 avg_d=0.723 std_dev=0.414
C4'	B	0, 0.221, 0.660, 1.099, 2.081 max_d=2.081 avg_d=0.660 std_dev=0.439
C1'	B	0, 0.330, 0.794, 1.259, 2.272 max_d=2.272 avg_d=0.794 std_dev=0.464
O4'	B	0, 0.283, 0.752, 1.220, 2.293 max_d=2.293 avg_d=0.752 std_dev=0.468
O5'	A	0, -0.172, 0.334, 0.839, 2.184 max_d=2.184 avg_d=0.334 std_dev=0.505
N1	B	0, 0.360, 0.868, 1.377, 2.487 max_d=2.487 avg_d=0.868 std_dev=0.509
O2'	B	0, 0.297, 0.893, 1.489, 2.311 max_d=2.311 avg_d=0.893 std_dev=0.596
C6	B	0, 0.242, 0.988, 1.734, 3.354 max_d=3.354 avg_d=0.988 std_dev=0.746
C2	B	0, 0.294, 1.092, 1.891, 3.344 max_d=3.344 avg_d=1.092 std_dev=0.798
C5	B	0, 0.175, 1.137, 2.099, 4.082 max_d=4.082 avg_d=1.137 std_dev=0.962
N3	B	0, 0.234, 1.218, 2.202, 4.011 max_d=4.011 avg_d=1.218 std_dev=0.984
C4	B	0, 0.220, 1.208, 2.196, 4.158 max_d=4.158 avg_d=1.208 std_dev=0.988
O2	B	0, 0.117, 1.268, 2.419, 4.307 max_d=4.307 avg_d=1.268 std_dev=1.151
O4	B	0, 0.119, 1.396, 2.672, 5.123 max_d=5.123 avg_d=1.396 std_dev=1.276

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.14	0.23	0.26	0.09
C2	0.01	0.00	0.04	0.02	0.00	0.01	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.04	0.03	0.20	0.18	0.29	0.11
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.03	0.01	0.07	0.03	0.07	0.02	0.02	0.03	0.09	0.00	0.01	0.00	0.07	0.31	0.27	0.15
C3'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.05	0.02	0.01	0.03	0.05	0.01	0.00	0.00	0.08	0.33	0.24	0.13
C4	0.01	0.00	0.03	0.03	0.00	0.03	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.04	0.01	0.31	0.16	0.20	0.11
C4'	0.00	0.01	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.04	0.02	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.24	0.19	0.05
C5	0.01	0.00	0.07	0.05	0.00	0.04	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.08	0.04	0.03	0.37	0.17	0.17	0.13
C5'	0.02	0.04	0.03	0.01	0.08	0.00	0.09	0.00	0.09	0.05	0.06	0.08	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.18	0.11	0.01
C6	0.00	0.00	0.07	0.05	0.00	0.04	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.08	0.04	0.04	0.35	0.19	0.17	0.12
N1	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.03	0.01	0.24	0.19	0.24	0.10
N3	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.04	0.02	0.25	0.17	0.26	0.11
N4	0.01	0.00	0.03	0.03	0.00	0.03	0.01	0.08	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.04	0.02	0.32	0.15	0.19	0.12
O2	0.01	0.00	0.09	0.05	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.15	0.05	0.05	0.13	0.18	0.33	0.13
O2'	0.01	0.06	0.00	0.01	0.04	0.01	0.08	0.03	0.08	0.02	0.04	0.05	0.15	0.00	0.02	0.00	0.05	0.36	0.30	0.18
O3'	0.03	0.04	0.01	0.00	0.04	0.01	0.04	0.02	0.04	0.03	0.04	0.04	0.05	0.02	0.00	0.02	0.10	0.34	0.24	0.13
O4'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.02	0.02	0.05	0.00	0.02	0.00	0.13	0.17	0.23	0.06
O5'	0.14	0.20	0.07	0.08	0.31	0.01	0.37	0.01	0.35	0.24	0.25	0.32	0.13	0.05	0.10	0.13	0.00	0.01	0.00	0.00
OP1	0.23	0.18	0.31	0.33	0.16	0.24	0.17	0.18	0.19	0.19	0.17	0.15	0.18	0.36	0.34	0.17	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.26	0.29	0.27	0.24	0.20	0.19	0.17	0.11	0.17	0.24	0.26	0.19	0.33	0.30	0.24	0.23	0.00	0.00	0.00	0.00
P	0.09	0.11	0.15	0.13	0.11	0.05	0.13	0.01	0.12	0.10	0.11	0.12	0.13	0.18	0.13	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.29	0.16	0.42	0.35	0.46	0.36	0.43	0.31	0.25	0.12	0.32	0.19	0.62	0.20	0.59	0.26	0.14	0.17	0.33	0.19
C2	0.30	0.29	0.49	0.39	0.51	0.44	0.33	0.43	0.17	0.15	0.48	0.31	0.62	0.23	0.67	0.29	0.14	0.16	0.27	0.16
C2'	0.24	0.16	0.29	0.26	0.44	0.28	0.45	0.18	0.29	0.15	0.30	0.18	0.43	0.15	0.55	0.22	0.19	0.26	0.42	0.27
C3'	0.23	0.15	0.25	0.22	0.45	0.22	0.55	0.13	0.41	0.17	0.24	0.28	0.41	0.13	0.55	0.20	0.22	0.24	0.40	0.26
C4	0.31	0.38	0.52	0.36	0.45	0.43	0.26	0.46	0.29	0.19	0.53	0.48	0.58	0.20	0.59	0.29	0.17	0.16	0.24	0.15
C4'	0.24	0.16	0.28	0.24	0.47	0.23	0.60	0.17	0.45	0.17	0.24	0.33	0.54	0.15	0.57	0.21	0.22	0.20	0.36	0.23
C5	0.31	0.33	0.51	0.35	0.38	0.40	0.24	0.43	0.27	0.18	0.45	0.41	0.57	0.18	0.50	0.27	0.15	0.17	0.31	0.16
C5'	0.20	0.18	0.18	0.15	0.46	0.14	0.62	0.09	0.51	0.21	0.23	0.35	0.41	0.12	0.53	0.16	0.30	0.25	0.42	0.29
C6	0.30	0.24	0.50	0.36	0.39	0.39	0.26	0.38	0.18	0.14	0.38	0.26	0.60	0.19	0.50	0.27	0.13	0.17	0.33	0.18
N1	0.30	0.23	0.47	0.37	0.45	0.40	0.33	0.38	0.17	0.13	0.39	0.23	0.62	0.21	0.59	0.28	0.13	0.17	0.31	0.17
N3	0.31	0.36	0.51	0.39	0.50	0.45	0.28	0.46	0.22	0.17	0.54	0.42	0.60	0.22	0.67	0.30	0.16	0.16	0.24	0.15
N4	0.31	0.45	0.52	0.35	0.45	0.41	0.32	0.46	0.39	0.22	0.59	0.60	0.55	0.20	0.59	0.29	0.21	0.16	0.16	0.14
O2	0.30	0.28	0.47	0.39	0.55	0.44	0.39	0.43	0.19	0.14	0.48	0.27	0.62	0.24	0.73	0.30	0.14	0.16	0.26	0.15
O2'	0.24	0.18	0.29	0.26	0.44	0.28	0.42	0.20	0.27	0.15	0.32	0.18	0.41	0.15	0.56	0.22	0.18	0.28	0.42	0.27
O3'	0.24	0.15	0.27	0.23	0.47	0.24	0.59	0.16	0.43	0.17	0.24	0.32	0.48	0.13	0.59	0.21	0.20	0.22	0.39	0.24
O4'	0.29	0.15	0.43	0.36	0.47	0.35	0.51	0.31	0.32	0.12	0.27	0.25	0.69	0.24	0.59	0.26	0.16	0.14	0.30	0.17
O5'	0.09	0.18	0.11	0.11	0.53	0.13	0.63	0.31	0.52	0.26	0.33	0.14	0.16	0.01	0.60	0.11	0.53	0.46	0.68	0.55
OP1	0.28	0.34	0.06	0.03	0.09	0.14	0.21	0.16	0.17	0.16	0.23	0.58	0.10	0.01	0.10	0.28	0.21	0.21	0.37	0.21
OP2	0.18	0.15	0.08	0.10	0.19	0.14	0.16	0.27	0.12	0.11	0.18	0.19	0.07	0.01	0.22	0.17	0.27	0.34	0.44	0.33
P	0.16	0.11	0.03	0.01	0.17	0.07	0.26	0.20	0.20	0.03	0.07	0.28	0.02	0.00	0.21	0.14	0.29	0.26	0.42	0.30

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.20	0.01	0.00	0.12	0.21	0.12	0.14
C2	0.01	0.00	0.13	0.10	0.00	0.19	0.01	0.28	0.00	0.01	0.00	0.00	0.37	0.21	0.01	0.22	0.46	0.42	0.46	0.46
C2'	0.00	0.13	0.00	0.00	0.04	0.00	0.07	0.15	0.11	0.02	0.10	0.20	0.00	0.01	0.04	0.01	0.22	0.24	0.21	0.24
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.18	0.00	0.21	0.01	0.18	0.11	0.14	0.08	0.01	0.00	0.20	0.01	0.16	0.15	0.10	0.08
C4	0.01	0.00	0.04	0.18	0.00	0.07	0.00	0.13	0.01	0.01	0.00	0.01	0.24	0.06	0.00	0.02	0.30	0.46	0.29	0.31
C4'	0.01	0.19	0.00	0.00	0.07	0.00	0.11	0.01	0.15	0.04	0.16	0.31	0.17	0.01	0.09	0.00	0.01	0.11	0.06	0.04
C5	0.01	0.01	0.07	0.21	0.00	0.11	0.00	0.30	0.00	0.00	0.00	0.01	0.08	0.14	0.00	0.17	0.35	0.84	0.50	0.59
C5'	0.06	0.28	0.15	0.01	0.13	0.01	0.30	0.00	0.36	0.08	0.24	0.51	0.03	0.11	0.14	0.00	0.01	0.18	0.07	0.01
C6	0.01	0.00	0.11	0.18	0.01	0.15	0.00	0.36	0.00	0.00	0.00	0.01	0.07	0.13	0.01	0.23	0.39	0.82	0.53	0.62
N1	0.00	0.01	0.02	0.11	0.01	0.04	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.13	0.09	0.01	0.01	0.20	0.32	0.17	0.21
N3	0.01	0.00	0.10	0.14	0.00	0.16	0.00	0.24	0.00	0.01	0.00	0.01	0.37	0.14	0.01	0.15	0.46	0.39	0.48	0.45
O2	0.01	0.00	0.20	0.08	0.01	0.31	0.01	0.51	0.01	0.01	0.01	0.00	0.49	0.37	0.01	0.40	0.66	0.81	0.75	0.77
O2'	0.01	0.37	0.00	0.01	0.24	0.17	0.08	0.03	0.07	0.13	0.37	0.49	0.00	0.03	0.27	0.12	0.21	0.19	0.15	0.18
O3'	0.20	0.21	0.01	0.00	0.06	0.01	0.14	0.11	0.13	0.09	0.14	0.37	0.03	0.00	0.07	0.14	0.16	0.14	0.20	0.12
O4	0.01	0.01	0.04	0.20	0.00	0.09	0.00	0.14	0.01	0.01	0.01	0.01	0.27	0.07	0.00	0.02	0.33	0.46	0.34	0.34
O4'	0.00	0.22	0.01	0.01	0.02	0.00	0.17	0.00	0.23	0.01	0.15	0.40	0.12	0.14	0.02	0.00	0.02	0.13	0.08	0.06
O5'	0.12	0.46	0.22	0.16	0.30	0.01	0.35	0.01	0.39	0.20	0.46	0.66	0.21	0.16	0.33	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.21	0.42	0.24	0.15	0.46	0.11	0.84	0.18	0.82	0.32	0.39	0.81	0.19	0.14	0.46	0.13	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.12	0.46	0.21	0.10	0.29	0.06	0.50	0.07	0.53	0.17	0.48	0.75	0.15	0.20	0.34	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.14	0.46	0.24	0.08	0.31	0.04	0.59	0.01	0.62	0.21	0.45	0.77	0.18	0.12	0.34	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00