Doublet Group distance statistics: 49284

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.002, 0.015, 0.028, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.015 std_dev=0.013
N3	A	0, 0.005, 0.025, 0.046, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.025 std_dev=0.020
C4	A	0, 0.001, 0.021, 0.041, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.021 std_dev=0.020
C2	A	0, 0.000, 0.026, 0.052, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.026 std_dev=0.026
C6	A	0, -0.001, 0.028, 0.058, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.028 std_dev=0.030
C1'	A	0, 0.006, 0.036, 0.067, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.036 std_dev=0.030
N1	A	0, 0.006, 0.040, 0.073, 0.082 max_d=0.082 avg_d=0.040 std_dev=0.033
N4	A	0, 0.005, 0.044, 0.083, 0.095 max_d=0.095 avg_d=0.044 std_dev=0.039
O4'	A	0, 0.010, 0.072, 0.134, 0.152 max_d=0.152 avg_d=0.072 std_dev=0.062
O2	A	0, -0.012, 0.064, 0.140, 0.171 max_d=0.171 avg_d=0.064 std_dev=0.076
C2'	A	0, 0.000, 0.092, 0.184, 0.218 max_d=0.218 avg_d=0.092 std_dev=0.092
O2'	A	0, 0.034, 0.156, 0.279, 0.299 max_d=0.299 avg_d=0.156 std_dev=0.123
C4'	A	0, 0.031, 0.174, 0.317, 0.350 max_d=0.350 avg_d=0.174 std_dev=0.143
C3'	A	0, -0.008, 0.162, 0.332, 0.397 max_d=0.397 avg_d=0.162 std_dev=0.170
O4	B	0, 0.052, 0.225, 0.397, 0.419 max_d=0.419 avg_d=0.225 std_dev=0.173
C4	B	0, 0.073, 0.248, 0.424, 0.379 max_d=0.379 avg_d=0.248 std_dev=0.176
C2'	B	0, 0.058, 0.252, 0.446, 0.472 max_d=0.472 avg_d=0.252 std_dev=0.194
O3'	A	0, -0.007, 0.196, 0.398, 0.474 max_d=0.474 avg_d=0.196 std_dev=0.202
O3'	B	0, 0.040, 0.249, 0.457, 0.510 max_d=0.510 avg_d=0.249 std_dev=0.208
C5'	A	0, 0.084, 0.297, 0.510, 0.485 max_d=0.485 avg_d=0.297 std_dev=0.213
C1'	B	0, 0.088, 0.309, 0.530, 0.506 max_d=0.506 avg_d=0.309 std_dev=0.221
O2'	B	0, 0.093, 0.317, 0.541, 0.478 max_d=0.478 avg_d=0.317 std_dev=0.224
N1	B	0, 0.087, 0.317, 0.547, 0.540 max_d=0.540 avg_d=0.317 std_dev=0.230
C3'	B	0, 0.023, 0.263, 0.502, 0.579 max_d=0.579 avg_d=0.263 std_dev=0.239
P	A	0, 0.106, 0.364, 0.622, 0.570 max_d=0.570 avg_d=0.364 std_dev=0.258
O5'	A	0, 0.111, 0.378, 0.646, 0.576 max_d=0.576 avg_d=0.378 std_dev=0.268
O4'	B	0, 0.106, 0.383, 0.659, 0.645 max_d=0.645 avg_d=0.383 std_dev=0.277
C4'	B	0, 0.102, 0.391, 0.679, 0.687 max_d=0.687 avg_d=0.391 std_dev=0.288
OP2	B	0, 0.123, 0.455, 0.787, 0.784 max_d=0.784 avg_d=0.455 std_dev=0.332
C5'	B	0, 0.135, 0.476, 0.817, 0.780 max_d=0.780 avg_d=0.476 std_dev=0.341
O5'	B	0, 0.105, 0.461, 0.816, 0.866 max_d=0.866 avg_d=0.461 std_dev=0.356
P	B	0, 0.103, 0.462, 0.821, 0.875 max_d=0.875 avg_d=0.462 std_dev=0.359
OP2	A	0, 0.115, 0.476, 0.837, 0.873 max_d=0.873 avg_d=0.476 std_dev=0.361
OP1	A	0, 0.155, 0.529, 0.904, 0.798 max_d=0.798 avg_d=0.529 std_dev=0.374
OP1	B	0, 0.170, 0.587, 1.003, 0.924 max_d=0.924 avg_d=0.587 std_dev=0.416
C2	B	0, 0.416, 1.422, 2.428, 2.181 max_d=2.181 avg_d=1.422 std_dev=1.006
N3	B	0, 0.419, 1.437, 2.456, 2.241 max_d=2.241 avg_d=1.437 std_dev=1.019
C5	B	0, 0.503, 1.720, 2.936, 2.624 max_d=2.624 avg_d=1.720 std_dev=1.217
C6	B	0, 0.522, 1.781, 3.040, 2.672 max_d=2.672 avg_d=1.781 std_dev=1.259
O2	B	0, 0.811, 2.771, 4.730, 4.195 max_d=4.195 avg_d=2.771 std_dev=1.960

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.06	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.03	0.10	0.01	0.02	0.00	0.03	0.08	0.12	0.05
C2	0.06	0.00	0.07	0.11	0.01	0.08	0.01	0.08	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.07	0.11	0.04	0.09	0.07	0.07	0.04
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.05	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.08	0.06	0.12	0.00	0.02	0.01	0.05	0.15	0.16	0.10
C3'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.11	0.01	0.07	0.01	0.04	0.06	0.13	0.11	0.14	0.03	0.00	0.01	0.03	0.13	0.14	0.09
C4	0.03	0.01	0.05	0.11	0.00	0.06	0.00	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.05	0.11	0.02	0.09	0.08	0.05	0.07
C4'	0.01	0.08	0.02	0.01	0.06	0.00	0.03	0.01	0.03	0.05	0.08	0.06	0.13	0.04	0.03	0.00	0.01	0.05	0.09	0.04
C5	0.01	0.01	0.02	0.07	0.00	0.03	0.00	0.08	0.00	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.07	0.03	0.07	0.07	0.04	0.06
C5'	0.01	0.08	0.01	0.01	0.08	0.01	0.08	0.00	0.07	0.06	0.08	0.09	0.10	0.04	0.04	0.01	0.00	0.07	0.02	0.01
C6	0.01	0.00	0.01	0.04	0.01	0.03	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.03	0.05	0.03	0.02	0.03
N1	0.02	0.01	0.01	0.06	0.01	0.05	0.02	0.06	0.00	0.00	0.02	0.01	0.03	0.02	0.06	0.02	0.06	0.04	0.07	0.02
N3	0.05	0.01	0.08	0.13	0.00	0.08	0.01	0.08	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.08	0.13	0.03	0.10	0.08	0.05	0.06
N4	0.03	0.00	0.06	0.11	0.00	0.06	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.12	0.02	0.10	0.11	0.09	0.10
O2	0.10	0.00	0.12	0.14	0.00	0.13	0.02	0.10	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.13	0.14	0.09	0.09	0.08	0.10	0.04
O2'	0.01	0.07	0.00	0.03	0.05	0.04	0.02	0.04	0.01	0.02	0.08	0.05	0.13	0.00	0.02	0.03	0.03	0.15	0.17	0.10
O3'	0.02	0.11	0.02	0.00	0.11	0.03	0.07	0.04	0.04	0.06	0.13	0.12	0.14	0.02	0.00	0.02	0.02	0.16	0.15	0.10
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.02	0.03	0.02	0.09	0.03	0.02	0.00	0.05	0.06	0.11	0.06
O5'	0.03	0.09	0.05	0.03	0.09	0.01	0.07	0.00	0.05	0.06	0.10	0.10	0.09	0.03	0.02	0.05	0.00	0.03	0.01	0.00
OP1	0.08	0.07	0.15	0.13	0.08	0.05	0.07	0.07	0.03	0.04	0.08	0.11	0.08	0.15	0.16	0.06	0.03	0.00	0.01	0.01
OP2	0.12	0.07	0.16	0.14	0.05	0.09	0.04	0.02	0.02	0.07	0.05	0.09	0.10	0.17	0.15	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.05	0.04	0.10	0.09	0.07	0.04	0.06	0.01	0.03	0.02	0.06	0.10	0.04	0.10	0.10	0.06	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.04	0.52	0.05	0.05	0.07	0.05	0.68	0.09	0.73	0.11	0.50	1.07	0.09	0.03	0.04	0.03	0.07	0.09	0.32	0.14
C2	0.04	0.57	0.07	0.10	0.04	0.10	0.66	0.14	0.69	0.06	0.55	1.12	0.10	0.07	0.04	0.08	0.08	0.17	0.35	0.17
C2'	0.05	0.50	0.05	0.02	0.08	0.06	0.67	0.11	0.72	0.13	0.47	1.02	0.06	0.05	0.04	0.06	0.06	0.13	0.35	0.17
C3'	0.08	0.44	0.07	0.03	0.10	0.05	0.63	0.09	0.69	0.15	0.41	0.93	0.07	0.06	0.05	0.07	0.08	0.09	0.30	0.14
C4	0.03	0.52	0.05	0.10	0.06	0.12	0.60	0.16	0.63	0.07	0.49	1.02	0.07	0.08	0.04	0.09	0.09	0.19	0.30	0.16
C4'	0.08	0.43	0.06	0.05	0.12	0.06	0.61	0.10	0.67	0.16	0.39	0.90	0.05	0.05	0.07	0.08	0.05	0.08	0.31	0.15
C5	0.02	0.53	0.06	0.12	0.06	0.12	0.59	0.14	0.65	0.07	0.48	1.04	0.08	0.10	0.04	0.08	0.09	0.11	0.28	0.13
C5'	0.11	0.38	0.09	0.09	0.13	0.10	0.53	0.14	0.59	0.18	0.33	0.79	0.05	0.08	0.09	0.12	0.04	0.09	0.32	0.18
C6	0.05	0.56	0.09	0.13	0.04	0.11	0.63	0.13	0.69	0.07	0.51	1.11	0.11	0.10	0.01	0.07	0.09	0.07	0.30	0.13
N1	0.05	0.57	0.08	0.10	0.04	0.10	0.65	0.12	0.70	0.07	0.54	1.13	0.11	0.07	0.04	0.06	0.08	0.10	0.32	0.14
N3	0.03	0.55	0.06	0.10	0.04	0.11	0.63	0.15	0.66	0.06	0.52	1.07	0.08	0.07	0.00	0.09	0.08	0.21	0.33	0.18
N4	0.05	0.49	0.05	0.10	0.09	0.13	0.54	0.17	0.56	0.07	0.46	0.93	0.06	0.08	0.09	0.12	0.11	0.24	0.25	0.17
O2	0.06	0.58	0.09	0.10	0.07	0.10	0.67	0.14	0.70	0.07	0.57	1.14	0.12	0.06	0.08	0.07	0.08	0.19	0.37	0.18
O2'	0.07	0.46	0.07	0.00	0.11	0.03	0.70	0.09	0.74	0.14	0.45	0.98	0.09	0.03	0.08	0.04	0.07	0.11	0.34	0.16
O3'	0.09	0.40	0.09	0.05	0.10	0.06	0.61	0.09	0.66	0.15	0.37	0.86	0.08	0.08	0.05	0.08	0.09	0.10	0.29	0.15
O4'	0.06	0.47	0.05	0.03	0.10	0.02	0.67	0.07	0.73	0.14	0.44	0.99	0.09	0.03	0.04	0.05	0.07	0.09	0.32	0.16
O5'	0.13	0.31	0.14	0.05	0.16	0.04	0.58	0.10	0.66	0.20	0.25	0.73	0.14	0.01	0.12	0.09	0.07	0.09	0.31	0.17
OP1	0.10	0.23	0.11	0.04	0.12	0.06	0.41	0.07	0.46	0.12	0.20	0.52	0.16	0.03	0.12	0.05	0.08	0.03	0.24	0.10
OP2	0.06	0.36	0.05	0.05	0.03	0.14	0.36	0.18	0.42	0.03	0.31	0.69	0.07	0.02	0.04	0.10	0.07	0.11	0.25	0.12
P	0.05	0.29	0.08	0.02	0.08	0.05	0.40	0.09	0.47	0.09	0.24	0.61	0.11	0.01	0.07	0.02	0.07	0.05	0.25	0.11

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.07	0.01	0.01	0.06	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.05	0.14	0.01	0.06	0.07	0.01	0.06	0.17	0.09	0.01
C2	0.07	0.00	0.15	0.24	0.04	0.10	0.05	0.15	0.02	0.01	0.01	0.00	0.07	0.24	0.05	0.02	0.26	0.14	0.36	0.23
C2'	0.01	0.15	0.00	0.01	0.07	0.00	0.15	0.02	0.19	0.02	0.13	0.24	0.00	0.06	0.09	0.01	0.04	0.14	0.11	0.04
C3'	0.01	0.24	0.01	0.00	0.08	0.01	0.22	0.02	0.28	0.03	0.21	0.44	0.02	0.01	0.10	0.01	0.07	0.10	0.12	0.05
C4	0.06	0.04	0.07	0.08	0.00	0.05	0.01	0.02	0.04	0.04	0.01	0.03	0.08	0.10	0.01	0.03	0.05	0.18	0.09	0.01
C4'	0.01	0.10	0.00	0.01	0.05	0.00	0.10	0.01	0.11	0.02	0.09	0.14	0.03	0.02	0.06	0.00	0.02	0.11	0.09	0.01
C5	0.02	0.05	0.15	0.22	0.01	0.10	0.00	0.14	0.01	0.04	0.02	0.06	0.05	0.24	0.02	0.03	0.19	0.26	0.26	0.22
C5'	0.01	0.15	0.02	0.02	0.02	0.01	0.14	0.00	0.17	0.02	0.13	0.26	0.04	0.02	0.03	0.02	0.00	0.07	0.10	0.01
C6	0.03	0.02	0.19	0.28	0.04	0.11	0.01	0.17	0.00	0.01	0.05	0.04	0.04	0.29	0.04	0.04	0.24	0.28	0.29	0.26
N1	0.01	0.01	0.02	0.03	0.04	0.02	0.04	0.02	0.01	0.00	0.02	0.04	0.01	0.06	0.05	0.01	0.06	0.18	0.09	0.03
N3	0.05	0.01	0.13	0.21	0.01	0.09	0.02	0.13	0.05	0.02	0.00	0.01	0.08	0.21	0.04	0.01	0.24	0.14	0.33	0.22
O2	0.14	0.00	0.24	0.44	0.03	0.14	0.06	0.26	0.04	0.04	0.01	0.00	0.09	0.44	0.04	0.09	0.44	0.15	0.61	0.42
O2'	0.01	0.07	0.00	0.02	0.08	0.03	0.05	0.04	0.04	0.01	0.08	0.09	0.00	0.07	0.10	0.03	0.05	0.12	0.11	0.05
O3'	0.06	0.24	0.06	0.01	0.10	0.02	0.24	0.02	0.29	0.06	0.21	0.44	0.07	0.00	0.12	0.03	0.10	0.07	0.17	0.09
O4	0.07	0.05	0.09	0.10	0.01	0.06	0.02	0.03	0.04	0.05	0.04	0.04	0.10	0.12	0.00	0.04	0.06	0.17	0.10	0.02
O4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.02	0.04	0.01	0.01	0.09	0.03	0.03	0.04	0.00	0.10	0.17	0.10	0.03
O5'	0.06	0.26	0.04	0.07	0.05	0.02	0.19	0.00	0.24	0.06	0.24	0.44	0.05	0.10	0.06	0.10	0.00	0.02	0.03	0.01
OP1	0.17	0.14	0.14	0.10	0.18	0.11	0.26	0.07	0.28	0.18	0.14	0.15	0.12	0.07	0.17	0.17	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.09	0.36	0.11	0.12	0.09	0.09	0.26	0.10	0.29	0.09	0.33	0.61	0.11	0.17	0.10	0.10	0.03	0.01	0.00	0.01
P	0.01	0.23	0.04	0.05	0.01	0.01	0.22	0.01	0.26	0.03	0.22	0.42	0.05	0.09	0.02	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00