Doublet Group distance statistics: 49286

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C4	A	0, 0.000, 0.010, 0.020, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.010 std_dev=0.010
C6	A	0, 0.000, 0.011, 0.022, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.011 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.000, 0.012, 0.023, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.012 std_dev=0.012
C5	A	0, 0.000, 0.019, 0.038, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.019 std_dev=0.019
C1'	A	0, 0.000, 0.029, 0.058, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.029 std_dev=0.029
N3	A	0, 0.000, 0.032, 0.064, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.032 std_dev=0.032
C2	A	0, 0.000, 0.035, 0.071, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.035 std_dev=0.035
N4	A	0, 0.000, 0.053, 0.106, 0.106 max_d=0.106 avg_d=0.053 std_dev=0.053
O2	A	0, 0.000, 0.065, 0.129, 0.129 max_d=0.129 avg_d=0.065 std_dev=0.065
O5'	B	0, 0.000, 0.330, 0.660, 0.660 max_d=0.660 avg_d=0.330 std_dev=0.330
OP1	B	0, 0.000, 0.337, 0.673, 0.673 max_d=0.673 avg_d=0.337 std_dev=0.337
O4'	A	0, 0.000, 0.345, 0.689, 0.689 max_d=0.689 avg_d=0.345 std_dev=0.345
O5'	A	0, 0.000, 0.427, 0.855, 0.855 max_d=0.855 avg_d=0.427 std_dev=0.427
C5'	B	0, 0.000, 0.444, 0.888, 0.888 max_d=0.888 avg_d=0.444 std_dev=0.444
C2'	A	0, 0.000, 0.459, 0.918, 0.918 max_d=0.918 avg_d=0.459 std_dev=0.459
P	B	0, 0.000, 0.568, 1.136, 1.136 max_d=1.136 avg_d=0.568 std_dev=0.568
C4'	A	0, 0.000, 0.613, 1.226, 1.226 max_d=1.226 avg_d=0.613 std_dev=0.613
C5'	A	0, 0.000, 0.661, 1.322, 1.322 max_d=1.322 avg_d=0.661 std_dev=0.661
C3'	A	0, 0.000, 0.742, 1.484, 1.484 max_d=1.484 avg_d=0.742 std_dev=0.742
O2'	A	0, 0.000, 0.747, 1.494, 1.494 max_d=1.494 avg_d=0.747 std_dev=0.747
C3'	B	0, 0.000, 0.758, 1.516, 1.516 max_d=1.516 avg_d=0.758 std_dev=0.758
P	A	0, 0.000, 0.805, 1.611, 1.611 max_d=1.611 avg_d=0.805 std_dev=0.805
OP2	A	0, 0.000, 0.806, 1.612, 1.612 max_d=1.612 avg_d=0.806 std_dev=0.806
C4'	B	0, 0.000, 0.842, 1.683, 1.683 max_d=1.683 avg_d=0.842 std_dev=0.842
O3'	B	0, 0.000, 1.003, 2.007, 2.007 max_d=2.007 avg_d=1.003 std_dev=1.003
OP2	B	0, 0.000, 1.151, 2.303, 2.303 max_d=2.303 avg_d=1.151 std_dev=1.151
OP1	A	0, 0.000, 1.181, 2.361, 2.361 max_d=2.361 avg_d=1.181 std_dev=1.181
C2'	B	0, 0.000, 1.255, 2.511, 2.511 max_d=2.511 avg_d=1.255 std_dev=1.255
O3'	A	0, 0.000, 1.256, 2.513, 2.513 max_d=2.513 avg_d=1.256 std_dev=1.256
O4'	B	0, 0.000, 1.309, 2.617, 2.617 max_d=2.617 avg_d=1.309 std_dev=1.309
C6	B	0, 0.000, 1.511, 3.022, 3.022 max_d=3.022 avg_d=1.511 std_dev=1.511
O2'	B	0, 0.000, 1.578, 3.156, 3.156 max_d=3.156 avg_d=1.578 std_dev=1.578
C1'	B	0, 0.000, 1.595, 3.189, 3.189 max_d=3.189 avg_d=1.595 std_dev=1.595
C5	B	0, 0.000, 1.707, 3.415, 3.415 max_d=3.415 avg_d=1.707 std_dev=1.707
N1	B	0, 0.000, 1.841, 3.682, 3.682 max_d=3.682 avg_d=1.841 std_dev=1.841
C4	B	0, 0.000, 2.172, 4.343, 4.343 max_d=4.343 avg_d=2.172 std_dev=2.172
C2	B	0, 0.000, 2.330, 4.661, 4.661 max_d=4.661 avg_d=2.330 std_dev=2.330
O4	B	0, 0.000, 2.361, 4.723, 4.723 max_d=4.723 avg_d=2.361 std_dev=2.361
N3	B	0, 0.000, 2.449, 4.899, 4.899 max_d=4.899 avg_d=2.449 std_dev=2.449
O2	B	0, 0.000, 2.651, 5.302, 5.302 max_d=5.302 avg_d=2.651 std_dev=2.651

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.05	0.00	0.01	0.04	0.02	0.06	0.00	0.22	0.00	0.13	0.03	0.02	0.09
C2	0.04	0.00	0.15	0.21	0.00	0.06	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.08	0.04	0.02	0.03	0.02	0.09	0.03
C2'	0.00	0.15	0.00	0.00	0.02	0.01	0.07	0.14	0.11	0.01	0.12	0.02	0.24	0.01	0.01	0.01	0.34	0.13	0.18	0.25
C3'	0.01	0.21	0.00	0.00	0.27	0.00	0.25	0.01	0.20	0.17	0.26	0.28	0.17	0.01	0.00	0.01	0.00	0.17	0.29	0.16
C4	0.02	0.00	0.02	0.27	0.00	0.07	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.23	0.11	0.00	0.00	0.05	0.06	0.06
C4'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.07	0.00	0.08	0.01	0.08	0.06	0.07	0.07	0.06	0.23	0.01	0.00	0.01	0.10	0.16	0.07
C5	0.00	0.01	0.07	0.25	0.00	0.08	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.26	0.15	0.03	0.00	0.09	0.00	0.09
C5'	0.05	0.01	0.14	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.03	0.00	0.08	0.17	0.01	0.01	0.03	0.05	0.01
C6	0.00	0.02	0.11	0.20	0.01	0.08	0.00	0.02	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.24	0.09	0.05	0.04	0.08	0.03	0.10
N1	0.01	0.02	0.01	0.17	0.01	0.06	0.00	0.02	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.14	0.04	0.00	0.06	0.02	0.03	0.07
N3	0.04	0.01	0.12	0.26	0.01	0.07	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.00	0.14	0.04	0.02	0.01	0.00	0.10	0.03
N4	0.02	0.01	0.02	0.28	0.00	0.07	0.01	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.24	0.15	0.00	0.00	0.08	0.05	0.07
O2	0.06	0.00	0.24	0.17	0.01	0.06	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.01	0.00	0.04	0.14	0.03	0.04	0.06	0.12	0.01
O2'	0.00	0.08	0.01	0.01	0.23	0.23	0.26	0.08	0.24	0.14	0.14	0.24	0.04	0.00	0.02	0.14	0.24	0.03	0.23	0.17
O3'	0.22	0.04	0.01	0.00	0.11	0.01	0.15	0.17	0.09	0.04	0.04	0.15	0.14	0.02	0.00	0.17	0.20	0.60	0.66	0.50
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.01	0.05	0.00	0.02	0.00	0.03	0.14	0.17	0.00	0.01	0.04	0.08	0.00
O5'	0.13	0.03	0.34	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.04	0.06	0.01	0.00	0.04	0.24	0.20	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.03	0.02	0.13	0.17	0.05	0.10	0.09	0.03	0.08	0.02	0.00	0.08	0.06	0.03	0.60	0.04	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.02	0.09	0.18	0.29	0.06	0.16	0.00	0.05	0.03	0.03	0.10	0.05	0.12	0.23	0.66	0.08	0.02	0.00	0.00	0.01
P	0.09	0.03	0.25	0.16	0.06	0.07	0.09	0.01	0.10	0.07	0.03	0.07	0.01	0.17	0.50	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.42	0.47	0.43	0.25	0.30	0.14	0.22	0.00	0.26	0.41	0.42	0.56	0.59	0.26	0.27	0.27	0.08	0.05	0.33	0.01
C2	0.54	0.67	0.59	0.30	0.55	0.14	0.46	0.01	0.47	0.59	0.65	0.74	0.78	0.27	0.53	0.31	0.13	0.12	0.29	0.07
C2'	0.49	0.51	0.52	0.40	0.37	0.28	0.32	0.16	0.35	0.47	0.47	0.58	0.64	0.38	0.34	0.38	0.27	0.12	0.07	0.20
C3'	0.03	0.09	0.06	0.08	0.06	0.20	0.13	0.33	0.11	0.02	0.05	0.19	0.24	0.05	0.08	0.09	0.23	0.33	0.49	0.28
C4	0.61	0.75	0.67	0.35	0.65	0.19	0.57	0.03	0.59	0.69	0.74	0.79	0.82	0.31	0.63	0.36	0.18	0.16	0.23	0.10
C4'	0.19	0.26	0.17	0.03	0.08	0.04	0.01	0.17	0.02	0.17	0.20	0.37	0.33	0.07	0.06	0.09	0.14	0.14	0.45	0.19
C5	0.56	0.63	0.62	0.35	0.48	0.20	0.41	0.03	0.46	0.58	0.59	0.69	0.74	0.32	0.45	0.35	0.14	0.07	0.29	0.02
C5'	0.17	0.19	0.10	0.03	0.01	0.01	0.06	0.10	0.02	0.12	0.13	0.30	0.20	0.09	0.01	0.13	0.11	0.08	0.36	0.15
C6	0.48	0.53	0.53	0.32	0.35	0.18	0.28	0.02	0.33	0.47	0.47	0.60	0.67	0.31	0.32	0.31	0.09	0.04	0.32	0.00
N1	0.48	0.56	0.52	0.29	0.41	0.15	0.32	0.00	0.35	0.50	0.52	0.64	0.70	0.28	0.38	0.29	0.10	0.07	0.32	0.02
N3	0.60	0.76	0.65	0.33	0.67	0.16	0.57	0.00	0.57	0.68	0.75	0.81	0.83	0.28	0.65	0.34	0.16	0.16	0.24	0.10
N4	0.66	0.84	0.70	0.37	0.78	0.22	0.71	0.06	0.70	0.77	0.85	0.86	0.83	0.32	0.77	0.40	0.23	0.24	0.13	0.17
O2	0.53	0.68	0.57	0.28	0.56	0.12	0.46	0.02	0.47	0.59	0.66	0.74	0.77	0.25	0.55	0.29	0.13	0.13	0.29	0.08
O2'	0.45	0.46	0.50	0.40	0.38	0.34	0.36	0.31	0.39	0.45	0.43	0.48	0.54	0.31	0.35	0.39	0.45	0.39	0.13	0.44
O3'	0.17	0.08	0.09	0.29	0.16	0.45	0.22	0.53	0.23	0.15	0.08	0.02	0.12	0.33	0.16	0.34	0.34	0.34	0.53	0.34
O4'	0.33	0.39	0.30	0.12	0.19	0.04	0.10	0.10	0.14	0.31	0.33	0.51	0.48	0.16	0.16	0.19	0.08	0.04	0.47	0.14
O5'	0.00	0.01	0.04	0.07	0.16	0.08	0.21	0.16	0.17	0.06	0.07	0.08	0.03	0.00	0.18	0.01	0.16	0.16	0.37	0.19
OP1	0.05	0.05	0.01	0.01	0.03	0.07	0.06	0.03	0.04	0.02	0.03	0.10	0.02	0.02	0.03	0.13	0.00	0.06	0.03	0.02
OP2	0.01	0.01	0.03	0.03	0.05	0.01	0.06	0.03	0.05	0.02	0.02	0.02	0.06	0.01	0.06	0.00	0.04	0.17	0.06	0.01
P	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.00	0.10	0.04	0.09	0.02	0.02	0.06	0.02	0.00	0.09	0.04	0.03	0.10	0.09	0.05

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.00	0.05	0.02	0.04	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.04	0.00	0.02	0.28	0.07	0.01
C2	0.00	0.00	0.04	0.01	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.00	0.00	0.00	0.06	0.00	0.00	0.02	0.04	0.40	0.07	0.01
C2'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.13	0.01	0.14	0.00	0.12	0.04	0.08	0.01	0.00	0.01	0.14	0.00	0.02	0.33	0.12	0.01
C3'	0.01	0.01	0.01	0.00	0.09	0.00	0.11	0.02	0.09	0.03	0.04	0.03	0.01	0.00	0.10	0.02	0.02	0.09	0.06	0.02
C4	0.04	0.00	0.13	0.09	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.19	0.07	0.00	0.00	0.11	0.41	0.03	0.06
C4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.04	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.05	0.17	0.02
C5	0.05	0.00	0.14	0.11	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.20	0.09	0.02	0.02	0.12	0.40	0.02	0.05
C5'	0.02	0.05	0.00	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.03	0.04	0.05	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.18	0.28	0.02
C6	0.04	0.01	0.12	0.09	0.01	0.03	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.15	0.08	0.02	0.02	0.09	0.39	0.04	0.01
N1	0.02	0.00	0.04	0.03	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.00	0.00	0.01	0.06	0.02	0.02	0.01	0.04	0.38	0.08	0.01
N3	0.01	0.00	0.08	0.04	0.00	0.01	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.12	0.02	0.00	0.02	0.07	0.42	0.02	0.02
O2	0.02	0.00	0.01	0.03	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.00	0.05	0.01	0.39	0.09	0.03
O2'	0.02	0.06	0.00	0.01	0.19	0.01	0.20	0.00	0.15	0.06	0.12	0.01	0.00	0.00	0.21	0.02	0.03	0.40	0.25	0.00
O3'	0.01	0.00	0.01	0.00	0.07	0.02	0.09	0.01	0.08	0.02	0.02	0.04	0.00	0.00	0.08	0.05	0.01	0.05	0.04	0.02
O4	0.04	0.00	0.14	0.10	0.00	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.00	0.00	0.21	0.08	0.00	0.00	0.13	0.40	0.07	0.08
O4'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.05	0.02	0.05	0.00	0.00	0.05	0.05	0.19	0.04
O5'	0.02	0.04	0.02	0.02	0.11	0.02	0.12	0.01	0.09	0.04	0.07	0.01	0.03	0.01	0.13	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01
OP1	0.28	0.40	0.33	0.09	0.41	0.05	0.40	0.18	0.39	0.38	0.42	0.39	0.40	0.05	0.40	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.07	0.07	0.12	0.06	0.03	0.17	0.02	0.28	0.04	0.08	0.02	0.09	0.25	0.04	0.07	0.19	0.00	0.01	0.00	0.01
P	0.01	0.01	0.01	0.02	0.06	0.02	0.05	0.02	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.02	0.08	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00